MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 114722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_015275	TAT	2	6	168848	168853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789249
4003	NC_015275	TA	3	6	168873	168878	50 %	50 %	0 %	0 %	326789249
4004	NC_015275	GTT	2	6	168879	168884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789249
4005	NC_015275	A	8	8	168894	168901	100 %	0 %	0 %	0 %	326789249
4006	NC_015275	AAAGG	2	10	168927	168936	60 %	0 %	40 %	0 %	326789249
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4010	NC_015275	ATT	2	6	169021	169026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789249
4011	NC_015275	AGA	2	6	169069	169074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789249
4012	NC_015275	T	7	7	169090	169096	0 %	100 %	0 %	0 %	326789249
4013	NC_015275	ATT	2	6	169107	169112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789249
4014	NC_015275	CCTA	2	8	169166	169173	25 %	25 %	0 %	50 %	326789249
4015	NC_015275	ATT	2	6	169294	169299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789249
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4017	NC_015275	AGGC	2	8	169388	169395	25 %	0 %	50 %	25 %	326789249
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4022	NC_015275	TA	3	6	169562	169567	50 %	50 %	0 %	0 %	326789249
4023	NC_015275	A	6	6	169590	169595	100 %	0 %	0 %	0 %	326789249
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4030	NC_015275	TTAC	2	8	169884	169891	25 %	50 %	0 %	25 %	326789249
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4055	NC_015275	ATA	2	6	170761	170766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789249
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4058	NC_015275	ATA	2	6	170817	170822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_015275	TTA	2	6	170830	170835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4062	NC_015275	TTGTT	2	10	171002	171011	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4064	NC_015275	AT	3	6	171152	171157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_015275	AAT	2	6	171239	171244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4068	NC_015275	TA	4	8	171314	171321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_015275	TCTA	2	8	171354	171361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4078	NC_015275	TCT	2	6	171796	171801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_015275	TTGGT	2	10	171848	171857	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_015275	ACC	2	6	171894	171899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4085	NC_015275	TAA	2	6	172184	172189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_015275	TA	3	6	172380	172385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_015275	ATT	2	6	172460	172465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_015275	TCA	2	6	172492	172497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4093	NC_015275	GTA	2	6	172577	172582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_015275	TA	4	8	172596	172603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_015275	A	6	6	172673	172678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_015275	AT	3	6	172691	172696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_015275	A	8	8	172709	172716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_015275	A	8	8	172801	172808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_015275	A	7	7	172810	172816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_015275	GCG	2	6	172860	172865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_015275	AAAC	2	8	172877	172884	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4102	NC_015275	GCA	2	6	172885	172890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_015275	AAT	3	9	172891	172899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_015275	CGG	2	6	172939	172944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_015275	AGG	2	6	173039	173044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015275	T	6	6	173191	173196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_015275	CGC	2	6	173226	173231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_015275	CGG	2	6	173239	173244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_015275	T	6	6	173299	173304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_015275	AAT	2	6	173501	173506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_015275	TA	3	6	173518	173523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_015275	AGA	2	6	173623	173628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_015275	GTC	2	6	173650	173655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_015275	ATTAT	2	10	173666	173675	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_015275	AGC	2	6	173704	173709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_015275	CAG	2	6	173721	173726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_015275	TCG	2	6	173746	173751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_015275	AGC	2	6	173882	173887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_015275	TCG	2	6	173896	173901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_015275	G	6	6	174091	174096	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_015275	T	7	7	174099	174105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_015275	GAAT	2	8	174158	174165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_015275	TA	3	6	174193	174198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_015275	A	6	6	174222	174227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_015275	AGG	2	6	174245	174250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_015275	ATA	2	6	174287	174292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789250
4127	NC_015275	A	6	6	174330	174335	100 %	0 %	0 %	0 %	326789250
4128	NC_015275	TA	3	6	174336	174341	50 %	50 %	0 %	0 %	326789250
4129	NC_015275	A	6	6	174387	174392	100 %	0 %	0 %	0 %	326789250
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4255	NC_015275	AGT	2	6	179367	179372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789254
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4376	NC_015275	AG	3	6	184383	184388	50 %	0 %	50 %	0 %	326789259
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