MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 6520

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014657	ATGC	2	8	606	613	25 %	25 %	25 %	25 %	312134083
2	NC_014657	ATGT	2	8	657	664	25 %	50 %	25 %	0 %	312134083
3	NC_014657	AAAG	2	8	789	796	75 %	0 %	25 %	0 %	312134083
4	NC_014657	CAAA	2	8	841	848	75 %	0 %	0 %	25 %	312134083
5	NC_014657	CAGA	2	8	865	872	50 %	0 %	25 %	25 %	312134083
6	NC_014657	AAAC	2	8	1051	1058	75 %	0 %	0 %	25 %	312134083
7	NC_014657	GAAA	2	8	3883	3890	75 %	0 %	25 %	0 %	312134085
8	NC_014657	TGCA	2	8	4554	4561	25 %	25 %	25 %	25 %	312134087
9	NC_014657	AAGC	2	8	5628	5635	50 %	0 %	25 %	25 %	312134087
10	NC_014657	CTTT	2	8	5796	5803	0 %	75 %	0 %	25 %	312134087
11	NC_014657	TTGT	2	8	6402	6409	0 %	75 %	25 %	0 %	312134088
12	NC_014657	GGCA	2	8	6418	6425	25 %	0 %	50 %	25 %	312134088
13	NC_014657	ACTT	2	8	6499	6506	25 %	50 %	0 %	25 %	312134088
14	NC_014657	GAGG	2	8	6672	6679	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014657	TAAA	2	8	7490	7497	75 %	25 %	0 %	0 %	312134089
16	NC_014657	AAGC	2	8	8795	8802	50 %	0 %	25 %	25 %	312134089
17	NC_014657	TTCT	2	8	9396	9403	0 %	75 %	0 %	25 %	312134090
18	NC_014657	ATTC	2	8	9708	9715	25 %	50 %	0 %	25 %	312134090
19	NC_014657	TTAT	2	8	9719	9726	25 %	75 %	0 %	0 %	312134090
20	NC_014657	AATA	2	8	9769	9776	75 %	25 %	0 %	0 %	312134090
21	NC_014657	TTTG	2	8	11164	11171	0 %	75 %	25 %	0 %	312134091
22	NC_014657	TTTA	2	8	11572	11579	25 %	75 %	0 %	0 %	312134092
23	NC_014657	AGAT	2	8	12244	12251	50 %	25 %	25 %	0 %	312134092
24	NC_014657	AAAC	2	8	12451	12458	75 %	0 %	0 %	25 %	312134092
25	NC_014657	TAAA	2	8	12459	12466	75 %	25 %	0 %	0 %	312134092
26	NC_014657	TCTT	2	8	12659	12666	0 %	75 %	0 %	25 %	312134092
27	NC_014657	GAAG	2	8	12989	12996	50 %	0 %	50 %	0 %	312134092
28	NC_014657	GATT	2	8	13081	13088	25 %	50 %	25 %	0 %	312134092
29	NC_014657	TACT	2	8	13455	13462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014657	ATTT	2	8	13526	13533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014657	CTAT	2	8	14376	14383	25 %	50 %	0 %	25 %	312134094
32	NC_014657	ATCC	2	8	14496	14503	25 %	25 %	0 %	50 %	312134094
33	NC_014657	TCAA	2	8	15042	15049	50 %	25 %	0 %	25 %	312134094
34	NC_014657	CAAT	2	8	15380	15387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014657	AAAT	2	8	15424	15431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014657	GAAA	2	8	15469	15476	75 %	0 %	25 %	0 %	312134095
37	NC_014657	AAAG	2	8	16088	16095	75 %	0 %	25 %	0 %	312134095
38	NC_014657	ATTT	2	8	16186	16193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014657	AAAC	2	8	17740	17747	75 %	0 %	0 %	25 %	312134096
40	NC_014657	AAAT	2	8	18601	18608	75 %	25 %	0 %	0 %	312134098
41	NC_014657	AGGC	2	8	19024	19031	25 %	0 %	50 %	25 %	312134098
42	NC_014657	ATTT	2	8	19341	19348	25 %	75 %	0 %	0 %	312134098
43	NC_014657	TTTA	2	8	19683	19690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014657	AAAC	2	8	19966	19973	75 %	0 %	0 %	25 %	312134099
45	NC_014657	AGAA	2	8	21014	21021	75 %	0 %	25 %	0 %	312134100
46	NC_014657	TGGC	2	8	21512	21519	0 %	25 %	50 %	25 %	312134100
47	NC_014657	TAAT	2	8	21903	21910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014657	TGGT	2	8	22388	22395	0 %	50 %	50 %	0 %	312134101
