MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B plasmid pCALKR01

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014719	AACT	2	8	185	192	50 %	25 %	0 %	25 %	312281361
2	NC_014719	AAAT	2	8	363	370	75 %	25 %	0 %	0 %	312281361
3	NC_014719	GGTA	2	8	936	943	25 %	25 %	50 %	0 %	312281361
4	NC_014719	TGCT	2	8	1808	1815	0 %	50 %	25 %	25 %	312281363
5	NC_014719	TTGG	2	8	2318	2325	0 %	50 %	50 %	0 %	312281363
6	NC_014719	AATA	2	8	2436	2443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014719	TAAA	2	8	2504	2511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014719	AAGA	2	8	3053	3060	75 %	0 %	25 %	0 %	312281365
9	NC_014719	TTTG	2	8	3157	3164	0 %	75 %	25 %	0 %	312281365
10	NC_014719	GATG	2	8	3193	3200	25 %	25 %	50 %	0 %	312281365
11	NC_014719	GGCA	2	8	3744	3751	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014719	AATG	2	8	3861	3868	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014719	ATTT	2	8	4163	4170	25 %	75 %	0 %	0 %	312281366
14	NC_014719	TGAA	2	8	4812	4819	50 %	25 %	25 %	0 %	312281367
15	NC_014719	TTGT	2	8	4896	4903	0 %	75 %	25 %	0 %	312281367
16	NC_014719	GTTT	2	8	4924	4931	0 %	75 %	25 %	0 %	312281367
17	NC_014719	GTTT	2	8	5125	5132	0 %	75 %	25 %	0 %	312281368
18	NC_014719	CAAA	2	8	5738	5745	75 %	0 %	0 %	25 %	312281368
19	NC_014719	TCAA	2	8	6595	6602	50 %	25 %	0 %	25 %	312281369
20	NC_014719	AAAG	2	8	7913	7920	75 %	0 %	25 %	0 %	312281371
21	NC_014719	TTAC	2	8	8045	8052	25 %	50 %	0 %	25 %	312281371
22	NC_014719	AAAT	2	8	8329	8336	75 %	25 %	0 %	0 %	312281371
23	NC_014719	TCAA	2	8	9090	9097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014719	TGTT	2	8	9273	9280	0 %	75 %	25 %	0 %	312281372
25	NC_014719	CTTT	2	8	9311	9318	0 %	75 %	0 %	25 %	312281372
26	NC_014719	CAAC	2	8	9591	9598	50 %	0 %	0 %	50 %	312281372
27	NC_014719	ACAA	2	8	10081	10088	75 %	0 %	0 %	25 %	312281372
28	NC_014719	TTTA	2	8	11054	11061	25 %	75 %	0 %	0 %	312281374
29	NC_014719	TCAA	2	8	11346	11353	50 %	25 %	0 %	25 %	312281374
30	NC_014719	TGAT	2	8	11385	11392	25 %	50 %	25 %	0 %	312281374
31	NC_014719	CAGC	2	8	11470	11477	25 %	0 %	25 %	50 %	312281374
32	NC_014719	TTTC	2	8	11794	11801	0 %	75 %	0 %	25 %	312281374
33	NC_014719	GTTA	2	8	11809	11816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014719	TAAA	2	8	12159	12166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014719	CCTT	2	8	12308	12315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014719	AGTT	2	8	13070	13077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014719	TGTA	2	8	13744	13751	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014719	CAGT	2	8	14484	14491	25 %	25 %	25 %	25 %	312281376
39	NC_014719	AAAC	2	8	14584	14591	75 %	0 %	0 %	25 %	312281376
40	NC_014719	ACTG	2	8	14924	14931	25 %	25 %	25 %	25 %	312281377
41	NC_014719	AGTA	3	12	15319	15330	50 %	25 %	25 %	0 %	312281377
42	NC_014719	TTTA	2	8	15458	15465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.