MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 chromosome

Total Repeats: 66536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014720	ATG	2	6	19192	19197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
502	NC_014720	AAG	2	6	19198	19203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
503	NC_014720	ATATGA	2	12	19244	19255	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312621140
504	NC_014720	AT	3	6	19281	19286	50 %	50 %	0 %	0 %	312621140
505	NC_014720	AAG	2	6	19321	19326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
506	NC_014720	GTAAT	2	10	19327	19336	40 %	40 %	20 %	0 %	312621140
507	NC_014720	ACTT	2	8	19513	19520	25 %	50 %	0 %	25 %	312621140
508	NC_014720	TGT	2	6	19547	19552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621140
509	NC_014720	GATA	2	8	19562	19569	50 %	25 %	25 %	0 %	312621140
510	NC_014720	TAT	2	6	19572	19577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621140
511	NC_014720	AGC	2	6	19584	19589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621140
512	NC_014720	GGT	3	9	19602	19610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621140
513	NC_014720	AT	3	6	19619	19624	50 %	50 %	0 %	0 %	312621140
514	NC_014720	ATG	2	6	19645	19650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
515	NC_014720	TAGG	2	8	19684	19691	25 %	25 %	50 %	0 %	312621140
516	NC_014720	ATG	2	6	19705	19710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
517	NC_014720	AGGT	2	8	19711	19718	25 %	25 %	50 %	0 %	312621140
518	NC_014720	AGAT	2	8	19736	19743	50 %	25 %	25 %	0 %	312621140
519	NC_014720	ATATGA	2	12	19760	19771	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312621140
520	NC_014720	TAAAT	2	10	19907	19916	60 %	40 %	0 %	0 %	312621140
521	NC_014720	AAC	2	6	19968	19973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621140
522	NC_014720	ACA	2	6	19984	19989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621140
523	NC_014720	GC	3	6	20021	20026	0 %	0 %	50 %	50 %	312621140
524	NC_014720	AGT	2	6	20054	20059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
525	NC_014720	TA	3	6	20143	20148	50 %	50 %	0 %	0 %	312621140
526	NC_014720	AGT	3	9	20177	20185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
527	NC_014720	AGA	2	6	20303	20308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
528	NC_014720	ATG	2	6	20335	20340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
529	NC_014720	AAT	2	6	20373	20378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621140
530	NC_014720	ACG	2	6	20395	20400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621140
531	NC_014720	AGA	2	6	20419	20424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
532	NC_014720	ATG	2	6	20434	20439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
533	NC_014720	TAC	2	6	20448	20453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621140
534	NC_014720	GCA	2	6	20461	20466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621140
535	NC_014720	TA	3	6	20471	20476	50 %	50 %	0 %	0 %	312621140
536	NC_014720	CAG	2	6	20504	20509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621140
537	NC_014720	AGGA	2	8	20531	20538	50 %	0 %	50 %	0 %	312621140
538	NC_014720	GTA	2	6	20545	20550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
539	NC_014720	GAA	2	6	20618	20623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
540	NC_014720	TA	3	6	20624	20629	50 %	50 %	0 %	0 %	312621140
541	NC_014720	GTAAT	2	10	20647	20656	40 %	40 %	20 %	0 %	312621140
542	NC_014720	TAC	2	6	20703	20708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621140
543	NC_014720	TAT	2	6	20730	20735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621140
544	NC_014720	TAT	2	6	20748	20753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621140
545	NC_014720	TAG	2	6	20756	20761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
546	NC_014720	AAT	2	6	20844	20849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621140
547	NC_014720	AGG	2	6	20909	20914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621140
548	NC_014720	GGGT	2	8	20938	20945	0 %	25 %	75 %	0 %	312621140
549	NC_014720	CAG	3	9	21034	21042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621140
550	NC_014720	AGG	2	6	21053	21058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621140
551	NC_014720	AGC	2	6	21098	21103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621140
552	NC_014720	AGC	2	6	21107	21112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621140
553	NC_014720	AGC	2	6	21116	21121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621140
554	NC_014720	AATT	2	8	21187	21194	50 %	50 %	0 %	0 %	312621140
555	NC_014720	GAA	2	6	21246	21251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
556	NC_014720	A	6	6	21264	21269	100 %	0 %	0 %	0 %	312621140
557	NC_014720	GAA	2	6	21299	21304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621140
558	NC_014720	GCT	2	6	21321	21326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621140
559	NC_014720	AGTG	2	8	21332	21339	25 %	25 %	50 %	0 %	312621140
560	NC_014720	AGC	2	6	21434	21439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621140
561	NC_014720	AGGA	2	8	21455	21462	50 %	0 %	50 %	0 %	312621140
562	NC_014720	AGAAC	2	10	21558	21567	60 %	0 %	20 %	20 %	312621140
563	NC_014720	TA	3	6	21594	21599	50 %	50 %	0 %	0 %	312621140
564	NC_014720	AAAG	2	8	21639	21646	75 %	0 %	25 %	0 %	312621140
565	NC_014720	ATT	2	6	21654	21659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621140
