MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pecorum E58 chromosome

Total Repeats: 23585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015408	GCA	2	6	215934	215939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443937
4502	NC_015408	CCA	2	6	215997	216002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330443937
4503	NC_015408	CTC	2	6	216052	216057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443937
4504	NC_015408	TC	3	6	216120	216125	0 %	50 %	0 %	50 %	330443937
4505	NC_015408	GA	3	6	216153	216158	50 %	0 %	50 %	0 %	330443937
4506	NC_015408	AAAT	2	8	216184	216191	75 %	25 %	0 %	0 %	330443937
4507	NC_015408	TC	3	6	216204	216209	0 %	50 %	0 %	50 %	330443938
4508	NC_015408	GGT	2	6	216254	216259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330443938
4509	NC_015408	CGC	2	6	216332	216337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330443938
4510	NC_015408	AC	3	6	216389	216394	50 %	0 %	0 %	50 %	330443938
4511	NC_015408	TA	3	6	216440	216445	50 %	50 %	0 %	0 %	330443938
4512	NC_015408	TCA	2	6	216447	216452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443938
4513	NC_015408	AG	3	6	216496	216501	50 %	0 %	50 %	0 %	330443938
4514	NC_015408	CTT	2	6	216508	216513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443938
4515	NC_015408	GGA	2	6	216533	216538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330443938
4516	NC_015408	CAT	2	6	216561	216566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443938
4517	NC_015408	AAAAG	2	10	216635	216644	80 %	0 %	20 %	0 %	330443938
4518	NC_015408	AGC	2	6	216651	216656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443938
4519	NC_015408	T	6	6	216676	216681	0 %	100 %	0 %	0 %	330443938
4520	NC_015408	AC	3	6	216795	216800	50 %	0 %	0 %	50 %	330443938
4521	NC_015408	GAA	2	6	216801	216806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443938
4522	NC_015408	CT	3	6	216823	216828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4523	NC_015408	TTTG	2	8	216867	216874	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_015408	AG	4	8	216882	216889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_015408	T	6	6	216891	216896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_015408	ATC	3	9	216914	216922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_015408	CCTT	2	8	216985	216992	0 %	50 %	0 %	50 %	330443939
4528	NC_015408	T	6	6	217024	217029	0 %	100 %	0 %	0 %	330443939
4529	NC_015408	GAT	2	6	217104	217109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443939
4530	NC_015408	TG	3	6	217119	217124	0 %	50 %	50 %	0 %	330443939
4531	NC_015408	CTT	2	6	217132	217137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443939
4532	NC_015408	CTT	2	6	217141	217146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443939
4533	NC_015408	CTT	2	6	217179	217184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443939
4534	NC_015408	CTC	2	6	217185	217190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443939
4535	NC_015408	TCT	2	6	217470	217475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443939
4536	NC_015408	AGGC	2	8	217516	217523	25 %	0 %	50 %	25 %	330443939
4537	NC_015408	GCA	2	6	217570	217575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443939
4538	NC_015408	T	8	8	217576	217583	0 %	100 %	0 %	0 %	330443939
4539	NC_015408	GAA	2	6	217624	217629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443939
4540	NC_015408	TGC	2	6	217722	217727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443939
4541	NC_015408	TGC	2	6	217767	217772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443939
4542	NC_015408	ATT	2	6	217785	217790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443939
4543	NC_015408	GTAA	2	8	217798	217805	50 %	25 %	25 %	0 %	330443939
4544	NC_015408	TTG	2	6	217916	217921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443939
4545	NC_015408	GC	3	6	217933	217938	0 %	0 %	50 %	50 %	330443939
4546	NC_015408	AAG	2	6	217951	217956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443939
4547	NC_015408	CT	5	10	218150	218159	0 %	50 %	0 %	50 %	330443939
4548	NC_015408	T	6	6	218261	218266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_015408	AAGT	2	8	218288	218295	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_015408	AATG	2	8	218302	218309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_015408	TGC	2	6	218454	218459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443940
4552	NC_015408	TTCA	2	8	218482	218489	25 %	50 %	0 %	25 %	330443940
4553	NC_015408	ACT	2	6	218519	218524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443940
4554	NC_015408	TGC	2	6	218544	218549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443940
4555	NC_015408	TCT	2	6	218580	218585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443940
4556	NC_015408	CGC	2	6	218591	218596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330443940
4557	NC_015408	T	6	6	218600	218605	0 %	100 %	0 %	0 %	330443940
4558	NC_015408	TCAT	2	8	218654	218661	25 %	50 %	0 %	25 %	330443940
4559	NC_015408	ATCGC	2	10	218717	218726	20 %	20 %	20 %	40 %	330443940
4560	NC_015408	TTTTC	2	10	218803	218812	0 %	80 %	0 %	20 %	330443940
4561	NC_015408	GA	3	6	218837	218842	50 %	0 %	50 %	0 %	330443940
4562	NC_015408	TC	3	6	218888	218893	0 %	50 %	0 %	50 %	330443940
4563	NC_015408	TAC	2	6	218895	218900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443940
4564	NC_015408	TC	3	6	218928	218933	0 %	50 %	0 %	50 %	330443940
4565	NC_015408	GAA	2	6	219047	219052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443940
4566	NC_015408	CTAT	2	8	219089	219096	25 %	50 %	0 %	25 %	330443940
4567	NC_015408	CTT	2	6	219097	219102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443940
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4570	NC_015408	CTTC	2	8	219189	219196	0 %	50 %	0 %	50 %	330443940
4571	NC_015408	CTT	2	6	219259	219264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443940
4572	NC_015408	ATCAG	2	10	219348	219357	40 %	20 %	20 %	20 %	330443940
4573	NC_015408	GAA	2	6	219361	219366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443940
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4576	NC_015408	CTTA	2	8	219442	219449	25 %	50 %	0 %	25 %	330443940
4577	NC_015408	CTT	2	6	219472	219477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443940
4578	NC_015408	ATG	2	6	219485	219490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443940
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4580	NC_015408	TTG	2	6	219599	219604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443940
