MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pecorum E58 chromosome

Total Repeats: 23585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015408	GTT	2	6	192413	192418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443923
4002	NC_015408	TCCA	2	8	192439	192446	25 %	25 %	0 %	50 %	330443923
4003	NC_015408	ATC	2	6	192520	192525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443923
4004	NC_015408	AAT	2	6	192606	192611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443923
4005	NC_015408	T	6	6	192636	192641	0 %	100 %	0 %	0 %	330443923
4006	NC_015408	AAG	2	6	192871	192876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443923
4007	NC_015408	GAG	2	6	193059	193064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330443923
4008	NC_015408	T	7	7	193069	193075	0 %	100 %	0 %	0 %	330443923
4009	NC_015408	TC	3	6	193113	193118	0 %	50 %	0 %	50 %	330443923
4010	NC_015408	AGA	2	6	193192	193197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443923
4011	NC_015408	TTC	2	6	193232	193237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443923
4012	NC_015408	CT	3	6	193315	193320	0 %	50 %	0 %	50 %	330443923
4013	NC_015408	TGT	2	6	193337	193342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443923
4014	NC_015408	TATTT	2	10	193375	193384	20 %	80 %	0 %	0 %	330443923
4015	NC_015408	TTC	2	6	193417	193422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443924
4016	NC_015408	AAC	2	6	193449	193454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443924
4017	NC_015408	CTG	2	6	193520	193525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443924
4018	NC_015408	GCT	2	6	193579	193584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443924
4019	NC_015408	TCC	2	6	193589	193594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443924
4020	NC_015408	GCT	2	6	193648	193653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443924
4021	NC_015408	TCGTC	2	10	193705	193714	0 %	40 %	20 %	40 %	330443924
4022	NC_015408	TAAG	2	8	193747	193754	50 %	25 %	25 %	0 %	330443924
4023	NC_015408	AAG	2	6	193804	193809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443924
4024	NC_015408	CCA	2	6	193819	193824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330443924
4025	NC_015408	GAA	2	6	193839	193844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443924
4026	NC_015408	AAT	2	6	193874	193879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443924
4027	NC_015408	TGCT	2	8	193898	193905	0 %	50 %	25 %	25 %	330443924
4028	NC_015408	AT	3	6	194009	194014	50 %	50 %	0 %	0 %	330443924
4029	NC_015408	TAG	2	6	194025	194030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443924
4030	NC_015408	ATC	2	6	194055	194060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443924
4031	NC_015408	AAT	2	6	194063	194068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443924
4032	NC_015408	TTG	3	9	194132	194140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443924
4033	NC_015408	TA	3	6	194173	194178	50 %	50 %	0 %	0 %	330443924
4034	NC_015408	CTG	2	6	194291	194296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443924
4035	NC_015408	GCA	2	6	194343	194348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443924
4036	NC_015408	AACT	2	8	194411	194418	50 %	25 %	0 %	25 %	330443924
4037	NC_015408	TAT	2	6	194449	194454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443924
4038	NC_015408	GTA	2	6	194484	194489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443924
4039	NC_015408	ATT	2	6	194504	194509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443924
4040	NC_015408	CGT	2	6	194545	194550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443924
4041	NC_015408	GCT	2	6	194589	194594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443924
4042	NC_015408	GCTT	2	8	194600	194607	0 %	50 %	25 %	25 %	330443924
4043	NC_015408	CTC	2	6	194624	194629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443924
4044	NC_015408	AGT	2	6	194699	194704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443924
4045	NC_015408	C	6	6	194832	194837	0 %	0 %	0 %	100 %	330443924
4046	NC_015408	TGC	2	6	194861	194866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443924
4047	NC_015408	CAT	2	6	194911	194916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443924
4048	NC_015408	AGC	2	6	194984	194989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443924
4049	NC_015408	GCA	2	6	195036	195041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443924
4050	NC_015408	ACC	2	6	195072	195077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330443924
4051	NC_015408	AGG	2	6	195113	195118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330443924
4052	NC_015408	AG	3	6	195175	195180	50 %	0 %	50 %	0 %	330443924
4053	NC_015408	CAG	2	6	195268	195273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443924
4054	NC_015408	C	6	6	195291	195296	0 %	0 %	0 %	100 %	330443924
4055	NC_015408	CTT	2	6	195385	195390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443924
4056	NC_015408	TTC	2	6	195494	195499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443924
4057	NC_015408	ACC	2	6	195626	195631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330443924
4058	NC_015408	GTA	2	6	195668	195673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443924
4059	NC_015408	CAT	2	6	195709	195714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_015408	T	6	6	195714	195719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015408	A	6	6	195731	195736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015408	A	7	7	195743	195749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015408	A	6	6	195752	195757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_015408	TGA	2	6	195758	195763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_015408	A	6	6	195780	195785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_015408	TTTTAT	2	12	195794	195805	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	330443925
