MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 114722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015275	A	6	6	230789	230794	100 %	0 %	0 %	0 %	326789306
5502	NC_015275	TCA	2	6	230827	230832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789306
5503	NC_015275	A	6	6	230892	230897	100 %	0 %	0 %	0 %	326789306
5504	NC_015275	TTC	2	6	230912	230917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789306
5505	NC_015275	GA	3	6	230960	230965	50 %	0 %	50 %	0 %	326789306
5506	NC_015275	ATG	2	6	230971	230976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789306
5507	NC_015275	ATTT	2	8	230998	231005	25 %	75 %	0 %	0 %	326789306
5508	NC_015275	CA	3	6	231020	231025	50 %	0 %	0 %	50 %	326789306
5509	NC_015275	CAGGA	2	10	231095	231104	40 %	0 %	40 %	20 %	326789306
5510	NC_015275	GAT	3	9	231151	231159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789306
5511	NC_015275	AT	3	6	231201	231206	50 %	50 %	0 %	0 %	326789306
5512	NC_015275	TGAT	2	8	231314	231321	25 %	50 %	25 %	0 %	326789306
5513	NC_015275	GAA	2	6	231391	231396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789306
5514	NC_015275	T	6	6	231499	231504	0 %	100 %	0 %	0 %	326789306
5515	NC_015275	AAATC	2	10	231530	231539	60 %	20 %	0 %	20 %	326789306
5516	NC_015275	AAGC	2	8	231590	231597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5517	NC_015275	TAAA	2	8	231617	231624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_015275	CGTTG	2	10	231628	231637	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5519	NC_015275	ATAG	2	8	231667	231674	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_015275	CGG	2	6	231680	231685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_015275	GCC	2	6	231705	231710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_015275	TA	3	6	231721	231726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_015275	TAA	2	6	231740	231745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_015275	T	7	7	231751	231757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_015275	TA	3	6	231858	231863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_015275	ATTG	2	8	231901	231908	25 %	50 %	25 %	0 %	326789307
5527	NC_015275	CTT	2	6	231927	231932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789307
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5529	NC_015275	TTA	2	6	232022	232027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789307
5530	NC_015275	TTTTA	2	10	232033	232042	20 %	80 %	0 %	0 %	326789307
5531	NC_015275	AGA	2	6	232106	232111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789307
5532	NC_015275	GA	3	6	232113	232118	50 %	0 %	50 %	0 %	326789307
5533	NC_015275	ATT	2	6	232153	232158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789307
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5535	NC_015275	TCA	2	6	232188	232193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789307
5536	NC_015275	CTT	2	6	232208	232213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789307
5537	NC_015275	ATT	3	9	232214	232222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789307
5538	NC_015275	CA	3	6	232260	232265	50 %	0 %	0 %	50 %	326789307
5539	NC_015275	CAG	2	6	232279	232284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789307
5540	NC_015275	AAT	2	6	232339	232344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789307
5541	NC_015275	CTA	2	6	232365	232370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789307
5542	NC_015275	TCT	2	6	232485	232490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789307
5543	NC_015275	GCTA	2	8	232550	232557	25 %	25 %	25 %	25 %	326789307
5544	NC_015275	AGAA	2	8	232559	232566	75 %	0 %	25 %	0 %	326789307
5545	NC_015275	AT	3	6	232573	232578	50 %	50 %	0 %	0 %	326789307
5546	NC_015275	T	7	7	232605	232611	0 %	100 %	0 %	0 %	326789307
5547	NC_015275	TAG	2	6	232629	232634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789307
5548	NC_015275	AAATT	2	10	232656	232665	60 %	40 %	0 %	0 %	326789307
5549	NC_015275	CTA	2	6	232692	232697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789307
5550	NC_015275	CTT	2	6	232729	232734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789307
5551	NC_015275	A	6	6	232823	232828	100 %	0 %	0 %	0 %	326789307
5552	NC_015275	ATG	2	6	232843	232848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789307
5553	NC_015275	CTTT	2	8	232924	232931	0 %	75 %	0 %	25 %	326789308
5554	NC_015275	CAG	2	6	232946	232951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789308
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5556	NC_015275	TCTT	2	8	233122	233129	0 %	75 %	0 %	25 %	326789308
5557	NC_015275	A	6	6	233142	233147	100 %	0 %	0 %	0 %	326789308
5558	NC_015275	TATT	2	8	233153	233160	25 %	75 %	0 %	0 %	326789308
5559	NC_015275	TGA	2	6	233177	233182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789308
5560	NC_015275	TTA	2	6	233195	233200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789308
5561	NC_015275	GTCA	2	8	233221	233228	25 %	25 %	25 %	25 %	326789308
5562	NC_015275	T	6	6	233268	233273	0 %	100 %	0 %	0 %	326789308
5563	NC_015275	ACT	2	6	233380	233385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789308
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5565	NC_015275	TAA	2	6	233481	233486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789308
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5594	NC_015275	TGA	2	6	234323	234328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789309
5595	NC_015275	A	6	6	234357	234362	100 %	0 %	0 %	0 %	326789309
5596	NC_015275	TGGT	2	8	234407	234414	0 %	50 %	50 %	0 %	326789309
5597	NC_015275	T	6	6	234414	234419	0 %	100 %	0 %	0 %	326789309
5598	NC_015275	AGC	2	6	234439	234444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789309
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5605	NC_015275	TAC	2	6	234878	234883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789309
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5608	NC_015275	AGCA	2	8	235066	235073	50 %	0 %	25 %	25 %	326789309
5609	NC_015275	TAA	2	6	235097	235102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789309
5610	NC_015275	TAA	2	6	235118	235123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789309
5611	NC_015275	CTA	2	6	235148	235153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_015275	GAAA	2	8	235157	235164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_015275	T	7	7	235224	235230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_015275	AGC	2	6	235356	235361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_015275	TAC	2	6	235377	235382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_015275	G	6	6	235410	235415	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_015275	ATG	2	6	235569	235574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789310
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5620	NC_015275	AGCTA	2	10	235678	235687	40 %	20 %	20 %	20 %	326789310
5621	NC_015275	TA	3	6	235731	235736	50 %	50 %	0 %	0 %	326789310
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5623	NC_015275	A	6	6	235769	235774	100 %	0 %	0 %	0 %	326789310
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