MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 chromosome

Total Repeats: 1635

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014802	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	315123617
2	NC_014802	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	315123617
3	NC_014802	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	315123617
4	NC_014802	GCTTT	2	10	3330	3339	0 %	60 %	20 %	20 %	315123619
5	NC_014802	GTTTT	2	10	4922	4931	0 %	80 %	20 %	0 %	315123620
6	NC_014802	TTTTA	2	10	6526	6535	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014802	TAAAA	2	10	6618	6627	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014802	GTTTT	2	10	7486	7495	0 %	80 %	20 %	0 %	315123622
9	NC_014802	ATTTT	2	10	8703	8712	20 %	80 %	0 %	0 %	315123623
10	NC_014802	AAGAG	2	10	9735	9744	60 %	0 %	40 %	0 %	315123623
11	NC_014802	ACTTC	2	10	10397	10406	20 %	40 %	0 %	40 %	315123623
12	NC_014802	TCAAA	2	10	10959	10968	60 %	20 %	0 %	20 %	315123623
13	NC_014802	GACAA	2	10	13566	13575	60 %	0 %	20 %	20 %	315123624
14	NC_014802	CTTAA	2	10	14995	15004	40 %	40 %	0 %	20 %	315123626
15	NC_014802	CATTT	2	10	15545	15554	20 %	60 %	0 %	20 %	315123626
16	NC_014802	GCGAT	2	10	15815	15824	20 %	20 %	40 %	20 %	315123627
17	NC_014802	AAAAT	2	10	17916	17925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014802	TTTCA	2	10	18383	18392	20 %	60 %	0 %	20 %	315123628
19	NC_014802	AAGAT	2	10	19936	19945	60 %	20 %	20 %	0 %	315123629
20	NC_014802	ACCAA	2	10	21599	21608	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014802	AAAAT	2	10	21740	21749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014802	GTTAA	2	10	21767	21776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014802	AGATA	2	10	23524	23533	60 %	20 %	20 %	0 %	315123631
24	NC_014802	TTTTA	2	10	25476	25485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014802	GCAAA	2	10	25802	25811	60 %	0 %	20 %	20 %	315123634
26	NC_014802	ATTTT	2	10	26280	26289	20 %	80 %	0 %	0 %	315123634
27	NC_014802	GATTT	2	10	26844	26853	20 %	60 %	20 %	0 %	315123635
28	NC_014802	GAATG	2	10	28123	28132	40 %	20 %	40 %	0 %	315123636
29	NC_014802	ATCTC	2	10	28419	28428	20 %	40 %	0 %	40 %	315123636
30	NC_014802	GCTTT	2	10	28559	28568	0 %	60 %	20 %	20 %	315123636
31	NC_014802	ATACT	2	10	29968	29977	40 %	40 %	0 %	20 %	315123636
32	NC_014802	AATCC	2	10	30418	30427	40 %	20 %	0 %	40 %	315123637
33	NC_014802	TGTTT	2	10	31405	31414	0 %	80 %	20 %	0 %	315123637
34	NC_014802	GCAAA	2	10	31472	31481	60 %	0 %	20 %	20 %	315123637
35	NC_014802	GAAAT	2	10	31890	31899	60 %	20 %	20 %	0 %	315123638
36	NC_014802	AAAGT	2	10	32374	32383	60 %	20 %	20 %	0 %	315123638
37	NC_014802	AAAAT	2	10	33626	33635	80 %	20 %	0 %	0 %	315123639
38	NC_014802	ATTAT	2	10	34371	34380	40 %	60 %	0 %	0 %	315123640
39	NC_014802	AAATC	2	10	35041	35050	60 %	20 %	0 %	20 %	315123640
40	NC_014802	TATAT	2	10	36863	36872	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014802	CTTTT	2	10	37152	37161	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014802	CTTTT	2	10	37323	37332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014802	GGTAA	2	10	37634	37643	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014802	TCGTG	2	10	38430	38439	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014802	TCTTT	2	10	39459	39468	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014802	CCGTA	2	10	41406	41415	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014802	ATTAT	2	10	43469	43478	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014802	GGAAT	2	10	43851	43860	40 %	20 %	40 %	0 %	315123642
49	NC_014802	TAAAA	2	10	45472	45481	80 %	20 %	0 %	0 %	315123642
