MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor owensensis OL chromosome

Total Repeats: 57205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014657	ATA	2	6	211057	211062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_014657	TA	3	6	211153	211158	50 %	50 %	0 %	0 %	312134239
5003	NC_014657	TTG	2	6	211250	211255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134239
5004	NC_014657	TTATC	2	10	211309	211318	20 %	60 %	0 %	20 %	312134239
5005	NC_014657	AGGAAA	2	12	211370	211381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134239
5006	NC_014657	GAT	2	6	211413	211418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134239
5007	NC_014657	TGA	2	6	211440	211445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134239
5008	NC_014657	AGG	2	6	211463	211468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134239
5009	NC_014657	AGA	2	6	211514	211519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134240
5010	NC_014657	TCT	2	6	211530	211535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134240
5011	NC_014657	GCA	2	6	211580	211585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134240
5012	NC_014657	GAA	2	6	211586	211591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134240
5013	NC_014657	TA	3	6	211704	211709	50 %	50 %	0 %	0 %	312134240
5014	NC_014657	TA	3	6	211728	211733	50 %	50 %	0 %	0 %	312134240
5015	NC_014657	TCA	2	6	211749	211754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134240
5016	NC_014657	ATC	2	6	211775	211780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134240
5017	NC_014657	TGA	2	6	211784	211789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134240
5018	NC_014657	AGG	2	6	211796	211801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134240
5019	NC_014657	T	6	6	211814	211819	0 %	100 %	0 %	0 %	312134240
5020	NC_014657	AAG	2	6	211912	211917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_014657	ATA	2	6	211968	211973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134241
5022	NC_014657	T	6	6	212099	212104	0 %	100 %	0 %	0 %	312134241
5023	NC_014657	AAC	2	6	212159	212164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312134241
5024	NC_014657	T	6	6	212184	212189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_014657	TA	3	6	212222	212227	50 %	50 %	0 %	0 %	312134242
5026	NC_014657	ATG	2	6	212237	212242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134242
5027	NC_014657	AGG	2	6	212248	212253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134242
5028	NC_014657	ATTT	2	8	212255	212262	25 %	75 %	0 %	0 %	312134242
5029	NC_014657	GTT	2	6	212272	212277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134242
5030	NC_014657	TAT	2	6	212282	212287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134242
5031	NC_014657	TGC	2	6	212346	212351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134242
5032	NC_014657	A	6	6	212358	212363	100 %	0 %	0 %	0 %	312134242
5033	NC_014657	GTT	2	6	212370	212375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134242
5034	NC_014657	TAT	2	6	212403	212408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134242
5035	NC_014657	CAG	2	6	212423	212428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134242
5036	NC_014657	ATTT	2	8	212444	212451	25 %	75 %	0 %	0 %	312134242
5037	NC_014657	A	6	6	212465	212470	100 %	0 %	0 %	0 %	312134242
5038	NC_014657	A	6	6	212500	212505	100 %	0 %	0 %	0 %	312134242
5039	NC_014657	T	6	6	212510	212515	0 %	100 %	0 %	0 %	312134242
5040	NC_014657	T	6	6	212596	212601	0 %	100 %	0 %	0 %	312134242
5041	NC_014657	TATT	2	8	212639	212646	25 %	75 %	0 %	0 %	312134242
5042	NC_014657	TA	3	6	212655	212660	50 %	50 %	0 %	0 %	312134242
5043	NC_014657	AAT	2	6	212703	212708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134242
5044	NC_014657	AGC	2	6	212768	212773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134242
5045	NC_014657	TAT	2	6	212952	212957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134242
5046	NC_014657	AT	3	6	213059	213064	50 %	50 %	0 %	0 %	312134242
5047	NC_014657	GCT	2	6	213115	213120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134242
5048	NC_014657	GCA	2	6	213121	213126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134242
5049	NC_014657	TGA	2	6	213189	213194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134242
5050	NC_014657	GTA	2	6	213314	213319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134242
5051	NC_014657	TA	3	6	213422	213427	50 %	50 %	0 %	0 %	312134242
5052	NC_014657	TGT	2	6	213447	213452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134242
5053	NC_014657	ATTT	3	12	213463	213474	25 %	75 %	0 %	0 %	312134242
5054	NC_014657	ATT	2	6	213532	213537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134242
5055	NC_014657	GCA	2	6	213541	213546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134242
5056	NC_014657	A	7	7	213546	213552	100 %	0 %	0 %	0 %	312134242
5057	NC_014657	TAT	2	6	213570	213575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134242
5058	NC_014657	GAAG	2	8	213610	213617	50 %	0 %	50 %	0 %	312134242
5059	NC_014657	GGA	2	6	213631	213636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134242
5060	NC_014657	TA	3	6	213686	213691	50 %	50 %	0 %	0 %	312134242
5061	NC_014657	TGA	2	6	213696	213701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134242
5062	NC_014657	TGATTC	2	12	213717	213728	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312134242
5063	NC_014657	AAT	2	6	213777	213782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134242
5064	NC_014657	AC	3	6	213790	213795	50 %	0 %	0 %	50 %	312134242
5065	NC_014657	ATT	2	6	213826	213831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134242
5066	NC_014657	TGAT	2	8	213833	213840	25 %	50 %	25 %	0 %	312134242
5067	NC_014657	AGA	2	6	213855	213860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134242
