MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pecorum E58 chromosome

Total Repeats: 23585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015408	GAT	3	9	166517	166525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443896
3502	NC_015408	CAA	2	6	166528	166533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443896
3503	NC_015408	TCA	2	6	166536	166541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443896
3504	NC_015408	TAT	2	6	166573	166578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443896
3505	NC_015408	TCCT	2	8	166579	166586	0 %	50 %	0 %	50 %	330443896
3506	NC_015408	GTTA	2	8	166663	166670	25 %	50 %	25 %	0 %	330443896
3507	NC_015408	CAA	2	6	166689	166694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443896
3508	NC_015408	AAAG	2	8	166704	166711	75 %	0 %	25 %	0 %	330443896
3509	NC_015408	AAG	2	6	166824	166829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443896
3510	NC_015408	TTTC	2	8	166851	166858	0 %	75 %	0 %	25 %	330443897
3511	NC_015408	AGCA	2	8	166936	166943	50 %	0 %	25 %	25 %	330443897
3512	NC_015408	GAA	2	6	166984	166989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443897
3513	NC_015408	CATTT	2	10	167156	167165	20 %	60 %	0 %	20 %	330443897
3514	NC_015408	CCTC	2	8	167193	167200	0 %	25 %	0 %	75 %	330443897
3515	NC_015408	T	6	6	167228	167233	0 %	100 %	0 %	0 %	330443897
3516	NC_015408	TGA	2	6	167241	167246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443897
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3519	NC_015408	GAT	2	6	167538	167543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443897
3520	NC_015408	TCT	2	6	167554	167559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443897
3521	NC_015408	TGT	2	6	167568	167573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443897
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3526	NC_015408	ACCT	2	8	167958	167965	25 %	25 %	0 %	50 %	330443898
3527	NC_015408	ATGG	2	8	168005	168012	25 %	25 %	50 %	0 %	330443898
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3530	NC_015408	TTA	2	6	168172	168177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443898
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3537	NC_015408	G	6	6	168635	168640	0 %	0 %	100 %	0 %	330443899
3538	NC_015408	GA	3	6	168663	168668	50 %	0 %	50 %	0 %	330443899
3539	NC_015408	TCT	2	6	168749	168754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_015408	CTA	2	6	168787	168792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443900
3541	NC_015408	ACG	2	6	168824	168829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443900
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3543	NC_015408	GCTAT	2	10	168864	168873	20 %	40 %	20 %	20 %	330443900
3544	NC_015408	CAA	2	6	168931	168936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443900
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3547	NC_015408	AT	3	6	169005	169010	50 %	50 %	0 %	0 %	330443900
3548	NC_015408	T	6	6	169018	169023	0 %	100 %	0 %	0 %	330443900
3549	NC_015408	GCAA	2	8	169028	169035	50 %	0 %	25 %	25 %	330443900
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3592	NC_015408	T	7	7	170940	170946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3594	NC_015408	TA	4	8	170967	170974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3597	NC_015408	AAT	2	6	171120	171125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_015408	ATA	2	6	171151	171156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3601	NC_015408	TTCT	2	8	171210	171217	0 %	75 %	0 %	25 %	330443902
3602	NC_015408	CTT	2	6	171228	171233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443902
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3612	NC_015408	ATTTGT	2	12	171927	171938	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	330443902
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3616	NC_015408	TATCT	2	10	172052	172061	20 %	60 %	0 %	20 %	330443902
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3619	NC_015408	TC	3	6	172183	172188	0 %	50 %	0 %	50 %	330443902
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3623	NC_015408	AAC	2	6	172541	172546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_015408	TGT	2	6	172767	172772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443903
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3996	NC_015408	GCA	2	6	192300	192305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443923
3997	NC_015408	CAT	2	6	192328	192333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443923
3998	NC_015408	CTG	2	6	192334	192339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443923
3999	NC_015408	TAA	2	6	192397	192402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443923
4000	NC_015408	TCC	2	6	192403	192408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443923

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