50	NC_014802	TATGT	2	10	45877	45886	20 %	60 %	20 %	0 %	315123643
51	NC_014802	TACTT	2	10	46632	46641	20 %	60 %	0 %	20 %	315123643
52	NC_014802	AAGGT	2	10	48592	48601	40 %	20 %	40 %	0 %	315123645
53	NC_014802	TTCTT	2	10	50956	50965	0 %	80 %	0 %	20 %	315123646
54	NC_014802	AAGAA	2	10	54354	54363	80 %	0 %	20 %	0 %	315123647
55	NC_014802	CAAGA	2	10	58623	58632	60 %	0 %	20 %	20 %	315123648
56	NC_014802	CAAAT	2	10	60795	60804	60 %	20 %	0 %	20 %	315123651
57	NC_014802	TACTC	2	10	63096	63105	20 %	40 %	0 %	40 %	315123652
58	NC_014802	CTTTT	2	10	64578	64587	0 %	80 %	0 %	20 %	315123654
59	NC_014802	CACCG	2	10	64603	64612	20 %	0 %	20 %	60 %	315123654
60	NC_014802	TTTCA	2	10	64825	64834	20 %	60 %	0 %	20 %	315123654
61	NC_014802	ATACT	2	10	64914	64923	40 %	40 %	0 %	20 %	315123654
62	NC_014802	AAGAT	2	10	66218	66227	60 %	20 %	20 %	0 %	315123655
63	NC_014802	TAATG	2	10	66270	66279	40 %	40 %	20 %	0 %	315123655
64	NC_014802	GATAA	2	10	66595	66604	60 %	20 %	20 %	0 %	315123656
65	NC_014802	AAATT	2	10	67504	67513	60 %	40 %	0 %	0 %	315123656
66	NC_014802	CAATG	2	10	67887	67896	40 %	20 %	20 %	20 %	315123656
67	NC_014802	TACTA	2	10	69360	69369	40 %	40 %	0 %	20 %	315123658
68	NC_014802	TGCTT	2	10	70154	70163	0 %	60 %	20 %	20 %	315123658
69	NC_014802	AATAT	2	10	70339	70348	60 %	40 %	0 %	0 %	315123658
70	NC_014802	CATTT	2	10	70938	70947	20 %	60 %	0 %	20 %	315123659
71	NC_014802	AATTT	2	10	70952	70961	40 %	60 %	0 %	0 %	315123659
72	NC_014802	ATTTC	2	10	71054	71063	20 %	60 %	0 %	20 %	315123659
73	NC_014802	TGATT	2	10	71105	71114	20 %	60 %	20 %	0 %	315123659
74	NC_014802	TTTTA	2	10	71172	71181	20 %	80 %	0 %	0 %	315123659
75	NC_014802	CAATA	2	10	71723	71732	60 %	20 %	0 %	20 %	315123659
76	NC_014802	GATAA	2	10	72106	72115	60 %	20 %	20 %	0 %	315123659
77	NC_014802	TCAAA	2	10	72657	72666	60 %	20 %	0 %	20 %	315123660
78	NC_014802	TGTGT	2	10	73152	73161	0 %	60 %	40 %	0 %	315123660
79	NC_014802	AAAAT	2	10	73332	73341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014802	ATTAC	2	10	73689	73698	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014802	AAAAT	2	10	74589	74598	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014802	ATATT	2	10	76664	76673	40 %	60 %	0 %	0 %	315123663
83	NC_014802	CTCTT	2	10	79684	79693	0 %	60 %	0 %	40 %	315123667
84	NC_014802	TTTTC	2	10	79725	79734	0 %	80 %	0 %	20 %	315123667
85	NC_014802	TCTCT	2	10	79989	79998	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014802	ATCTC	2	10	80540	80549	20 %	40 %	0 %	40 %	315123668
87	NC_014802	GCCAA	2	10	80678	80687	40 %	0 %	20 %	40 %	315123668
88	NC_014802	TTTTG	2	10	81922	81931	0 %	80 %	20 %	0 %	315123669
89	NC_014802	TAAGG	2	10	86397	86406	40 %	20 %	40 %	0 %	315123673
90	NC_014802	ATTTT	2	10	86450	86459	20 %	80 %	0 %	0 %	315123673
91	NC_014802	TAGGA	2	10	86726	86735	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014802	AAAAT	2	10	86752	86761	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014802	ATTTT	2	10	86762	86771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014802	CTTTT	2	10	87142	87151	0 %	80 %	0 %	20 %	315123674
95	NC_014802	TAAGA	2	10	87821	87830	60 %	20 %	20 %	0 %	315123675
96	NC_014802	CAAAA	2	10	88113	88122	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014802	TAAAA	3	15	88165	88179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014802	TGGAT	2	10	88632	88641	20 %	40 %	40 %	0 %	315123676
99	NC_014802	TAAAA	2	10	88914	88923	80 %	20 %	0 %	0 %	315123677
100	NC_014802	TTGTT	2	10	89071	89080	0 %	80 %	20 %	0 %	315123677
101	NC_014802	TAAGA	2	10	89223	89232	60 %	20 %	20 %	0 %	315123677
