MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 chromosome

Total Repeats: 2580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014720	GGAAA	2	10	752	761	60 %	0 %	40 %	0 %	312621128
2	NC_014720	AGGCG	2	10	1312	1321	20 %	0 %	60 %	20 %	312621128
3	NC_014720	TAAAA	2	10	2200	2209	80 %	20 %	0 %	0 %	312621130
4	NC_014720	CTTCT	2	10	2908	2917	0 %	60 %	0 %	40 %	312621131
5	NC_014720	TTTAG	2	10	3414	3423	20 %	60 %	20 %	0 %	312621131
6	NC_014720	CTTCT	2	10	3658	3667	0 %	60 %	0 %	40 %	312621131
7	NC_014720	GACAG	2	10	4704	4713	40 %	0 %	40 %	20 %	312621133
8	NC_014720	CAAGG	2	10	7525	7534	40 %	0 %	40 %	20 %	312621136
9	NC_014720	AAAAG	2	10	8143	8152	80 %	0 %	20 %	0 %	312621136
10	NC_014720	AGACA	2	10	8947	8956	60 %	0 %	20 %	20 %	312621136
11	NC_014720	AATTG	2	10	9367	9376	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014720	TGTCA	2	10	9518	9527	20 %	40 %	20 %	20 %	312621137
13	NC_014720	AAATT	2	10	9865	9874	60 %	40 %	0 %	0 %	312621137
14	NC_014720	GTATT	2	10	10046	10055	20 %	60 %	20 %	0 %	312621137
15	NC_014720	CAAAT	2	10	10073	10082	60 %	20 %	0 %	20 %	312621137
16	NC_014720	GTTTT	2	10	11194	11203	0 %	80 %	20 %	0 %	312621137
17	NC_014720	ATTCA	2	10	11825	11834	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014720	TGGTT	2	10	13292	13301	0 %	60 %	40 %	0 %	312621140
19	NC_014720	ACCAA	2	10	13328	13337	60 %	0 %	0 %	40 %	312621140
20	NC_014720	GATAA	2	10	13881	13890	60 %	20 %	20 %	0 %	312621140
21	NC_014720	GTAAT	2	10	18073	18082	40 %	40 %	20 %	0 %	312621140
22	NC_014720	AGATT	2	10	18676	18685	40 %	40 %	20 %	0 %	312621140
23	NC_014720	TAATT	2	10	18956	18965	40 %	60 %	0 %	0 %	312621140
24	NC_014720	GTAAT	2	10	19327	19336	40 %	40 %	20 %	0 %	312621140
25	NC_014720	TAAAT	2	10	19907	19916	60 %	40 %	0 %	0 %	312621140
26	NC_014720	GTAAT	2	10	20647	20656	40 %	40 %	20 %	0 %	312621140
27	NC_014720	AGAAC	2	10	21558	21567	60 %	0 %	20 %	20 %	312621140
28	NC_014720	TTAAG	2	10	22729	22738	40 %	40 %	20 %	0 %	312621141
29	NC_014720	CATTT	2	10	23818	23827	20 %	60 %	0 %	20 %	312621142
30	NC_014720	AATGG	2	10	24308	24317	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014720	ATCTC	2	10	25357	25366	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_014720	TGTCA	2	10	27427	27436	20 %	40 %	20 %	20 %	312621143
33	NC_014720	CCTAT	2	10	27803	27812	20 %	40 %	0 %	40 %	312621143
34	NC_014720	AAAAT	2	10	28496	28505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014720	GCTGA	2	10	28793	28802	20 %	20 %	40 %	20 %	312621144
36	NC_014720	CATTT	2	10	30352	30361	20 %	60 %	0 %	20 %	312621145
37	NC_014720	AATTT	2	10	30518	30527	40 %	60 %	0 %	0 %	312621145
38	NC_014720	AATCA	2	10	30889	30898	60 %	20 %	0 %	20 %	312621145
39	NC_014720	TTTTC	2	10	31303	31312	0 %	80 %	0 %	20 %	312621145
40	NC_014720	GCATT	2	10	31708	31717	20 %	40 %	20 %	20 %	312621146
41	NC_014720	TCAAT	2	10	33938	33947	40 %	40 %	0 %	20 %	312621146
42	NC_014720	ATTTT	2	10	34693	34702	20 %	80 %	0 %	0 %	312621146
43	NC_014720	TAATA	2	10	35868	35877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014720	ACACT	2	10	36760	36769	40 %	20 %	0 %	40 %	312621148
45	NC_014720	AAGGC	2	10	37335	37344	40 %	0 %	40 %	20 %	312621148
46	NC_014720	GCAAT	2	10	38544	38553	40 %	20 %	20 %	20 %	312621149
47	NC_014720	GGGAA	2	10	38925	38934	40 %	0 %	60 %	0 %	312621150
