MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p3BKT015925

Total Repeats: 317

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015418	TA	6	12	98	109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015418	TA	3	6	189	194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015418	AT	4	8	591	598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015418	AT	3	6	625	630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015418	AT	3	6	640	645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015418	AT	3	6	676	681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015418	AT	3	6	687	692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015418	TA	3	6	784	789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015418	AT	3	6	875	880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015418	GT	4	8	1247	1254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015418	AG	3	6	1533	1538	50 %	0 %	50 %	0 %	331271089
12	NC_015418	TA	4	8	1609	1616	50 %	50 %	0 %	0 %	331271089
13	NC_015418	TA	3	6	2038	2043	50 %	50 %	0 %	0 %	331271089
14	NC_015418	TA	3	6	2088	2093	50 %	50 %	0 %	0 %	331271089
15	NC_015418	TA	3	6	2452	2457	50 %	50 %	0 %	0 %	331271089
16	NC_015418	AT	3	6	2486	2491	50 %	50 %	0 %	0 %	331271089
17	NC_015418	TA	3	6	3034	3039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015418	AT	4	8	3205	3212	50 %	50 %	0 %	0 %	331271090
19	NC_015418	TA	3	6	3256	3261	50 %	50 %	0 %	0 %	331271090
20	NC_015418	AT	3	6	3588	3593	50 %	50 %	0 %	0 %	331271090
21	NC_015418	AT	3	6	3714	3719	50 %	50 %	0 %	0 %	331271090
22	NC_015418	TG	3	6	3992	3997	0 %	50 %	50 %	0 %	331271090
23	NC_015418	AT	3	6	4151	4156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015418	AT	3	6	4165	4170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015418	GA	3	6	4216	4221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015418	AT	4	8	4299	4306	50 %	50 %	0 %	0 %	331271091
27	NC_015418	TA	3	6	4350	4355	50 %	50 %	0 %	0 %	331271091
28	NC_015418	TA	3	6	4392	4397	50 %	50 %	0 %	0 %	331271091
29	NC_015418	AT	4	8	4682	4689	50 %	50 %	0 %	0 %	331271091
30	NC_015418	TG	3	6	5086	5091	0 %	50 %	50 %	0 %	331271091
31	NC_015418	TA	3	6	5119	5124	50 %	50 %	0 %	0 %	331271091
32	NC_015418	TA	3	6	5248	5253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015418	AT	3	6	5260	5265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015418	AT	3	6	5949	5954	50 %	50 %	0 %	0 %	331271092
35	NC_015418	AT	3	6	6101	6106	50 %	50 %	0 %	0 %	331271092
36	NC_015418	AT	3	6	6335	6340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015418	AT	5	10	6403	6412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015418	AT	3	6	6429	6434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015418	TA	4	8	6615	6622	50 %	50 %	0 %	0 %	331271093
40	NC_015418	TA	3	6	6645	6650	50 %	50 %	0 %	0 %	331271093
41	NC_015418	AT	3	6	6896	6901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015418	TG	3	6	7017	7022	0 %	50 %	50 %	0 %	331271094
43	NC_015418	GA	3	6	7153	7158	50 %	0 %	50 %	0 %	331271094
44	NC_015418	TA	3	6	7202	7207	50 %	50 %	0 %	0 %	331271094
45	NC_015418	AT	5	10	7461	7470	50 %	50 %	0 %	0 %	331271095
46	NC_015418	AT	3	6	7495	7500	50 %	50 %	0 %	0 %	331271095
47	NC_015418	TA	3	6	7677	7682	50 %	50 %	0 %	0 %	331271095
48	NC_015418	AT	3	6	8176	8181	50 %	50 %	0 %	0 %	331271096
49	NC_015418	TA	3	6	8563	8568	50 %	50 %	0 %	0 %	331271096