102	NC_014802	TTAAT	2	10	89532	89541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014802	TATTT	2	10	89600	89609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014802	GTATA	2	10	89616	89625	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014802	TAAAA	2	10	93392	93401	80 %	20 %	0 %	0 %	315123681
106	NC_014802	CAAAA	2	10	93925	93934	80 %	0 %	0 %	20 %	315123681
107	NC_014802	TTAAA	2	10	94358	94367	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014802	TAAAA	2	10	96635	96644	80 %	20 %	0 %	0 %	315123684
109	NC_014802	CTTGA	2	10	96669	96678	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014802	GAAAT	2	10	97512	97521	60 %	20 %	20 %	0 %	315123685
111	NC_014802	TGGTT	2	10	97696	97705	0 %	60 %	40 %	0 %	315123685
112	NC_014802	TCCAT	2	10	98309	98318	20 %	40 %	0 %	40 %	315123685
113	NC_014802	TATTT	2	10	98856	98865	20 %	80 %	0 %	0 %	315123686
114	NC_014802	TTTTA	2	10	98868	98877	20 %	80 %	0 %	0 %	315123686
115	NC_014802	TATTT	2	10	99216	99225	20 %	80 %	0 %	0 %	315123686
116	NC_014802	TTGGC	2	10	99730	99739	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014802	AAGAT	2	10	99817	99826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014802	GTAAA	2	10	101383	101392	60 %	20 %	20 %	0 %	315123688
119	NC_014802	TTATT	2	10	101533	101542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014802	AGAAT	2	10	101917	101926	60 %	20 %	20 %	0 %	315123689
121	NC_014802	TTAAA	2	10	102559	102568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014802	AAGAA	2	10	102599	102608	80 %	0 %	20 %	0 %	315123690
123	NC_014802	CCTTG	2	10	103040	103049	0 %	40 %	20 %	40 %	315123690
124	NC_014802	AGGTA	2	10	103556	103565	40 %	20 %	40 %	0 %	315123690
125	NC_014802	ACCTT	2	10	106325	106334	20 %	40 %	0 %	40 %	315123692
126	NC_014802	TATTT	2	10	106840	106849	20 %	80 %	0 %	0 %	315123693
127	NC_014802	TCAAA	2	10	106898	106907	60 %	20 %	0 %	20 %	315123693
128	NC_014802	TTAGA	2	10	107169	107178	40 %	40 %	20 %	0 %	315123693
129	NC_014802	GCTTT	2	10	107260	107269	0 %	60 %	20 %	20 %	315123694
130	NC_014802	GTTTA	2	10	107777	107786	20 %	60 %	20 %	0 %	315123694
131	NC_014802	TAAAA	2	10	107842	107851	80 %	20 %	0 %	0 %	315123694
132	NC_014802	ATGAA	2	10	107921	107930	60 %	20 %	20 %	0 %	315123695
133	NC_014802	AAATG	2	10	108027	108036	60 %	20 %	20 %	0 %	315123695
134	NC_014802	AGGCA	2	10	108663	108672	40 %	0 %	40 %	20 %	315123695
135	NC_014802	TAAAA	2	10	109026	109035	80 %	20 %	0 %	0 %	315123695
136	NC_014802	AAATT	2	10	110021	110030	60 %	40 %	0 %	0 %	315123696
137	NC_014802	AAAGC	2	10	110716	110725	60 %	0 %	20 %	20 %	315123697
138	NC_014802	CTTTG	2	10	111129	111138	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014802	AAGAA	2	10	112091	112100	80 %	0 %	20 %	0 %	315123698
140	NC_014802	TTTTG	2	10	117568	117577	0 %	80 %	20 %	0 %	315123706
141	NC_014802	ATTAA	2	10	117863	117872	60 %	40 %	0 %	0 %	315123706
142	NC_014802	ATTTC	2	10	119687	119696	20 %	60 %	0 %	20 %	315123708
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149	NC_014802	AAAAG	2	10	122707	122716	80 %	0 %	20 %	0 %	315123711
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265	NC_014802	TTTTA	2	10	243265	243274	20 %	80 %	0 %	0 %	315123841
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406	NC_014802	TGTTT	2	10	396713	396722	0 %	80 %	20 %	0 %	315123983
407	NC_014802	CTTTT	2	10	398179	398188	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
408	NC_014802	CTTTT	2	10	398350	398359	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
409	NC_014802	GGTAA	2	10	398661	398670	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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