48	NC_014720	TAAAA	2	10	41315	41324	80 %	20 %	0 %	0 %	312621150
49	NC_014720	ATTAA	2	10	48420	48429	60 %	40 %	0 %	0 %	312621154
50	NC_014720	GATTT	2	10	49438	49447	20 %	60 %	20 %	0 %	312621155
51	NC_014720	AATAG	2	10	49549	49558	60 %	20 %	20 %	0 %	312621155
52	NC_014720	AAAGA	2	10	50520	50529	80 %	0 %	20 %	0 %	312621155
53	NC_014720	TTAAC	2	10	50575	50584	40 %	40 %	0 %	20 %	312621155
54	NC_014720	CAAAA	2	10	50594	50603	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014720	ATAAA	2	10	50629	50638	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014720	CAAAA	2	10	51516	51525	80 %	0 %	0 %	20 %	312621156
57	NC_014720	TGTTT	2	10	52020	52029	0 %	80 %	20 %	0 %	312621156
58	NC_014720	TCAAG	2	10	52241	52250	40 %	20 %	20 %	20 %	312621156
59	NC_014720	CAAGC	2	10	53616	53625	40 %	0 %	20 %	40 %	312621157
60	NC_014720	CATTT	2	10	55166	55175	20 %	60 %	0 %	20 %	312621159
61	NC_014720	TAACT	2	10	56743	56752	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014720	CATTA	2	10	57234	57243	40 %	40 %	0 %	20 %	312621161
63	NC_014720	GAAAA	2	10	57460	57469	80 %	0 %	20 %	0 %	312621161
64	NC_014720	AACAG	2	10	58889	58898	60 %	0 %	20 %	20 %	312621162
65	NC_014720	GAAAA	2	10	60915	60924	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014720	CATTT	2	10	61374	61383	20 %	60 %	0 %	20 %	312621163
67	NC_014720	ATGCC	2	10	61819	61828	20 %	20 %	20 %	40 %	312621163
68	NC_014720	TAAAA	2	10	63074	63083	80 %	20 %	0 %	0 %	312621165
69	NC_014720	TTGGG	2	10	64043	64052	0 %	40 %	60 %	0 %	312621166
70	NC_014720	AAAAT	2	10	64578	64587	80 %	20 %	0 %	0 %	312621166
71	NC_014720	ATTCA	2	10	66370	66379	40 %	40 %	0 %	20 %	312621167
72	NC_014720	AAATG	2	10	66963	66972	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014720	TGGAT	2	10	67460	67469	20 %	40 %	40 %	0 %	312621168
74	NC_014720	ACGAT	2	10	67627	67636	40 %	20 %	20 %	20 %	312621168
75	NC_014720	ACAAA	2	10	68178	68187	80 %	0 %	0 %	20 %	312621169
76	NC_014720	CAAAA	2	10	68479	68488	80 %	0 %	0 %	20 %	312621169
77	NC_014720	AAAGG	2	10	70704	70713	60 %	0 %	40 %	0 %	312621171
78	NC_014720	GTAAT	2	10	71234	71243	40 %	40 %	20 %	0 %	312621171
79	NC_014720	AAATT	2	10	72333	72342	60 %	40 %	0 %	0 %	312621172
80	NC_014720	TTACT	2	10	73425	73434	20 %	60 %	0 %	20 %	312621173
81	NC_014720	AATAA	2	10	74942	74951	80 %	20 %	0 %	0 %	312621174
82	NC_014720	AAACA	2	10	75150	75159	80 %	0 %	0 %	20 %	312621175
83	NC_014720	GCAAG	2	10	75395	75404	40 %	0 %	40 %	20 %	312621175
84	NC_014720	ATTTA	2	10	76104	76113	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014720	GGAAG	2	10	76238	76247	40 %	0 %	60 %	0 %	312621177
86	NC_014720	TTTTC	2	10	76502	76511	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014720	ATATC	2	10	79107	79116	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014720	GAAAA	2	10	82196	82205	80 %	0 %	20 %	0 %	312621182
89	NC_014720	AAAAC	2	10	82261	82270	80 %	0 %	0 %	20 %	312621182
90	NC_014720	CAGAA	2	10	82332	82341	60 %	0 %	20 %	20 %	312621182
91	NC_014720	TTTTG	2	10	83337	83346	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014720	AATTA	2	10	83974	83983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014720	AAGAG	2	10	84562	84571	60 %	0 %	40 %	0 %	312621184
94	NC_014720	TATTT	2	10	85248	85257	20 %	80 %	0 %	0 %	312621185
