MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 4090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015275	ATTCA	2	10	667	676	40 %	40 %	0 %	20 %	326789140
2	NC_015275	GTAAA	2	10	6920	6929	60 %	20 %	20 %	0 %	326789145
3	NC_015275	CTTAA	2	10	7237	7246	40 %	40 %	0 %	20 %	326789145
4	NC_015275	ATTAT	2	10	7865	7874	40 %	60 %	0 %	0 %	326789145
5	NC_015275	TTATT	2	10	9764	9773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015275	TCGTG	2	10	11502	11511	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015275	TATTT	2	10	12007	12016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015275	GGGAG	2	10	13032	13041	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015275	CCGTA	2	10	14142	14151	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_015275	AAGAT	2	10	15291	15300	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015275	TTTAT	2	10	16509	16518	20 %	80 %	0 %	0 %	326789147
12	NC_015275	ATTTA	2	10	18583	18592	40 %	60 %	0 %	0 %	326789149
13	NC_015275	ATATA	2	10	18649	18658	60 %	40 %	0 %	0 %	326789149
14	NC_015275	AATGC	2	10	20879	20888	40 %	20 %	20 %	20 %	326789152
15	NC_015275	TAAAG	2	10	21720	21729	60 %	20 %	20 %	0 %	326789153
16	NC_015275	AAAGA	2	10	21754	21763	80 %	0 %	20 %	0 %	326789153
17	NC_015275	TATTT	2	10	21830	21839	20 %	80 %	0 %	0 %	326789153
18	NC_015275	GTTAA	2	10	22622	22631	40 %	40 %	20 %	0 %	326789154
19	NC_015275	AATAT	2	10	22914	22923	60 %	40 %	0 %	0 %	326789154
20	NC_015275	GCAAG	2	10	22957	22966	40 %	0 %	40 %	20 %	326789154
21	NC_015275	TAGAA	2	10	23474	23483	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015275	ATAAA	2	10	23533	23542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015275	AATAT	2	10	25222	25231	60 %	40 %	0 %	0 %	326789156
24	NC_015275	AAGAA	2	10	26040	26049	80 %	0 %	20 %	0 %	326789157
25	NC_015275	ATCTA	2	10	26306	26315	40 %	40 %	0 %	20 %	326789157
26	NC_015275	TTTAA	2	10	27061	27070	40 %	60 %	0 %	0 %	326789158
27	NC_015275	TCTTT	2	10	27782	27791	0 %	80 %	0 %	20 %	326789159
28	NC_015275	TTACC	2	10	31988	31997	20 %	40 %	0 %	40 %	326789164
29	NC_015275	TAAAA	2	10	32486	32495	80 %	20 %	0 %	0 %	326789164
30	NC_015275	AAATC	2	10	34466	34475	60 %	20 %	0 %	20 %	326789166
31	NC_015275	AGATT	2	10	34995	35004	40 %	40 %	20 %	0 %	326789166
32	NC_015275	TGCGT	2	10	35313	35322	0 %	40 %	40 %	20 %	326789167
33	NC_015275	TATAA	2	10	37177	37186	60 %	40 %	0 %	0 %	326789168
34	NC_015275	GATAC	2	10	37974	37983	40 %	20 %	20 %	20 %	326789169
35	NC_015275	ATTAA	2	10	38313	38322	60 %	40 %	0 %	0 %	326789169
36	NC_015275	ATTAA	2	10	40106	40115	60 %	40 %	0 %	0 %	326789170
37	NC_015275	GAGAA	2	10	41531	41540	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015275	AGGTA	2	10	41732	41741	40 %	20 %	40 %	0 %	326789172
39	NC_015275	TTAGA	2	10	42298	42307	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015275	TGAAT	2	10	42443	42452	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015275	AAAGA	2	10	43478	43487	80 %	0 %	20 %	0 %	326789174
42	NC_015275	CTTTA	2	10	44794	44803	20 %	60 %	0 %	20 %	326789176
43	NC_015275	AATGG	2	10	45578	45587	40 %	20 %	40 %	0 %	326789176
44	NC_015275	TCGTG	2	10	47287	47296	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015275	TGTTT	2	10	47793	47802	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015275	TATTT	2	10	47868	47877	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015275	AGTTT	2	10	48195	48204	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015275	GATAA	2	10	49623	49632	60 %	20 %	20 %	0 %	326789177
49	NC_015275	GAAGA	2	10	50089	50098	60 %	0 %	40 %	0 %	326789177
50	NC_015275	AAATG	2	10	50347	50356	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015275	TGGGG	2	10	51683	51692	0 %	20 %	80 %	0 %	326789179
52	NC_015275	AAATT	2	10	52117	52126	60 %	40 %	0 %	0 %	326789179
53	NC_015275	TTGTT	2	10	52325	52334	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015275	ACAAT	2	10	52339	52348	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015275	AGGTA	2	10	52784	52793	40 %	20 %	40 %	0 %	326789180
56	NC_015275	TGGTT	2	10	53010	53019	0 %	60 %	40 %	0 %	326789180
