MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Blochmannia vafer str. BVAF chromosome

Total Repeats: 441

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014909	CTATTT	2	12	1838	1849	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319760151
2	NC_014909	ATTTTT	2	12	2132	2143	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014909	ATATCA	2	12	2846	2857	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319760152
4	NC_014909	TTTTAT	2	12	3168	3179	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	319760152
5	NC_014909	GTTTTT	2	12	3613	3624	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014909	ATTTGA	2	12	6115	6126	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319760156
7	NC_014909	TAAAAA	2	12	6295	6306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	319760157
8	NC_014909	TGAGTG	2	12	7173	7184	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	319760158
9	NC_014909	CTTTTT	2	12	12640	12651	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	319760162
10	NC_014909	AACCAG	2	12	12885	12896	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	319760162
11	NC_014909	TAAATT	2	12	12911	12922	50 %	50 %	0 %	0 %	319760162
12	NC_014909	ATTTTT	2	12	13979	13990	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	319760162
13	NC_014909	ATTCTA	2	12	14654	14665	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319760164
14	NC_014909	TATCAA	2	12	18079	18090	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319760166
15	NC_014909	TAATTC	2	12	19318	19329	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319760167
16	NC_014909	ATGTTA	2	12	21835	21846	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319760169
17	NC_014909	AATGAA	2	12	23279	23290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319760170
18	NC_014909	ATATGA	2	12	24883	24894	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	319760171
19	NC_014909	GATGTA	2	12	26289	26300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760172
20	NC_014909	GATAAA	2	12	27763	27774	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319760173
21	NC_014909	TGATAT	2	12	29595	29606	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319760174
22	NC_014909	CCTTTA	2	12	33914	33925	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	319760178
23	NC_014909	ATTAGT	2	12	34096	34107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319760178
24	NC_014909	TTCTAT	2	12	37417	37428	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319760180
25	NC_014909	CAGTAT	2	12	38134	38145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319760181
26	NC_014909	ATTCAA	2	12	39702	39713	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319760182
27	NC_014909	TGTTGA	2	12	44868	44879	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	319760185
28	NC_014909	GTATTA	2	12	46808	46819	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319760187
29	NC_014909	TGTTTT	2	12	47000	47011	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	319760187
30	NC_014909	ATTTTT	2	12	49041	49052	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	319760189
31	NC_014909	AAGTAA	2	12	52320	52331	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319760193
32	NC_014909	ATTAAT	2	12	52341	52352	50 %	50 %	0 %	0 %	319760193
33	NC_014909	ATTTTT	2	12	52465	52476	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014909	AATATA	2	12	60432	60443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014909	ATTGTT	2	12	60642	60653	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014909	TTAATT	2	12	61345	61356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760202
37	NC_014909	CTGTTA	2	12	63005	63016	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319760203
38	NC_014909	AGCATA	2	12	65144	65155	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319760204
39	NC_014909	TAAAAA	2	12	68510	68521	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014909	TATATT	2	12	69571	69582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760209
41	NC_014909	AATTAA	2	12	70717	70728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014909	CTGGAG	2	12	71696	71707	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319760210
43	NC_014909	TATGAA	2	12	71860	71871	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	319760210
44	NC_014909	TGTATG	2	12	74002	74013	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014909	TTTTAA	2	12	74171	74182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760213
46	NC_014909	ATTAGA	2	12	78764	78775	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	319760217
47	NC_014909	GTTAAG	2	12	79630	79641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014909	TAATAC	2	12	80192	80203	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319760218
49	NC_014909	ATCCTA	2	12	80888	80899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760219
50	NC_014909	TAATTT	2	12	82419	82430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760219
51	NC_014909	CTAATT	2	12	83075	83086	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319760219
52	NC_014909	GTATGT	2	12	83722	83733	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014909	TAAAAA	2	12	83746	83757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014909	AGGTTG	2	12	86143	86154	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014909	ATATTA	2	12	87141	87152	50 %	50 %	0 %	0 %	319760223
56	NC_014909	GCATCA	2	12	88436	88447	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319760223
57	NC_014909	TAAAAA	2	12	91671	91682	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	319760226
58	NC_014909	CTGATT	2	12	93861	93872	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319760227
59	NC_014909	TATTTG	2	12	96494	96505	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014909	TAATAT	2	12	97754	97765	50 %	50 %	0 %	0 %	319760232
61	NC_014909	ATAAAT	2	12	98407	98418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760233
62	NC_014909	GGTTTA	2	12	104007	104018	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	319760235
63	NC_014909	CTTGTT	2	12	105924	105935	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	319760237
64	NC_014909	TAATAG	2	12	106026	106037	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	319760237
