MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Pelagibacter sp. IMCC9063 chromosome

Total Repeats: 1243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015380	ACCTT	2	10	2105	2114	20 %	40 %	0 %	40 %	330812978
2	NC_015380	TCATT	2	10	2151	2160	20 %	60 %	0 %	20 %	330812978
3	NC_015380	TGCAT	2	10	3041	3050	20 %	40 %	20 %	20 %	330812978
4	NC_015380	GGAAT	2	10	3569	3578	40 %	20 %	40 %	0 %	330812978
5	NC_015380	ATTTT	2	10	4062	4071	20 %	80 %	0 %	0 %	330812979
6	NC_015380	TAAAG	2	10	4507	4516	60 %	20 %	20 %	0 %	330812979
7	NC_015380	TTGCT	2	10	5786	5795	0 %	60 %	20 %	20 %	330812980
8	NC_015380	GGAAA	2	10	6086	6095	60 %	0 %	40 %	0 %	330812980
9	NC_015380	ATTGC	2	10	6602	6611	20 %	40 %	20 %	20 %	330812982
10	NC_015380	ACCAC	2	10	7428	7437	40 %	0 %	0 %	60 %	330812983
11	NC_015380	TAAAA	2	10	8543	8552	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015380	CCCTT	2	10	8780	8789	0 %	40 %	0 %	60 %	330812984
13	NC_015380	ATTTT	2	10	9199	9208	20 %	80 %	0 %	0 %	330812984
14	NC_015380	AAGTT	2	10	9711	9720	40 %	40 %	20 %	0 %	330812985
15	NC_015380	CATCC	2	10	11458	11467	20 %	20 %	0 %	60 %	330812986
16	NC_015380	AACTT	2	10	11818	11827	40 %	40 %	0 %	20 %	330812986
17	NC_015380	CAAAT	2	10	12348	12357	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015380	TTTTG	2	10	13154	13163	0 %	80 %	20 %	0 %	330812987
19	NC_015380	ACTGT	2	10	13496	13505	20 %	40 %	20 %	20 %	330812988
20	NC_015380	GATCT	2	10	14337	14346	20 %	40 %	20 %	20 %	330812988
21	NC_015380	GGTTT	2	10	14868	14877	0 %	60 %	40 %	0 %	330812989
22	NC_015380	TAAAA	2	10	15022	15031	80 %	20 %	0 %	0 %	330812990
23	NC_015380	TCTTT	2	10	16123	16132	0 %	80 %	0 %	20 %	330812992
24	NC_015380	AATTT	2	10	17330	17339	40 %	60 %	0 %	0 %	330812994
25	NC_015380	AGATT	2	10	17623	17632	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015380	AATAA	2	10	18581	18590	80 %	20 %	0 %	0 %	330812997
27	NC_015380	ACAAG	2	10	20087	20096	60 %	0 %	20 %	20 %	330812998
28	NC_015380	TAATT	2	10	21656	21665	40 %	60 %	0 %	0 %	330812999
29	NC_015380	ATAAA	2	10	21976	21985	80 %	20 %	0 %	0 %	330812999
30	NC_015380	GCTTT	2	10	22058	22067	0 %	60 %	20 %	20 %	330812999
31	NC_015380	GTAAC	2	10	25361	25370	40 %	20 %	20 %	20 %	330813002
32	NC_015380	CTCTT	2	10	25587	25596	0 %	60 %	0 %	40 %	330813003
33	NC_015380	TTAAT	2	10	26231	26240	40 %	60 %	0 %	0 %	330813004
34	NC_015380	ATTCT	2	10	30167	30176	20 %	60 %	0 %	20 %	330813007
35	NC_015380	AAATA	2	10	31814	31823	80 %	20 %	0 %	0 %	330813010
36	NC_015380	TAAAG	2	10	32019	32028	60 %	20 %	20 %	0 %	330813010
37	NC_015380	ATAAA	2	10	33423	33432	80 %	20 %	0 %	0 %	330813011
38	NC_015380	AGGAA	2	10	33983	33992	60 %	0 %	40 %	0 %	330813011
39	NC_015380	CAACT	2	10	34073	34082	40 %	20 %	0 %	40 %	330813011
40	NC_015380	TACAT	2	10	35760	35769	40 %	40 %	0 %	20 %	330813014
41	NC_015380	ATTTT	2	10	35811	35820	20 %	80 %	0 %	0 %	330813014
42	NC_015380	TAAAA	2	10	35904	35913	80 %	20 %	0 %	0 %	330813015
43	NC_015380	TATAA	2	10	36217	36226	60 %	40 %	0 %	0 %	330813015
44	NC_015380	AAAAT	2	10	36992	37001	80 %	20 %	0 %	0 %	330813016
45	NC_015380	ATTTC	2	10	39089	39098	20 %	60 %	0 %	20 %	330813020
46	NC_015380	TGGAT	2	10	39965	39974	20 %	40 %	40 %	0 %	330813021
