MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B plasmid pCALKR01

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014719	GTACA	2	10	28	37	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014719	GGTAA	2	10	460	469	40 %	20 %	40 %	0 %	312281361
3	NC_014719	GGAAA	2	10	2554	2563	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014719	AAAAG	2	10	2749	2758	80 %	0 %	20 %	0 %	312281364
5	NC_014719	ATATT	2	10	3087	3096	40 %	60 %	0 %	0 %	312281365
6	NC_014719	GGAGA	2	10	3733	3742	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014719	GAAAA	2	10	4191	4200	80 %	0 %	20 %	0 %	312281366
8	NC_014719	CTTGT	2	10	6040	6049	0 %	60 %	20 %	20 %	312281368
9	NC_014719	CTGTA	2	10	7034	7043	20 %	40 %	20 %	20 %	312281369
10	NC_014719	AGAGA	2	10	8765	8774	60 %	0 %	40 %	0 %	312281371
11	NC_014719	AGAGA	2	10	8781	8790	60 %	0 %	40 %	0 %	312281371
12	NC_014719	TCTTT	2	10	9300	9309	0 %	80 %	0 %	20 %	312281372
13	NC_014719	CCATA	2	10	10226	10235	40 %	20 %	0 %	40 %	312281372
14	NC_014719	GAATT	2	10	10854	10863	40 %	40 %	20 %	0 %	312281373
15	NC_014719	ACTGG	2	10	12728	12737	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014719	AGAAA	2	10	14256	14265	80 %	0 %	20 %	0 %	312281376
17	NC_014719	TAAAA	2	10	15359	15368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.