50	NC_015418	AT	3	6	9069	9074	50 %	50 %	0 %	0 %	331271096
51	NC_015418	AC	4	8	9333	9340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015418	AT	3	6	9672	9677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015418	TA	3	6	9721	9726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015418	AT	3	6	9780	9785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015418	AT	3	6	9907	9912	50 %	50 %	0 %	0 %	331271098
56	NC_015418	TA	3	6	9954	9959	50 %	50 %	0 %	0 %	331271098
57	NC_015418	AT	3	6	9983	9988	50 %	50 %	0 %	0 %	331271098
58	NC_015418	AT	4	8	10123	10130	50 %	50 %	0 %	0 %	331271098
59	NC_015418	TA	3	6	10266	10271	50 %	50 %	0 %	0 %	331271098
60	NC_015418	AT	3	6	10294	10299	50 %	50 %	0 %	0 %	331271098
61	NC_015418	TA	3	6	10788	10793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015418	AT	3	6	11153	11158	50 %	50 %	0 %	0 %	331271099
63	NC_015418	TA	4	8	11405	11412	50 %	50 %	0 %	0 %	331271099
64	NC_015418	TG	3	6	11878	11883	0 %	50 %	50 %	0 %	331271099
65	NC_015418	TA	3	6	12234	12239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015418	AT	3	6	12263	12268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015418	TA	3	6	12290	12295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015418	GA	3	6	12433	12438	50 %	0 %	50 %	0 %	331271100
69	NC_015418	TA	3	6	12481	12486	50 %	50 %	0 %	0 %	331271100
70	NC_015418	AT	3	6	12525	12530	50 %	50 %	0 %	0 %	331271100
71	NC_015418	TA	3	6	12716	12721	50 %	50 %	0 %	0 %	331271100
72	NC_015418	AT	3	6	13123	13128	50 %	50 %	0 %	0 %	331271100
73	NC_015418	TA	3	6	13243	13248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015418	AT	3	6	13321	13326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015418	AT	3	6	13414	13419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015418	AT	3	6	13883	13888	50 %	50 %	0 %	0 %	331271101
77	NC_015418	AT	4	8	14002	14009	50 %	50 %	0 %	0 %	331271101
78	NC_015418	TA	4	8	14155	14162	50 %	50 %	0 %	0 %	331271101
79	NC_015418	AT	3	6	14426	14431	50 %	50 %	0 %	0 %	331271102
80	NC_015418	AT	3	6	15173	15178	50 %	50 %	0 %	0 %	331271103
81	NC_015418	AT	3	6	16076	16081	50 %	50 %	0 %	0 %	331271105
82	NC_015418	TA	3	6	16125	16130	50 %	50 %	0 %	0 %	331271105
83	NC_015418	TA	3	6	16304	16309	50 %	50 %	0 %	0 %	331271105
84	NC_015418	TA	4	8	16634	16641	50 %	50 %	0 %	0 %	331271105
85	NC_015418	AT	3	6	16721	16726	50 %	50 %	0 %	0 %	331271105
86	NC_015418	TA	3	6	17217	17222	50 %	50 %	0 %	0 %	331271106
87	NC_015418	AG	3	6	17261	17266	50 %	0 %	50 %	0 %	331271106
88	NC_015418	AG	3	6	17282	17287	50 %	0 %	50 %	0 %	331271106
89	NC_015418	AG	3	6	17483	17488	50 %	0 %	50 %	0 %	331271106
90	NC_015418	TA	3	6	17661	17666	50 %	50 %	0 %	0 %	331271107
91	NC_015418	TA	3	6	17692	17697	50 %	50 %	0 %	0 %	331271107
92	NC_015418	AT	5	10	18073	18082	50 %	50 %	0 %	0 %	331271107
93	NC_015418	AT	3	6	18103	18108	50 %	50 %	0 %	0 %	331271107
94	NC_015418	TA	3	6	18143	18148	50 %	50 %	0 %	0 %	331271107
95	NC_015418	AT	3	6	18660	18665	50 %	50 %	0 %	0 %	331271107
96	NC_015418	TA	3	6	18973	18978	50 %	50 %	0 %	0 %	331271107
97	NC_015418	TA	3	6	19104	19109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015418	AT	3	6	19544	19549	50 %	50 %	0 %	0 %	331271108
99	NC_015418	AT	4	8	19930	19937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015418	TA	3	6	20015	20020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015418	TA	3	6	20316	20321	50 %	50 %	0 %	0 %	331271110