47	NC_015380	TATTT	2	10	40549	40558	20 %	80 %	0 %	0 %	330813021
48	NC_015380	AATGA	2	10	40975	40984	60 %	20 %	20 %	0 %	330813023
49	NC_015380	TCCAA	2	10	41668	41677	40 %	20 %	0 %	40 %	330813024
50	NC_015380	TTCTT	2	10	42559	42568	0 %	80 %	0 %	20 %	330813026
51	NC_015380	AGAAA	2	10	42575	42584	80 %	0 %	20 %	0 %	330813026
52	NC_015380	TTAAA	2	10	42608	42617	60 %	40 %	0 %	0 %	330813026
53	NC_015380	AAAAT	2	10	44116	44125	80 %	20 %	0 %	0 %	330813028
54	NC_015380	ATTTT	2	10	44440	44449	20 %	80 %	0 %	0 %	330813029
55	NC_015380	AGAAA	2	10	45357	45366	80 %	0 %	20 %	0 %	330813031
56	NC_015380	AATTT	2	10	46262	46271	40 %	60 %	0 %	0 %	330813032
57	NC_015380	TTCAT	2	10	46391	46400	20 %	60 %	0 %	20 %	330813032
58	NC_015380	ACTTA	2	10	46789	46798	40 %	40 %	0 %	20 %	330813032
59	NC_015380	ATATA	2	10	47116	47125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015380	AAATT	2	10	47720	47729	60 %	40 %	0 %	0 %	330813035
61	NC_015380	TTCTT	2	10	48897	48906	0 %	80 %	0 %	20 %	330813036
62	NC_015380	TGGGA	2	10	49888	49897	20 %	20 %	60 %	0 %	330813037
63	NC_015380	AAAAT	2	10	50727	50736	80 %	20 %	0 %	0 %	330813038
64	NC_015380	ATTTT	2	10	51509	51518	20 %	80 %	0 %	0 %	330813038
65	NC_015380	ATTTT	2	10	52005	52014	20 %	80 %	0 %	0 %	330813040
66	NC_015380	CTTTT	2	10	52306	52315	0 %	80 %	0 %	20 %	330813040
67	NC_015380	GTTTT	2	10	53055	53064	0 %	80 %	20 %	0 %	330813042
68	NC_015380	ATATT	2	10	54733	54742	40 %	60 %	0 %	0 %	330813044
69	NC_015380	AAATA	2	10	55722	55731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015380	AAAAT	2	10	56564	56573	80 %	20 %	0 %	0 %	330813045
71	NC_015380	CTTTG	2	10	56692	56701	0 %	60 %	20 %	20 %	330813045
72	NC_015380	TTTGT	2	10	56973	56982	0 %	80 %	20 %	0 %	330813046
73	NC_015380	GATTT	2	10	57153	57162	20 %	60 %	20 %	0 %	330813046
74	NC_015380	ATTAC	2	10	57300	57309	40 %	40 %	0 %	20 %	330813046
75	NC_015380	TTGTT	2	10	57843	57852	0 %	80 %	20 %	0 %	330813047
76	NC_015380	TTTGT	2	10	58133	58142	0 %	80 %	20 %	0 %	330813047
77	NC_015380	AGAAT	2	10	58284	58293	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015380	ATTGA	2	10	58453	58462	40 %	40 %	20 %	0 %	330813048
79	NC_015380	CAATC	2	10	62270	62279	40 %	20 %	0 %	40 %	330813053
80	NC_015380	ATTTA	2	10	63363	63372	40 %	60 %	0 %	0 %	330813056
81	NC_015380	ATTAC	2	10	63730	63739	40 %	40 %	0 %	20 %	330813056
82	NC_015380	TTAAT	2	10	65766	65775	40 %	60 %	0 %	0 %	330813060
83	NC_015380	GAATA	2	10	66453	66462	60 %	20 %	20 %	0 %	330813060
84	NC_015380	TTTTA	2	10	67364	67373	20 %	80 %	0 %	0 %	330813062
85	NC_015380	TTTTA	2	10	67583	67592	20 %	80 %	0 %	0 %	330813062
86	NC_015380	GTTAA	2	10	68109	68118	40 %	40 %	20 %	0 %	330813063
87	NC_015380	CTCTT	2	10	68896	68905	0 %	60 %	0 %	40 %	330813064
88	NC_015380	ATATT	2	10	69385	69394	40 %	60 %	0 %	0 %	330813066
89	NC_015380	ATTTA	2	10	70531	70540	40 %	60 %	0 %	0 %	330813067
90	NC_015380	GTTTT	2	10	71654	71663	0 %	80 %	20 %	0 %	330813068
91	NC_015380	AAGAA	2	10	71857	71866	80 %	0 %	20 %	0 %	330813068
92	NC_015380	ATAAA	2	10	72130	72139	80 %	20 %	0 %	0 %	330813068
93	NC_015380	ATTTT	2	10	72380	72389	20 %	80 %	0 %	0 %	330813069
94	NC_015380	TAAAA	2	10	72453	72462	80 %	20 %	0 %	0 %	330813069
