MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 114722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015275	CAG	2	6	250941	250946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789322
6002	NC_015275	AAT	3	9	251024	251032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789322
6003	NC_015275	TAG	2	6	251076	251081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789322
6004	NC_015275	CTT	2	6	251083	251088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789322
6005	NC_015275	TTATA	2	10	251165	251174	40 %	60 %	0 %	0 %	326789322
6006	NC_015275	TG	3	6	251183	251188	0 %	50 %	50 %	0 %	326789322
6007	NC_015275	GTA	2	6	251189	251194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789322
6008	NC_015275	ATT	2	6	251212	251217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789322
6009	NC_015275	TTTA	2	8	251218	251225	25 %	75 %	0 %	0 %	326789322
6010	NC_015275	AGC	2	6	251233	251238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789322
6011	NC_015275	AAG	2	6	251243	251248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789322
6012	NC_015275	GT	3	6	251381	251386	0 %	50 %	50 %	0 %	326789322
6013	NC_015275	TA	3	6	251523	251528	50 %	50 %	0 %	0 %	326789322
6014	NC_015275	TAA	2	6	251557	251562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789322
6015	NC_015275	AGG	2	6	251586	251591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326789322
6016	NC_015275	AAC	2	6	251659	251664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789322
6017	NC_015275	AGA	2	6	251683	251688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789322
6018	NC_015275	ATG	2	6	251693	251698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789322
6019	NC_015275	AT	3	6	251761	251766	50 %	50 %	0 %	0 %	326789322
6020	NC_015275	TGA	2	6	251772	251777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789322
6021	NC_015275	AAG	2	6	251781	251786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789322
6022	NC_015275	TTA	2	6	251819	251824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789322
6023	NC_015275	AGA	2	6	251848	251853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789322
6024	NC_015275	CTT	2	6	251863	251868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789322
6025	NC_015275	TAT	2	6	251876	251881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789322
6026	NC_015275	TGA	2	6	251899	251904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789322
6027	NC_015275	TAA	2	6	251962	251967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789322
6028	NC_015275	AAT	2	6	252050	252055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789322
6029	NC_015275	TAGA	2	8	252065	252072	50 %	25 %	25 %	0 %	326789322
6030	NC_015275	GCT	2	6	252119	252124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326789323
6031	NC_015275	TAA	2	6	252140	252145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789323
6032	NC_015275	ATA	2	6	252162	252167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789323
6033	NC_015275	CTA	2	6	252176	252181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789323
6034	NC_015275	TCT	2	6	252186	252191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789323
6035	NC_015275	TAAA	2	8	252198	252205	75 %	25 %	0 %	0 %	326789323
6036	NC_015275	TAA	2	6	252269	252274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789323
6037	NC_015275	TTAA	2	8	252280	252287	50 %	50 %	0 %	0 %	326789323
6038	NC_015275	CTT	2	6	252293	252298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789323
6039	NC_015275	AAGT	2	8	252372	252379	50 %	25 %	25 %	0 %	326789323
6040	NC_015275	GGA	2	6	252381	252386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326789323
6041	NC_015275	CTT	2	6	252416	252421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789323
6042	NC_015275	GAA	2	6	252513	252518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789323
6043	NC_015275	T	7	7	252599	252605	0 %	100 %	0 %	0 %	326789323
6044	NC_015275	GCT	2	6	252647	252652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326789323
6045	NC_015275	CTC	2	6	252701	252706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_015275	T	7	7	252731	252737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_015275	AAT	2	6	252792	252797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789324
6048	NC_015275	CAG	2	6	252800	252805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789324
6049	NC_015275	ACA	2	6	252859	252864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789324
6050	NC_015275	CTT	2	6	252971	252976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789324
6051	NC_015275	GA	3	6	253031	253036	50 %	0 %	50 %	0 %	326789324
6052	NC_015275	ACC	2	6	253102	253107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326789324
6053	NC_015275	ATG	2	6	253126	253131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789324
6054	NC_015275	AAG	2	6	253191	253196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789324
6055	NC_015275	TAG	2	6	253226	253231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789324
6056	NC_015275	AGA	2	6	253335	253340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789324
6057	NC_015275	T	6	6	253352	253357	0 %	100 %	0 %	0 %	326789324
6058	NC_015275	CTG	2	6	253398	253403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326789324
6059	NC_015275	AAG	2	6	253407	253412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789324
