MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Blochmannia vafer str. BVAF chromosome

Total Repeats: 22571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_014909	AT	3	6	720519	720524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22502	NC_014909	ATA	2	6	720539	720544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22503	NC_014909	ATT	2	6	720562	720567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22504	NC_014909	TG	3	6	720585	720590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22505	NC_014909	GTT	2	6	720608	720613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760737
22506	NC_014909	ATT	2	6	720626	720631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760737
22507	NC_014909	T	6	6	720636	720641	0 %	100 %	0 %	0 %	319760737
22508	NC_014909	ATT	2	6	720647	720652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760737
22509	NC_014909	ATA	2	6	720671	720676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760737
22510	NC_014909	AATTA	2	10	720731	720740	60 %	40 %	0 %	0 %	319760737
22511	NC_014909	ATT	2	6	720743	720748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760737
22512	NC_014909	AAT	2	6	720757	720762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760737
22513	NC_014909	CAT	2	6	720829	720834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760737
22514	NC_014909	ATT	2	6	720866	720871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760737
22515	NC_014909	TAAT	2	8	720877	720884	50 %	50 %	0 %	0 %	319760737
22516	NC_014909	TAAAT	2	10	720939	720948	60 %	40 %	0 %	0 %	319760737
22517	NC_014909	TCA	2	6	720993	720998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760737
22518	NC_014909	CTA	2	6	721051	721056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760737
22519	NC_014909	T	10	10	721058	721067	0 %	100 %	0 %	0 %	319760737
22520	NC_014909	GCT	2	6	721104	721109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760737
22521	NC_014909	AAAT	2	8	721123	721130	75 %	25 %	0 %	0 %	319760737
22522	NC_014909	GATGT	2	10	721137	721146	20 %	40 %	40 %	0 %	319760737
22523	NC_014909	GTT	2	6	721147	721152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319760737
22524	NC_014909	ATT	2	6	721286	721291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760737
22525	NC_014909	TAA	2	6	721337	721342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760737
22526	NC_014909	T	8	8	721405	721412	0 %	100 %	0 %	0 %	319760737
22527	NC_014909	ATTAA	2	10	721416	721425	60 %	40 %	0 %	0 %	319760737
22528	NC_014909	TTC	2	6	721473	721478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319760737
22529	NC_014909	T	6	6	721496	721501	0 %	100 %	0 %	0 %	319760737
22530	NC_014909	ATA	2	6	721545	721550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760737
22531	NC_014909	GT	3	6	721604	721609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22532	NC_014909	TATT	2	8	721634	721641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22533	NC_014909	TAA	2	6	721654	721659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22534	NC_014909	AT	3	6	721676	721681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22535	NC_014909	TATAT	2	10	721702	721711	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22536	NC_014909	AT	3	6	721723	721728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22537	NC_014909	A	6	6	721750	721755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22538	NC_014909	TA	3	6	721768	721773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22539	NC_014909	TTTG	2	8	721787	721794	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22540	NC_014909	TAA	2	6	721797	721802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22541	NC_014909	ATTA	2	8	721804	721811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22542	NC_014909	GTAT	2	8	721814	721821	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22543	NC_014909	T	7	7	721826	721832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22544	NC_014909	G	9	9	721849	721857	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22545	NC_014909	AAT	2	6	721861	721866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22546	NC_014909	TTTA	3	12	721893	721904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22547	NC_014909	ACC	2	6	721927	721932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22548	NC_014909	ATT	2	6	722009	722014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22549	NC_014909	TGTT	2	8	722038	722045	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22550	NC_014909	TAA	2	6	722072	722077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22551	NC_014909	TTA	2	6	722078	722083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22552	NC_014909	TAT	2	6	722101	722106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22553	NC_014909	TA	4	8	722172	722179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22554	NC_014909	TA	4	8	722205	722212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22555	NC_014909	TTTA	2	8	722228	722235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22556	NC_014909	ATTTA	2	10	722264	722273	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22557	NC_014909	AT	5	10	722279	722288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22558	NC_014909	TAA	2	6	722290	722295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22559	NC_014909	TTA	2	6	722320	722325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22560	NC_014909	AAATTT	2	12	722395	722406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22561	NC_014909	TGA	2	6	722424	722429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22562	NC_014909	TGT	2	6	722435	722440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22563	NC_014909	T	6	6	722453	722458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22564	NC_014909	TGA	2	6	722464	722469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22565	NC_014909	ATT	3	9	722475	722483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22566	NC_014909	T	6	6	722494	722499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22567	NC_014909	AT	3	6	722507	722512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22568	NC_014909	AGT	2	6	722520	722525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22569	NC_014909	TTG	2	6	722527	722532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22570	NC_014909	ATT	2	6	722542	722547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22571	NC_014909	AGT	2	6	722557	722562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.