MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 57205

< Previous12...103104105106107108109110111112113114115Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_014657	CAA	2	6	2421443	2421448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136220
57002	NC_014657	ACC	2	6	2421450	2421455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136220
57003	NC_014657	CAA	2	6	2421470	2421475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136220
57004	NC_014657	TCA	2	6	2421538	2421543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136220
57005	NC_014657	CAT	2	6	2421545	2421550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136220
57006	NC_014657	CAA	2	6	2421557	2421562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136220
57007	NC_014657	GCA	2	6	2421565	2421570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136220
57008	NC_014657	CAA	2	6	2421701	2421706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136220
57009	NC_014657	ACAA	2	8	2421760	2421767	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57010	NC_014657	TAATG	2	10	2421823	2421832	40 %	40 %	20 %	0 %	312136221
57011	NC_014657	CTC	2	6	2421850	2421855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136221
57012	NC_014657	TGT	2	6	2421868	2421873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136221
57013	NC_014657	GTG	2	6	2421896	2421901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136221
57014	NC_014657	TTC	2	6	2421909	2421914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136221
57015	NC_014657	CTT	2	6	2421956	2421961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136221
57016	NC_014657	CTT	2	6	2421991	2421996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136221
57017	NC_014657	AAG	2	6	2422036	2422041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136221
57018	NC_014657	TCC	2	6	2422055	2422060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136221
57019	NC_014657	CTC	2	6	2422068	2422073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136221
57020	NC_014657	CAA	2	6	2422080	2422085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136221
57021	NC_014657	ATCC	2	8	2422195	2422202	25 %	25 %	0 %	50 %	312136221
57022	NC_014657	AGCA	2	8	2422225	2422232	50 %	0 %	25 %	25 %	312136221
57023	NC_014657	TCT	2	6	2422254	2422259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136221
57024	NC_014657	ATT	2	6	2422310	2422315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136221
57025	NC_014657	TCA	2	6	2422337	2422342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136221
57026	NC_014657	ATT	2	6	2422343	2422348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136221
57027	NC_014657	T	6	6	2422425	2422430	0 %	100 %	0 %	0 %	312136221
57028	NC_014657	TCC	2	6	2422453	2422458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57029	NC_014657	T	6	6	2422469	2422474	0 %	100 %	0 %	0 %	312136222
57030	NC_014657	TCT	3	9	2422481	2422489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136222
57031	NC_014657	T	7	7	2422493	2422499	0 %	100 %	0 %	0 %	312136222
57032	NC_014657	CTG	2	6	2422515	2422520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136222
57033	NC_014657	CT	3	6	2422536	2422541	0 %	50 %	0 %	50 %	312136222
57034	NC_014657	TC	3	6	2422545	2422550	0 %	50 %	0 %	50 %	312136222
57035	NC_014657	TCA	2	6	2422591	2422596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136222
57036	NC_014657	TCT	2	6	2422609	2422614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136222
57037	NC_014657	TTC	2	6	2422626	2422631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136222
57038	NC_014657	T	6	6	2422652	2422657	0 %	100 %	0 %	0 %	312136222
57039	NC_014657	T	6	6	2422677	2422682	0 %	100 %	0 %	0 %	312136222
57040	NC_014657	CTTCT	2	10	2422683	2422692	0 %	60 %	0 %	40 %	312136222
57041	NC_014657	T	6	6	2422698	2422703	0 %	100 %	0 %	0 %	312136222
57042	NC_014657	T	6	6	2422713	2422718	0 %	100 %	0 %	0 %	312136222
57043	NC_014657	CTG	2	6	2422743	2422748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136222
57044	NC_014657	AATAA	2	10	2422812	2422821	80 %	20 %	0 %	0 %	312136222
57045	NC_014657	TTG	2	6	2422852	2422857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136222
57046	NC_014657	TGA	2	6	2422923	2422928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136222
57047	NC_014657	AAG	2	6	2422941	2422946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136222
57048	NC_014657	GCA	2	6	2422954	2422959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136222
