MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci RD1

Total Repeats: 2994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014796	AAGG	2	8	266	273	50 %	0 %	50 %	0 %	392376214
2	NC_014796	GCGT	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	392376214
3	NC_014796	TTAA	2	8	1353	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	392376215
4	NC_014796	AGAT	2	8	2543	2550	50 %	25 %	25 %	0 %	392376215
5	NC_014796	TGTT	2	8	2841	2848	0 %	75 %	25 %	0 %	392376216
6	NC_014796	GAAG	2	8	2952	2959	50 %	0 %	50 %	0 %	392376216
7	NC_014796	AGTA	2	8	2982	2989	50 %	25 %	25 %	0 %	392376216
8	NC_014796	TTTG	2	8	3300	3307	0 %	75 %	25 %	0 %	392376217
9	NC_014796	TCCT	2	8	3326	3333	0 %	50 %	0 %	50 %	392376217
10	NC_014796	GAAA	2	8	5255	5262	75 %	0 %	25 %	0 %	392376217
11	NC_014796	AATC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014796	CGAG	2	8	5526	5533	25 %	0 %	50 %	25 %	392376218
13	NC_014796	TAAT	2	8	6732	6739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014796	GAAT	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014796	AGAA	2	8	6964	6971	75 %	0 %	25 %	0 %	392376219
16	NC_014796	TCCC	2	8	7281	7288	0 %	25 %	0 %	75 %	392376219
17	NC_014796	GTAG	2	8	7315	7322	25 %	25 %	50 %	0 %	392376219
18	NC_014796	AATA	2	8	8012	8019	75 %	25 %	0 %	0 %	392376220
19	NC_014796	ATGA	2	8	8483	8490	50 %	25 %	25 %	0 %	392376220
20	NC_014796	TGGA	2	8	8671	8678	25 %	25 %	50 %	0 %	392376220
21	NC_014796	CTGT	2	8	8681	8688	0 %	50 %	25 %	25 %	392376220
22	NC_014796	ATTT	2	8	9403	9410	25 %	75 %	0 %	0 %	392376220
23	NC_014796	AAAG	2	8	10227	10234	75 %	0 %	25 %	0 %	392376220
24	NC_014796	AAGT	2	8	10526	10533	50 %	25 %	25 %	0 %	392376220
25	NC_014796	AGGG	2	8	10765	10772	25 %	0 %	75 %	0 %	392376220
26	NC_014796	TAAG	2	8	10775	10782	50 %	25 %	25 %	0 %	392376220
27	NC_014796	AAAG	2	8	11068	11075	75 %	0 %	25 %	0 %	392376221
28	NC_014796	AGTA	2	8	11726	11733	50 %	25 %	25 %	0 %	392376221
29	NC_014796	TCTT	2	8	12007	12014	0 %	75 %	0 %	25 %	392376221
30	NC_014796	TAAT	2	8	12148	12155	50 %	50 %	0 %	0 %	392376221
31	NC_014796	CAAA	2	8	12459	12466	75 %	0 %	0 %	25 %	392376221
32	NC_014796	AGAT	2	8	12569	12576	50 %	25 %	25 %	0 %	392376221
33	NC_014796	AAGA	2	8	12580	12587	75 %	0 %	25 %	0 %	392376221
34	NC_014796	ACTT	2	8	12702	12709	25 %	50 %	0 %	25 %	392376221
35	NC_014796	CACT	2	8	12799	12806	25 %	25 %	0 %	50 %	392376221
36	NC_014796	GCAA	2	8	13327	13334	50 %	0 %	25 %	25 %	392376221
37	NC_014796	GAAA	2	8	13747	13754	75 %	0 %	25 %	0 %	392376221
38	NC_014796	AGAT	2	8	14316	14323	50 %	25 %	25 %	0 %	392376222
39	NC_014796	TTGT	2	8	14366	14373	0 %	75 %	25 %	0 %	392376222
40	NC_014796	GGAT	2	8	14950	14957	25 %	25 %	50 %	0 %	392376222
41	NC_014796	CCCA	2	8	15421	15428	25 %	0 %	0 %	75 %	392376222
42	NC_014796	TAAA	2	8	17025	17032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014796	AGAA	2	8	17165	17172	75 %	0 %	25 %	0 %	392376224
44	NC_014796	TCTT	2	8	17435	17442	0 %	75 %	0 %	25 %	392376224
45	NC_014796	TTTC	2	8	17682	17689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014796	GTCA	2	8	17837	17844	25 %	25 %	25 %	25 %	392376225
47	NC_014796	AAGC	2	8	18228	18235	50 %	0 %	25 %	25 %	392376225
