MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p1BKT015925

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015417	GTATT	2	10	294	303	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015417	TATAA	2	10	1938	1947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015417	AAGAA	2	10	4558	4567	80 %	0 %	20 %	0 %	331270871
4	NC_015417	ATGAA	2	10	5064	5073	60 %	20 %	20 %	0 %	331270871
5	NC_015417	TAAAT	2	10	8386	8395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015417	GATAA	2	10	8398	8407	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015417	ATTAA	2	10	8445	8454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015417	TAAAA	2	10	8662	8671	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015417	TGAAA	2	10	10176	10185	60 %	20 %	20 %	0 %	331270875
10	NC_015417	GAAAA	2	10	10423	10432	80 %	0 %	20 %	0 %	331270875
11	NC_015417	AAGTT	2	10	12755	12764	40 %	40 %	20 %	0 %	331270878
12	NC_015417	AAATA	2	10	14506	14515	80 %	20 %	0 %	0 %	331270880
13	NC_015417	AAAAT	2	10	16454	16463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015417	AAATA	2	10	16566	16575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015417	ACAAT	2	10	17051	17060	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015417	TCTTT	2	10	17839	17848	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015417	TTTTG	2	10	18083	18092	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015417	GAAAT	2	10	18504	18513	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015417	AATAA	2	10	18983	18992	80 %	20 %	0 %	0 %	331270885
20	NC_015417	ATAGA	2	10	19479	19488	60 %	20 %	20 %	0 %	331270885
21	NC_015417	AATTA	2	10	19823	19832	60 %	40 %	0 %	0 %	331270886
22	NC_015417	GTATA	2	10	19959	19968	40 %	40 %	20 %	0 %	331270886
23	NC_015417	AAAAG	2	10	20352	20361	80 %	0 %	20 %	0 %	331270886
24	NC_015417	TTTAA	2	10	20878	20887	40 %	60 %	0 %	0 %	331270886
25	NC_015417	GAAAA	2	10	21225	21234	80 %	0 %	20 %	0 %	331270886
26	NC_015417	ATTTA	2	10	22484	22493	40 %	60 %	0 %	0 %	331270887
27	NC_015417	AAGAA	2	10	23005	23014	80 %	0 %	20 %	0 %	331270889
28	NC_015417	ATGAA	2	10	23511	23520	60 %	20 %	20 %	0 %	331270889
29	NC_015417	AATAC	2	10	24927	24936	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015417	TCATA	2	10	26427	26436	40 %	40 %	0 %	20 %	331270891
31	NC_015417	AAAAT	2	10	29505	29514	80 %	20 %	0 %	0 %	331270892
32	NC_015417	ATTTA	2	10	30138	30147	40 %	60 %	0 %	0 %	331270892
33	NC_015417	ATTTA	2	10	30421	30430	40 %	60 %	0 %	0 %	331270892
34	NC_015417	AAAAG	2	10	30854	30863	80 %	0 %	20 %	0 %	331270893
35	NC_015417	AGAAA	2	10	31900	31909	80 %	0 %	20 %	0 %	331270894
36	NC_015417	GAAGA	2	10	32428	32437	60 %	0 %	40 %	0 %	331270894
37	NC_015417	TAACC	2	10	32709	32718	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015417	AACGA	2	10	33825	33834	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015417	AATAT	2	10	33911	33920	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015417	TTGGA	2	10	33967	33976	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015417	TGAAG	2	10	34005	34014	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015417	AGAAA	2	10	34147	34156	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015417	ACTAA	2	10	35761	35770	60 %	20 %	0 %	20 %	331270897
44	NC_015417	TAAAT	2	10	37246	37255	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015417	TAACT	2	10	38835	38844	40 %	40 %	0 %	20 %	331270899
