MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 plasmid pTet

Total Repeats: 1235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014801	CAA	2	6	37248	37253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315123609
1002	NC_014801	TAG	2	6	37265	37270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123609
1003	NC_014801	TCGTT	2	10	37317	37326	0 %	60 %	20 %	20 %	315123609
1004	NC_014801	A	6	6	37380	37385	100 %	0 %	0 %	0 %	315123609
1005	NC_014801	T	6	6	37405	37410	0 %	100 %	0 %	0 %	315123609
1006	NC_014801	CTTA	2	8	37459	37466	25 %	50 %	0 %	25 %	315123609
1007	NC_014801	TA	3	6	37465	37470	50 %	50 %	0 %	0 %	315123609
1008	NC_014801	AAAG	2	8	37495	37502	75 %	0 %	25 %	0 %	315123609
1009	NC_014801	TGA	2	6	37542	37547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123609
1010	NC_014801	A	6	6	37581	37586	100 %	0 %	0 %	0 %	315123609
1011	NC_014801	A	7	7	37588	37594	100 %	0 %	0 %	0 %	315123609
1012	NC_014801	AGG	2	6	37638	37643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315123609
1013	NC_014801	TGAA	2	8	37644	37651	50 %	25 %	25 %	0 %	315123609
1014	NC_014801	TA	3	6	37661	37666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014801	A	8	8	37668	37675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014801	A	6	6	37679	37684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014801	A	6	6	37686	37691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014801	A	7	7	37709	37715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014801	A	6	6	37721	37726	100 %	0 %	0 %	0 %	315123610
1020	NC_014801	ACAA	2	8	37768	37775	75 %	0 %	0 %	25 %	315123610
1021	NC_014801	AAGG	2	8	37795	37802	50 %	0 %	50 %	0 %	315123610
1022	NC_014801	CAA	2	6	37810	37815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315123610
1023	NC_014801	TTA	2	6	37844	37849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315123610
1024	NC_014801	AAG	2	6	37850	37855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315123610
1025	NC_014801	TGC	2	6	37866	37871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315123610
1026	NC_014801	T	6	6	37892	37897	0 %	100 %	0 %	0 %	315123610
1027	NC_014801	A	6	6	37946	37951	100 %	0 %	0 %	0 %	315123610
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1030	NC_014801	AATT	2	8	38078	38085	50 %	50 %	0 %	0 %	315123610
1031	NC_014801	GAA	2	6	38167	38172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315123610
1032	NC_014801	GTT	2	6	38239	38244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315123610
1033	NC_014801	TGAAA	2	10	38253	38262	60 %	20 %	20 %	0 %	315123610
1034	NC_014801	AAC	2	6	38276	38281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315123610
1035	NC_014801	A	6	6	38315	38320	100 %	0 %	0 %	0 %	315123610
1036	NC_014801	TTA	3	9	38380	38388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014801	TTA	2	6	38390	38395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014801	ATA	2	6	38408	38413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014801	TA	3	6	38460	38465	50 %	50 %	0 %	0 %	315123611
1040	NC_014801	A	8	8	38473	38480	100 %	0 %	0 %	0 %	315123611
1041	NC_014801	TAA	2	6	38512	38517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315123611
1042	NC_014801	A	7	7	38537	38543	100 %	0 %	0 %	0 %	315123611
1043	NC_014801	AT	3	6	38651	38656	50 %	50 %	0 %	0 %	315123611
1044	NC_014801	ATATTT	2	12	38666	38677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315123611
1045	NC_014801	A	6	6	38691	38696	100 %	0 %	0 %	0 %	315123611
1046	NC_014801	ATTT	2	8	38704	38711	25 %	75 %	0 %	0 %	315123611
1047	NC_014801	AAT	2	6	38715	38720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315123611
1048	NC_014801	A	7	7	38776	38782	100 %	0 %	0 %	0 %	315123611
1049	NC_014801	GAA	3	9	38796	38804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315123611
1050	NC_014801	AT	3	6	38834	38839	50 %	50 %	0 %	0 %	315123611
1051	NC_014801	TAA	2	6	38840	38845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315123611
1052	NC_014801	A	6	6	38865	38870	100 %	0 %	0 %	0 %	315123611
1053	NC_014801	AGA	2	6	38891	38896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315123611
1054	NC_014801	TAA	2	6	38912	38917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315123611
1055	NC_014801	GAA	2	6	38925	38930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315123611
1056	NC_014801	AAG	3	9	38941	38949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315123611
1057	NC_014801	T	7	7	39005	39011	0 %	100 %	0 %	0 %	315123611