57	NC_015275	GATTT	2	10	53779	53788	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015275	TGGAC	2	10	54112	54121	20 %	20 %	40 %	20 %	326789181
59	NC_015275	ATACT	2	10	54280	54289	40 %	40 %	0 %	20 %	326789181
60	NC_015275	GATAC	2	10	55851	55860	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015275	TAAAA	2	10	56358	56367	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015275	TACAA	2	10	56514	56523	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015275	TTACC	2	10	57417	57426	20 %	40 %	0 %	40 %	326789182
64	NC_015275	GAGAA	2	10	57527	57536	60 %	0 %	40 %	0 %	326789182
65	NC_015275	TTATA	2	10	57869	57878	40 %	60 %	0 %	0 %	326789182
66	NC_015275	TTTGC	2	10	59880	59889	0 %	60 %	20 %	20 %	326789184
67	NC_015275	TTTAT	2	10	60750	60759	20 %	80 %	0 %	0 %	326789185
68	NC_015275	CCTTT	2	10	60833	60842	0 %	60 %	0 %	40 %	326789185
69	NC_015275	GAAAG	2	10	61287	61296	60 %	0 %	40 %	0 %	326789186
70	NC_015275	GTTTT	2	10	61439	61448	0 %	80 %	20 %	0 %	326789186
71	NC_015275	ATAAA	2	10	63756	63765	80 %	20 %	0 %	0 %	326789187
72	NC_015275	ATGCA	2	10	65121	65130	40 %	20 %	20 %	20 %	326789189
73	NC_015275	ATATC	2	10	68605	68614	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015275	GGGAG	2	10	69574	69583	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015275	CCGTA	2	10	70685	70694	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_015275	AAGAT	2	10	71841	71850	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015275	GAAAA	2	10	74440	74449	80 %	0 %	20 %	0 %	326789193
78	NC_015275	TCGTG	2	10	77891	77900	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015275	TTTTG	2	10	78399	78408	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015275	GGGAG	2	10	79446	79455	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015275	CCGTA	2	10	80556	80565	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_015275	AAGAT	2	10	81706	81715	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015275	ATCAT	2	10	82030	82039	40 %	40 %	0 %	20 %	326789194
84	NC_015275	CTTTT	2	10	82142	82151	0 %	80 %	0 %	20 %	326789194
85	NC_015275	TGATT	2	10	82340	82349	20 %	60 %	20 %	0 %	326789194
86	NC_015275	GAAAA	2	10	83640	83649	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015275	TCGTG	2	10	85448	85457	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015275	TTTTG	2	10	85957	85966	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015275	GGGAG	2	10	87002	87011	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015275	CCGTA	2	10	88112	88121	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_015275	AAGAT	2	10	89263	89272	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015275	TGATA	2	10	91457	91466	40 %	40 %	20 %	0 %	326789196
93	NC_015275	AAATG	2	10	91601	91610	60 %	20 %	20 %	0 %	326789196
94	NC_015275	AAATG	2	10	92596	92605	60 %	20 %	20 %	0 %	326789197
95	NC_015275	AGAAA	2	10	94141	94150	80 %	0 %	20 %	0 %	326789197
96	NC_015275	GTTTG	2	10	94256	94265	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015275	AAGAT	2	10	96298	96307	60 %	20 %	20 %	0 %	326789198
98	NC_015275	ATAGG	2	10	96593	96602	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015275	TGGAG	2	10	99163	99172	20 %	20 %	60 %	0 %	326789200
100	NC_015275	CAGCT	2	10	102194	102203	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015275	GATAA	2	10	106648	106657	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015275	GCCAT	2	10	108374	108383	20 %	20 %	20 %	40 %	326789207
103	NC_015275	CTAGA	2	10	110381	110390	40 %	20 %	20 %	20 %	326789209
104	NC_015275	TGAAA	2	10	111279	111288	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015275	TTAAA	2	10	111596	111605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015275	TAGTT	2	10	115002	115011	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015275	AGAGT	2	10	115210	115219	40 %	20 %	40 %	0 %	326789214
108	NC_015275	TCTAG	2	10	116095	116104	20 %	40 %	20 %	20 %	326789214
109	NC_015275	TATAA	2	10	118463	118472	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015275	ATAAG	2	10	120605	120614	60 %	20 %	20 %	0 %	326789217
111	NC_015275	CAGAT	2	10	120995	121004	40 %	20 %	20 %	20 %	326789217
