MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci RD1

Total Repeats: 24631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_014796	GT	3	6	119010	119015	0 %	50 %	50 %	0 %	392376325
2503	NC_014796	GTT	2	6	119076	119081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376325
2504	NC_014796	GAG	2	6	119159	119164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_014796	TTTAC	2	10	119191	119200	20 %	60 %	0 %	20 %	392376326
2506	NC_014796	AGTC	2	8	119220	119227	25 %	25 %	25 %	25 %	392376326
2507	NC_014796	ATG	2	6	119231	119236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376326
2508	NC_014796	AG	4	8	119296	119303	50 %	0 %	50 %	0 %	392376326
2509	NC_014796	ATT	2	6	119369	119374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376326
2510	NC_014796	AGA	2	6	119428	119433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376326
2511	NC_014796	ATC	2	6	119444	119449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376326
2512	NC_014796	TTA	2	6	119468	119473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376326
2513	NC_014796	ATT	2	6	119518	119523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376326
2514	NC_014796	TGG	2	6	119566	119571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392376326
2515	NC_014796	AAG	2	6	119604	119609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376326
2516	NC_014796	TAC	2	6	119707	119712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376326
2517	NC_014796	CGT	2	6	119779	119784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392376326
2518	NC_014796	AGA	2	6	119803	119808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376326
2519	NC_014796	AAG	2	6	119883	119888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376326
2520	NC_014796	A	6	6	119937	119942	100 %	0 %	0 %	0 %	392376326
2521	NC_014796	GAA	2	6	119950	119955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376326
2522	NC_014796	GAA	2	6	119966	119971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376326
2523	NC_014796	TTC	2	6	120006	120011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376326
2524	NC_014796	AGTT	2	8	120015	120022	25 %	50 %	25 %	0 %	392376326
2525	NC_014796	TTA	2	6	120105	120110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376326
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2527	NC_014796	AGAA	2	8	120322	120329	75 %	0 %	25 %	0 %	392376327
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2529	NC_014796	AGAA	2	8	120402	120409	75 %	0 %	25 %	0 %	392376327
2530	NC_014796	ACT	2	6	120415	120420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376327
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2532	NC_014796	GAT	2	6	120459	120464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376327
2533	NC_014796	AAG	2	6	120548	120553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376327
2534	NC_014796	GGT	2	6	120568	120573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392376327
2535	NC_014796	TGG	2	6	120654	120659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392376327
2536	NC_014796	TAT	2	6	120714	120719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376327
2537	NC_014796	T	8	8	120743	120750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_014796	ACT	2	6	120760	120765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_014796	TTC	2	6	120845	120850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376328
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2542	NC_014796	A	6	6	121077	121082	100 %	0 %	0 %	0 %	392376328
2543	NC_014796	TAC	2	6	121229	121234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376328
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2545	NC_014796	ACC	2	6	121299	121304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392376328
2546	NC_014796	CGC	2	6	121310	121315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392376328
2547	NC_014796	CA	3	6	121322	121327	50 %	0 %	0 %	50 %	392376328
2548	NC_014796	A	7	7	121349	121355	100 %	0 %	0 %	0 %	392376328
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2554	NC_014796	TTC	2	6	121646	121651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376328
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2560	NC_014796	CTG	2	6	121981	121986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392376329
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2562	NC_014796	AGC	2	6	122099	122104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392376329
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2585	NC_014796	AGT	2	6	122675	122680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2588	NC_014796	AAT	2	6	122772	122777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_014796	ATT	2	6	122792	122797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_014796	TGG	2	6	122805	122810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_014796	CTTTT	2	10	122882	122891	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2592	NC_014796	AAAG	2	8	122935	122942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_014796	T	6	6	122951	122956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_014796	T	6	6	122969	122974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_014796	T	6	6	123022	123027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_014796	TTTCTT	2	12	123040	123051	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2597	NC_014796	TAAT	2	8	123104	123111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2601	NC_014796	AAC	2	6	123324	123329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376330
2602	NC_014796	AGCA	2	8	123354	123361	50 %	0 %	25 %	25 %	392376330
2603	NC_014796	TCCT	2	8	123363	123370	0 %	50 %	0 %	50 %	392376330
2604	NC_014796	AGAA	2	8	123420	123427	75 %	0 %	25 %	0 %	392376330
2605	NC_014796	GAGAT	2	10	123438	123447	40 %	20 %	40 %	0 %	392376330
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2609	NC_014796	CAA	2	6	123581	123586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376330
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2614	NC_014796	TA	4	8	124061	124068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_014796	TTG	2	6	124199	124204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376331
2616	NC_014796	AGC	2	6	124205	124210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392376331
2617	NC_014796	AGC	2	6	124283	124288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392376331
2618	NC_014796	GAG	2	6	124400	124405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392376331
2619	NC_014796	GCT	3	9	124417	124425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392376331
2620	NC_014796	AG	3	6	124469	124474	50 %	0 %	50 %	0 %	392376331
2621	NC_014796	TGT	2	6	124476	124481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376331
2622	NC_014796	TGCATT	2	12	124581	124592	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	392376331
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2999	NC_014796	T	6	6	143140	143145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3000	NC_014796	ATG	2	6	143227	143232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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