MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 1095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014657	ACACAA	2	12	1171	1182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134083
2	NC_014657	ATGCAA	2	12	1848	1859	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312134084
3	NC_014657	GTTGAA	2	12	2247	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134084
4	NC_014657	CTTGAA	2	12	3481	3492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312134085
5	NC_014657	TGACAG	2	12	3852	3863	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312134085
6	NC_014657	GGAAAG	2	12	7396	7407	50 %	0 %	50 %	0 %	312134089
7	NC_014657	GATGCA	2	12	7615	7626	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312134089
8	NC_014657	GATGAG	2	12	8956	8967	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	312134089
9	NC_014657	TTATTT	2	12	9339	9350	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312134090
10	NC_014657	ATTTAC	2	12	10423	10434	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312134091
11	NC_014657	AAAAGA	2	12	10716	10727	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312134091
12	NC_014657	GGAAAA	2	12	11073	11084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134091
13	NC_014657	ATCAAT	2	12	14660	14671	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312134094
14	NC_014657	TCAAAC	2	12	14673	14684	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	312134094
15	NC_014657	ATGTCA	2	12	14763	14774	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312134094
16	NC_014657	ATTTCA	2	12	15078	15089	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312134094
17	NC_014657	TTTTTA	2	12	16786	16797	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312134096
18	NC_014657	TTTTAG	2	12	18041	18052	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312134097
19	NC_014657	TTTTCT	2	12	19776	19787	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312134099
20	NC_014657	GTGAAA	2	12	27307	27318	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312134105
21	NC_014657	AGGAAA	2	12	35970	35981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134111
22	NC_014657	AGAAAT	2	12	36811	36822	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312134112
23	NC_014657	CTTTGT	2	12	38211	38222	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312134114
24	NC_014657	ACATTT	2	12	41523	41534	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312134116
25	NC_014657	AAAGCA	2	12	41797	41808	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312134116
26	NC_014657	TATGCA	2	12	43689	43700	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312134116
27	NC_014657	ATGTAA	2	12	46556	46567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312134118
28	NC_014657	TTTTAA	2	12	50501	50512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134122
29	NC_014657	AATTAA	2	12	52946	52957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134124
30	NC_014657	TACTGT	2	12	54008	54019	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312134125
31	NC_014657	AACAAT	2	12	54333	54344	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312134125
32	NC_014657	TTTTTG	2	12	55792	55803	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014657	ATGTAA	2	12	57338	57349	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014657	TTTCTA	2	12	58340	58351	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312134126
35	NC_014657	AATGTT	2	12	59204	59215	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312134127
36	NC_014657	TCGTTT	2	12	62902	62913	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312134129
37	NC_014657	ATTAAA	2	12	63447	63458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134130
38	NC_014657	CAAATT	2	12	64487	64498	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312134130
39	NC_014657	AAAGTG	2	12	64657	64668	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312134130
40	NC_014657	AAAATT	2	12	66593	66604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014657	CTGTTG	2	12	68421	68432	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	312134132
42	NC_014657	ATACCT	2	12	76457	76468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014657	AGTAAT	2	12	77273	77284	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014657	TTTTCA	2	12	79449	79460	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312134137
45	NC_014657	AGAAAA	2	12	83801	83812	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312134141
46	NC_014657	AAAATA	2	12	85496	85507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312134143
47	NC_014657	ATTTTG	2	12	86226	86237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312134143
48	NC_014657	AAAATC	2	12	96917	96928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312134148
49	NC_014657	AAAGTA	2	12	100631	100642	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014657	AGAAGC	2	12	102154	102165	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312134150
51	NC_014657	TAAAAT	2	12	105010	105021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014657	GACAAC	2	12	105629	105640	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	312134152
53	NC_014657	GTTTTT	2	12	106382	106393	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312134153
54	NC_014657	AACAAA	2	12	107259	107270	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	312134154
55	NC_014657	TTGATT	2	12	107831	107842	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312134155
56	NC_014657	AGGTAT	2	12	108713	108724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134156
57	NC_014657	GCAGTG	2	12	109865	109876	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312134157
58	NC_014657	TACCAA	2	12	110270	110281	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	312134157
59	NC_014657	TGAAGA	2	12	110656	110667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312134158