49	NC_014657	TTTG	2	8	22854	22861	0 %	75 %	25 %	0 %	312134101
50	NC_014657	TTAC	2	8	23922	23929	25 %	50 %	0 %	25 %	312134102
51	NC_014657	TGTT	2	8	23941	23948	0 %	75 %	25 %	0 %	312134102
52	NC_014657	TATT	2	8	23976	23983	25 %	75 %	0 %	0 %	312134102
53	NC_014657	TATT	2	8	25550	25557	25 %	75 %	0 %	0 %	312134102
54	NC_014657	ATTG	2	8	26293	26300	25 %	50 %	25 %	0 %	312134103
55	NC_014657	AAAT	2	8	26325	26332	75 %	25 %	0 %	0 %	312134103
56	NC_014657	TTAA	2	8	26539	26546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014657	AGGA	2	8	26803	26810	50 %	0 %	50 %	0 %	312134104
58	NC_014657	CTTG	2	8	27998	28005	0 %	50 %	25 %	25 %	312134105
59	NC_014657	GAAA	3	12	28361	28372	75 %	0 %	25 %	0 %	312134105
60	NC_014657	TTAT	2	8	28484	28491	25 %	75 %	0 %	0 %	312134105
61	NC_014657	TCGC	2	8	28704	28711	0 %	25 %	25 %	50 %	312134105
62	NC_014657	ATAG	2	8	29163	29170	50 %	25 %	25 %	0 %	312134105
63	NC_014657	TAAT	2	8	29519	29526	50 %	50 %	0 %	0 %	312134106
64	NC_014657	TCCT	2	8	30331	30338	0 %	50 %	0 %	50 %	312134106
65	NC_014657	ATTT	2	8	31035	31042	25 %	75 %	0 %	0 %	312134107
66	NC_014657	TTGG	2	8	31117	31124	0 %	50 %	50 %	0 %	312134107
67	NC_014657	CCAG	2	8	31139	31146	25 %	0 %	25 %	50 %	312134107
68	NC_014657	TAAA	2	8	31159	31166	75 %	25 %	0 %	0 %	312134107
69	NC_014657	ATCT	2	8	31185	31192	25 %	50 %	0 %	25 %	312134107
70	NC_014657	TGGT	2	8	31917	31924	0 %	50 %	50 %	0 %	312134107
71	NC_014657	TCAA	2	8	32381	32388	50 %	25 %	0 %	25 %	312134108
72	NC_014657	TTAT	2	8	32475	32482	25 %	75 %	0 %	0 %	312134108
73	NC_014657	TTGG	2	8	32673	32680	0 %	50 %	50 %	0 %	312134108
74	NC_014657	ACAA	2	8	32937	32944	75 %	0 %	0 %	25 %	312134108
75	NC_014657	ATTT	2	8	32960	32967	25 %	75 %	0 %	0 %	312134108
76	NC_014657	AAGA	2	8	33604	33611	75 %	0 %	25 %	0 %	312134109
77	NC_014657	CTTT	2	8	33633	33640	0 %	75 %	0 %	25 %	312134109
78	NC_014657	TGTA	2	8	34001	34008	25 %	50 %	25 %	0 %	312134109
79	NC_014657	ATTT	2	8	35404	35411	25 %	75 %	0 %	0 %	312134111
80	NC_014657	GTTT	2	8	35439	35446	0 %	75 %	25 %	0 %	312134111
81	NC_014657	TATT	2	8	35510	35517	25 %	75 %	0 %	0 %	312134111
82	NC_014657	GTAA	2	8	35921	35928	50 %	25 %	25 %	0 %	312134111
83	NC_014657	TCCT	2	8	35955	35962	0 %	50 %	0 %	50 %	312134111
84	NC_014657	CCTT	2	8	36193	36200	0 %	50 %	0 %	50 %	312134111
85	NC_014657	TTTA	2	8	36250	36257	25 %	75 %	0 %	0 %	312134111
86	NC_014657	ATGT	2	8	36314	36321	25 %	50 %	25 %	0 %	312134111
87	NC_014657	CTTT	2	8	36404	36411	0 %	75 %	0 %	25 %	312134111
88	NC_014657	TTGG	2	8	36440	36447	0 %	50 %	50 %	0 %	312134111
89	NC_014657	AAAG	2	8	37088	37095	75 %	0 %	25 %	0 %	312134112
90	NC_014657	AAGA	2	8	37349	37356	75 %	0 %	25 %	0 %	312134112
91	NC_014657	TTAT	2	8	37604	37611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014657	TCAA	2	8	37734	37741	50 %	25 %	0 %	25 %	312134113
93	NC_014657	TGTA	2	8	37901	37908	25 %	50 %	25 %	0 %	312134113
94	NC_014657	CTTT	2	8	38779	38786	0 %	75 %	0 %	25 %	312134115
95	NC_014657	AGCC	2	8	38929	38936	25 %	0 %	25 %	50 %	312134115
96	NC_014657	ATAC	2	8	39370	39377	50 %	25 %	0 %	25 %	312134116
97	NC_014657	ATAA	2	8	40302	40309	75 %	25 %	0 %	0 %	312134116