46	NC_015417	AAATT	3	15	39284	39298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015417	AATTA	2	10	39712	39721	60 %	40 %	0 %	0 %	331270901
48	NC_015417	ATAAA	3	15	40474	40488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015417	TAAAA	2	10	40908	40917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015417	AGTTA	2	10	41344	41353	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015417	ATAAC	2	10	41726	41735	60 %	20 %	0 %	20 %	331270905
52	NC_015417	TATAG	2	10	41980	41989	40 %	40 %	20 %	0 %	331270905
53	NC_015417	AATTA	2	10	43203	43212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015417	AATTA	2	10	43442	43451	60 %	40 %	0 %	0 %	331270907
55	NC_015417	AGAAA	2	10	43494	43503	80 %	0 %	20 %	0 %	331270907
56	NC_015417	ATTAA	2	10	43694	43703	60 %	40 %	0 %	0 %	331270907
57	NC_015417	CATTG	2	10	44069	44078	20 %	40 %	20 %	20 %	331270908
58	NC_015417	GAATT	2	10	44731	44740	40 %	40 %	20 %	0 %	331270909
59	NC_015417	TAATT	2	10	45330	45339	40 %	60 %	0 %	0 %	331270911
60	NC_015417	GGCTT	2	10	45612	45621	0 %	40 %	40 %	20 %	331270911
61	NC_015417	TCTTT	2	10	45768	45777	0 %	80 %	0 %	20 %	331270911
62	NC_015417	AATAA	2	10	46340	46349	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015417	ATACA	2	10	46771	46780	60 %	20 %	0 %	20 %	331270912
64	NC_015417	TAAAA	2	10	47032	47041	80 %	20 %	0 %	0 %	331270912
65	NC_015417	ATAGT	2	10	47316	47325	40 %	40 %	20 %	0 %	331270912
66	NC_015417	GAGAT	2	10	47544	47553	40 %	20 %	40 %	0 %	331270913
67	NC_015417	AAAAT	2	10	49101	49110	80 %	20 %	0 %	0 %	331270915
68	NC_015417	AAAAG	2	10	49393	49402	80 %	0 %	20 %	0 %	331270916
69	NC_015417	TAAAT	2	10	50059	50068	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015417	AAATT	3	15	50392	50406	60 %	40 %	0 %	0 %	331270917
71	NC_015417	AATGG	2	10	50504	50513	40 %	20 %	40 %	0 %	331270918
72	NC_015417	ATTAT	2	10	51595	51604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015417	TTAGT	2	10	52153	52162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015417	AAACC	2	10	53094	53103	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_015417	TACGT	2	10	53168	53177	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015417	AACTA	2	10	54137	54146	60 %	20 %	0 %	20 %	331270924
77	NC_015417	AGAAA	2	10	54801	54810	80 %	0 %	20 %	0 %	331270924
78	NC_015417	TAAAT	2	10	55445	55454	60 %	40 %	0 %	0 %	331270925
79	NC_015417	TTTTC	2	10	55968	55977	0 %	80 %	0 %	20 %	331270925
80	NC_015417	AAATT	2	10	56553	56562	60 %	40 %	0 %	0 %	331270925
81	NC_015417	TAATT	2	10	57570	57579	40 %	60 %	0 %	0 %	331270927
82	NC_015417	ATATA	2	10	58872	58881	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015417	ATATT	2	10	58954	58963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015417	AACAA	2	10	59343	59352	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_015417	TAGAA	2	10	59895	59904	60 %	20 %	20 %	0 %	331270932
86	NC_015417	ATTAG	2	10	60955	60964	40 %	40 %	20 %	0 %	331270933
87	NC_015417	AAAGA	2	10	61317	61326	80 %	0 %	20 %	0 %	331270933
88	NC_015417	TAAAA	2	10	61392	61401	80 %	20 %	0 %	0 %	331270933
89	NC_015417	GAAAA	2	10	61728	61737	80 %	0 %	20 %	0 %	331270934
90	NC_015417	GCTTT	2	10	62123	62132	0 %	60 %	20 %	20 %	331270934
91	NC_015417	GTACT	2	10	64961	64970	20 %	40 %	20 %	20 %	331270936
92	NC_015417	AAAAG	2	10	65357	65366	80 %	0 %	20 %	0 %	331270937
93	NC_015417	CATGG	2	10	66184	66193	20 %	20 %	40 %	20 %	331270938
