MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pecorum E58 chromosome

Total Repeats: 23585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_015408	CAAC	2	8	116117	116124	50 %	0 %	0 %	50 %	330443856
2503	NC_015408	GTT	2	6	116141	116146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443856
2504	NC_015408	CTC	2	6	116167	116172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443856
2505	NC_015408	T	6	6	116232	116237	0 %	100 %	0 %	0 %	330443856
2506	NC_015408	GC	3	6	116265	116270	0 %	0 %	50 %	50 %	330443856
2507	NC_015408	AGA	2	6	116303	116308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443856
2508	NC_015408	CGG	2	6	116312	116317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330443856
2509	NC_015408	TCC	2	6	116458	116463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443856
2510	NC_015408	CTC	2	6	116471	116476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443856
2511	NC_015408	TC	3	6	116499	116504	0 %	50 %	0 %	50 %	330443857
2512	NC_015408	CTA	2	6	116507	116512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443857
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2514	NC_015408	CAG	2	6	116636	116641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443857
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2516	NC_015408	AAT	2	6	116675	116680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443857
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2518	NC_015408	TCT	2	6	116731	116736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443857
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2522	NC_015408	GA	3	6	116824	116829	50 %	0 %	50 %	0 %	330443857
2523	NC_015408	A	6	6	116946	116951	100 %	0 %	0 %	0 %	330443857
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2531	NC_015408	ATC	2	6	117237	117242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443857
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2541	NC_015408	AGTA	2	8	117550	117557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_015408	ATTA	2	8	117567	117574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_015408	CAAG	2	8	117585	117592	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2546	NC_015408	AG	3	6	117658	117663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2550	NC_015408	TAT	2	6	118035	118040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443858
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2558	NC_015408	ACC	2	6	118312	118317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330443858
2559	NC_015408	GAA	2	6	118344	118349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443859
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2588	NC_015408	GAAG	2	8	119923	119930	50 %	0 %	50 %	0 %	330443860
2589	NC_015408	TATC	2	8	119979	119986	25 %	50 %	0 %	25 %	330443860
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2594	NC_015408	T	7	7	120233	120239	0 %	100 %	0 %	0 %	330443861
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2603	NC_015408	CAA	2	6	120756	120761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443862
2604	NC_015408	GAA	3	9	120773	120781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443862
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2606	NC_015408	CAA	2	6	120870	120875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443862
2607	NC_015408	GAT	2	6	120924	120929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443862
2608	NC_015408	AG	4	8	120945	120952	50 %	0 %	50 %	0 %	330443862
2609	NC_015408	A	11	11	120962	120972	100 %	0 %	0 %	0 %	330443862
2610	NC_015408	AC	3	6	120995	121000	50 %	0 %	0 %	50 %	330443862
2611	NC_015408	ACT	2	6	121060	121065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443862
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2614	NC_015408	CTG	2	6	121128	121133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443863
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2617	NC_015408	CTT	2	6	121254	121259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443863
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2619	NC_015408	A	7	7	121374	121380	100 %	0 %	0 %	0 %	330443863
2620	NC_015408	T	6	6	121427	121432	0 %	100 %	0 %	0 %	330443863
2621	NC_015408	AGA	2	6	121494	121499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443863
2622	NC_015408	CT	3	6	121585	121590	0 %	50 %	0 %	50 %	330443863
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2624	NC_015408	CTT	2	6	121625	121630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443863
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2998	NC_015408	TG	3	6	141838	141843	0 %	50 %	50 %	0 %	330443883
2999	NC_015408	TTTC	2	8	141927	141934	0 %	75 %	0 %	25 %	330443883
3000	NC_015408	CAT	2	6	142011	142016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443883

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