MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 chromosome

Total Repeats: 66536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_014720	TCA	2	6	162332	162337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621233
4003	NC_014720	ATT	2	6	162389	162394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621233
4004	NC_014720	TGC	2	6	162426	162431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621233
4005	NC_014720	AT	4	8	162440	162447	50 %	50 %	0 %	0 %	312621233
4006	NC_014720	GTG	2	6	162461	162466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621233
4007	NC_014720	TACT	2	8	162540	162547	25 %	50 %	0 %	25 %	312621233
4008	NC_014720	CTG	2	6	162560	162565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621233
4009	NC_014720	AGA	2	6	162594	162599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621233
4010	NC_014720	ACA	2	6	162610	162615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621233
4011	NC_014720	GAAA	2	8	162742	162749	75 %	0 %	25 %	0 %	312621233
4012	NC_014720	GTTA	2	8	162790	162797	25 %	50 %	25 %	0 %	312621233
4013	NC_014720	GCA	2	6	162856	162861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621233
4014	NC_014720	TA	3	6	162937	162942	50 %	50 %	0 %	0 %	312621233
4015	NC_014720	AAC	2	6	163099	163104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621233
4016	NC_014720	CTT	2	6	163144	163149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621233
4017	NC_014720	AAG	2	6	163152	163157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621233
4018	NC_014720	GGT	2	6	163177	163182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621233
4019	NC_014720	TGG	2	6	163242	163247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621233
4020	NC_014720	CAA	2	6	163268	163273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621233
4021	NC_014720	ATC	2	6	163324	163329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621233
4022	NC_014720	TGA	2	6	163368	163373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621233
4023	NC_014720	CAT	2	6	163412	163417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621233
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4028	NC_014720	ACC	2	6	163537	163542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312621233
4029	NC_014720	TA	3	6	163549	163554	50 %	50 %	0 %	0 %	312621233
4030	NC_014720	TGC	2	6	163557	163562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621233
4031	NC_014720	CTT	2	6	163655	163660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621233
4032	NC_014720	GCA	2	6	163696	163701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621233
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4034	NC_014720	AAC	2	6	163806	163811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621233
4035	NC_014720	CAG	2	6	163835	163840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621233
4036	NC_014720	AGAAA	2	10	163884	163893	80 %	0 %	20 %	0 %	312621233
4037	NC_014720	TA	3	6	163912	163917	50 %	50 %	0 %	0 %	312621233
4038	NC_014720	ATG	2	6	163928	163933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621233
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4040	NC_014720	CCAT	2	8	164105	164112	25 %	25 %	0 %	50 %	312621233
4041	NC_014720	TGC	2	6	164127	164132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621233
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4043	NC_014720	ATG	2	6	164270	164275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621233
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4053	NC_014720	TAA	2	6	164736	164741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621233
4054	NC_014720	TGT	2	6	164751	164756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621233
4055	NC_014720	ATTGG	2	10	164764	164773	20 %	40 %	40 %	0 %	312621233
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4059	NC_014720	GTA	2	6	164998	165003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621233
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4103	NC_014720	CAA	2	6	166951	166956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621234
4104	NC_014720	T	6	6	166969	166974	0 %	100 %	0 %	0 %	312621234
4105	NC_014720	ATT	2	6	167012	167017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621234
4106	NC_014720	A	6	6	167151	167156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_014720	GA	3	6	167157	167162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_014720	TAA	3	9	167185	167193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_014720	A	6	6	167240	167245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_014720	A	6	6	167266	167271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_014720	TAAA	2	8	167283	167290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_014720	GGT	2	6	167291	167296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_014720	TAAA	2	8	167309	167316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_014720	AGG	2	6	167360	167365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_014720	A	6	6	167377	167382	100 %	0 %	0 %	0 %	312621235
4116	NC_014720	A	6	6	167386	167391	100 %	0 %	0 %	0 %	312621235
