MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 plasmid pCALNI01

Total Repeats: 742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014749	TTA	2	6	44	49	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014749	GGA	2	6	372	377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014749	GTC	2	6	381	386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014749	GTA	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014749	CTG	2	6	555	560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014749	TGG	2	6	831	836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313652021
7	NC_014749	CTG	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014749	TTA	2	6	1194	1199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014749	TGA	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014749	ATT	2	6	1381	1386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014749	TTC	2	6	1432	1437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014749	TAA	2	6	1454	1459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014749	AGA	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014749	ACT	2	6	1516	1521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014749	ATC	3	9	1694	1702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014749	TCC	2	6	1739	1744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014749	GAA	2	6	1851	1856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652022
18	NC_014749	TCT	2	6	1885	1890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652022
19	NC_014749	GAT	2	6	2044	2049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313652022
20	NC_014749	CTT	2	6	2063	2068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652022
21	NC_014749	ATA	2	6	2426	2431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313652022
22	NC_014749	TAC	2	6	2486	2491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313652022
23	NC_014749	TGT	2	6	2657	2662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313652022
24	NC_014749	TGC	2	6	2670	2675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313652022
25	NC_014749	TGT	2	6	2721	2726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313652022
26	NC_014749	AGA	2	6	2793	2798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652022
27	NC_014749	TCC	2	6	2814	2819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313652022
28	NC_014749	CTA	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313652022
29	NC_014749	TAT	2	6	2883	2888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313652022
30	NC_014749	TAT	2	6	2901	2906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313652022
31	NC_014749	CTT	3	9	2915	2923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652022
32	NC_014749	TTG	2	6	2935	2940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313652022
33	NC_014749	TAA	2	6	2964	2969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313652022
34	NC_014749	TCT	2	6	3004	3009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652022
35	NC_014749	TTC	2	6	3102	3107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652022
36	NC_014749	TTC	3	9	3123	3131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652022
37	NC_014749	TTC	3	9	3186	3194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652022
38	NC_014749	TCT	2	6	3251	3256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652022
39	NC_014749	TTC	2	6	3345	3350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652022
40	NC_014749	TAA	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313652022
41	NC_014749	TAC	2	6	3940	3945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313652023
42	NC_014749	TCT	2	6	3951	3956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652023
43	NC_014749	CTT	2	6	3984	3989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652023
44	NC_014749	ATG	2	6	4021	4026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313652023
45	NC_014749	TAG	2	6	4114	4119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313652023
46	NC_014749	CTT	2	6	4162	4167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652023
47	NC_014749	TTC	2	6	4175	4180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652023
48	NC_014749	CTG	2	6	4401	4406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313652023
49	NC_014749	ATC	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313652023
50	NC_014749	TTC	2	6	4430	4435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652023
51	NC_014749	TAA	2	6	4564	4569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313652023
52	NC_014749	TCT	2	6	4617	4622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652023
53	NC_014749	CTA	2	6	4675	4680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313652023
54	NC_014749	TGT	2	6	4729	4734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313652023
55	NC_014749	GAT	2	6	4848	4853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313652023
56	NC_014749	CTT	2	6	5074	5079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652023
57	NC_014749	TCT	2	6	5109	5114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652023
58	NC_014749	CTA	2	6	5227	5232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313652023
59	NC_014749	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652023
60	NC_014749	TGC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313652023
61	NC_014749	TCA	2	6	5517	5522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313652023
62	NC_014749	TCA	2	6	5577	5582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313652023
63	NC_014749	CAG	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313652023
64	NC_014749	TCG	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313652023
65	NC_014749	TGC	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313652023
66	NC_014749	TAA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313652023
67	NC_014749	GAT	2	6	5739	5744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313652023
68	NC_014749	GTT	2	6	5812	5817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313652023
69	NC_014749	CTA	2	6	5899	5904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313652023
70	NC_014749	CTC	2	6	5947	5952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014749	TCT	2	6	6030	6035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652024