60	NC_014657	TTTTTA	2	12	112455	112466	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014657	TTCTGT	2	12	113523	113534	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	312134160
62	NC_014657	ATAAAA	2	12	113633	113644	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312134160
63	NC_014657	CAAAGG	2	12	117083	117094	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312134165
64	NC_014657	AAATGT	2	12	117955	117966	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312134165
65	NC_014657	GATTAT	2	12	119258	119269	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312134165
66	NC_014657	GGTTAA	2	12	120586	120597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134165
67	NC_014657	GCAATG	2	12	134466	134477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312134177
68	NC_014657	AAAAGA	2	12	136708	136719	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312134180
69	NC_014657	ATATTT	2	12	142337	142348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134184
70	NC_014657	GCTTAT	2	12	143183	143194	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312134185
71	NC_014657	TTGGAG	2	12	143310	143321	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	312134185
72	NC_014657	GAGGGT	2	12	144878	144889	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	312134185
73	NC_014657	GTTTTG	2	12	145293	145304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134186
74	NC_014657	TAAGAG	2	12	153923	153934	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312134191
75	NC_014657	TTGATT	2	12	155312	155323	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312134191
76	NC_014657	TTTTTG	2	12	164525	164536	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014657	GCTAAA	2	12	166641	166652	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312134198
78	NC_014657	AGAGGA	2	12	167647	167658	50 %	0 %	50 %	0 %	312134198
79	NC_014657	TCATAA	2	12	167762	167773	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312134198
80	NC_014657	TTCAAG	2	12	168231	168242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312134199
81	NC_014657	TGAAGC	2	12	170891	170902	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312134204
82	NC_014657	TATCAA	2	12	171333	171344	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	312134204
83	NC_014657	AGGACA	2	12	172656	172667	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312134206
84	NC_014657	GATTCA	2	12	176214	176225	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312134207
85	NC_014657	GTTTTT	2	12	176744	176755	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014657	AGAGGA	2	12	177330	177341	50 %	0 %	50 %	0 %	312134208
87	NC_014657	TAGATG	2	12	183415	183426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134214
88	NC_014657	TCAATG	2	12	185530	185541	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312134216
89	NC_014657	TGATTT	2	12	187151	187162	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312134218
90	NC_014657	GATATT	2	12	187531	187542	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312134219
91	NC_014657	AGAAAA	2	12	188329	188340	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312134220
92	NC_014657	TTTTGT	2	12	188429	188440	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	312134220
93	NC_014657	AAAAGA	2	12	189162	189173	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312134222
94	NC_014657	ATAGAC	2	12	192788	192799	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312134224
95	NC_014657	ATGGGC	2	12	194488	194499	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312134225
96	NC_014657	AATTTG	2	12	196139	196150	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312134228
97	NC_014657	TATTTC	2	12	197576	197587	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312134229
98	NC_014657	ATTGAG	2	12	199362	199373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014657	GTATTT	2	12	199410	199421	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014657	GGAAAT	2	12	200493	200504	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312134231
101	NC_014657	AAAAGA	2	12	201346	201357	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312134231
102	NC_014657	AACATG	2	12	201500	201511	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312134231
103	NC_014657	AACAAA	2	12	206380	206391	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	312134235
104	NC_014657	AATTCG	2	12	208546	208557	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312134237
105	NC_014657	AGGAAA	2	12	211370	211381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134239
106	NC_014657	TGATTC	2	12	213717	213728	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312134242
107	NC_014657	AATTGC	2	12	215475	215486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312134243
108	NC_014657	CCTGTA	2	12	217302	217313	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312134246
109	NC_014657	TACTTT	2	12	219194	219205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312134249
110	NC_014657	GCAGAA	2	12	221327	221338	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312134250
111	NC_014657	TTATAA	2	12	221603	221614	50 %	50 %	0 %	0 %	312134250
112	NC_014657	GATGTA	2	12	225300	225311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134254
113	NC_014657	GAGTTT	2	12	225405	225416	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312134254
114	NC_014657	CCATTT	2	12	227525	227536	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	312134255
115	NC_014657	AGTTTA	2	12	228718	228729	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312134255
116	NC_014657	TTGGTT	2	12	229013	229024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134255
117	NC_014657	TGTATT	2	12	232072	232083	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	312134257