1058	NC_014801	AGT	2	6	39021	39026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123611
1059	NC_014801	A	6	6	39032	39037	100 %	0 %	0 %	0 %	315123611
1060	NC_014801	AATATC	2	12	39069	39080	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	315123611
1061	NC_014801	TAA	2	6	39104	39109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014801	TA	3	6	39110	39115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014801	TAA	2	6	39120	39125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014801	TAT	2	6	39127	39132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014801	TAA	2	6	39147	39152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014801	ATT	2	6	39196	39201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315123612
1067	NC_014801	AT	3	6	39274	39279	50 %	50 %	0 %	0 %	315123612
1068	NC_014801	ATA	2	6	39291	39296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315123612
1069	NC_014801	TTA	2	6	39297	39302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315123612
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1073	NC_014801	A	6	6	39431	39436	100 %	0 %	0 %	0 %	315123612
1074	NC_014801	ATT	2	6	39446	39451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315123612
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1086	NC_014801	AATT	2	8	39973	39980	50 %	50 %	0 %	0 %	315123612
1087	NC_014801	ATG	2	6	40218	40223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123612
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1090	NC_014801	TAT	2	6	40387	40392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315123612
1091	NC_014801	GA	3	6	40408	40413	50 %	0 %	50 %	0 %	315123612
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1093	NC_014801	AATT	2	8	40429	40436	50 %	50 %	0 %	0 %	315123612
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1098	NC_014801	A	6	6	40573	40578	100 %	0 %	0 %	0 %	315123612
1099	NC_014801	A	7	7	40614	40620	100 %	0 %	0 %	0 %	315123612
1100	NC_014801	CAAA	2	8	40622	40629	75 %	0 %	0 %	25 %	315123612
1101	NC_014801	TAC	2	6	40640	40645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315123612
1102	NC_014801	TGA	2	6	40696	40701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123612
1103	NC_014801	A	6	6	40709	40714	100 %	0 %	0 %	0 %	315123612
1104	NC_014801	GTG	2	6	40752	40757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315123612
1105	NC_014801	CAA	2	6	40773	40778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315123612
1106	NC_014801	AG	3	6	40808	40813	50 %	0 %	50 %	0 %	315123612
1107	NC_014801	TA	3	6	40814	40819	50 %	50 %	0 %	0 %	315123612
1108	NC_014801	AAGT	2	8	40821	40828	50 %	25 %	25 %	0 %	315123612
1109	NC_014801	A	6	6	40835	40840	100 %	0 %	0 %	0 %	315123612
1110	NC_014801	A	6	6	40859	40864	100 %	0 %	0 %	0 %	315123612
1111	NC_014801	TTAA	2	8	40874	40881	50 %	50 %	0 %	0 %	315123612
1112	NC_014801	TTA	2	6	40899	40904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315123612
1113	NC_014801	TGACA	2	10	40909	40918	40 %	20 %	20 %	20 %	315123612
1114	NC_014801	CAA	2	6	40934	40939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315123612
1115	NC_014801	A	6	6	40938	40943	100 %	0 %	0 %	0 %	315123612
1116	NC_014801	AAG	2	6	40963	40968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315123612
1117	NC_014801	AGA	2	6	40981	40986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315123612
1118	NC_014801	AAG	2	6	40995	41000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315123612
1119	NC_014801	AAAC	2	8	41059	41066	75 %	0 %	0 %	25 %	315123612
1120	NC_014801	GCAAT	2	10	41083	41092	40 %	20 %	20 %	20 %	315123612
1121	NC_014801	AAACA	2	10	41205	41214	80 %	0 %	0 %	20 %	315123612
1122	NC_014801	AGCA	3	12	41215	41226	50 %	0 %	25 %	25 %	315123612
1123	NC_014801	TAC	2	6	41231	41236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315123612
1124	NC_014801	GCAAT	2	10	41249	41258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1125	NC_014801	TGG	3	9	41301	41309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014801	TAT	2	6	41346	41351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014801	ATA	2	6	41373	41378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014801	TAA	2	6	41391	41396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014801	AT	4	8	41403	41410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014801	TAAT	2	8	41411	41418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1132	NC_014801	ATA	2	6	41437	41442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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