MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 6159

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014657	AT	3	6	196	201	50 %	50 %	0 %	0 %	312134083
2	NC_014657	GT	3	6	234	239	0 %	50 %	50 %	0 %	312134083
3	NC_014657	AG	3	6	1062	1067	50 %	0 %	50 %	0 %	312134083
4	NC_014657	AG	3	6	1314	1319	50 %	0 %	50 %	0 %	312134083
5	NC_014657	AT	3	6	1327	1332	50 %	50 %	0 %	0 %	312134083
6	NC_014657	CA	3	6	1371	1376	50 %	0 %	0 %	50 %	312134083
7	NC_014657	TG	3	6	1499	1504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014657	AG	3	6	1965	1970	50 %	0 %	50 %	0 %	312134084
9	NC_014657	TA	3	6	4340	4345	50 %	50 %	0 %	0 %	312134087
10	NC_014657	AT	3	6	4679	4684	50 %	50 %	0 %	0 %	312134087
11	NC_014657	GA	4	8	4880	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	312134087
12	NC_014657	GC	3	6	5294	5299	0 %	0 %	50 %	50 %	312134087
13	NC_014657	GC	3	6	5402	5407	0 %	0 %	50 %	50 %	312134087
14	NC_014657	AG	3	6	5426	5431	50 %	0 %	50 %	0 %	312134087
15	NC_014657	AG	3	6	6110	6115	50 %	0 %	50 %	0 %	312134087
16	NC_014657	AT	3	6	6153	6158	50 %	50 %	0 %	0 %	312134087
17	NC_014657	TA	3	6	6751	6756	50 %	50 %	0 %	0 %	312134089
18	NC_014657	TA	3	6	7274	7279	50 %	50 %	0 %	0 %	312134089
19	NC_014657	AT	3	6	7353	7358	50 %	50 %	0 %	0 %	312134089
20	NC_014657	TA	3	6	8230	8235	50 %	50 %	0 %	0 %	312134089
21	NC_014657	GT	3	6	8820	8825	0 %	50 %	50 %	0 %	312134089
22	NC_014657	TA	3	6	9850	9855	50 %	50 %	0 %	0 %	312134090
23	NC_014657	TA	3	6	10360	10365	50 %	50 %	0 %	0 %	312134091
24	NC_014657	TA	3	6	10486	10491	50 %	50 %	0 %	0 %	312134091
25	NC_014657	TA	3	6	11035	11040	50 %	50 %	0 %	0 %	312134091
26	NC_014657	AT	3	6	11320	11325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014657	AT	3	6	12574	12579	50 %	50 %	0 %	0 %	312134092
28	NC_014657	AT	3	6	12910	12915	50 %	50 %	0 %	0 %	312134092
29	NC_014657	TA	3	6	12955	12960	50 %	50 %	0 %	0 %	312134092
30	NC_014657	AT	3	6	13009	13014	50 %	50 %	0 %	0 %	312134092
31	NC_014657	AT	3	6	13049	13054	50 %	50 %	0 %	0 %	312134092
32	NC_014657	AT	3	6	13405	13410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014657	CT	3	6	14885	14890	0 %	50 %	0 %	50 %	312134094
34	NC_014657	TA	3	6	16569	16574	50 %	50 %	0 %	0 %	312134096
35	NC_014657	TA	3	6	17658	17663	50 %	50 %	0 %	0 %	312134096
36	NC_014657	TA	4	8	17961	17968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014657	AC	3	6	19850	19855	50 %	0 %	0 %	50 %	312134099
38	NC_014657	TA	3	6	20566	20571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014657	CG	3	6	20604	20609	0 %	0 %	50 %	50 %	312134100
40	NC_014657	GA	3	6	21172	21177	50 %	0 %	50 %	0 %	312134100
41	NC_014657	AG	3	6	21474	21479	50 %	0 %	50 %	0 %	312134100
42	NC_014657	AC	3	6	21589	21594	50 %	0 %	0 %	50 %	312134100
43	NC_014657	AG	3	6	21846	21851	50 %	0 %	50 %	0 %	312134100
44	NC_014657	GA	3	6	22606	22611	50 %	0 %	50 %	0 %	312134101
45	NC_014657	AG	3	6	23391	23396	50 %	0 %	50 %	0 %	312134101
46	NC_014657	TA	3	6	23489	23494	50 %	50 %	0 %	0 %	312134101
47	NC_014657	AT	5	10	23998	24007	50 %	50 %	0 %	0 %	312134102
48	NC_014657	AT	3	6	24455	24460	50 %	50 %	0 %	0 %	312134102
49	NC_014657	TA	3	6	24846	24851	50 %	50 %	0 %	0 %	312134102
50	NC_014657	TG	3	6	24884	24889	0 %	50 %	50 %	0 %	312134102
51	NC_014657	TG	3	6	25434	25439	0 %	50 %	50 %	0 %	312134102
52	NC_014657	TG	3	6	25678	25683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014657	AG	3	6	25952	25957	50 %	0 %	50 %	0 %	312134103
54	NC_014657	TA	3	6	26564	26569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014657	TA	3	6	26598	26603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014657	GA	3	6	27270	27275	50 %	0 %	50 %	0 %	312134105
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61	NC_014657	AT	3	6	27986	27991	50 %	50 %	0 %	0 %	312134105
62	NC_014657	GA	3	6	28209	28214	50 %	0 %	50 %	0 %	312134105
63	NC_014657	AG	3	6	29360	29365	50 %	0 %	50 %	0 %	312134105
64	NC_014657	AT	3	6	29664	29669	50 %	50 %	0 %	0 %	312134106
65	NC_014657	TA	3	6	29855	29860	50 %	50 %	0 %	0 %	312134106
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69	NC_014657	TA	3	6	30735	30740	50 %	50 %	0 %	0 %	312134107
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71	NC_014657	AT	3	6	30976	30981	50 %	50 %	0 %	0 %	312134107
72	NC_014657	AT	3	6	31255	31260	50 %	50 %	0 %	0 %	312134107
73	NC_014657	AG	3	6	31782	31787	50 %	0 %	50 %	0 %	312134107
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107	NC_014657	AT	3	6	44726	44731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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126	NC_014657	AT	3	6	51348	51353	50 %	50 %	0 %	0 %	312134122
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