112	NC_015275	TTTAT	2	10	121781	121790	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015275	ATAAA	2	10	121842	121851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015275	AGTGA	2	10	121914	121923	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015275	ATGAT	2	10	122432	122441	40 %	40 %	20 %	0 %	326789219
116	NC_015275	AGGGG	2	10	125632	125641	20 %	0 %	80 %	0 %	326789224
117	NC_015275	ATGAA	2	10	126331	126340	60 %	20 %	20 %	0 %	326789224
118	NC_015275	GATTG	2	10	128223	128232	20 %	40 %	40 %	0 %	326789225
119	NC_015275	AAACA	2	10	132471	132480	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015275	AAAAC	2	10	132496	132505	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015275	TTAGT	2	10	133356	133365	20 %	60 %	20 %	0 %	326789231
122	NC_015275	ATTTG	2	10	133969	133978	20 %	60 %	20 %	0 %	326789232
123	NC_015275	AGTTA	2	10	135045	135054	40 %	40 %	20 %	0 %	326789232
124	NC_015275	CCATT	2	10	135463	135472	20 %	40 %	0 %	40 %	326789233
125	NC_015275	TAAAG	2	10	136084	136093	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015275	GAGTA	2	10	136465	136474	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015275	GATAT	2	10	138114	138123	40 %	40 %	20 %	0 %	326789234
128	NC_015275	ATACC	2	10	138396	138405	40 %	20 %	0 %	40 %	326789234
129	NC_015275	AAATT	2	10	139950	139959	60 %	40 %	0 %	0 %	326789236
130	NC_015275	GGAGT	2	10	140373	140382	20 %	20 %	60 %	0 %	326789236
131	NC_015275	CATAT	2	10	140863	140872	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015275	AAGAG	2	10	140886	140895	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015275	AGAAA	2	10	140914	140923	80 %	0 %	20 %	0 %	326789237
134	NC_015275	TCGTG	2	10	142553	142562	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015275	TGTTT	2	10	143060	143069	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015275	GAAGC	2	10	143110	143119	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015275	GGGAG	2	10	144155	144164	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015275	CCGTA	2	10	145264	145273	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_015275	AAGAT	2	10	146415	146424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015275	TTTGA	2	10	147981	147990	20 %	60 %	20 %	0 %	326789238
141	NC_015275	GGTAT	2	10	149218	149227	20 %	40 %	40 %	0 %	326789239
142	NC_015275	AGTAA	2	10	149559	149568	60 %	20 %	20 %	0 %	326789240
143	NC_015275	AAAAG	2	10	149957	149966	80 %	0 %	20 %	0 %	326789240
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145	NC_015275	TCGTG	2	10	152680	152689	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015275	TGTTT	2	10	153186	153195	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_015275	GGGAG	2	10	154289	154298	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_015275	TATAT	2	10	157580	157589	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015275	AAAGT	2	10	157618	157627	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_015275	TTTAG	2	10	161466	161475	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015275	TAAAG	2	10	163469	163478	60 %	20 %	20 %	0 %	326789245
157	NC_015275	TTTAC	2	10	163554	163563	20 %	60 %	0 %	20 %	326789245
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161	NC_015275	ATAAG	2	10	165556	165565	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015275	TTAAT	2	10	165580	165589	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_015275	ATTCA	2	10	171492	171501	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_015275	TTGGT	2	10	171848	171857	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_015275	GATTG	2	10	277518	277527	20 %	40 %	40 %	0 %	326789339
262	NC_015275	TGAGG	2	10	279612	279621	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
263	NC_015275	TTGAT	2	10	280013	280022	20 %	60 %	20 %	0 %	326789342
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270	NC_015275	TATAA	2	10	290130	290139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_015275	ATAGC	2	10	292709	292718	40 %	20 %	20 %	20 %	326789353
272	NC_015275	ATACC	2	10	293679	293688	40 %	20 %	0 %	40 %	326789355
273	NC_015275	AGATG	2	10	294020	294029	40 %	20 %	40 %	0 %	326789355
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