48	NC_014796	ATTA	2	8	18368	18375	50 %	50 %	0 %	0 %	392376225
49	NC_014796	ATTA	2	8	18990	18997	50 %	50 %	0 %	0 %	392376226
50	NC_014796	GTTT	2	8	19263	19270	0 %	75 %	25 %	0 %	392376226
51	NC_014796	TTTG	2	8	19503	19510	0 %	75 %	25 %	0 %	392376226
52	NC_014796	TGCC	2	8	19535	19542	0 %	25 %	25 %	50 %	392376226
53	NC_014796	GCGT	2	8	19667	19674	0 %	25 %	50 %	25 %	392376226
54	NC_014796	TGGT	2	8	20448	20455	0 %	50 %	50 %	0 %	392376227
55	NC_014796	TAAA	2	8	21088	21095	75 %	25 %	0 %	0 %	392376227
56	NC_014796	TATG	2	8	21587	21594	25 %	50 %	25 %	0 %	392376227
57	NC_014796	CAAT	2	8	22282	22289	50 %	25 %	0 %	25 %	392376228
58	NC_014796	AGAA	2	8	22699	22706	75 %	0 %	25 %	0 %	392376228
59	NC_014796	TGAT	2	8	22906	22913	25 %	50 %	25 %	0 %	392376228
60	NC_014796	AGCT	2	8	24167	24174	25 %	25 %	25 %	25 %	392376229
61	NC_014796	AAAT	2	8	24504	24511	75 %	25 %	0 %	0 %	392376229
62	NC_014796	AATT	2	8	24629	24636	50 %	50 %	0 %	0 %	392376229
63	NC_014796	ATAA	2	8	24696	24703	75 %	25 %	0 %	0 %	392376229
64	NC_014796	TTCT	2	8	24927	24934	0 %	75 %	0 %	25 %	392376229
65	NC_014796	TAGT	2	8	24985	24992	25 %	50 %	25 %	0 %	392376229
66	NC_014796	GAAC	2	8	25444	25451	50 %	0 %	25 %	25 %	392376229
67	NC_014796	ATTC	2	8	25883	25890	25 %	50 %	0 %	25 %	392376229
68	NC_014796	TTTC	2	8	26015	26022	0 %	75 %	0 %	25 %	392376229
69	NC_014796	ATAG	2	8	26110	26117	50 %	25 %	25 %	0 %	392376229
70	NC_014796	TAAA	2	8	26474	26481	75 %	25 %	0 %	0 %	392376229
71	NC_014796	ATTT	2	8	26656	26663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014796	ATTA	2	8	26667	26674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014796	CTGG	2	8	27187	27194	0 %	25 %	50 %	25 %	392376230
74	NC_014796	AATT	2	8	27960	27967	50 %	50 %	0 %	0 %	392376230
75	NC_014796	AAAT	2	8	28809	28816	75 %	25 %	0 %	0 %	392376230
76	NC_014796	GGCA	2	8	29087	29094	25 %	0 %	50 %	25 %	392376230
77	NC_014796	AGGG	2	8	29432	29439	25 %	0 %	75 %	0 %	392376231
78	NC_014796	GAAT	2	8	29626	29633	50 %	25 %	25 %	0 %	392376232
79	NC_014796	AGAA	2	8	29791	29798	75 %	0 %	25 %	0 %	392376232
80	NC_014796	ACCA	2	8	30241	30248	50 %	0 %	0 %	50 %	392376232
81	NC_014796	GTTT	2	8	31412	31419	0 %	75 %	25 %	0 %	392376234
82	NC_014796	TTTC	2	8	31652	31659	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014796	TCTA	2	8	32056	32063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014796	AATT	2	8	32380	32387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014796	TTAA	2	8	32420	32427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014796	ATTT	2	8	32435	32442	25 %	75 %	0 %	0 %	392376236
87	NC_014796	TTGT	2	8	32461	32468	0 %	75 %	25 %	0 %	392376236
88	NC_014796	TAGA	2	8	32667	32674	50 %	25 %	25 %	0 %	392376236
89	NC_014796	TTTA	2	8	33121	33128	25 %	75 %	0 %	0 %	392376236
90	NC_014796	TTAA	2	8	33516	33523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014796	AGAT	2	8	33559	33566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014796	TGAA	2	8	34018	34025	50 %	25 %	25 %	0 %	392376238
93	NC_014796	GTAC	2	8	34096	34103	25 %	25 %	25 %	25 %	392376238
94	NC_014796	GATA	2	8	34132	34139	50 %	25 %	25 %	0 %	392376238