4117	NC_014720	TCT	2	6	167435	167440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621235
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4120	NC_014720	GTA	2	6	167629	167634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621235
4121	NC_014720	GACG	2	8	167682	167689	25 %	0 %	50 %	25 %	312621235
4122	NC_014720	CAG	2	6	167720	167725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621235
4123	NC_014720	GGA	2	6	167731	167736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621235
4124	NC_014720	AG	4	8	167793	167800	50 %	0 %	50 %	0 %	312621235
4125	NC_014720	TGG	2	6	167841	167846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621235
4126	NC_014720	AGC	2	6	167847	167852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621235
4127	NC_014720	CAT	2	6	167906	167911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621235
4128	NC_014720	GT	3	6	168017	168022	0 %	50 %	50 %	0 %	312621235
4129	NC_014720	GGT	2	6	168036	168041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621235
4130	NC_014720	GGA	2	6	168139	168144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621235
4131	NC_014720	AG	4	8	168201	168208	50 %	0 %	50 %	0 %	312621235
4132	NC_014720	TAA	2	6	168284	168289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621235
4133	NC_014720	CGA	2	6	168353	168358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621235
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4135	NC_014720	CAA	2	6	168434	168439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621235
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4137	NC_014720	ATATA	2	10	168609	168618	60 %	40 %	0 %	0 %	312621235
4138	NC_014720	TCGT	2	8	168621	168628	0 %	50 %	25 %	25 %	312621235
4139	NC_014720	ACAG	2	8	168688	168695	50 %	0 %	25 %	25 %	312621235
4140	NC_014720	TAT	2	6	168715	168720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621235
4141	NC_014720	TCA	2	6	168832	168837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621235
4142	NC_014720	GAT	2	6	168994	168999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621235
4143	NC_014720	TGGA	2	8	169036	169043	25 %	25 %	50 %	0 %	312621235
4144	NC_014720	CAG	2	6	169124	169129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621235
4145	NC_014720	GCA	2	6	169144	169149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621235
4146	NC_014720	GCT	2	6	169156	169161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621235
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4149	NC_014720	TTG	2	6	169358	169363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621235
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4152	NC_014720	TGT	2	6	169569	169574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621235
4153	NC_014720	CTG	2	6	169595	169600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621235
4154	NC_014720	TA	3	6	169653	169658	50 %	50 %	0 %	0 %	312621235
4155	NC_014720	TAA	2	6	169778	169783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621235
4156	NC_014720	AAT	2	6	169813	169818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621235
4157	NC_014720	GTA	2	6	169850	169855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621235
4158	NC_014720	GGT	2	6	169909	169914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621235
4159	NC_014720	AATA	2	8	170022	170029	75 %	25 %	0 %	0 %	312621235
4160	NC_014720	ATT	2	6	170044	170049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621235
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4164	NC_014720	ATGGA	2	10	170115	170124	40 %	20 %	40 %	0 %	312621235
4165	NC_014720	GA	3	6	170123	170128	50 %	0 %	50 %	0 %	312621235
4166	NC_014720	ATG	2	6	170165	170170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621235
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4177	NC_014720	TAC	3	9	170631	170639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621235
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4181	NC_014720	AGTTA	2	10	170871	170880	40 %	40 %	20 %	0 %	312621235
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4183	NC_014720	AACGG	2	10	170965	170974	40 %	0 %	40 %	20 %	312621235
4184	NC_014720	AGGT	2	8	171012	171019	25 %	25 %	50 %	0 %	312621235
4185	NC_014720	ACGT	2	8	171020	171027	25 %	25 %	25 %	25 %	312621235
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4188	NC_014720	ATA	2	6	171117	171122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4189	NC_014720	G	6	6	171148	171153	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4190	NC_014720	AATT	2	8	171158	171165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4191	NC_014720	TAA	2	6	171166	171171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4192	NC_014720	TGG	2	6	171179	171184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4193	NC_014720	A	6	6	171201	171206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4194	NC_014720	A	6	6	171210	171215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4195	NC_014720	TA	4	8	171288	171295	50 %	50 %	0 %	0 %	312621236
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4198	NC_014720	GAT	2	6	171583	171588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621236
