MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p3BKT015925

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015418	ATATT	2	10	838	847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015418	AAGTA	2	10	1492	1501	60 %	20 %	20 %	0 %	331271089
3	NC_015418	GTATG	2	10	1587	1596	20 %	40 %	40 %	0 %	331271089
4	NC_015418	AAAAG	2	10	2627	2636	80 %	0 %	20 %	0 %	331271089
5	NC_015418	TATAA	2	10	2739	2748	60 %	40 %	0 %	0 %	331271089
6	NC_015418	TATCA	2	10	3153	3162	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015418	ATAAA	2	10	3323	3332	80 %	20 %	0 %	0 %	331271090
8	NC_015418	TATCA	2	10	4247	4256	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015418	ATAAA	2	10	4417	4426	80 %	20 %	0 %	0 %	331271091
10	NC_015418	TTACT	2	10	6720	6729	20 %	60 %	0 %	20 %	331271093
11	NC_015418	TGATA	2	10	7365	7374	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015418	TAATT	2	10	7387	7396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015418	ATATG	2	10	8639	8648	40 %	40 %	20 %	0 %	331271096
14	NC_015418	CAATA	2	10	9750	9759	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015418	TTTTC	2	10	11128	11137	0 %	80 %	0 %	20 %	331271099
16	NC_015418	TCTTT	2	10	11638	11647	0 %	80 %	0 %	20 %	331271099
17	NC_015418	ATATA	2	10	13425	13434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015418	ATTAT	2	10	15963	15972	40 %	60 %	0 %	0 %	331271104
19	NC_015418	ACTTT	2	10	16147	16156	20 %	60 %	0 %	20 %	331271105
20	NC_015418	TAAAA	2	10	16883	16892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015418	AAAAT	2	10	16930	16939	80 %	20 %	0 %	0 %	331271106
22	NC_015418	GAATT	2	10	18239	18248	40 %	40 %	20 %	0 %	331271107
23	NC_015418	ATATT	2	10	19115	19124	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015418	CTTCT	2	10	19405	19414	0 %	60 %	0 %	40 %	331271108
25	NC_015418	AGAAA	2	10	20249	20258	80 %	0 %	20 %	0 %	331271110
26	NC_015418	TAATT	2	10	22071	22080	40 %	60 %	0 %	0 %	331271112
27	NC_015418	AGAAA	2	10	22656	22665	80 %	0 %	20 %	0 %	331271112
28	NC_015418	ATTTA	2	10	23180	23189	40 %	60 %	0 %	0 %	331271112
29	NC_015418	TATAG	2	10	23351	23360	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015418	TAAAA	2	10	24659	24668	80 %	20 %	0 %	0 %	331271114
31	NC_015418	ACTAT	2	10	26900	26909	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015418	ATTTT	2	10	27048	27057	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015418	TCCTT	2	10	28138	28147	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015418	TATAA	2	10	28244	28253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015418	GCTTT	2	10	28483	28492	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015418	CTATA	2	10	29124	29133	40 %	40 %	0 %	20 %	331271119
37	NC_015418	TTTTA	2	10	29317	29326	20 %	80 %	0 %	0 %	331271119
38	NC_015418	TTTGT	2	10	29474	29483	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015418	TATAT	2	10	31401	31410	40 %	60 %	0 %	0 %	331271122
40	NC_015418	ATTAT	2	10	31777	31786	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015418	ATTTT	2	10	32115	32124	20 %	80 %	0 %	0 %	331271123
42	NC_015418	TTAAT	2	10	33799	33808	40 %	60 %	0 %	0 %	331271124
43	NC_015418	GAAAA	2	10	35076	35085	80 %	0 %	20 %	0 %	331271124
44	NC_015418	ATTTT	2	10	35093	35102	20 %	80 %	0 %	0 %	331271124
45	NC_015418	TTCAT	2	10	35504	35513	20 %	60 %	0 %	20 %	331271124
46	NC_015418	TAAAG	2	10	35673	35682	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015418	TAATA	2	10	37939	37948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015418	ATGAA	2	10	39013	39022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015418	AATGT	2	10	39609	39618	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015418	ATTTT	2	10	39643	39652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015418	TAAAA	2	10	41100	41109	80 %	20 %	0 %	0 %	331271131
