MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 57205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_014657	TGT	2	6	167337	167342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134198
4003	NC_014657	AAG	2	6	167351	167356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134198
4004	NC_014657	AAG	2	6	167381	167386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134198
4005	NC_014657	ACA	2	6	167416	167421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134198
4006	NC_014657	AGGA	2	8	167438	167445	50 %	0 %	50 %	0 %	312134198
4007	NC_014657	AGA	2	6	167522	167527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134198
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4010	NC_014657	AGAGGA	2	12	167647	167658	50 %	0 %	50 %	0 %	312134198
4011	NC_014657	GGT	2	6	167716	167721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134198
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4013	NC_014657	TTGGC	2	10	167739	167748	0 %	40 %	40 %	20 %	312134198
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4019	NC_014657	TGGT	2	8	167989	167996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_014657	CAAT	2	8	168034	168041	50 %	25 %	0 %	25 %	312134199
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4037	NC_014657	TGC	2	6	168718	168723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134200
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4055	NC_014657	GAG	2	6	169638	169643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_014657	TCA	2	6	169763	169768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134202
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4097	NC_014657	CAAT	2	8	171631	171638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_014657	AAAAT	2	10	171678	171687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4100	NC_014657	AAAT	2	8	171827	171834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_014657	TGG	2	6	171842	171847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4115	NC_014657	AAG	2	6	172304	172309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_014657	GAA	2	6	172324	172329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134206
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4119	NC_014657	TTTG	2	8	172519	172526	0 %	75 %	25 %	0 %	312134206
4120	NC_014657	A	6	6	172538	172543	100 %	0 %	0 %	0 %	312134206
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4126	NC_014657	A	6	6	172733	172738	100 %	0 %	0 %	0 %	312134206
4127	NC_014657	CAGA	2	8	172771	172778	50 %	0 %	25 %	25 %	312134206
4128	NC_014657	GCA	2	6	172898	172903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134206
4129	NC_014657	TAT	2	6	172969	172974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134206
4130	NC_014657	CTT	2	6	172994	172999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134206
4131	NC_014657	CTA	2	6	173022	173027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134206
4132	NC_014657	CTTT	2	8	173037	173044	0 %	75 %	0 %	25 %	312134206
4133	NC_014657	CTT	2	6	173192	173197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134206
4134	NC_014657	GAT	2	6	173212	173217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134206
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4138	NC_014657	TCTG	2	8	173410	173417	0 %	50 %	25 %	25 %	312134206
4139	NC_014657	GAA	2	6	173456	173461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134206
4140	NC_014657	TGA	2	6	173470	173475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134206
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4143	NC_014657	GCT	2	6	173711	173716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134206
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4147	NC_014657	TTC	2	6	173831	173836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134206
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4151	NC_014657	ATG	2	6	173967	173972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134206
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4156	NC_014657	TA	3	6	174290	174295	50 %	50 %	0 %	0 %	312134206
4157	NC_014657	GAACT	2	10	174327	174336	40 %	20 %	20 %	20 %	312134206
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4160	NC_014657	TAA	2	6	174381	174386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134206
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4163	NC_014657	GAA	2	6	174473	174478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134206
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4166	NC_014657	TTG	2	6	174710	174715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134207
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4236	NC_014657	CTT	2	6	177871	177876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4237	NC_014657	TGC	2	6	177888	177893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4238	NC_014657	TA	3	6	177980	177985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4239	NC_014657	AAAT	2	8	178022	178029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_014657	T	6	6	178079	178084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_014657	T	7	7	178086	178092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_014657	GCAA	2	8	178093	178100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4243	NC_014657	AAT	2	6	178137	178142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_014657	GA	3	6	178143	178148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_014657	AGG	2	6	178160	178165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_014657	A	6	6	178181	178186	100 %	0 %	0 %	0 %	312134209
4247	NC_014657	GCTT	2	8	178212	178219	0 %	50 %	25 %	25 %	312134209
4248	NC_014657	CAG	2	6	178281	178286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134209
4249	NC_014657	ACT	2	6	178344	178349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134209
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4251	NC_014657	TG	3	6	178432	178437	0 %	50 %	50 %	0 %	312134209
4252	NC_014657	GA	3	6	178465	178470	50 %	0 %	50 %	0 %	312134209
4253	NC_014657	TGT	2	6	178492	178497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134209
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4258	NC_014657	AG	3	6	178798	178803	50 %	0 %	50 %	0 %	312134209
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4277	NC_014657	TGA	2	6	179590	179595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134209
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4362	NC_014657	A	6	6	183233	183238	100 %	0 %	0 %	0 %	312134214
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4368	NC_014657	TCAA	2	8	183583	183590	50 %	25 %	0 %	25 %	312134214
4369	NC_014657	A	6	6	183612	183617	100 %	0 %	0 %	0 %	312134214
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4373	NC_014657	AAG	2	6	183822	183827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134214
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4376	NC_014657	TG	3	6	183898	183903	0 %	50 %	50 %	0 %	312134214
4377	NC_014657	GTG	3	9	183901	183909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134214
4378	NC_014657	TAT	2	6	183950	183955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134214
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4380	NC_014657	ATG	2	6	184092	184097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134214
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4385	NC_014657	TGC	2	6	184283	184288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134214
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4389	NC_014657	CTG	2	6	184436	184441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4391	NC_014657	TGA	2	6	184478	184483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4397	NC_014657	GCT	2	6	184665	184670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134215
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4407	NC_014657	AT	3	6	185189	185194	50 %	50 %	0 %	0 %	312134216
4408	NC_014657	AAAAC	2	10	185195	185204	80 %	0 %	0 %	20 %	312134216
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4419	NC_014657	A	6	6	185902	185907	100 %	0 %	0 %	0 %	312134217
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4422	NC_014657	TTTC	2	8	186020	186027	0 %	75 %	0 %	25 %	312134217
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4441	NC_014657	A	6	6	187036	187041	100 %	0 %	0 %	0 %	312134218
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4462	NC_014657	TG	3	6	187971	187976	0 %	50 %	50 %	0 %	312134220
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4481	NC_014657	TC	3	6	188648	188653	0 %	50 %	0 %	50 %	312134221
4482	NC_014657	ATA	2	6	188719	188724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134221
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4487	NC_014657	TA	4	8	188918	188925	50 %	50 %	0 %	0 %	312134221
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4490	NC_014657	GTGGG	2	10	189044	189053	0 %	20 %	80 %	0 %	312134222
4491	NC_014657	TTG	2	6	189084	189089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134222
4492	NC_014657	TTTG	2	8	189110	189117	0 %	75 %	25 %	0 %	312134222
4493	NC_014657	AAAAGA	2	12	189162	189173	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312134222
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4496	NC_014657	T	6	6	189270	189275	0 %	100 %	0 %	0 %	312134222
4497	NC_014657	TGA	2	6	189284	189289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134222
4498	NC_014657	A	6	6	189365	189370	100 %	0 %	0 %	0 %	312134222
4499	NC_014657	ACA	2	6	189412	189417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134222
4500	NC_014657	AGG	2	6	189535	189540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134222

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