MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Liberibacter solanacearum CLso-ZC1 chromosome

Total Repeats: 30837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014774	T	6	6	191073	191078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_014774	ATCA	2	8	191099	191106	50 %	25 %	0 %	25 %	315121938
4503	NC_014774	TCT	3	9	191135	191143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121938
4504	NC_014774	TTG	3	9	191193	191201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121938
4505	NC_014774	CTTCA	2	10	191259	191268	20 %	40 %	0 %	40 %	315121938
4506	NC_014774	TATCAA	2	12	191330	191341	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	315121938
4507	NC_014774	GAA	2	6	191405	191410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121938
4508	NC_014774	TTG	2	6	191430	191435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121938
4509	NC_014774	TTGTG	2	10	191515	191524	0 %	60 %	40 %	0 %	315121938
4510	NC_014774	ATC	2	6	191551	191556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121938
4511	NC_014774	CCT	2	6	191581	191586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121938
4512	NC_014774	TC	4	8	191612	191619	0 %	50 %	0 %	50 %	315121938
4513	NC_014774	TCT	2	6	191621	191626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121938
4514	NC_014774	CAG	2	6	191682	191687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121938
4515	NC_014774	CTC	2	6	191724	191729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121938
4516	NC_014774	AAAG	2	8	191872	191879	75 %	0 %	25 %	0 %	315121938
4517	NC_014774	TTCG	2	8	191898	191905	0 %	50 %	25 %	25 %	315121938
4518	NC_014774	TCA	2	6	191968	191973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121938
4519	NC_014774	AAT	2	6	191994	191999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121938
4520	NC_014774	AGT	2	6	192009	192014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121938
4521	NC_014774	A	6	6	192030	192035	100 %	0 %	0 %	0 %	315121938
4522	NC_014774	TCA	2	6	192043	192048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121938
4523	NC_014774	TCTT	2	8	192088	192095	0 %	75 %	0 %	25 %	315121938
4524	NC_014774	ATGA	2	8	192126	192133	50 %	25 %	25 %	0 %	315121938
4525	NC_014774	TTCT	2	8	192150	192157	0 %	75 %	0 %	25 %	315121938
4526	NC_014774	CCA	2	6	192208	192213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121938
4527	NC_014774	TGA	2	6	192265	192270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121938
4528	NC_014774	TCA	2	6	192337	192342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121938
4529	NC_014774	CAA	2	6	192380	192385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121938
4530	NC_014774	T	7	7	192485	192491	0 %	100 %	0 %	0 %	315121938
4531	NC_014774	TCC	2	6	192502	192507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121938
4532	NC_014774	AAAG	2	8	192512	192519	75 %	0 %	25 %	0 %	315121938
4533	NC_014774	A	7	7	192531	192537	100 %	0 %	0 %	0 %	315121938
4534	NC_014774	TAA	2	6	192575	192580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121938
4535	NC_014774	GAA	2	6	192583	192588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121938
4536	NC_014774	AG	3	6	192597	192602	50 %	0 %	50 %	0 %	315121938
4537	NC_014774	AGA	2	6	192670	192675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121938
4538	NC_014774	CTC	2	6	192684	192689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121938
4539	NC_014774	CTCTT	2	10	192705	192714	0 %	60 %	0 %	40 %	315121938
4540	NC_014774	ATT	2	6	192759	192764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121938
4541	NC_014774	GCGG	3	12	192798	192809	0 %	0 %	75 %	25 %	315121939
4542	NC_014774	TCCCTC	2	12	192858	192869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121939
4543	NC_014774	TTA	2	6	192915	192920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121939
4544	NC_014774	TTA	2	6	192927	192932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121939
4545	NC_014774	CAC	2	6	192982	192987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121939
4546	NC_014774	TAA	2	6	192989	192994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121939
4547	NC_014774	CCGC	2	8	192996	193003	0 %	0 %	25 %	75 %	315121939
4548	NC_014774	C	6	6	193009	193014	0 %	0 %	0 %	100 %	315121939
4549	NC_014774	ACC	2	6	193019	193024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121939
4550	NC_014774	TGT	2	6	193089	193094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121939
4551	NC_014774	CAA	2	6	193121	193126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121940
4552	NC_014774	AAT	2	6	193223	193228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121940
4553	NC_014774	ATA	3	9	193470	193478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121940
4554	NC_014774	ACG	2	6	193614	193619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121940
4555	NC_014774	CAACA	2	10	193620	193629	60 %	0 %	0 %	40 %	315121940
4556	NC_014774	CT	3	6	193701	193706	0 %	50 %	0 %	50 %	315121940
4557	NC_014774	CTT	2	6	193715	193720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121940
4558	NC_014774	TGT	2	6	193756	193761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121940
4559	NC_014774	TTA	2	6	193817	193822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121940
4560	NC_014774	TATC	2	8	193865	193872	25 %	50 %	0 %	25 %	315121940
4561	NC_014774	TCT	2	6	193888	193893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121940