94	NC_015417	ATTAT	2	10	67444	67453	40 %	60 %	0 %	0 %	331270939
95	NC_015417	CATAT	2	10	68326	68335	40 %	40 %	0 %	20 %	331270939
96	NC_015417	ATGGA	2	10	69738	69747	40 %	20 %	40 %	0 %	331270939
97	NC_015417	AAATT	2	10	70238	70247	60 %	40 %	0 %	0 %	331270939
98	NC_015417	AGTAG	2	10	70433	70442	40 %	20 %	40 %	0 %	331270939
99	NC_015417	AAATA	2	10	70984	70993	80 %	20 %	0 %	0 %	331270940
100	NC_015417	GAATA	2	10	71047	71056	60 %	20 %	20 %	0 %	331270940
101	NC_015417	AAAGA	2	10	71268	71277	80 %	0 %	20 %	0 %	331270940
102	NC_015417	AATAT	2	10	71875	71884	60 %	40 %	0 %	0 %	331270940
103	NC_015417	GATGT	2	10	72106	72115	20 %	40 %	40 %	0 %	331270940
104	NC_015417	TATGA	2	10	72255	72264	40 %	40 %	20 %	0 %	331270940
105	NC_015417	ATATA	2	10	74186	74195	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015417	AAATA	2	10	77789	77798	80 %	20 %	0 %	0 %	331270947
107	NC_015417	AGAAA	2	10	78276	78285	80 %	0 %	20 %	0 %	331270947
108	NC_015417	ATTAA	2	10	78620	78629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015417	TAAAT	2	10	78632	78641	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015417	TATAT	2	10	80020	80029	40 %	60 %	0 %	0 %	331270949
111	NC_015417	AAGGT	2	10	81260	81269	40 %	20 %	40 %	0 %	331270950
112	NC_015417	AATTA	2	10	81344	81353	60 %	40 %	0 %	0 %	331270951
113	NC_015417	GAAAA	2	10	81356	81365	80 %	0 %	20 %	0 %	331270951
114	NC_015417	TACAA	2	10	81484	81493	60 %	20 %	0 %	20 %	331270951
115	NC_015417	ATTAA	2	10	82038	82047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015417	ATTAA	2	10	82797	82806	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015417	GATAT	2	10	83081	83090	40 %	40 %	20 %	0 %	331270954
118	NC_015417	TAAAT	2	10	83253	83262	60 %	40 %	0 %	0 %	331270954
119	NC_015417	ACTTT	2	10	83537	83546	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015417	TTTAT	2	10	83691	83700	20 %	80 %	0 %	0 %	331270955
121	NC_015417	TATAT	2	10	84257	84266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015417	ATTAT	2	10	84323	84332	40 %	60 %	0 %	0 %	331270956
123	NC_015417	TAATA	2	10	84732	84741	60 %	40 %	0 %	0 %	331270956
124	NC_015417	TAAAA	2	10	85674	85683	80 %	20 %	0 %	0 %	331270956
125	NC_015417	TACTA	2	10	86309	86318	40 %	40 %	0 %	20 %	331270957
126	NC_015417	ATTTT	2	10	86575	86584	20 %	80 %	0 %	0 %	331270957
127	NC_015417	TAAGA	2	10	87333	87342	60 %	20 %	20 %	0 %	331270958
128	NC_015417	TTTTA	2	10	87360	87369	20 %	80 %	0 %	0 %	331270958
129	NC_015417	TTTGA	2	10	87407	87416	20 %	60 %	20 %	0 %	331270958
130	NC_015417	AGAAC	2	10	88554	88563	60 %	0 %	20 %	20 %	331270959
131	NC_015417	TATAA	2	10	88923	88932	60 %	40 %	0 %	0 %	331270959
132	NC_015417	TTTGG	2	10	89578	89587	0 %	60 %	40 %	0 %	331270959
133	NC_015417	ATGCA	2	10	92112	92121	40 %	20 %	20 %	20 %	331270960
134	NC_015417	AATAC	2	10	93938	93947	60 %	20 %	0 %	20 %	331270960
135	NC_015417	ACAAA	2	10	94042	94051	80 %	0 %	0 %	20 %	331270960
136	NC_015417	ATATT	2	10	94720	94729	40 %	60 %	0 %	0 %	331270960
137	NC_015417	TGGTG	2	10	95636	95645	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015417	GTATA	2	10	96047	96056	40 %	40 %	20 %	0 %	331270961
139	NC_015417	TAAAA	2	10	96396	96405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015417	AGTTT	2	10	97450	97459	20 %	60 %	20 %	0 %	331270964
141	NC_015417	ATATA	2	10	97856	97865	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015417	TCAAT	2	10	98253	98262	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.