MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 57205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_014657	TTGT	2	8	41815	41822	0 %	75 %	25 %	0 %	312134116
1003	NC_014657	ATG	2	6	41830	41835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134116
1004	NC_014657	A	6	6	41836	41841	100 %	0 %	0 %	0 %	312134116
1005	NC_014657	TGT	2	6	41915	41920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134116
1006	NC_014657	GAT	2	6	41925	41930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134116
1007	NC_014657	ACA	2	6	42021	42026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134116
1008	NC_014657	AAT	2	6	42039	42044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134116
1009	NC_014657	GAT	2	6	42264	42269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134116
1010	NC_014657	TTC	2	6	42405	42410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134116
1011	NC_014657	ATG	2	6	42432	42437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134116
1012	NC_014657	AAGA	2	8	42466	42473	75 %	0 %	25 %	0 %	312134116
1013	NC_014657	AAG	2	6	42479	42484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134116
1014	NC_014657	GATAT	2	10	42595	42604	40 %	40 %	20 %	0 %	312134116
1015	NC_014657	ATGT	2	8	42702	42709	25 %	50 %	25 %	0 %	312134116
1016	NC_014657	TTG	2	6	42739	42744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134116
1017	NC_014657	GCAA	2	8	42768	42775	50 %	0 %	25 %	25 %	312134116
1018	NC_014657	GCAT	2	8	42782	42789	25 %	25 %	25 %	25 %	312134116
1019	NC_014657	GAT	2	6	42840	42845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134116
1020	NC_014657	GGA	2	6	42858	42863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134116
1021	NC_014657	TGG	2	6	42921	42926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134116
1022	NC_014657	AACT	2	8	42956	42963	50 %	25 %	0 %	25 %	312134116
1023	NC_014657	TAC	2	6	42978	42983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134116
1024	NC_014657	GTT	2	6	43005	43010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134116
1025	NC_014657	TTG	2	6	43039	43044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134116
1026	NC_014657	TTA	2	6	43081	43086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134116
1027	NC_014657	TGA	2	6	43118	43123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134116
1028	NC_014657	GGAA	2	8	43151	43158	50 %	0 %	50 %	0 %	312134116
1029	NC_014657	GTT	2	6	43245	43250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134116
1030	NC_014657	CAG	2	6	43294	43299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134116
1031	NC_014657	TTAG	2	8	43314	43321	25 %	50 %	25 %	0 %	312134116
1032	NC_014657	ATG	2	6	43348	43353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134116
1033	NC_014657	GTA	2	6	43419	43424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134116
1034	NC_014657	AAG	2	6	43427	43432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134116
1035	NC_014657	GAA	2	6	43458	43463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134116
1036	NC_014657	AT	4	8	43480	43487	50 %	50 %	0 %	0 %	312134116
1037	NC_014657	ATG	2	6	43516	43521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134116
1038	NC_014657	TAT	2	6	43553	43558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134116
1039	NC_014657	ATT	2	6	43580	43585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134116
1040	NC_014657	ATT	2	6	43623	43628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134116
1041	NC_014657	AT	3	6	43640	43645	50 %	50 %	0 %	0 %	312134116
1042	NC_014657	TATGCA	2	12	43689	43700	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312134116
1043	NC_014657	CA	3	6	43921	43926	50 %	0 %	0 %	50 %	312134116
1044	NC_014657	ATG	2	6	43936	43941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134116
1045	NC_014657	GCAA	2	8	44028	44035	50 %	0 %	25 %	25 %	312134116
1046	NC_014657	CAT	2	6	44162	44167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134116
1047	NC_014657	TCT	2	6	44229	44234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134116
1048	NC_014657	CTG	2	6	44254	44259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134116
1049	NC_014657	ATA	2	6	44287	44292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134116
1050	NC_014657	TGA	2	6	44315	44320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134116
1051	NC_014657	ATC	2	6	44340	44345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134116
1052	NC_014657	GGT	2	6	44469	44474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134116
1053	NC_014657	AAG	2	6	44480	44485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134116
1054	NC_014657	A	6	6	44510	44515	100 %	0 %	0 %	0 %	312134116
1055	NC_014657	A	6	6	44540	44545	100 %	0 %	0 %	0 %	312134116
1056	NC_014657	AAG	3	9	44548	44556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134116