4562	NC_014774	AT	3	6	193907	193912	50 %	50 %	0 %	0 %	315121940
4563	NC_014774	AACC	2	8	193918	193925	50 %	0 %	0 %	50 %	315121940
4564	NC_014774	CCG	2	6	193932	193937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315121940
4565	NC_014774	A	6	6	193983	193988	100 %	0 %	0 %	0 %	315121940
4566	NC_014774	ATG	2	6	194064	194069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121940
4567	NC_014774	TCC	2	6	194092	194097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121940
4568	NC_014774	CA	3	6	194170	194175	50 %	0 %	0 %	50 %	315121940
4569	NC_014774	ACTT	2	8	194237	194244	25 %	50 %	0 %	25 %	315121940
4570	NC_014774	GGTCG	2	10	194311	194320	0 %	20 %	60 %	20 %	315121940
4571	NC_014774	CAT	2	6	194334	194339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121940
4572	NC_014774	GTT	2	6	194353	194358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121940
4573	NC_014774	CAGT	2	8	194431	194438	25 %	25 %	25 %	25 %	315121940
4574	NC_014774	TTCGC	2	10	194503	194512	0 %	40 %	20 %	40 %	315121940
4575	NC_014774	GTC	2	6	194559	194564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315121940
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4577	NC_014774	TA	3	6	194724	194729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_014774	CTC	2	6	194739	194744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_014774	G	6	6	194747	194752	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_014774	CAAAA	2	10	194765	194774	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4581	NC_014774	A	8	8	194771	194778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_014774	TAG	2	6	194853	194858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121941
4583	NC_014774	ACTTA	2	10	194872	194881	40 %	40 %	0 %	20 %	315121941
4584	NC_014774	TTG	2	6	194935	194940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121941
4585	NC_014774	TTC	2	6	194946	194951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121941
4586	NC_014774	TCT	2	6	195105	195110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121941
4587	NC_014774	CTT	2	6	195111	195116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121941
4588	NC_014774	CTT	2	6	195196	195201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121941
4589	NC_014774	GTC	2	6	195205	195210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315121941
4590	NC_014774	TTA	2	6	195311	195316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121941
4591	NC_014774	ATA	2	6	195361	195366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_014774	ATAG	2	8	195379	195386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_014774	T	6	6	195404	195409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_014774	A	6	6	195559	195564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_014774	AAG	2	6	195600	195605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_014774	AGT	2	6	195631	195636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_014774	GTG	2	6	195641	195646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_014774	TAA	2	6	195661	195666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_014774	A	6	6	195665	195670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_014774	ATC	2	6	195684	195689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_014774	T	7	7	195716	195722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_014774	GGT	2	6	195725	195730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_014774	ACT	2	6	195800	195805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_014774	AG	3	6	195808	195813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_014774	GGT	2	6	195821	195826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_014774	A	7	7	195868	195874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_014774	GT	3	6	195891	195896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_014774	AT	3	6	195905	195910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_014774	GTA	2	6	195911	195916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_014774	AGA	2	6	195929	195934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_014774	TGAT	2	8	195972	195979	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_014774	T	7	7	195989	195995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_014774	A	6	6	196075	196080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_014774	TTTTAA	2	12	196099	196110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_014774	A	8	8	196147	196154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_014774	TTG	2	6	196200	196205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_014774	ATC	2	6	196222	196227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_014774	CTCC	2	8	196230	196237	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4619	NC_014774	GCGT	2	8	196282	196289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4620	NC_014774	CTA	2	6	196332	196337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_014774	TCC	2	6	196352	196357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_014774	CTA	2	6	196503	196508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121942
4623	NC_014774	GATT	2	8	196540	196547	25 %	50 %	25 %	0 %	315121942
4624	NC_014774	TGATT	5	25	196543	196567	20 %	60 %	20 %	0 %	315121942
4625	NC_014774	TGCTT	3	15	196568	196582	0 %	60 %	20 %	20 %	315121942
4626	NC_014774	T	6	6	196594	196599	0 %	100 %	0 %	0 %	315121942
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