4067	NC_015408	ATA	2	6	195927	195932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443925
4068	NC_015408	CTC	2	6	195934	195939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443925
4069	NC_015408	GAG	2	6	195948	195953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330443925
4070	NC_015408	GAA	2	6	195986	195991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443925
4071	NC_015408	TCC	2	6	196025	196030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443925
4072	NC_015408	GCA	2	6	196221	196226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443925
4073	NC_015408	CTA	2	6	196263	196268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443925
4074	NC_015408	GCT	2	6	196271	196276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443925
4075	NC_015408	ACG	2	6	196360	196365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443925
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4078	NC_015408	TGC	2	6	196471	196476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443925
4079	NC_015408	CCA	2	6	196552	196557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330443925
4080	NC_015408	CAG	2	6	196569	196574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443925
4081	NC_015408	A	7	7	196663	196669	100 %	0 %	0 %	0 %	330443925
4082	NC_015408	ATC	2	6	196729	196734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443925
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4087	NC_015408	TTC	2	6	196931	196936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443925
4088	NC_015408	TCC	2	6	196951	196956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443925
4089	NC_015408	ATC	2	6	196987	196992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443925
4090	NC_015408	AACA	2	8	197157	197164	75 %	0 %	0 %	25 %	330443925
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4092	NC_015408	ATT	2	6	197317	197322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443925
4093	NC_015408	AAAT	2	8	197355	197362	75 %	25 %	0 %	0 %	330443925
4094	NC_015408	GAA	2	6	197396	197401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443925
4095	NC_015408	A	6	6	197408	197413	100 %	0 %	0 %	0 %	330443925
4096	NC_015408	CA	4	8	197505	197512	50 %	0 %	0 %	50 %	330443925
4097	NC_015408	TTC	2	6	197566	197571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443925
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4102	NC_015408	CAG	2	6	197792	197797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443926
4103	NC_015408	AC	3	6	197833	197838	50 %	0 %	0 %	50 %	330443926
4104	NC_015408	TTG	2	6	197847	197852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443926
4105	NC_015408	TAATCT	2	12	197987	197998	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	330443926
4106	NC_015408	CAG	2	6	198002	198007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443926
4107	NC_015408	ATC	2	6	198019	198024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443926
4108	NC_015408	TACG	2	8	198031	198038	25 %	25 %	25 %	25 %	330443926
4109	NC_015408	TAAT	2	8	198046	198053	50 %	50 %	0 %	0 %	330443926
4110	NC_015408	TCA	2	6	198061	198066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443926
4111	NC_015408	TCA	2	6	198070	198075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443926
4112	NC_015408	CCT	2	6	198109	198114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443926
4113	NC_015408	AAT	2	6	198120	198125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443926
4114	NC_015408	TCC	2	6	198141	198146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443926
4115	NC_015408	GCA	2	6	198205	198210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443926
4116	NC_015408	TGCA	2	8	198249	198256	25 %	25 %	25 %	25 %	330443926
4117	NC_015408	TTAA	2	8	198358	198365	50 %	50 %	0 %	0 %	330443926
4118	NC_015408	GAG	2	6	198443	198448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330443926
4119	NC_015408	CAA	2	6	198515	198520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443926
4120	NC_015408	AGA	2	6	198605	198610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443926
4121	NC_015408	GC	3	6	198692	198697	0 %	0 %	50 %	50 %	330443926
4122	NC_015408	CAT	2	6	198704	198709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443927
4123	NC_015408	CTT	2	6	198729	198734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443927
4124	NC_015408	TCA	3	9	198758	198766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443927
4125	NC_015408	TGA	2	6	198771	198776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443927
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4127	NC_015408	TTC	2	6	198823	198828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443927
4128	NC_015408	GACC	2	8	198862	198869	25 %	0 %	25 %	50 %	330443927
4129	NC_015408	CAG	2	6	198915	198920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443927
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4134	NC_015408	ACA	2	6	199258	199263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443927
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4149	NC_015408	AATC	2	8	199651	199658	50 %	25 %	0 %	25 %	330443927
4150	NC_015408	ATC	2	6	199673	199678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443927
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4153	NC_015408	CAT	2	6	199809	199814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443927