6060	NC_015275	TAG	4	12	253454	253465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789324
6061	NC_015275	AAT	2	6	253503	253508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789324
6062	NC_015275	TTG	2	6	253524	253529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789324
6063	NC_015275	TCT	2	6	253538	253543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789324
6064	NC_015275	CAT	2	6	253568	253573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789324
6065	NC_015275	T	6	6	253609	253614	0 %	100 %	0 %	0 %	326789324
6066	NC_015275	AGG	2	6	253663	253668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326789324
6067	NC_015275	ATC	2	6	253698	253703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789324
6068	NC_015275	CAG	2	6	253736	253741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789324
6069	NC_015275	GAA	2	6	253813	253818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789324
6070	NC_015275	AGC	2	6	253824	253829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789324
6071	NC_015275	CAG	2	6	253850	253855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789324
6072	NC_015275	AAG	2	6	253869	253874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789324
6073	NC_015275	CTA	2	6	253882	253887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789324
6074	NC_015275	TTA	2	6	253906	253911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789324
6075	NC_015275	CCT	2	6	253928	253933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326789325
6076	NC_015275	TGATT	2	10	253964	253973	20 %	60 %	20 %	0 %	326789325
6077	NC_015275	ATT	2	6	253977	253982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789325
6078	NC_015275	AGT	2	6	253987	253992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789325
6079	NC_015275	GGT	2	6	253995	254000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789325
6080	NC_015275	TCA	2	6	254018	254023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789325
6081	NC_015275	AT	3	6	254068	254073	50 %	50 %	0 %	0 %	326789325
6082	NC_015275	TAGC	2	8	254122	254129	25 %	25 %	25 %	25 %	326789325
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6084	NC_015275	GAA	2	6	254160	254165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789325
6085	NC_015275	GAT	2	6	254204	254209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789325
6086	NC_015275	TACCT	2	10	254238	254247	20 %	40 %	0 %	40 %	326789325
6087	NC_015275	ATCA	2	8	254250	254257	50 %	25 %	0 %	25 %	326789325
6088	NC_015275	CAC	2	6	254280	254285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326789325
6089	NC_015275	GAT	2	6	254292	254297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789325
6090	NC_015275	CTA	2	6	254363	254368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789325
6091	NC_015275	TA	3	6	254492	254497	50 %	50 %	0 %	0 %	326789325
6092	NC_015275	TCA	2	6	254566	254571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789325
6093	NC_015275	AGGGTA	2	12	254575	254586	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	326789325
6094	NC_015275	TAA	2	6	254611	254616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789325
6095	NC_015275	GAA	2	6	254673	254678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789325
6096	NC_015275	TTCA	2	8	254844	254851	25 %	50 %	0 %	25 %	326789325
6097	NC_015275	AG	3	6	254904	254909	50 %	0 %	50 %	0 %	326789325
6098	NC_015275	CT	3	6	254946	254951	0 %	50 %	0 %	50 %	326789325
6099	NC_015275	CAT	2	6	254952	254957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789325
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6101	NC_015275	TTG	2	6	255069	255074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789325
6102	NC_015275	ACC	2	6	255142	255147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326789325
6103	NC_015275	TTGA	2	8	255194	255201	25 %	50 %	25 %	0 %	326789325
6104	NC_015275	TAG	2	6	255289	255294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789325
6105	NC_015275	GAAATA	2	12	255376	255387	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	326789325
6106	NC_015275	AAT	2	6	255396	255401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789325
6107	NC_015275	CAT	2	6	255452	255457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789325
6108	NC_015275	AGT	2	6	255465	255470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789325
6109	NC_015275	TAT	2	6	255479	255484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789325
6110	NC_015275	AGAAA	2	10	255496	255505	80 %	0 %	20 %	0 %	326789325
6111	NC_015275	AAAG	2	8	255508	255515	75 %	0 %	25 %	0 %	326789325
6112	NC_015275	T	7	7	255517	255523	0 %	100 %	0 %	0 %	326789325
6113	NC_015275	ATG	2	6	255539	255544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789325
6114	NC_015275	TTTG	2	8	255596	255603	0 %	75 %	25 %	0 %	326789325
6115	NC_015275	TAAG	2	8	255627	255634	50 %	25 %	25 %	0 %	326789325
6116	NC_015275	T	6	6	255676	255681	0 %	100 %	0 %	0 %	326789325
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6119	NC_015275	GAA	2	6	255878	255883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789325
6120	NC_015275	TAATA	2	10	256101	256110	60 %	40 %	0 %	0 %	326789325
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6122	NC_015275	ATC	2	6	256310	256315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789326
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