57049	NC_014657	GAA	2	6	2422970	2422975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136222
57050	NC_014657	CAG	2	6	2422977	2422982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136222
57051	NC_014657	T	6	6	2422986	2422991	0 %	100 %	0 %	0 %	312136222
57052	NC_014657	A	6	6	2423008	2423013	100 %	0 %	0 %	0 %	312136222
57053	NC_014657	TCA	2	6	2423041	2423046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136222
57054	NC_014657	ATA	2	6	2423148	2423153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136222
57055	NC_014657	A	6	6	2423159	2423164	100 %	0 %	0 %	0 %	312136222
57056	NC_014657	GAAT	2	8	2423326	2423333	50 %	25 %	25 %	0 %	312136222
57057	NC_014657	TA	3	6	2423340	2423345	50 %	50 %	0 %	0 %	312136222
57058	NC_014657	GAA	3	9	2423351	2423359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136222
57059	NC_014657	AAG	2	6	2423379	2423384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136222
57060	NC_014657	TG	3	6	2423414	2423419	0 %	50 %	50 %	0 %	312136222
57061	NC_014657	AT	3	6	2423436	2423441	50 %	50 %	0 %	0 %	312136222
57062	NC_014657	A	6	6	2423473	2423478	100 %	0 %	0 %	0 %	312136222
57063	NC_014657	TTTC	2	8	2423501	2423508	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57064	NC_014657	CTC	2	6	2423509	2423514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57065	NC_014657	CTATTT	2	12	2423549	2423560	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312136223
57066	NC_014657	CCG	2	6	2423574	2423579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312136223
57067	NC_014657	ATGG	2	8	2423587	2423594	25 %	25 %	50 %	0 %	312136223
57068	NC_014657	TAT	2	6	2423600	2423605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136223
57069	NC_014657	AAC	2	6	2423699	2423704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136223
57070	NC_014657	AT	3	6	2423763	2423768	50 %	50 %	0 %	0 %	312136223
57071	NC_014657	T	7	7	2423768	2423774	0 %	100 %	0 %	0 %	312136223
57072	NC_014657	TCT	2	6	2423832	2423837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136224
57073	NC_014657	TTTAT	2	10	2423868	2423877	20 %	80 %	0 %	0 %	312136224
57074	NC_014657	TTC	2	6	2423887	2423892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136224
57075	NC_014657	CAA	2	6	2423902	2423907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136224
57076	NC_014657	TTTAT	2	10	2423922	2423931	20 %	80 %	0 %	0 %	312136224
57077	NC_014657	ACA	2	6	2424057	2424062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136224
57078	NC_014657	CTT	2	6	2424090	2424095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136224
57079	NC_014657	CTC	2	6	2424110	2424115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312136224
57080	NC_014657	T	8	8	2424117	2424124	0 %	100 %	0 %	0 %	312136224
57081	NC_014657	TTCA	2	8	2424141	2424148	25 %	50 %	0 %	25 %	312136224
57082	NC_014657	CTT	2	6	2424149	2424154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57083	NC_014657	TTAT	2	8	2424174	2424181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57084	NC_014657	CTT	2	6	2424187	2424192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57085	NC_014657	T	8	8	2424191	2424198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57086	NC_014657	TCT	3	9	2424269	2424277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136225
57087	NC_014657	TTC	2	6	2424289	2424294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136225
57088	NC_014657	CTAA	2	8	2424312	2424319	50 %	25 %	0 %	25 %	312136225
57089	NC_014657	GT	3	6	2424326	2424331	0 %	50 %	50 %	0 %	312136225
57090	NC_014657	TCT	2	6	2424338	2424343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136225
57091	NC_014657	CTC	2	6	2424382	2424387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57092	NC_014657	TAT	2	6	2424441	2424446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57093	NC_014657	GTT	2	6	2424475	2424480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57094	NC_014657	TGC	2	6	2424481	2424486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57095	NC_014657	T	6	6	2424495	2424500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57096	NC_014657	A	6	6	2424514	2424519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57097	NC_014657	T	6	6	2424529	2424534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57098	NC_014657	TAT	2	6	2424548	2424553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57099	NC_014657	CTG	2	6	2424559	2424564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57100	NC_014657	AAAT	2	8	2424569	2424576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57101	NC_014657	A	6	6	2424599	2424604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57102	NC_014657	A	6	6	2424609	2424614	100 %	0 %	0 %	0 %	312136226
