MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 chromosome

Total Repeats: 66536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_014720	AAT	2	6	207695	207700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621255
5003	NC_014720	CA	3	6	207712	207717	50 %	0 %	0 %	50 %	312621255
5004	NC_014720	CTCA	2	8	207728	207735	25 %	25 %	0 %	50 %	312621255
5005	NC_014720	TTC	2	6	207760	207765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621255
5006	NC_014720	CTT	2	6	207799	207804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312621255
5007	NC_014720	TCA	2	6	207837	207842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621255
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5009	NC_014720	CAG	2	6	207919	207924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312621255
5010	NC_014720	T	6	6	207978	207983	0 %	100 %	0 %	0 %	312621255
5011	NC_014720	TCTT	2	8	208087	208094	0 %	75 %	0 %	25 %	312621255
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5013	NC_014720	GTT	2	6	208185	208190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621255
5014	NC_014720	TCC	2	6	208320	208325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_014720	ATT	2	6	208336	208341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_014720	T	7	7	208369	208375	0 %	100 %	0 %	0 %	312621256
5017	NC_014720	CCG	2	6	208383	208388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312621256
5018	NC_014720	AT	3	6	208482	208487	50 %	50 %	0 %	0 %	312621256
5019	NC_014720	ATA	2	6	208520	208525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621256
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5021	NC_014720	T	6	6	208603	208608	0 %	100 %	0 %	0 %	312621256
5022	NC_014720	AGA	2	6	208613	208618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621256
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5029	NC_014720	TA	3	6	208897	208902	50 %	50 %	0 %	0 %	312621256
5030	NC_014720	TTTA	2	8	208905	208912	25 %	75 %	0 %	0 %	312621256
5031	NC_014720	GAAAAG	2	12	208932	208943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621256
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5035	NC_014720	T	6	6	209111	209116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_014720	AAG	2	6	209120	209125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_014720	AG	3	6	209140	209145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5039	NC_014720	T	6	6	209205	209210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_014720	AAG	2	6	209211	209216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_014720	AAT	2	6	209219	209224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_014720	AAG	2	6	209233	209238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_014720	AAC	2	6	209250	209255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_014720	TGA	2	6	209260	209265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_014720	ATT	2	6	209271	209276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_014720	AAC	2	6	209277	209282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_014720	T	6	6	209295	209300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5049	NC_014720	ATA	2	6	209368	209373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_014720	A	6	6	209462	209467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_014720	A	6	6	209497	209502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_014720	AAGT	2	8	209627	209634	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_014720	AAAT	2	8	209658	209665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_014720	TA	3	6	209692	209697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5057	NC_014720	T	6	6	209818	209823	0 %	100 %	0 %	0 %	312621257
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5059	NC_014720	T	7	7	209853	209859	0 %	100 %	0 %	0 %	312621257
5060	NC_014720	ATC	2	6	209926	209931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621257
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5094	NC_014720	ATT	2	6	211174	211179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5097	NC_014720	A	7	7	211211	211217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_014720	TAA	2	6	211230	211235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_014720	TA	5	10	211258	211267	50 %	50 %	0 %	0 %	312621259
5100	NC_014720	TGA	2	6	211271	211276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621259
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5110	NC_014720	TA	3	6	211743	211748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_014720	AGA	2	6	211755	211760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_014720	GATT	2	8	211783	211790	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_014720	TGGA	2	8	211804	211811	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_014720	TAT	2	6	211812	211817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_014720	AAG	2	6	211830	211835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5117	NC_014720	AT	3	6	211947	211952	50 %	50 %	0 %	0 %	312621260
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5128	NC_014720	A	6	6	212276	212281	100 %	0 %	0 %	0 %	312621260
5129	NC_014720	TGA	2	6	212300	212305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621260
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5240	NC_014720	TTGA	2	8	217533	217540	25 %	50 %	25 %	0 %	312621265
5241	NC_014720	A	7	7	217569	217575	100 %	0 %	0 %	0 %	312621265
5242	NC_014720	AG	3	6	217613	217618	50 %	0 %	50 %	0 %	312621265
5243	NC_014720	A	6	6	217623	217628	100 %	0 %	0 %	0 %	312621265
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5249	NC_014720	GGGA	2	8	218044	218051	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_014720	AAG	2	6	218077	218082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621266
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5252	NC_014720	A	6	6	218111	218116	100 %	0 %	0 %	0 %	312621266
5253	NC_014720	AAGAG	2	10	218158	218167	60 %	0 %	40 %	0 %	312621266
5254	NC_014720	TTG	2	6	218211	218216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621266
5255	NC_014720	TTG	2	6	218262	218267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621266
5256	NC_014720	GAA	2	6	218303	218308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621266
5257	NC_014720	AC	3	6	218337	218342	50 %	0 %	0 %	50 %	312621266
5258	NC_014720	TGC	2	6	218392	218397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621266
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5262	NC_014720	TGA	2	6	218635	218640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621266
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5267	NC_014720	AAAGA	2	10	218804	218813	80 %	0 %	20 %	0 %	312621266
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5271	NC_014720	TGT	2	6	218887	218892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621266
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5278	NC_014720	TCT	2	6	219039	219044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5279	NC_014720	AGG	2	6	219069	219074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5280	NC_014720	A	6	6	219105	219110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5281	NC_014720	ATT	2	6	219114	219119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5282	NC_014720	AAT	2	6	219134	219139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5283	NC_014720	AAT	2	6	219157	219162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5284	NC_014720	AAT	2	6	219244	219249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621267
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5289	NC_014720	TTG	2	6	219411	219416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621267
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5291	NC_014720	TGA	2	6	219523	219528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621267
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5330	NC_014720	TA	3	6	221540	221545	50 %	50 %	0 %	0 %	312621269
5331	NC_014720	ACT	2	6	221566	221571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621269
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5333	NC_014720	ATG	2	6	221686	221691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621269
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5335	NC_014720	TAC	2	6	221767	221772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312621270
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5340	NC_014720	A	6	6	222047	222052	100 %	0 %	0 %	0 %	312621270
5341	NC_014720	CATC	2	8	222214	222221	25 %	25 %	0 %	50 %	312621270
5342	NC_014720	TG	3	6	222280	222285	0 %	50 %	50 %	0 %	312621270
5343	NC_014720	ATGCC	2	10	222293	222302	20 %	20 %	20 %	40 %	312621270
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5364	NC_014720	T	6	6	223350	223355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5365	NC_014720	TTG	2	6	223418	223423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312621272
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5367	NC_014720	A	6	6	223479	223484	100 %	0 %	0 %	0 %	312621272
5368	NC_014720	AGA	2	6	223545	223550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312621272
5369	NC_014720	GATA	2	8	223597	223604	50 %	25 %	25 %	0 %	312621272
5370	NC_014720	CTG	2	6	223616	223621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312621272
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5372	NC_014720	A	6	6	223692	223697	100 %	0 %	0 %	0 %	312621272
5373	NC_014720	A	7	7	223758	223764	100 %	0 %	0 %	0 %	312621272
5374	NC_014720	TAA	2	6	223766	223771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312621272
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5377	NC_014720	TGA	2	6	223806	223811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312621272
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5379	NC_014720	TA	3	6	223930	223935	50 %	50 %	0 %	0 %	312621272
5380	NC_014720	ATT	3	9	223978	223986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312621272
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