4154	NC_015408	ATCA	2	8	199861	199868	50 %	25 %	0 %	25 %	330443927
4155	NC_015408	CA	3	6	199937	199942	50 %	0 %	0 %	50 %	330443927
4156	NC_015408	AAT	2	6	199990	199995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443927
4157	NC_015408	ATC	2	6	200023	200028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443927
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4164	NC_015408	GTA	2	6	200512	200517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443927
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4166	NC_015408	TCA	2	6	200561	200566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443927
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4186	NC_015408	A	6	6	201506	201511	100 %	0 %	0 %	0 %	330443927
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4189	NC_015408	CT	3	6	201803	201808	0 %	50 %	0 %	50 %	330443927
4190	NC_015408	TCT	3	9	201806	201814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443927
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4193	NC_015408	T	6	6	201850	201855	0 %	100 %	0 %	0 %	330443927
4194	NC_015408	CT	3	6	201895	201900	0 %	50 %	0 %	50 %	330443927
4195	NC_015408	ACC	2	6	201911	201916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330443927
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4197	NC_015408	AC	3	6	202084	202089	50 %	0 %	0 %	50 %	330443927
4198	NC_015408	TC	3	6	202092	202097	0 %	50 %	0 %	50 %	330443927
4199	NC_015408	AG	3	6	202105	202110	50 %	0 %	50 %	0 %	330443927
4200	NC_015408	ACC	2	6	202124	202129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330443927
4201	NC_015408	ATCA	2	8	202273	202280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4202	NC_015408	ACA	2	6	202318	202323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4203	NC_015408	T	6	6	202374	202379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4204	NC_015408	TCA	2	6	202444	202449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4205	NC_015408	A	6	6	202612	202617	100 %	0 %	0 %	0 %	330443928
4206	NC_015408	A	8	8	202621	202628	100 %	0 %	0 %	0 %	330443928
4207	NC_015408	TTCCA	2	10	202632	202641	20 %	40 %	0 %	40 %	330443928
4208	NC_015408	AAAGG	2	10	202651	202660	60 %	0 %	40 %	0 %	330443928
4209	NC_015408	TGA	2	6	202665	202670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443928
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4211	NC_015408	AC	3	6	202728	202733	50 %	0 %	0 %	50 %	330443928
4212	NC_015408	AAG	2	6	202808	202813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443928
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4214	NC_015408	CA	3	6	202908	202913	50 %	0 %	0 %	50 %	330443928
4215	NC_015408	AAG	2	6	202919	202924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443928
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4223	NC_015408	TGA	2	6	203103	203108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443928
4224	NC_015408	TCC	2	6	203179	203184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443928
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4227	NC_015408	CTT	2	6	203431	203436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443928
4228	NC_015408	GAG	2	6	203506	203511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330443928
4229	NC_015408	CAAA	2	8	203523	203530	75 %	0 %	0 %	25 %	330443928
4230	NC_015408	AAG	2	6	203540	203545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443928
4231	NC_015408	TAT	2	6	203576	203581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443928
4232	NC_015408	GAA	2	6	203629	203634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443928
4233	NC_015408	AG	3	6	203662	203667	50 %	0 %	50 %	0 %	330443928
4234	NC_015408	CTAT	2	8	203815	203822	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4235	NC_015408	TTA	2	6	203883	203888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4236	NC_015408	GGCA	2	8	203893	203900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4237	NC_015408	TAA	2	6	203901	203906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4238	NC_015408	ACTATA	2	12	203918	203929	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4239	NC_015408	GCTTA	2	10	203942	203951	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4240	NC_015408	TGA	2	6	203970	203975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_015408	A	6	6	204154	204159	100 %	0 %	0 %	0 %	330443929
4242	NC_015408	TCA	2	6	204173	204178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443929
4243	NC_015408	G	6	6	204187	204192	0 %	0 %	100 %	0 %	330443929
4244	NC_015408	CTT	2	6	204231	204236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443929
4245	NC_015408	TGTGA	2	10	204241	204250	20 %	40 %	40 %	0 %	330443929
4246	NC_015408	TACT	2	8	204252	204259	25 %	50 %	0 %	25 %	330443929
4247	NC_015408	AGC	2	6	204270	204275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443929
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4367	NC_015408	CAC	2	6	209268	209273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330443933
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4372	NC_015408	ATCCAT	2	12	209616	209627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443934
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4496	NC_015408	CAG	2	6	215666	215671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443937
4497	NC_015408	AGG	2	6	215702	215707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330443937
4498	NC_015408	CCCT	2	8	215786	215793	0 %	25 %	0 %	75 %	330443937
4499	NC_015408	TGC	2	6	215844	215849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443937
4500	NC_015408	A	6	6	215854	215859	100 %	0 %	0 %	0 %	330443937

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