57103	NC_014657	CAT	2	6	2424637	2424642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136226
57104	NC_014657	TAA	2	6	2424700	2424705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136226
57105	NC_014657	TAA	2	6	2424778	2424783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136226
57106	NC_014657	GA	3	6	2424809	2424814	50 %	0 %	50 %	0 %	312136226
57107	NC_014657	GAA	2	6	2424849	2424854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136226
57108	NC_014657	AGA	2	6	2424902	2424907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136226
57109	NC_014657	GAA	2	6	2425023	2425028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136226
57110	NC_014657	GTT	2	6	2425041	2425046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136226
57111	NC_014657	TTA	2	6	2425099	2425104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136226
57112	NC_014657	GAA	2	6	2425105	2425110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136226
57113	NC_014657	TC	3	6	2425140	2425145	0 %	50 %	0 %	50 %	312136226
57114	NC_014657	TA	3	6	2425185	2425190	50 %	50 %	0 %	0 %	312136226
57115	NC_014657	A	7	7	2425202	2425208	100 %	0 %	0 %	0 %	312136226
57116	NC_014657	GAC	2	6	2425231	2425236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136226
57117	NC_014657	TA	3	6	2425275	2425280	50 %	50 %	0 %	0 %	312136226
57118	NC_014657	AGA	2	6	2425292	2425297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136226
57119	NC_014657	GTT	2	6	2425350	2425355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136226
57120	NC_014657	GGAA	2	8	2425367	2425374	50 %	0 %	50 %	0 %	312136226
57121	NC_014657	TTG	2	6	2425387	2425392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136226
57122	NC_014657	AT	3	6	2425421	2425426	50 %	50 %	0 %	0 %	312136226
57123	NC_014657	TTG	2	6	2425429	2425434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136226
57124	NC_014657	ATT	3	9	2425456	2425464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136226
57125	NC_014657	ATT	2	6	2425474	2425479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136226
57126	NC_014657	T	6	6	2425512	2425517	0 %	100 %	0 %	0 %	312136226
57127	NC_014657	CAA	2	6	2425522	2425527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136226
57128	NC_014657	CTGC	2	8	2425530	2425537	0 %	25 %	25 %	50 %	312136226
57129	NC_014657	ACA	2	6	2425554	2425559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136226
57130	NC_014657	CAGG	2	8	2425611	2425618	25 %	0 %	50 %	25 %	312136226
57131	NC_014657	AAG	2	6	2425678	2425683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136226
57132	NC_014657	GGCA	2	8	2425711	2425718	25 %	0 %	50 %	25 %	312136226
57133	NC_014657	GCA	2	6	2425752	2425757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312136226
57134	NC_014657	TGG	2	6	2425786	2425791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136226
57135	NC_014657	TCT	2	6	2425881	2425886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136226
57136	NC_014657	AAT	2	6	2425904	2425909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136226
57137	NC_014657	A	7	7	2426042	2426048	100 %	0 %	0 %	0 %	312136226
57138	NC_014657	GGT	2	6	2426084	2426089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57139	NC_014657	A	6	6	2426090	2426095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57140	NC_014657	T	6	6	2426142	2426147	0 %	100 %	0 %	0 %	312136227
57141	NC_014657	AATAG	2	10	2426151	2426160	60 %	20 %	20 %	0 %	312136227
57142	NC_014657	TTA	2	6	2426167	2426172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136227
57143	NC_014657	CAC	2	6	2426194	2426199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312136227
57144	NC_014657	A	6	6	2426201	2426206	100 %	0 %	0 %	0 %	312136227
57145	NC_014657	TTAT	2	8	2426269	2426276	25 %	75 %	0 %	0 %	312136227
57146	NC_014657	TA	3	6	2426361	2426366	50 %	50 %	0 %	0 %	312136227
57147	NC_014657	TTTC	2	8	2426372	2426379	0 %	75 %	0 %	25 %	312136227
57148	NC_014657	TTG	2	6	2426407	2426412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136227
57149	NC_014657	TAT	2	6	2426447	2426452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136227
57150	NC_014657	T	7	7	2426452	2426458	0 %	100 %	0 %	0 %	312136227
57151	NC_014657	A	6	6	2426496	2426501	100 %	0 %	0 %	0 %	312136227
57152	NC_014657	CATT	2	8	2426539	2426546	25 %	50 %	0 %	25 %	312136227
57153	NC_014657	TTA	2	6	2426566	2426571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136227