98	NC_014657	AATT	2	8	40918	40925	50 %	50 %	0 %	0 %	312134116
99	NC_014657	TGGA	2	8	40933	40940	25 %	25 %	50 %	0 %	312134116
100	NC_014657	TTAT	2	8	41170	41177	25 %	75 %	0 %	0 %	312134116
101	NC_014657	CAAA	2	8	41392	41399	75 %	0 %	0 %	25 %	312134116
102	NC_014657	TTGT	2	8	41815	41822	0 %	75 %	25 %	0 %	312134116
103	NC_014657	AAGA	2	8	42466	42473	75 %	0 %	25 %	0 %	312134116
104	NC_014657	ATGT	2	8	42702	42709	25 %	50 %	25 %	0 %	312134116
105	NC_014657	GCAA	2	8	42768	42775	50 %	0 %	25 %	25 %	312134116
106	NC_014657	GCAT	2	8	42782	42789	25 %	25 %	25 %	25 %	312134116
107	NC_014657	AACT	2	8	42956	42963	50 %	25 %	0 %	25 %	312134116
108	NC_014657	GGAA	2	8	43151	43158	50 %	0 %	50 %	0 %	312134116
109	NC_014657	TTAG	2	8	43314	43321	25 %	50 %	25 %	0 %	312134116
110	NC_014657	GCAA	2	8	44028	44035	50 %	0 %	25 %	25 %	312134116
111	NC_014657	TTTG	2	8	44588	44595	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014657	AGAC	2	8	44964	44971	50 %	0 %	25 %	25 %	312134117
113	NC_014657	GAAA	2	8	45610	45617	75 %	0 %	25 %	0 %	312134117
114	NC_014657	CAAG	2	8	46183	46190	50 %	0 %	25 %	25 %	312134117
115	NC_014657	ATAA	2	8	46688	46695	75 %	25 %	0 %	0 %	312134118
116	NC_014657	AAGG	2	8	47182	47189	50 %	0 %	50 %	0 %	312134119
117	NC_014657	TGTA	2	8	47301	47308	25 %	50 %	25 %	0 %	312134119
118	NC_014657	GAAA	2	8	48047	48054	75 %	0 %	25 %	0 %	312134120
119	NC_014657	GGAT	2	8	48127	48134	25 %	25 %	50 %	0 %	312134120
120	NC_014657	TCAT	2	8	48628	48635	25 %	50 %	0 %	25 %	312134120
121	NC_014657	GAAA	2	8	48722	48729	75 %	0 %	25 %	0 %	312134120
122	NC_014657	CAGG	2	8	48796	48803	25 %	0 %	50 %	25 %	312134120
123	NC_014657	TATC	2	8	49023	49030	25 %	50 %	0 %	25 %	312134120
124	NC_014657	CTTG	2	8	49551	49558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014657	TGAA	2	8	50131	50138	50 %	25 %	25 %	0 %	312134122
126	NC_014657	ATTT	2	8	50197	50204	25 %	75 %	0 %	0 %	312134122
127	NC_014657	TCAG	2	8	50274	50281	25 %	25 %	25 %	25 %	312134122
128	NC_014657	CAAT	2	8	50376	50383	50 %	25 %	0 %	25 %	312134122
129	NC_014657	GAAA	2	8	51307	51314	75 %	0 %	25 %	0 %	312134122
130	NC_014657	ATTT	2	8	51506	51513	25 %	75 %	0 %	0 %	312134123
131	NC_014657	AAGA	2	8	52275	52282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014657	AAAG	2	8	53157	53164	75 %	0 %	25 %	0 %	312134124
133	NC_014657	ATAA	2	8	53304	53311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014657	ATGG	2	8	53797	53804	25 %	25 %	50 %	0 %	312134125
135	NC_014657	AAAG	2	8	54377	54384	75 %	0 %	25 %	0 %	312134125
136	NC_014657	ATAA	3	12	54689	54700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014657	AATA	2	8	54842	54849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014657	TCCT	2	8	55085	55092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014657	TTAG	2	8	55836	55843	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014657	TATT	2	8	55905	55912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014657	TTGA	2	8	56263	56270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_014657	AAAG	2	8	56640	56647	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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