MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 32703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014657	GTT	2	6	43	48	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014657	ATG	2	6	127	132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134083
3	NC_014657	AGG	2	6	157	162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134083
4	NC_014657	TCA	2	6	163	168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134083
5	NC_014657	GAC	2	6	243	248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134083
6	NC_014657	TTC	2	6	373	378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134083
7	NC_014657	AAC	2	6	440	445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134083
8	NC_014657	TGT	2	6	479	484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134083
9	NC_014657	AAC	2	6	492	497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134083
10	NC_014657	TGA	2	6	719	724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134083
11	NC_014657	GAC	2	6	765	770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134083
12	NC_014657	AGG	2	6	802	807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134083
13	NC_014657	ATA	2	6	852	857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134083
14	NC_014657	AGA	2	6	896	901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134083
15	NC_014657	AAG	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134083
16	NC_014657	AAG	2	6	1262	1267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134083
17	NC_014657	TGT	2	6	1439	1444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134083
18	NC_014657	AAT	2	6	1477	1482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134083
19	NC_014657	TTA	2	6	1604	1609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014657	ATT	3	9	1624	1632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014657	TAC	2	6	1635	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014657	AAG	2	6	1642	1647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014657	TGG	2	6	1654	1659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014657	GGA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014657	TGT	2	6	1709	1714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134084
26	NC_014657	CTG	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134084
27	NC_014657	CAA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134084
28	NC_014657	ACC	2	6	1830	1835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312134084
29	NC_014657	AAG	2	6	1988	1993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134084
30	NC_014657	AGA	2	6	1996	2001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134084
31	NC_014657	TTG	2	6	2080	2085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134084
32	NC_014657	TTG	2	6	2095	2100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134084
33	NC_014657	GAT	2	6	2184	2189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134084
34	NC_014657	TTG	2	6	2200	2205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134084
35	NC_014657	CAA	2	6	2383	2388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134084
36	NC_014657	CAA	2	6	2455	2460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134084
37	NC_014657	GAT	2	6	2567	2572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134084
38	NC_014657	ATA	2	6	2839	2844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134085
39	NC_014657	TAA	2	6	3011	3016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134085
40	NC_014657	AAT	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134085
41	NC_014657	GAC	2	6	3227	3232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134085
42	NC_014657	CTT	2	6	3304	3309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134085
43	NC_014657	ATA	2	6	3349	3354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134085
44	NC_014657	GAA	3	9	3520	3528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134085
45	NC_014657	GGT	2	6	3548	3553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134085
46	NC_014657	ACA	2	6	3580	3585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134085
47	NC_014657	TGC	2	6	3696	3701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134085
48	NC_014657	AGA	2	6	3758	3763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134085
49	NC_014657	TCA	2	6	3955	3960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134086
50	NC_014657	CTT	2	6	3972	3977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134086
51	NC_014657	AGA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134086
52	NC_014657	TTG	2	6	4057	4062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134086
53	NC_014657	ATG	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134086
54	NC_014657	ATA	2	6	4089	4094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134086
55	NC_014657	AAT	2	6	4124	4129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134086
56	NC_014657	GTC	2	6	4139	4144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134086
57	NC_014657	AAT	2	6	4259	4264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134087
58	NC_014657	TCA	2	6	4369	4374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134087
59	NC_014657	TCG	2	6	4389	4394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134087
60	NC_014657	GTT	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134087
61	NC_014657	GGT	2	6	4562	4567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134087
62	NC_014657	CGG	2	6	4597	4602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312134087
63	NC_014657	TGT	2	6	4624	4629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134087
64	NC_014657	CGA	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134087
65	NC_014657	ATG	2	6	4917	4922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134087
66	NC_014657	ACA	2	6	5076	5081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134087
67	NC_014657	CAA	2	6	5085	5090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134087
68	NC_014657	CTG	2	6	5124	5129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134087
69	NC_014657	TGC	2	6	5332	5337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134087
70	NC_014657	AGA	2	6	5344	5349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134087
71	NC_014657	TAA	2	6	5436	5441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134087
72	NC_014657	GGT	2	6	5549	5554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134087
73	NC_014657	CTT	2	6	5663	5668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134087
74	NC_014657	CTT	3	9	5786	5794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134087
75	NC_014657	GAA	2	6	6021	6026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134087
76	NC_014657	TTC	3	9	6027	6035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134087
77	NC_014657	AGA	2	6	6064	6069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134087
78	NC_014657	AAG	2	6	6106	6111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134087
79	NC_014657	CAG	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134088
80	NC_014657	TGT	2	6	6265	6270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134088
81	NC_014657	AAT	2	6	6301	6306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134088
82	NC_014657	AAG	2	6	6442	6447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134088
83	NC_014657	TAA	2	6	6454	6459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134088
84	NC_014657	TGA	2	6	6508	6513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134088
85	NC_014657	GCA	2	6	6584	6589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134088
86	NC_014657	AAG	2	6	6623	6628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134088
87	NC_014657	AGA	2	6	6826	6831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134089
88	NC_014657	TGC	2	6	6936	6941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134089
89	NC_014657	TTG	2	6	6995	7000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134089