566	NC_014720	GTA	2	6	21669	21674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
567	NC_014720	CAAT	2	8	21750	21757	50 %	25 %	0 %	25 %	312621140
568	NC_014720	AGG	2	6	21791	21796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621140
569	NC_014720	GAT	2	6	21854	21859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621140
570	NC_014720	AGA	3	9	21983	21991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014720	TAA	2	6	22042	22047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621141
572	NC_014720	TTG	2	6	22053	22058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621141
573	NC_014720	TTGT	2	8	22074	22081	0 %	75 %	25 %	0 %	312621141
574	NC_014720	T	6	6	22164	22169	0 %	100 %	0 %	0 %	312621141
575	NC_014720	T	7	7	22192	22198	0 %	100 %	0 %	0 %	312621141
576	NC_014720	T	8	8	22231	22238	0 %	100 %	0 %	0 %	312621141
577	NC_014720	A	7	7	22290	22296	100 %	0 %	0 %	0 %	312621141
578	NC_014720	TAAA	2	8	22342	22349	75 %	25 %	0 %	0 %	312621141
579	NC_014720	ACA	2	6	22359	22364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312621141
580	NC_014720	T	6	6	22379	22384	0 %	100 %	0 %	0 %	312621141
581	NC_014720	TAG	2	6	22391	22396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621141
582	NC_014720	GAG	2	6	22458	22463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621141
583	NC_014720	AGG	2	6	22493	22498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621141
584	NC_014720	AGA	2	6	22499	22504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621141
585	NC_014720	AT	3	6	22506	22511	50 %	50 %	0 %	0 %	312621141
586	NC_014720	AGA	2	6	22529	22534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621141
587	NC_014720	TGT	2	6	22553	22558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621141
588	NC_014720	GAA	2	6	22581	22586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621141
589	NC_014720	ATT	2	6	22616	22621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621141
590	NC_014720	AGA	3	9	22622	22630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621141
591	NC_014720	TAG	2	6	22633	22638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621141
592	NC_014720	AAT	2	6	22641	22646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621141
593	NC_014720	AG	3	6	22670	22675	50 %	0 %	50 %	0 %	312621141
594	NC_014720	GAA	2	6	22683	22688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621141
595	NC_014720	GCT	2	6	22713	22718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621141
596	NC_014720	TTAAG	2	10	22729	22738	40 %	40 %	20 %	0 %	312621141
597	NC_014720	AGA	2	6	22747	22752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621141
598	NC_014720	TAT	2	6	22785	22790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621141
599	NC_014720	T	7	7	22817	22823	0 %	100 %	0 %	0 %	312621141
600	NC_014720	CGT	2	6	22837	22842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621141
601	NC_014720	TAG	2	6	22919	22924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621141
602	NC_014720	CTA	2	6	22965	22970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621141
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605	NC_014720	A	6	6	23088	23093	100 %	0 %	0 %	0 %	312621141
606	NC_014720	AGG	2	6	23108	23113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312621141
607	NC_014720	A	6	6	23151	23156	100 %	0 %	0 %	0 %	312621141
608	NC_014720	AGA	2	6	23165	23170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621141
609	NC_014720	TAAAAA	2	12	23191	23202	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312621141
610	NC_014720	A	7	7	23198	23204	100 %	0 %	0 %	0 %	312621141
611	NC_014720	TAA	2	6	23236	23241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621141
612	NC_014720	TTC	2	6	23249	23254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621141
613	NC_014720	TGA	2	6	23255	23260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621141
614	NC_014720	GGT	2	6	23298	23303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312621141
615	NC_014720	TAG	2	6	23326	23331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621142
616	NC_014720	AGA	2	6	23342	23347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621142
617	NC_014720	A	6	6	23349	23354	100 %	0 %	0 %	0 %	312621142
618	NC_014720	A	6	6	23356	23361	100 %	0 %	0 %	0 %	312621142
619	NC_014720	GTT	2	6	23406	23411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621142
620	NC_014720	TTA	2	6	23430	23435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621142
621	NC_014720	GAT	2	6	23481	23486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621142
622	NC_014720	CTG	2	6	23569	23574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621142
623	NC_014720	GGC	2	6	23605	23610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312621142
624	NC_014720	TAG	2	6	23650	23655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621142
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626	NC_014720	A	6	6	23778	23783	100 %	0 %	0 %	0 %	312621142
627	NC_014720	GAT	2	6	23793	23798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621142
628	NC_014720	AGA	2	6	23804	23809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621142
629	NC_014720	CATTT	2	10	23818	23827	20 %	60 %	0 %	20 %	312621142
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744	NC_014720	A	7	7	28562	28568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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761	NC_014720	AAAG	2	8	29177	29184	75 %	0 %	25 %	0 %	312621144
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