72	NC_014749	ATT	2	6	6140	6145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313652024
73	NC_014749	ATA	3	9	6285	6293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313652024
74	NC_014749	GCT	3	9	6342	6350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313652024
75	NC_014749	AGA	2	6	6464	6469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652024
76	NC_014749	CAT	2	6	6499	6504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313652024
77	NC_014749	AAT	2	6	6506	6511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313652024
78	NC_014749	ACC	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313652024
79	NC_014749	AAT	2	6	6625	6630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313652024
80	NC_014749	ATC	2	6	6642	6647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313652024
81	NC_014749	ATT	2	6	6810	6815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313652024
82	NC_014749	CTT	2	6	6952	6957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652024
83	NC_014749	TTG	2	6	7182	7187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313652024
84	NC_014749	CCA	2	6	7222	7227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313652024
85	NC_014749	CAG	2	6	7231	7236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313652024
86	NC_014749	TCT	2	6	7309	7314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652024
87	NC_014749	GCT	2	6	7472	7477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313652024
88	NC_014749	TAT	2	6	7499	7504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313652024
89	NC_014749	TCT	2	6	7533	7538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652024
90	NC_014749	TCA	2	6	7545	7550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313652024
91	NC_014749	CCA	2	6	7630	7635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313652024
92	NC_014749	TAA	3	9	7869	7877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014749	GAT	2	6	7888	7893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014749	TGA	2	6	7986	7991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313652025
95	NC_014749	TTA	2	6	8032	8037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313652025
96	NC_014749	ATT	2	6	8152	8157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014749	GAA	2	6	8204	8209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652026
98	NC_014749	GTT	2	6	8212	8217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313652026
99	NC_014749	GAA	2	6	8542	8547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652026
100	NC_014749	AGA	2	6	8565	8570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652026
101	NC_014749	AAT	2	6	8582	8587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313652026
102	NC_014749	ATT	2	6	8680	8685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313652027
103	NC_014749	AAG	2	6	8791	8796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652027
104	NC_014749	AGT	2	6	8819	8824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313652027
105	NC_014749	ATT	2	6	8879	8884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313652027
106	NC_014749	AGA	2	6	8890	8895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652027
107	NC_014749	TAA	2	6	9158	9163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313652027
108	NC_014749	ATT	2	6	9343	9348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313652027
109	NC_014749	GAA	2	6	9511	9516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652027
110	NC_014749	ATT	2	6	9533	9538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313652027
111	NC_014749	GTA	2	6	9559	9564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313652027
112	NC_014749	CTG	2	6	9620	9625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313652027
113	NC_014749	GGA	2	6	9707	9712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313652027
114	NC_014749	TCT	2	6	9724	9729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652027
115	NC_014749	TTA	2	6	9807	9812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014749	TAG	2	6	9823	9828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014749	ATA	2	6	9833	9838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014749	ATT	2	6	10040	10045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014749	ATT	2	6	10050	10055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014749	ATT	2	6	10110	10115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313652028
121	NC_014749	CTT	2	6	10137	10142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652028
122	NC_014749	CAG	2	6	10158	10163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313652028
123	NC_014749	TAA	2	6	10306	10311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313652028
124	NC_014749	TGT	2	6	10332	10337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313652028
125	NC_014749	TAG	2	6	10428	10433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014749	GTA	2	6	10475	10480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014749	CAA	2	6	10489	10494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014749	AAT	2	6	10533	10538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014749	AAT	2	6	10754	10759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014749	AGA	2	6	10787	10792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014749	TGA	2	6	10822	10827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014749	TAT	2	6	11116	11121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014749	AGA	2	6	11181	11186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652029
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250	NC_014749	ATT	2	6	21185	21190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_014749	ACT	2	6	21923	21928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_014749	CTT	2	6	21967	21972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_014749	ATG	2	6	22178	22183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_014749	TCT	2	6	22791	22796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652037
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372	NC_014749	ATT	2	6	30959	30964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_014749	ATA	2	6	31514	31519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313652045
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