1057	NC_014657	GA	4	8	44562	44569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_014657	TC	3	6	44574	44579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_014657	TTTG	2	8	44588	44595	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014657	A	6	6	44623	44628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014657	AT	3	6	44726	44731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014657	CAG	2	6	44823	44828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134117
1063	NC_014657	CTA	2	6	44843	44848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134117
1064	NC_014657	GC	3	6	44852	44857	0 %	0 %	50 %	50 %	312134117
1065	NC_014657	TA	3	6	44891	44896	50 %	50 %	0 %	0 %	312134117
1066	NC_014657	GAC	2	6	44951	44956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134117
1067	NC_014657	AGAC	2	8	44964	44971	50 %	0 %	25 %	25 %	312134117
1068	NC_014657	AG	5	10	45063	45072	50 %	0 %	50 %	0 %	312134117
1069	NC_014657	GCG	2	6	45075	45080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312134117
1070	NC_014657	TGG	2	6	45088	45093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134117
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1072	NC_014657	TGT	2	6	45172	45177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134117
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1075	NC_014657	TAT	2	6	45273	45278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134117
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1078	NC_014657	CAGAA	2	10	45397	45406	60 %	0 %	20 %	20 %	312134117
1079	NC_014657	GA	3	6	45537	45542	50 %	0 %	50 %	0 %	312134117
1080	NC_014657	CT	3	6	45584	45589	0 %	50 %	0 %	50 %	312134117
1081	NC_014657	GAAA	2	8	45610	45617	75 %	0 %	25 %	0 %	312134117
1082	NC_014657	A	7	7	45615	45621	100 %	0 %	0 %	0 %	312134117
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1090	NC_014657	GGT	2	6	46046	46051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134117
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1092	NC_014657	CAAG	2	8	46183	46190	50 %	0 %	25 %	25 %	312134117
1093	NC_014657	AAT	2	6	46237	46242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134117
1094	NC_014657	ATC	2	6	46254	46259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134117
1095	NC_014657	A	6	6	46364	46369	100 %	0 %	0 %	0 %	312134117
1096	NC_014657	AAT	2	6	46409	46414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014657	TGC	2	6	46478	46483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134118
1098	NC_014657	TA	3	6	46505	46510	50 %	50 %	0 %	0 %	312134118
1099	NC_014657	ATGTAA	2	12	46556	46567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312134118
1100	NC_014657	GAA	2	6	46578	46583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134118
1101	NC_014657	A	6	6	46638	46643	100 %	0 %	0 %	0 %	312134118
1102	NC_014657	ATAA	2	8	46688	46695	75 %	25 %	0 %	0 %	312134118
1103	NC_014657	AGC	2	6	46733	46738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134118
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1106	NC_014657	AAG	3	9	46813	46821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134118
1107	NC_014657	TGC	3	9	46824	46832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134118
1108	NC_014657	A	6	6	46855	46860	100 %	0 %	0 %	0 %	312134118
1109	NC_014657	TAT	2	6	46920	46925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014657	T	6	6	46963	46968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014657	AGC	2	6	46969	46974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_014657	ACT	2	6	46997	47002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_014657	GAAAA	2	10	47081	47090	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014657	A	6	6	47087	47092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014657	GGA	2	6	47093	47098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014657	TTG	3	9	47129	47137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134119
1117	NC_014657	ATG	2	6	47138	47143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134119
1118	NC_014657	TTG	2	6	47153	47158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134119
1119	NC_014657	ATA	2	6	47161	47166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134119
1120	NC_014657	AAGG	2	8	47182	47189	50 %	0 %	50 %	0 %	312134119
1121	NC_014657	TGTA	2	8	47301	47308	25 %	50 %	25 %	0 %	312134119
1122	NC_014657	TGA	2	6	47361	47366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134119
1123	NC_014657	GAT	2	6	47401	47406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134119
1124	NC_014657	AG	3	6	47431	47436	50 %	0 %	50 %	0 %	312134119
1125	NC_014657	GAG	2	6	47463	47468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134119
1126	NC_014657	GAA	2	6	47547	47552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134119
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1128	NC_014657	GA	3	6	47580	47585	50 %	0 %	50 %	0 %	312134119
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