5068	NC_014657	ATG	2	6	213869	213874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134242
5069	NC_014657	A	6	6	213886	213891	100 %	0 %	0 %	0 %	312134242
5070	NC_014657	AT	3	6	213895	213900	50 %	50 %	0 %	0 %	312134242
5071	NC_014657	ACAGC	2	10	213913	213922	40 %	0 %	20 %	40 %	312134242
5072	NC_014657	ATGA	2	8	213925	213932	50 %	25 %	25 %	0 %	312134242
5073	NC_014657	AAG	2	6	213950	213955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_014657	T	6	6	214004	214009	0 %	100 %	0 %	0 %	312134243
5075	NC_014657	AAG	2	6	214022	214027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134243
5076	NC_014657	TA	3	6	214052	214057	50 %	50 %	0 %	0 %	312134243
5077	NC_014657	TA	3	6	214102	214107	50 %	50 %	0 %	0 %	312134243
5078	NC_014657	GTT	2	6	214204	214209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134243
5079	NC_014657	AT	3	6	214233	214238	50 %	50 %	0 %	0 %	312134243
5080	NC_014657	ACT	2	6	214261	214266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134243
5081	NC_014657	TAA	2	6	214268	214273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134243
5082	NC_014657	A	6	6	214278	214283	100 %	0 %	0 %	0 %	312134243
5083	NC_014657	A	6	6	214290	214295	100 %	0 %	0 %	0 %	312134243
5084	NC_014657	A	6	6	214325	214330	100 %	0 %	0 %	0 %	312134243
5085	NC_014657	ATG	2	6	214364	214369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134243
5086	NC_014657	TGT	2	6	214446	214451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134243
5087	NC_014657	A	6	6	214568	214573	100 %	0 %	0 %	0 %	312134243
5088	NC_014657	TTG	2	6	214604	214609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134243
5089	NC_014657	TTA	2	6	214622	214627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134243
5090	NC_014657	AG	3	6	214703	214708	50 %	0 %	50 %	0 %	312134243
5091	NC_014657	ATT	2	6	214739	214744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134243
5092	NC_014657	AGG	2	6	214782	214787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134243
5093	NC_014657	TTG	2	6	214789	214794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134243
5094	NC_014657	ATT	2	6	214795	214800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134243
5095	NC_014657	TAATT	2	10	214821	214830	40 %	60 %	0 %	0 %	312134243
5096	NC_014657	TCT	2	6	214851	214856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312134243
5097	NC_014657	T	6	6	214864	214869	0 %	100 %	0 %	0 %	312134243
5098	NC_014657	ATT	2	6	214974	214979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312134243
5099	NC_014657	A	7	7	215001	215007	100 %	0 %	0 %	0 %	312134243
5100	NC_014657	GAAT	2	8	215013	215020	50 %	25 %	25 %	0 %	312134243
5101	NC_014657	ATA	2	6	215069	215074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134243
5102	NC_014657	A	6	6	215113	215118	100 %	0 %	0 %	0 %	312134243
5103	NC_014657	TTG	2	6	215135	215140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312134243
5104	NC_014657	GATTT	2	10	215263	215272	20 %	60 %	20 %	0 %	312134243
5105	NC_014657	AT	4	8	215288	215295	50 %	50 %	0 %	0 %	312134243
5106	NC_014657	GTC	2	6	215333	215338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134243
5107	NC_014657	GGC	2	6	215367	215372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312134243
5108	NC_014657	GTG	2	6	215441	215446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312134243
5109	NC_014657	AATTGC	2	12	215475	215486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312134243
5110	NC_014657	A	6	6	215499	215504	100 %	0 %	0 %	0 %	312134243
5111	NC_014657	TGAT	2	8	215567	215574	25 %	50 %	25 %	0 %	312134243
5112	NC_014657	CTG	2	6	215633	215638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312134243
5113	NC_014657	A	6	6	215756	215761	100 %	0 %	0 %	0 %	312134243
5114	NC_014657	ATA	2	6	215808	215813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312134244
5115	NC_014657	TGGA	2	8	215833	215840	25 %	25 %	50 %	0 %	312134244
5116	NC_014657	TCA	2	6	215884	215889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312134244
5117	NC_014657	GAG	2	6	215890	215895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312134244
5118	NC_014657	T	6	6	215984	215989	0 %	100 %	0 %	0 %	312134244
5119	NC_014657	ATTTT	2	10	216018	216027	20 %	80 %	0 %	0 %	312134244
5120	NC_014657	T	6	6	216036	216041	0 %	100 %	0 %	0 %	312134244
5121	NC_014657	A	7	7	216063	216069	100 %	0 %	0 %	0 %	312134244
5122	NC_014657	TTTTC	2	10	216101	216110	0 %	80 %	0 %	20 %	312134244
5123	NC_014657	TGTT	2	8	216141	216148	0 %	75 %	25 %	0 %	312134244
5124	NC_014657	A	6	6	216239	216244	100 %	0 %	0 %	0 %	312134244
5125	NC_014657	T	6	6	216284	216289	0 %	100 %	0 %	0 %	312134245
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5243	NC_014657	A	7	7	221043	221049	100 %	0 %	0 %	0 %	312134250
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5248	NC_014657	AGC	2	6	221312	221317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312134250
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5251	NC_014657	AT	3	6	221394	221399	50 %	50 %	0 %	0 %	312134250
5252	NC_014657	GAA	2	6	221418	221423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134250
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5255	NC_014657	GTA	2	6	221475	221480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312134250
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5363	NC_014657	A	7	7	226946	226952	100 %	0 %	0 %	0 %	312134255
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5368	NC_014657	AAAG	2	8	227038	227045	75 %	0 %	25 %	0 %	312134255
5369	NC_014657	CAGA	2	8	227062	227069	50 %	0 %	25 %	25 %	312134255
5370	NC_014657	GAA	2	6	227083	227088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312134255
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5372	NC_014657	TA	3	6	227227	227232	50 %	50 %	0 %	0 %	312134255
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