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4201	NC_014720	TACG	2	8	171706	171713	25 %	25 %	25 %	25 %	312621236
4202	NC_014720	TATGGT	2	12	171772	171783	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312621236
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4211	NC_014720	TGG	2	6	172378	172383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621236
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4215	NC_014720	TGA	2	6	172623	172628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621236
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4218	NC_014720	GTTA	2	8	173023	173030	25 %	50 %	25 %	0 %	312621236
4219	NC_014720	ACA	2	6	173062	173067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621236
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4222	NC_014720	CAT	2	6	173156	173161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621236
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4224	NC_014720	AAAG	2	8	173326	173333	75 %	0 %	25 %	0 %	312621236
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4227	NC_014720	CTTA	2	8	173485	173492	25 %	50 %	0 %	25 %	312621236
4228	NC_014720	TAC	2	6	173515	173520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621236
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4230	NC_014720	TGG	2	6	173559	173564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621236
4231	NC_014720	CTT	2	6	173601	173606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621236
4232	NC_014720	GCA	2	6	173629	173634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621236
4233	NC_014720	CCT	2	6	173642	173647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312621236
4234	NC_014720	GGT	2	6	173674	173679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621236
4235	NC_014720	TTTA	2	8	173855	173862	25 %	75 %	0 %	0 %	312621236
4236	NC_014720	TGT	2	6	174055	174060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621236
4237	NC_014720	ACTT	2	8	174100	174107	25 %	50 %	0 %	25 %	312621236
4238	NC_014720	ATT	2	6	174231	174236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621236
4239	NC_014720	GAT	2	6	174265	174270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621236
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4242	NC_014720	A	6	6	174388	174393	100 %	0 %	0 %	0 %	312621236
4243	NC_014720	TAA	2	6	174456	174461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621236
4244	NC_014720	GTA	2	6	174469	174474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621236
4245	NC_014720	CCA	2	6	174490	174495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312621236
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4247	NC_014720	CCA	2	6	174553	174558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312621236
4248	NC_014720	TAT	2	6	174616	174621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621236
4249	NC_014720	GTA	2	6	174635	174640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621236
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4252	NC_014720	AGGA	2	8	174722	174729	50 %	0 %	50 %	0 %	312621236
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4309	NC_014720	TGGG	2	8	177808	177815	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4357	NC_014720	A	7	7	179796	179802	100 %	0 %	0 %	0 %	312621238
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4365	NC_014720	A	6	6	180142	180147	100 %	0 %	0 %	0 %	312621238
4366	NC_014720	ATA	3	9	180152	180160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621238
4367	NC_014720	A	6	6	180169	180174	100 %	0 %	0 %	0 %	312621238
4368	NC_014720	T	6	6	180181	180186	0 %	100 %	0 %	0 %	312621238
4369	NC_014720	CCT	2	6	180212	180217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4370	NC_014720	CA	3	6	180239	180244	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4371	NC_014720	ACT	2	6	180255	180260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4372	NC_014720	TCAAT	2	10	180275	180284	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4373	NC_014720	TAA	2	6	180305	180310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4374	NC_014720	TAA	2	6	180352	180357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4375	NC_014720	AGG	2	6	180440	180445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4454	NC_014720	AGG	2	6	184070	184075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4493	NC_014720	GTA	2	6	185711	185716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621242
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4495	NC_014720	AAGACA	2	12	185800	185811	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312621242
4496	NC_014720	AAAGA	2	10	185836	185845	80 %	0 %	20 %	0 %	312621242
4497	NC_014720	A	6	6	185855	185860	100 %	0 %	0 %	0 %	312621242
4498	NC_014720	TAAT	2	8	185897	185904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_014720	TA	3	6	185935	185940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_014720	AAT	2	6	185941	185946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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