118	NC_014657	TCTTCA	2	12	233976	233987	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	312134258
119	NC_014657	TACAAG	2	12	237635	237646	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312134262
120	NC_014657	TCTTCC	2	12	243193	243204	0 %	50 %	0 %	50 %	312134269
121	NC_014657	TCAAAA	2	12	250943	250954	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	312134276
122	NC_014657	TTTGAG	2	12	257298	257309	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312134281
123	NC_014657	CAGATG	2	12	260016	260027	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312134284
124	NC_014657	TGGGCA	2	12	264324	264335	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312134286
125	NC_014657	AGATTG	2	12	269518	269529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134289
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130	NC_014657	TTTTGG	2	12	282824	282835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134299
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140	NC_014657	AAAGAG	2	12	311841	311852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134323
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237	NC_014657	AGATTT	2	12	498827	498838	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312134478
238	NC_014657	AGCTTG	2	12	502225	502236	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312134482
239	NC_014657	TGGTAT	2	12	502604	502615	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312134482
240	NC_014657	AATTTC	2	12	503071	503082	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
241	NC_014657	AGAGTG	2	12	510189	510200	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	312134489
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340	NC_014657	AAAAGA	2	12	748556	748567	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312134688
341	NC_014657	TACATG	2	12	750540	750551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312134688
342	NC_014657	CAGGAA	2	12	756233	756244	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	312134693
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344	NC_014657	GCTTGA	2	12	757597	757608	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312134693
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347	NC_014657	ATTTGG	2	12	769002	769013	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
348	NC_014657	AAGAGA	2	12	769970	769981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134706
349	NC_014657	ATGAGT	2	12	770449	770460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134706
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352	NC_014657	GTTTGT	2	12	775498	775509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134712
353	NC_014657	TGATAT	2	12	775650	775661	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312134712
354	NC_014657	ATATAA	2	12	777097	777108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134714
355	NC_014657	TTTTAT	2	12	781922	781933	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312134720
356	NC_014657	TTTTTC	2	12	789012	789023	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	312134728
357	NC_014657	GTTTTG	2	12	789111	789122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134729
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359	NC_014657	AGGAAT	2	12	797019	797030	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	312134732
360	NC_014657	TTGATG	2	12	811371	811382	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312134741
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363	NC_014657	CATTTA	2	12	812981	812992	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312134742
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367	NC_014657	TGCAAT	2	12	818771	818782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312134747
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379	NC_014657	AGTAAA	2	12	834974	834985	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
380	NC_014657	TGAAAC	2	12	838905	838916	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312134765
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450	NC_014657	TAAAAT	2	12	1008078	1008089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_014657	TTGAGT	2	12	1009552	1009563	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
452	NC_014657	TTGATA	2	12	1010529	1010540	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312134950
453	NC_014657	TGGAAC	2	12	1010962	1010973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312134950
454	NC_014657	GGCAGA	2	12	1017422	1017433	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	312134955
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456	NC_014657	GAAATA	2	12	1027612	1027623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312134969
457	NC_014657	GCAGGT	2	12	1032646	1032657	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312134973
458	NC_014657	TTGCTG	2	12	1034330	1034341	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	312134973
459	NC_014657	TTTATT	2	12	1034403	1034414	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312134973
460	NC_014657	TCATTT	2	12	1037877	1037888	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312134977
461	NC_014657	AAATTG	2	12	1038531	1038542	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
462	NC_014657	CAGATG	2	12	1039161	1039172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312134978
463	NC_014657	TTGGTT	2	12	1040620	1040631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134979
464	NC_014657	CTCATG	2	12	1040647	1040658	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312134979
465	NC_014657	ACTGGA	2	12	1041921	1041932	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312134981
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467	NC_014657	TTGAAT	2	12	1044615	1044626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312134983
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