95	NC_015380	CATTC	2	10	73513	73522	20 %	40 %	0 %	40 %	330813070
96	NC_015380	CTTTT	2	10	73608	73617	0 %	80 %	0 %	20 %	330813070
97	NC_015380	ATATA	2	10	73895	73904	60 %	40 %	0 %	0 %	330813070
98	NC_015380	ATTTG	2	10	75186	75195	20 %	60 %	20 %	0 %	330813071
99	NC_015380	TTGGC	2	10	75757	75766	0 %	40 %	40 %	20 %	330813072
100	NC_015380	ATCTG	2	10	75812	75821	20 %	40 %	20 %	20 %	330813072
101	NC_015380	ATTTT	2	10	76939	76948	20 %	80 %	0 %	0 %	330813073
102	NC_015380	AATTG	2	10	77478	77487	40 %	40 %	20 %	0 %	330813074
103	NC_015380	GTCCA	2	10	78725	78734	20 %	20 %	20 %	40 %	330813076
104	NC_015380	TTTGA	2	10	79221	79230	20 %	60 %	20 %	0 %	330813077
105	NC_015380	ATAGT	2	10	79727	79736	40 %	40 %	20 %	0 %	330813078
106	NC_015380	AATGA	2	10	79901	79910	60 %	20 %	20 %	0 %	330813078
107	NC_015380	GAAAA	2	10	81823	81832	80 %	0 %	20 %	0 %	330813079
108	NC_015380	ATTAT	2	10	83355	83364	40 %	60 %	0 %	0 %	330813081
109	NC_015380	CTTAG	2	10	83680	83689	20 %	40 %	20 %	20 %	330813082
110	NC_015380	CTTAA	2	10	83860	83869	40 %	40 %	0 %	20 %	330813082
111	NC_015380	AATAG	2	10	85121	85130	60 %	20 %	20 %	0 %	330813083
112	NC_015380	TTATT	2	10	86681	86690	20 %	80 %	0 %	0 %	330813087
113	NC_015380	AAATT	2	10	87292	87301	60 %	40 %	0 %	0 %	330813087
114	NC_015380	AAGCC	2	10	89388	89397	40 %	0 %	20 %	40 %	330813090
115	NC_015380	ATTTT	3	15	89824	89838	20 %	80 %	0 %	0 %	330813091
116	NC_015380	CAATT	2	10	90329	90338	40 %	40 %	0 %	20 %	330813091
117	NC_015380	AATTA	2	10	90768	90777	60 %	40 %	0 %	0 %	330813092
118	NC_015380	TTTTA	2	10	91362	91371	20 %	80 %	0 %	0 %	330813092
119	NC_015380	ACAAA	2	10	91516	91525	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015380	TTTTC	2	10	91736	91745	0 %	80 %	0 %	20 %	330813093
121	NC_015380	TACAA	2	10	92726	92735	60 %	20 %	0 %	20 %	330813094
122	NC_015380	ATTTT	2	10	93117	93126	20 %	80 %	0 %	0 %	330813094
123	NC_015380	ATTGT	2	10	94292	94301	20 %	60 %	20 %	0 %	330813096
124	NC_015380	ATTAA	2	10	95787	95796	60 %	40 %	0 %	0 %	330813097
125	NC_015380	AATGG	2	10	95976	95985	40 %	20 %	40 %	0 %	330813097
126	NC_015380	CAAAG	2	10	96084	96093	60 %	0 %	20 %	20 %	330813097
127	NC_015380	GATAT	2	10	97055	97064	40 %	40 %	20 %	0 %	330813098
128	NC_015380	GATAA	2	10	97103	97112	60 %	20 %	20 %	0 %	330813098
129	NC_015380	AAAAC	2	10	97238	97247	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015380	AGAAA	2	10	97756	97765	80 %	0 %	20 %	0 %	330813099
131	NC_015380	TGATA	2	10	98406	98415	40 %	40 %	20 %	0 %	330813099
132	NC_015380	TAAAT	2	10	98657	98666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015380	TTGAG	2	10	98758	98767	20 %	40 %	40 %	0 %	330813100
134	NC_015380	AAGGG	2	10	100399	100408	40 %	0 %	60 %	0 %	330813102
135	NC_015380	CTTAC	2	10	103534	103543	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_015380	TTCAA	2	10	104398	104407	40 %	40 %	0 %	20 %	330813110
137	NC_015380	ACAAA	2	10	104656	104665	80 %	0 %	0 %	20 %	330813111
138	NC_015380	ACATT	2	10	109352	109361	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015380	CACGA	2	10	109946	109955	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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