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4582	NC_015408	T	6	6	219666	219671	0 %	100 %	0 %	0 %	330443940
4583	NC_015408	TCA	2	6	219688	219693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443940
4584	NC_015408	CT	3	6	219698	219703	0 %	50 %	0 %	50 %	330443940
4585	NC_015408	TCT	2	6	219741	219746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443940
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4588	NC_015408	CCTA	2	8	219858	219865	25 %	25 %	0 %	50 %	330443940
4589	NC_015408	T	6	6	219907	219912	0 %	100 %	0 %	0 %	330443940
4590	NC_015408	A	6	6	219920	219925	100 %	0 %	0 %	0 %	330443940
4591	NC_015408	AC	3	6	219946	219951	50 %	0 %	0 %	50 %	330443940
4592	NC_015408	A	6	6	220080	220085	100 %	0 %	0 %	0 %	330443940
4593	NC_015408	A	6	6	220087	220092	100 %	0 %	0 %	0 %	330443940
4594	NC_015408	TA	3	6	220100	220105	50 %	50 %	0 %	0 %	330443940
4595	NC_015408	ACA	2	6	220128	220133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443940
4596	NC_015408	ACA	2	6	220152	220157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443940
4597	NC_015408	TTC	2	6	220291	220296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443940
4598	NC_015408	GCA	2	6	220309	220314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443940
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4600	NC_015408	ATC	2	6	220352	220357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443940
4601	NC_015408	TA	3	6	220403	220408	50 %	50 %	0 %	0 %	330443940
4602	NC_015408	CTT	2	6	220426	220431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443940
4603	NC_015408	TGA	2	6	220434	220439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443940
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4605	NC_015408	GTC	2	6	220483	220488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443940
4606	NC_015408	TCC	2	6	220495	220500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443940
4607	NC_015408	GTA	2	6	220528	220533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443940
4608	NC_015408	TAA	2	6	220617	220622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443940
4609	NC_015408	TCC	2	6	220635	220640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443940
4610	NC_015408	CCT	2	6	220658	220663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443940
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4612	NC_015408	TGA	2	6	220725	220730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443940
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4619	NC_015408	AAG	2	6	220992	220997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443940
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4621	NC_015408	CT	3	6	221059	221064	0 %	50 %	0 %	50 %	330443940
4622	NC_015408	ACA	2	6	221097	221102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443940
4623	NC_015408	A	6	6	221105	221110	100 %	0 %	0 %	0 %	330443940
4624	NC_015408	GAA	2	6	221134	221139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443940
4625	NC_015408	ACC	2	6	221174	221179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330443940
4626	NC_015408	ATC	2	6	221195	221200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443940
4627	NC_015408	GAA	2	6	221224	221229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443940
4628	NC_015408	ACCATC	2	12	221231	221242	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	330443940
4629	NC_015408	GTC	2	6	221305	221310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443940
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4631	NC_015408	AT	3	6	221322	221327	50 %	50 %	0 %	0 %	330443940
4632	NC_015408	GAA	2	6	221359	221364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443940
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4644	NC_015408	CTT	2	6	222274	222279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4645	NC_015408	AAC	2	6	222305	222310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4646	NC_015408	A	6	6	222366	222371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4647	NC_015408	ATG	2	6	222424	222429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4649	NC_015408	GTT	2	6	222525	222530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443942
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4655	NC_015408	GATT	2	8	222734	222741	25 %	50 %	25 %	0 %	330443942
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4724	NC_015408	AAG	2	6	226674	226679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443945
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4726	NC_015408	GCG	2	6	226887	226892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4734	NC_015408	A	6	6	227235	227240	100 %	0 %	0 %	0 %	330443946
4735	NC_015408	CTAT	2	8	227333	227340	25 %	50 %	0 %	25 %	330443946
4736	NC_015408	TTG	2	6	227363	227368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443946
4737	NC_015408	A	7	7	227389	227395	100 %	0 %	0 %	0 %	330443946
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4751	NC_015408	TTCT	2	8	228050	228057	0 %	75 %	0 %	25 %	330443947
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4754	NC_015408	ATTT	2	8	228137	228144	25 %	75 %	0 %	0 %	330443947
4755	NC_015408	TTG	2	6	228170	228175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443947
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4762	NC_015408	CTT	2	6	228481	228486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443947
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4765	NC_015408	ATC	2	6	228648	228653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4788	NC_015408	TGG	2	6	229622	229627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330443948
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4873	NC_015408	ATGCC	2	10	233230	233239	20 %	20 %	20 %	40 %	330443955
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4875	NC_015408	ACTC	2	8	233296	233303	25 %	25 %	0 %	50 %	330443955
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4877	NC_015408	T	6	6	233451	233456	0 %	100 %	0 %	0 %	330443955
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4883	NC_015408	AAGCT	2	10	233677	233686	40 %	20 %	20 %	20 %	330443955
4884	NC_015408	GCA	2	6	233710	233715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443955
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4890	NC_015408	T	9	9	233869	233877	0 %	100 %	0 %	0 %	330443955
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4987	NC_015408	A	8	8	239001	239008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5000	NC_015408	CTT	2	6	239657	239662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443959

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