95	NC_014796	TCTT	2	8	34392	34399	0 %	75 %	0 %	25 %	392376239
96	NC_014796	AGGA	2	8	35344	35351	50 %	0 %	50 %	0 %	392376239
97	NC_014796	TAAT	2	8	36132	36139	50 %	50 %	0 %	0 %	392376240
98	NC_014796	CGCT	2	8	36848	36855	0 %	25 %	25 %	50 %	392376240
99	NC_014796	TCAA	2	8	37781	37788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014796	AAAG	2	8	38203	38210	75 %	0 %	25 %	0 %	392376241
101	NC_014796	TAAT	2	8	38219	38226	50 %	50 %	0 %	0 %	392376241
102	NC_014796	TCAA	2	8	38355	38362	50 %	25 %	0 %	25 %	392376241
103	NC_014796	TTTA	2	8	38688	38695	25 %	75 %	0 %	0 %	392376241
104	NC_014796	CTTT	2	8	38818	38825	0 %	75 %	0 %	25 %	392376241
105	NC_014796	AGCG	2	8	39007	39014	25 %	0 %	50 %	25 %	392376241
106	NC_014796	CCTG	2	8	40303	40310	0 %	25 %	25 %	50 %	392376244
107	NC_014796	GAAA	2	8	41244	41251	75 %	0 %	25 %	0 %	392376244
108	NC_014796	AGCA	2	8	41415	41422	50 %	0 %	25 %	25 %	392376244
109	NC_014796	CTGT	2	8	41883	41890	0 %	50 %	25 %	25 %	392376244
110	NC_014796	TCTT	2	8	41923	41930	0 %	75 %	0 %	25 %	392376244
111	NC_014796	GAAG	2	8	42334	42341	50 %	0 %	50 %	0 %	392376244
112	NC_014796	AATA	2	8	42365	42372	75 %	25 %	0 %	0 %	392376244
113	NC_014796	GAAA	2	8	43502	43509	75 %	0 %	25 %	0 %	392376248
114	NC_014796	GTCG	2	8	44200	44207	0 %	25 %	50 %	25 %	392376249
115	NC_014796	TTAA	2	8	44230	44237	50 %	50 %	0 %	0 %	392376249
116	NC_014796	ATCA	2	8	44819	44826	50 %	25 %	0 %	25 %	392376249
117	NC_014796	ATGA	2	8	45097	45104	50 %	25 %	25 %	0 %	392376249
118	NC_014796	TAAA	2	8	45997	46004	75 %	25 %	0 %	0 %	392376251
119	NC_014796	GAAA	2	8	46979	46986	75 %	0 %	25 %	0 %	392376252
120	NC_014796	TCTT	2	8	47085	47092	0 %	75 %	0 %	25 %	392376252
121	NC_014796	GCTT	2	8	47614	47621	0 %	50 %	25 %	25 %	392376252
122	NC_014796	AAGA	2	8	48056	48063	75 %	0 %	25 %	0 %	392376253
123	NC_014796	TGTT	2	8	48466	48473	0 %	75 %	25 %	0 %	392376253
124	NC_014796	ATAA	2	8	49534	49541	75 %	25 %	0 %	0 %	392376254
125	NC_014796	TAAA	2	8	49703	49710	75 %	25 %	0 %	0 %	392376254
126	NC_014796	AAGC	2	8	49732	49739	50 %	0 %	25 %	25 %	392376254
127	NC_014796	CCAA	2	8	49756	49763	50 %	0 %	0 %	50 %	392376254
128	NC_014796	TTCC	2	8	49903	49910	0 %	50 %	0 %	50 %	392376254
129	NC_014796	AACA	2	8	50880	50887	75 %	0 %	0 %	25 %	392376254
130	NC_014796	AAAG	2	8	52614	52621	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014796	TTTA	2	8	52624	52631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014796	GAAG	2	8	52727	52734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014796	ATCC	2	8	53033	53040	25 %	25 %	0 %	50 %	392376255
134	NC_014796	AGCA	2	8	53325	53332	50 %	0 %	25 %	25 %	392376255
135	NC_014796	TTCA	2	8	53485	53492	25 %	50 %	0 %	25 %	392376255
136	NC_014796	GTAT	2	8	54138	54145	25 %	50 %	25 %	0 %	392376256
137	NC_014796	CATA	2	8	54333	54340	50 %	25 %	0 %	25 %	392376256
138	NC_014796	AAAG	2	8	54792	54799	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014796	TAGC	2	8	55864	55871	25 %	25 %	25 %	25 %	392376258
140	NC_014796	CTGT	2	8	56043	56050	0 %	50 %	25 %	25 %	392376258
141	NC_014796	CTTT	2	8	56433	56440	0 %	75 %	0 %	25 %	392376259
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