65	NC_014909	AAAAAT	2	12	106939	106950	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	319760238
66	NC_014909	TAGATT	2	12	109607	109618	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014909	TAAATA	2	12	110284	110295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760242
68	NC_014909	ATAATT	2	12	119045	119056	50 %	50 %	0 %	0 %	319760248
69	NC_014909	TGTATC	2	12	119667	119678	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319760248
70	NC_014909	TGCTAT	2	12	120542	120553	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319760249
71	NC_014909	AAGATG	2	12	121653	121664	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014909	TTTTTA	2	12	122204	122215	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014909	GAATCG	2	12	122802	122813	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319760252
74	NC_014909	ATAATT	2	12	125563	125574	50 %	50 %	0 %	0 %	319760253
75	NC_014909	AATTAT	2	12	127107	127118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014909	TTAACA	2	12	127707	127718	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014909	GAATTA	2	12	134568	134579	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	319760258
78	NC_014909	TGTATA	2	12	134804	134815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014909	TTAATA	2	12	134982	134993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014909	AGGTCA	2	12	135518	135529	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319760259
81	NC_014909	TTACCA	2	12	137439	137450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760261
82	NC_014909	TTAATT	2	12	138903	138914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760262
83	NC_014909	TTATCT	2	12	143610	143621	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319760266
84	NC_014909	CTCAAG	2	12	144001	144012	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319760266
85	NC_014909	AGCTTT	2	12	144161	144172	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319760266
86	NC_014909	TTTAGA	2	12	144796	144807	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319760267
87	NC_014909	GTAGAT	2	12	146792	146803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760267
88	NC_014909	TTAATA	2	12	147822	147833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014909	TATCTT	2	12	148138	148149	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319760268
90	NC_014909	AATTTT	2	12	148748	148759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760269
91	NC_014909	GTAAAT	2	12	149029	149040	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	319760269
92	NC_014909	AAAATC	2	12	149147	149158	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319760269
93	NC_014909	TATATG	2	12	149305	149316	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014909	CTATTA	2	12	149970	149981	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319760270
95	NC_014909	TAAAAA	2	12	152436	152447	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	319760272
96	NC_014909	ATTTTA	2	12	158360	158371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760277
97	NC_014909	TGTTTT	2	12	158655	158666	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	319760277
98	NC_014909	AAAGCA	2	12	159807	159818	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	319760277
99	NC_014909	ATTGGC	2	12	162688	162699	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319760280
100	NC_014909	ATATGG	2	12	162841	162852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760280
101	NC_014909	AAATCC	2	12	162944	162955	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	319760280
102	NC_014909	AATTTA	2	12	163715	163726	50 %	50 %	0 %	0 %	319760281
103	NC_014909	GAGAAA	2	12	165504	165515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760282
104	NC_014909	TAATTG	2	12	166928	166939	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319760283
105	NC_014909	ATTACA	2	12	174387	174398	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319760289
106	NC_014909	AGGAGC	2	12	174999	175010	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	319760290
107	NC_014909	ATGTAA	2	12	177097	177108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014909	ATTAAG	2	12	177453	177464	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014909	TGCTCA	2	12	179356	179367	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319760292
110	NC_014909	TTTAGA	2	12	181492	181503	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319760294
111	NC_014909	AGCTCC	2	12	183412	183423	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319760295
112	NC_014909	AATATT	2	12	184473	184484	50 %	50 %	0 %	0 %	319760296
113	NC_014909	ATTAAT	2	12	185313	185324	50 %	50 %	0 %	0 %	319760296
114	NC_014909	GATTTA	2	12	192991	193002	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319760300
115	NC_014909	AATATA	2	12	196029	196040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014909	TTTTAT	2	12	196122	196133	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014909	TAATAT	2	12	196147	196158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014909	CAGGAA	2	12	197674	197685	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	319760302
119	NC_014909	AGATCA	2	12	197855	197866	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319760302
120	NC_014909	GGCAGA	2	12	199426	199437	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	319760303
121	NC_014909	TCAGAA	2	12	202186	202197	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319760306
122	NC_014909	TTTATA	2	12	207142	207153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014909	TATTAG	2	12	212500	212511	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014909	ATTAAA	2	12	214948	214959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760318
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126	NC_014909	AATTAA	2	12	215612	215623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760319
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244	NC_014909	TTCTAC	2	12	382229	382240	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	319760467
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247	NC_014909	TAATAT	2	12	390815	390826	50 %	50 %	0 %	0 %	319760476
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360	NC_014909	TATCTT	2	12	563264	563275	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.