90	NC_014657	CTG	2	6	7040	7045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134089
91	NC_014657	TGA	2	6	7137	7142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134089
92	NC_014657	CAA	2	6	7226	7231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134089
93	NC_014657	CCT	2	6	7237	7242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312134089
94	NC_014657	GAT	2	6	7306	7311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134089
95	NC_014657	AAT	2	6	7320	7325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134089
96	NC_014657	AGG	2	6	7347	7352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134089
97	NC_014657	AAT	2	6	7461	7466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134089
98	NC_014657	TTG	2	6	7697	7702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134089
99	NC_014657	AGA	2	6	7777	7782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134089
100	NC_014657	AGA	2	6	7806	7811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134089
101	NC_014657	ATA	2	6	7864	7869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134089
102	NC_014657	TCA	2	6	7882	7887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134089
103	NC_014657	AGA	3	9	8007	8015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134089
104	NC_014657	GAT	2	6	8034	8039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134089
105	NC_014657	AGA	2	6	8134	8139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134089
106	NC_014657	GAA	2	6	8176	8181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134089
107	NC_014657	CAA	2	6	8300	8305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134089
108	NC_014657	GAT	2	6	8311	8316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134089
109	NC_014657	TTG	2	6	8318	8323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134089
110	NC_014657	ACA	3	9	8338	8346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134089
111	NC_014657	CAC	2	6	8347	8352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312134089
112	NC_014657	AAG	2	6	8510	8515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134089
113	NC_014657	ATG	2	6	8524	8529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134089
114	NC_014657	GAT	3	9	8617	8625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134089
115	NC_014657	ATG	2	6	8711	8716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134089
116	NC_014657	TTG	2	6	8780	8785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134089
117	NC_014657	TCT	2	6	8814	8819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134089
118	NC_014657	AAG	2	6	8847	8852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134089
119	NC_014657	TTG	2	6	8933	8938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134089
120	NC_014657	ATC	2	6	9087	9092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134089
121	NC_014657	GAG	2	6	9112	9117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134089
122	NC_014657	GTG	2	6	9165	9170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014657	GTT	2	6	9205	9210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014657	AAC	2	6	9223	9228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134090
125	NC_014657	TTC	2	6	9234	9239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134090
126	NC_014657	ATA	2	6	9253	9258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134090
127	NC_014657	TCA	2	6	9266	9271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134090
128	NC_014657	TTA	2	6	9366	9371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134090
129	NC_014657	TTC	2	6	9454	9459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134090
130	NC_014657	AAT	2	6	9579	9584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134090
131	NC_014657	ATG	2	6	9624	9629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134090
132	NC_014657	TCT	2	6	9667	9672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134090
133	NC_014657	ATT	2	6	10076	10081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134090
134	NC_014657	TTA	2	6	10131	10136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014657	TAT	2	6	10137	10142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014657	TGA	3	9	10253	10261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134091
137	NC_014657	TAA	2	6	10304	10309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134091
138	NC_014657	GCT	2	6	10348	10353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134091
139	NC_014657	TTG	2	6	10373	10378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134091
140	NC_014657	GGA	2	6	10453	10458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134091
141	NC_014657	TAA	2	6	10463	10468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134091
142	NC_014657	TAT	2	6	10513	10518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134091
143	NC_014657	TTA	2	6	10556	10561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134091
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149	NC_014657	ATA	2	6	10910	10915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134091
150	NC_014657	TAA	2	6	10955	10960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134091
151	NC_014657	CAC	2	6	11200	11205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312134091
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153	NC_014657	ATG	2	6	11278	11283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014657	TAA	2	6	11328	11333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014657	CAA	2	6	11403	11408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134092
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157	NC_014657	TTC	2	6	11452	11457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134092
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159	NC_014657	TTC	2	6	11494	11499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134092
160	NC_014657	ATT	2	6	11636	11641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134092
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162	NC_014657	TAT	2	6	11719	11724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134092
163	NC_014657	TTG	2	6	11757	11762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134092
164	NC_014657	TTA	2	6	11763	11768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134092
165	NC_014657	TAA	2	6	11881	11886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134092
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197	NC_014657	TTG	2	6	14228	14233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_014657	TAA	2	6	15456	15461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
211	NC_014657	ACA	2	6	15560	15565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134095
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258	NC_014657	GAT	2	6	19377	19382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134098
259	NC_014657	ATG	2	6	19384	19389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134098
260	NC_014657	GGA	2	6	19407	19412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134098
261	NC_014657	GGA	2	6	19443	19448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134098
262	NC_014657	TGG	3	9	19457	19465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134098
263	NC_014657	CAT	2	6	19636	19641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_014657	ATA	2	6	21993	21998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_014657	TAT	2	6	29304	29309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134105
380	NC_014657	GAG	2	6	29331	29336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134105
381	NC_014657	GAA	2	6	29348	29353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134105
382	NC_014657	TAA	2	6	29377	29382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134105
383	NC_014657	GGA	2	6	29510	29515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
384	NC_014657	TTA	2	6	29598	29603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134106
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