57154	NC_014657	TAA	2	6	2426572	2426577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136227
57155	NC_014657	TCT	2	6	2426601	2426606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136227
57156	NC_014657	AT	3	6	2426629	2426634	50 %	50 %	0 %	0 %	312136227
57157	NC_014657	TGG	2	6	2426648	2426653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136227
57158	NC_014657	TA	3	6	2426709	2426714	50 %	50 %	0 %	0 %	312136227
57159	NC_014657	CTG	2	6	2426772	2426777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312136227
57160	NC_014657	ATTTT	2	10	2426786	2426795	20 %	80 %	0 %	0 %	312136227
57161	NC_014657	GCAA	2	8	2426838	2426845	50 %	0 %	25 %	25 %	312136227
57162	NC_014657	T	6	6	2427061	2427066	0 %	100 %	0 %	0 %	312136227
57163	NC_014657	TAGA	2	8	2427091	2427098	50 %	25 %	25 %	0 %	312136227
57164	NC_014657	TACTT	2	10	2427114	2427123	20 %	60 %	0 %	20 %	312136227
57165	NC_014657	GTTGAG	2	12	2427185	2427196	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	312136227
57166	NC_014657	GTG	2	6	2427421	2427426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312136228
57167	NC_014657	TCA	2	6	2427431	2427436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136228
57168	NC_014657	CAAA	2	8	2427483	2427490	75 %	0 %	0 %	25 %	312136228
57169	NC_014657	CA	3	6	2427504	2427509	50 %	0 %	0 %	50 %	312136228
57170	NC_014657	AAT	2	6	2427514	2427519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136228
57171	NC_014657	TTC	2	6	2427573	2427578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136228
57172	NC_014657	TAA	2	6	2427693	2427698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136228
57173	NC_014657	ACT	2	6	2427702	2427707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136228
57174	NC_014657	CAA	2	6	2427780	2427785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136228
57175	NC_014657	CAT	2	6	2427807	2427812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312136228
57176	NC_014657	TCT	2	6	2427821	2427826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136228
57177	NC_014657	A	6	6	2427849	2427854	100 %	0 %	0 %	0 %	312136228
57178	NC_014657	TAA	2	6	2427865	2427870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312136228
57179	NC_014657	CA	3	6	2427892	2427897	50 %	0 %	0 %	50 %	312136228
57180	NC_014657	TAAAA	2	10	2427931	2427940	80 %	20 %	0 %	0 %	312136228
57181	NC_014657	A	6	6	2427967	2427972	100 %	0 %	0 %	0 %	312136228
57182	NC_014657	TAAAA	2	10	2428018	2428027	80 %	20 %	0 %	0 %	312136228
57183	NC_014657	T	7	7	2428039	2428045	0 %	100 %	0 %	0 %	312136228
57184	NC_014657	AAC	2	6	2428057	2428062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312136228
57185	NC_014657	TTG	2	6	2428113	2428118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312136228
57186	NC_014657	A	7	7	2428126	2428132	100 %	0 %	0 %	0 %	312136228
57187	NC_014657	A	7	7	2428174	2428180	100 %	0 %	0 %	0 %	312136228
57188	NC_014657	TCTT	2	8	2428228	2428235	0 %	75 %	0 %	25 %	312136228
57189	NC_014657	A	7	7	2428238	2428244	100 %	0 %	0 %	0 %	312136228
57190	NC_014657	ATTTT	2	10	2428263	2428272	20 %	80 %	0 %	0 %	312136228
57191	NC_014657	TTA	2	6	2428296	2428301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312136228
57192	NC_014657	ATG	2	6	2428313	2428318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312136228
57193	NC_014657	A	6	6	2428326	2428331	100 %	0 %	0 %	0 %	312136228
57194	NC_014657	A	6	6	2428340	2428345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57195	NC_014657	AGA	2	6	2428417	2428422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312136229
57196	NC_014657	T	6	6	2428441	2428446	0 %	100 %	0 %	0 %	312136229
57197	NC_014657	A	6	6	2428532	2428537	100 %	0 %	0 %	0 %	312136229
57198	NC_014657	CTT	2	6	2428549	2428554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312136229
57199	NC_014657	TTAT	2	8	2428558	2428565	25 %	75 %	0 %	0 %	312136229
57200	NC_014657	A	6	6	2428602	2428607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57201	NC_014657	A	6	6	2428618	2428623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57202	NC_014657	ACA	2	6	2428632	2428637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57203	NC_014657	AATCA	2	10	2428678	2428687	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57204	NC_014657	AT	3	6	2428845	2428850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57205	NC_014657	T	8	8	2428871	2428878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...103104105106107108109110111112113114115Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.