52	NC_015418	GTATA	2	10	42175	42184	40 %	40 %	20 %	0 %	331271132
53	NC_015418	TGTAA	2	10	42551	42560	40 %	40 %	20 %	0 %	331271133
54	NC_015418	ATAAA	2	10	43100	43109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015418	ATACT	2	10	43158	43167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015418	AATGG	2	10	45598	45607	40 %	20 %	40 %	0 %	331271136
57	NC_015418	AATCT	2	10	46721	46730	40 %	40 %	0 %	20 %	331271136
58	NC_015418	TAATA	2	10	46868	46877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015418	TTGAA	2	10	47749	47758	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015418	TTTAT	2	10	48337	48346	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015418	ATATT	2	10	48871	48880	40 %	60 %	0 %	0 %	331271137
62	NC_015418	TAAAA	2	10	51691	51700	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015418	TTGTT	2	10	51905	51914	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015418	ATTTA	2	10	53000	53009	40 %	60 %	0 %	0 %	331271140
65	NC_015418	CACTA	2	10	53709	53718	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_015418	TTAAT	2	10	54775	54784	40 %	60 %	0 %	0 %	331271141
67	NC_015418	AGATA	2	10	54971	54980	60 %	20 %	20 %	0 %	331271142
68	NC_015418	GTATA	2	10	56074	56083	40 %	40 %	20 %	0 %	331271143
69	NC_015418	ATGAT	2	10	56986	56995	40 %	40 %	20 %	0 %	331271144
70	NC_015418	GATAT	2	10	57090	57099	40 %	40 %	20 %	0 %	331271144
71	NC_015418	AGCTA	2	10	57852	57861	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015418	TAATA	2	10	58755	58764	60 %	40 %	0 %	0 %	331271146
73	NC_015418	TAAAG	2	10	59218	59227	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015418	TAAGT	2	10	59580	59589	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015418	TAAAG	2	10	60242	60251	60 %	20 %	20 %	0 %	331271149
76	NC_015418	CTATT	2	10	61114	61123	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015418	TCTTT	2	10	61473	61482	0 %	80 %	0 %	20 %	331271150
78	NC_015418	ATAAA	2	10	62981	62990	80 %	20 %	0 %	0 %	331271153
79	NC_015418	TACTA	2	10	63271	63280	40 %	40 %	0 %	20 %	331271154
80	NC_015418	TCATT	2	10	63975	63984	20 %	60 %	0 %	20 %	331271154
81	NC_015418	ATTTA	2	10	63988	63997	40 %	60 %	0 %	0 %	331271154
82	NC_015418	TAAAT	2	10	68038	68047	60 %	40 %	0 %	0 %	331271160
83	NC_015418	TTTTC	2	10	68561	68570	0 %	80 %	0 %	20 %	331271160
84	NC_015418	AAATT	2	10	69146	69155	60 %	40 %	0 %	0 %	331271160
85	NC_015418	TTTGT	2	10	71613	71622	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015418	ATATT	2	10	72894	72903	40 %	60 %	0 %	0 %	331271164
87	NC_015418	ACTTT	2	10	72908	72917	20 %	60 %	0 %	20 %	331271164
88	NC_015418	ATAAA	2	10	74065	74074	80 %	20 %	0 %	0 %	331271165
89	NC_015418	AATGA	2	10	74151	74160	60 %	20 %	20 %	0 %	331271165
90	NC_015418	TCTTA	2	10	75445	75454	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015418	TAATA	2	10	75651	75660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015418	TAAAC	2	10	75797	75806	60 %	20 %	0 %	20 %	331271167
93	NC_015418	TAATT	2	10	75971	75980	40 %	60 %	0 %	0 %	331271167
94	NC_015418	ATGTT	2	10	76222	76231	20 %	60 %	20 %	0 %	331271167
95	NC_015418	TAAAA	2	10	76304	76313	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015418	CATGA	2	10	76496	76505	40 %	20 %	20 %	20 %	331271168
97	NC_015418	TACTA	2	10	77056	77065	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015418	TTAAA	2	10	77150	77159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015418	ACAAG	2	10	79898	79907	60 %	0 %	20 %	20 %	331271173
100	NC_015418	CTATA	2	10	79941	79950	40 %	40 %	0 %	20 %	331271173

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.