MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p3BKT015925

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015418	GATTAA	2	12	1855	1866	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331271089
2	NC_015418	CAACAG	2	12	6482	6493	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	331271093
3	NC_015418	AAATAT	2	12	7769	7780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331271095
4	NC_015418	TTTATG	2	12	10741	10752	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015418	TGTTCC	2	12	12087	12098	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	331271099
6	NC_015418	ATGCTA	2	12	12149	12160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	331271099
7	NC_015418	TTAGAG	2	12	12817	12828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331271100
8	NC_015418	TATACT	2	12	13781	13792	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331271101
9	NC_015418	CAATTG	2	12	16519	16530	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	331271105
10	NC_015418	GATTTT	2	12	18208	18219	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	331271107
11	NC_015418	TTTATC	2	12	19722	19733	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331271109
12	NC_015418	TATTTG	2	12	20140	20151	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	331271110
13	NC_015418	AAATAC	2	12	20807	20818	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015418	TGTCCA	2	12	20843	20854	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015418	TTAAAT	2	12	21979	21990	50 %	50 %	0 %	0 %	331271112
16	NC_015418	CTTTGG	2	12	22465	22476	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	331271112
17	NC_015418	TTTACC	2	12	22811	22822	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	331271112
18	NC_015418	TGTTTT	2	12	24282	24293	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015418	AAAATT	2	12	26160	26171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331271115
20	NC_015418	ACAATA	2	12	27506	27517	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	331271117
21	NC_015418	AACTGT	2	12	28412	28423	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015418	TTGTAC	2	12	30074	30085	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	331271120
23	NC_015418	AAAATC	2	12	32161	32172	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	331271123
24	NC_015418	GTTGCT	2	12	34980	34991	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	331271124
25	NC_015418	TCTTTT	2	12	35379	35390	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	331271124
26	NC_015418	TTTAAT	2	12	36632	36643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331271125
27	NC_015418	TACTCA	2	12	38888	38899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331271127
28	NC_015418	CTTTTA	2	12	40708	40719	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015418	TAAAGT	2	12	41913	41924	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331271131
30	NC_015418	CTTTAT	2	12	45100	45111	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	331271135
31	NC_015418	AGTTAC	2	12	45969	45980	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	331271136
32	NC_015418	ATACGA	2	12	48307	48318	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015418	TTATTT	2	12	51335	51346	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	331271139
34	NC_015418	AGTAAT	2	12	52464	52475	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015418	ATATAG	2	12	55063	55074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331271142
36	NC_015418	TTTATT	2	12	55316	55327	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	331271143
37	NC_015418	TGTTAT	2	12	55863	55874	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	331271143
38	NC_015418	GATAAT	2	12	60942	60953	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	331271149
39	NC_015418	AGGTAA	2	12	68404	68415	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	331271160
40	NC_015418	CCAAAG	2	12	68751	68762	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	331271160
41	NC_015418	ATTTAA	2	12	69239	69250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015418	TAGCGT	2	12	70228	70239	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	331271162
43	NC_015418	TTTCTC	2	12	71257	71268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331271162
44	NC_015418	AATTAT	2	12	73872	73883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015418	TACAAA	2	12	74654	74665	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	331271165
46	NC_015418	GAACTG	2	12	75289	75300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	331271166
47	NC_015418	TTATTT	2	12	75577	75588	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015418	GTTTAT	2	12	75593	75604	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015418	TCTTAA	2	12	77773	77784	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015418	CTATGT	2	12	78669	78680	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	331271171
51	NC_015418	TTTACA	2	12	79110	79121	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015418	ATTATC	2	12	80068	80079	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	331271173
53	NC_015418	ATCCTA	2	12	80145	80156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331271173

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.