95	NC_014720	TAGCA	2	10	85692	85701	40 %	20 %	20 %	20 %	312621185
96	NC_014720	GGTAT	2	10	85729	85738	20 %	40 %	40 %	0 %	312621185
97	NC_014720	CAAGG	2	10	86304	86313	40 %	0 %	40 %	20 %	312621185
98	NC_014720	TTAAC	2	10	86601	86610	40 %	40 %	0 %	20 %	312621186
99	NC_014720	TACCA	2	10	90018	90027	40 %	20 %	0 %	40 %	312621189
100	NC_014720	TGAAA	2	10	90338	90347	60 %	20 %	20 %	0 %	312621190
101	NC_014720	ATTAC	2	10	91520	91529	40 %	40 %	0 %	20 %	312621191
102	NC_014720	CAAAC	2	10	91847	91856	60 %	0 %	0 %	40 %	312621191
103	NC_014720	TTTTA	2	10	94095	94104	20 %	80 %	0 %	0 %	312621192
104	NC_014720	AAAAG	2	10	95840	95849	80 %	0 %	20 %	0 %	312621193
105	NC_014720	TAAAA	2	10	97766	97775	80 %	20 %	0 %	0 %	312621194
106	NC_014720	GTGTT	2	10	97978	97987	0 %	60 %	40 %	0 %	312621194
107	NC_014720	CCAGA	2	10	98151	98160	40 %	0 %	20 %	40 %	312621194
108	NC_014720	AAGAA	2	10	98372	98381	80 %	0 %	20 %	0 %	312621194
109	NC_014720	GAATT	2	10	99442	99451	40 %	40 %	20 %	0 %	312621194
110	NC_014720	CAAGG	2	10	101084	101093	40 %	0 %	40 %	20 %	312621194
111	NC_014720	GATGT	2	10	102697	102706	20 %	40 %	40 %	0 %	312621195
112	NC_014720	AAGAA	2	10	103688	103697	80 %	0 %	20 %	0 %	312621195
113	NC_014720	TTTAG	2	10	105906	105915	20 %	60 %	20 %	0 %	312621196
114	NC_014720	TTTTC	2	10	106188	106197	0 %	80 %	0 %	20 %	312621196
115	NC_014720	ATTTT	2	10	107489	107498	20 %	80 %	0 %	0 %	312621197
116	NC_014720	AAAAC	2	10	107582	107591	80 %	0 %	0 %	20 %	312621197
117	NC_014720	ACAAA	2	10	108139	108148	80 %	0 %	0 %	20 %	312621198
118	NC_014720	TAACA	2	10	109583	109592	60 %	20 %	0 %	20 %	312621199
119	NC_014720	CATGG	2	10	109988	109997	20 %	20 %	40 %	20 %	312621199
120	NC_014720	GTTTG	2	10	110348	110357	0 %	60 %	40 %	0 %	312621200
121	NC_014720	TTTTA	2	10	110681	110690	20 %	80 %	0 %	0 %	312621200
122	NC_014720	GAGCT	2	10	110929	110938	20 %	20 %	40 %	20 %	312621200
123	NC_014720	ACAAA	2	10	111150	111159	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014720	TTTGT	2	10	111527	111536	0 %	80 %	20 %	0 %	312621201
125	NC_014720	GATAA	2	10	111602	111611	60 %	20 %	20 %	0 %	312621201
126	NC_014720	CAGAG	2	10	113012	113021	40 %	0 %	40 %	20 %	312621201
127	NC_014720	TAGTT	2	10	113425	113434	20 %	60 %	20 %	0 %	312621201
128	NC_014720	TAAAA	2	10	114405	114414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014720	GAAGG	2	10	114782	114791	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014720	TATTG	2	10	115015	115024	20 %	60 %	20 %	0 %	312621202
131	NC_014720	ATAAA	2	10	117078	117087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014720	AGGAA	2	10	117196	117205	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014720	CAAAA	2	10	117373	117382	80 %	0 %	0 %	20 %	312621204
134	NC_014720	TTCTA	2	10	117435	117444	20 %	60 %	0 %	20 %	312621204
135	NC_014720	TATAT	2	10	117769	117778	40 %	60 %	0 %	0 %	312621205
136	NC_014720	GGATA	2	10	117787	117796	40 %	20 %	40 %	0 %	312621205
137	NC_014720	TTATT	2	10	118410	118419	20 %	80 %	0 %	0 %	312621206
138	NC_014720	TTTGC	2	10	123575	123584	0 %	60 %	20 %	20 %	312621209
139	NC_014720	ATTTA	2	10	126190	126199	40 %	60 %	0 %	0 %	312621210
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267	NC_014720	AAAAG	2	10	271610	271619	80 %	0 %	20 %	0 %	312621303
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