102	NC_015418	AT	4	8	20351	20358	50 %	50 %	0 %	0 %	331271110
103	NC_015418	TC	3	6	20471	20476	0 %	50 %	0 %	50 %	331271110
104	NC_015418	CT	3	6	20495	20500	0 %	50 %	0 %	50 %	331271110
105	NC_015418	AT	3	6	20597	20602	50 %	50 %	0 %	0 %	331271110
106	NC_015418	TA	3	6	20732	20737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015418	TA	3	6	20829	20834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015418	TA	3	6	21964	21969	50 %	50 %	0 %	0 %	331271112
109	NC_015418	TA	3	6	22172	22177	50 %	50 %	0 %	0 %	331271112
110	NC_015418	GA	3	6	22688	22693	50 %	0 %	50 %	0 %	331271112
111	NC_015418	AT	3	6	22908	22913	50 %	50 %	0 %	0 %	331271112
112	NC_015418	AT	3	6	24332	24337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015418	AT	4	8	24365	24372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015418	TA	3	6	24509	24514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015418	GT	3	6	24544	24549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015418	TC	3	6	25216	25221	0 %	50 %	0 %	50 %	331271115
117	NC_015418	TG	3	6	25240	25245	0 %	50 %	50 %	0 %	331271115
118	NC_015418	AT	3	6	25743	25748	50 %	50 %	0 %	0 %	331271115
119	NC_015418	TA	3	6	26012	26017	50 %	50 %	0 %	0 %	331271115
120	NC_015418	AT	3	6	26453	26458	50 %	50 %	0 %	0 %	331271116
121	NC_015418	AT	3	6	26670	26675	50 %	50 %	0 %	0 %	331271116
122	NC_015418	TA	5	10	26808	26817	50 %	50 %	0 %	0 %	331271116
123	NC_015418	TA	3	6	26894	26899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015418	AT	3	6	26942	26947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015418	TC	4	8	27026	27033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015418	TA	3	6	27034	27039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015418	TA	4	8	27807	27814	50 %	50 %	0 %	0 %	331271118
128	NC_015418	TA	3	6	27868	27873	50 %	50 %	0 %	0 %	331271118
129	NC_015418	AT	3	6	27957	27962	50 %	50 %	0 %	0 %	331271118
130	NC_015418	TA	4	8	28276	28283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015418	AT	3	6	28925	28930	50 %	50 %	0 %	0 %	331271119
132	NC_015418	AT	3	6	29430	29435	50 %	50 %	0 %	0 %	331271119
133	NC_015418	TA	3	6	29468	29473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015418	AT	3	6	29511	29516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015418	TA	3	6	29575	29580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015418	TA	3	6	29582	29587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015418	AT	4	8	29861	29868	50 %	50 %	0 %	0 %	331271120
138	NC_015418	AT	3	6	30320	30325	50 %	50 %	0 %	0 %	331271120
139	NC_015418	AT	4	8	30842	30849	50 %	50 %	0 %	0 %	331271121
140	NC_015418	TA	5	10	31035	31044	50 %	50 %	0 %	0 %	331271121
141	NC_015418	AT	3	6	31387	31392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015418	TA	3	6	31834	31839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015418	GA	3	6	31925	31930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015418	TA	3	6	31933	31938	50 %	50 %	0 %	0 %	331271123
145	NC_015418	AT	3	6	32305	32310	50 %	50 %	0 %	0 %	331271123
146	NC_015418	TA	3	6	32559	32564	50 %	50 %	0 %	0 %	331271123
147	NC_015418	AT	3	6	33713	33718	50 %	50 %	0 %	0 %	331271124
148	NC_015418	CA	3	6	34473	34478	50 %	0 %	0 %	50 %	331271124
149	NC_015418	TC	3	6	34522	34527	0 %	50 %	0 %	50 %	331271124
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.