MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 7080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014652	CAAG	2	8	410	417	50 %	0 %	25 %	25 %	312126263
2	NC_014652	TTTA	2	8	561	568	25 %	75 %	0 %	0 %	312126263
3	NC_014652	ATGT	2	8	651	658	25 %	50 %	25 %	0 %	312126263
4	NC_014652	AGAC	2	8	709	716	50 %	0 %	25 %	25 %	312126263
5	NC_014652	TGAT	2	8	1644	1651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014652	TGGA	2	8	2687	2694	25 %	25 %	50 %	0 %	312126264
7	NC_014652	ACAA	2	8	2865	2872	75 %	0 %	0 %	25 %	312126265
8	NC_014652	TAGA	2	8	3408	3415	50 %	25 %	25 %	0 %	312126265
9	NC_014652	CTTG	2	8	3466	3473	0 %	50 %	25 %	25 %	312126265
10	NC_014652	GATT	2	8	3625	3632	25 %	50 %	25 %	0 %	312126265
11	NC_014652	GATT	2	8	4192	4199	25 %	50 %	25 %	0 %	312126266
12	NC_014652	AACC	2	8	4694	4701	50 %	0 %	0 %	50 %	312126267
13	NC_014652	TGTC	2	8	5216	5223	0 %	50 %	25 %	25 %	312126267
14	NC_014652	CTTT	2	8	5783	5790	0 %	75 %	0 %	25 %	312126267
15	NC_014652	ATTA	2	8	7141	7148	50 %	50 %	0 %	0 %	312126269
16	NC_014652	TGGA	2	8	7435	7442	25 %	25 %	50 %	0 %	312126269
17	NC_014652	ACAG	2	8	7463	7470	50 %	0 %	25 %	25 %	312126269
18	NC_014652	TGTC	2	8	8361	8368	0 %	50 %	25 %	25 %	312126269
19	NC_014652	TTGA	2	8	8546	8553	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014652	AAGG	2	8	10255	10262	50 %	0 %	50 %	0 %	312126270
21	NC_014652	TATT	2	8	11331	11338	25 %	75 %	0 %	0 %	312126271
22	NC_014652	TTTA	2	8	12261	12268	25 %	75 %	0 %	0 %	312126271
23	NC_014652	AAGA	2	8	12343	12350	75 %	0 %	25 %	0 %	312126271
24	NC_014652	AGAT	2	8	12564	12571	50 %	25 %	25 %	0 %	312126271
25	NC_014652	TTTG	2	8	12931	12938	0 %	75 %	25 %	0 %	312126271
26	NC_014652	AAAT	2	8	13244	13251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014652	GAAA	2	8	13361	13368	75 %	0 %	25 %	0 %	312126272
28	NC_014652	CAAT	2	8	13425	13432	50 %	25 %	0 %	25 %	312126272
29	NC_014652	GAAA	2	8	15091	15098	75 %	0 %	25 %	0 %	312126273
30	NC_014652	AAAT	2	8	15166	15173	75 %	25 %	0 %	0 %	312126273
31	NC_014652	AATT	2	8	15481	15488	50 %	50 %	0 %	0 %	312126274
32	NC_014652	TTTA	2	8	15499	15506	25 %	75 %	0 %	0 %	312126274
33	NC_014652	TTTA	2	8	16945	16952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014652	TTTG	2	8	16960	16967	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014652	CCAA	2	8	17791	17798	50 %	0 %	0 %	50 %	312126278
36	NC_014652	TTAT	2	8	18906	18913	25 %	75 %	0 %	0 %	312126278
37	NC_014652	TTTG	2	8	19172	19179	0 %	75 %	25 %	0 %	312126278
38	NC_014652	ATTT	2	8	20048	20055	25 %	75 %	0 %	0 %	312126278
39	NC_014652	TGCT	2	8	20138	20145	0 %	50 %	25 %	25 %	312126278
40	NC_014652	TTGA	2	8	20210	20217	25 %	50 %	25 %	0 %	312126278
41	NC_014652	TTGT	2	8	20388	20395	0 %	75 %	25 %	0 %	312126279
42	NC_014652	ATCA	2	8	20402	20409	50 %	25 %	0 %	25 %	312126279
43	NC_014652	ATTT	2	8	21067	21074	25 %	75 %	0 %	0 %	312126279
44	NC_014652	AAAT	2	8	21953	21960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014652	AGGA	2	8	22057	22064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014652	CAGA	2	8	22425	22432	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014652	ATTT	3	12	22810	22821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014652	GAAT	2	8	23133	23140	50 %	25 %	25 %	0 %	312126280
49	NC_014652	AAAG	2	8	23369	23376	75 %	0 %	25 %	0 %	312126280
50	NC_014652	GTTT	2	8	23603	23610	0 %	75 %	25 %	0 %	312126280
51	NC_014652	CTTT	2	8	23702	23709	0 %	75 %	0 %	25 %	312126280
52	NC_014652	GATA	2	8	23983	23990	50 %	25 %	25 %	0 %	312126280
53	NC_014652	TGTA	2	8	23994	24001	25 %	50 %	25 %	0 %	312126280
54	NC_014652	TTTC	2	8	24525	24532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014652	TTGA	2	8	24730	24737	25 %	50 %	25 %	0 %	312126281
56	NC_014652	AAAT	2	8	25199	25206	75 %	25 %	0 %	0 %	312126281
57	NC_014652	GCCT	2	8	25253	25260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014652	AATT	2	8	25958	25965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014652	AGAA	2	8	26506	26513	75 %	0 %	25 %	0 %	312126283
60	NC_014652	GGCT	2	8	27005	27012	0 %	25 %	50 %	25 %	312126283
61	NC_014652	CAGG	2	8	28630	28637	25 %	0 %	50 %	25 %	312126284
62	NC_014652	ATTT	2	8	28779	28786	25 %	75 %	0 %	0 %	312126284
63	NC_014652	TTTG	2	8	29624	29631	0 %	75 %	25 %	0 %	312126285
64	NC_014652	TCTT	2	8	29666	29673	0 %	75 %	0 %	25 %	312126285
65	NC_014652	CTGT	2	8	30300	30307	0 %	50 %	25 %	25 %	312126285
66	NC_014652	TCGA	2	8	30363	30370	25 %	25 %	25 %	25 %	312126285
67	NC_014652	GAAA	2	8	31104	31111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014652	AAGA	2	8	31918	31925	75 %	0 %	25 %	0 %	312126286
69	NC_014652	TTAA	2	8	32224	32231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014652	AAGG	2	8	32487	32494	50 %	0 %	50 %	0 %	312126287
71	NC_014652	GCCC	2	8	33453	33460	0 %	0 %	25 %	75 %	312126288
72	NC_014652	CTTG	2	8	33683	33690	0 %	50 %	25 %	25 %	312126288
73	NC_014652	GAAA	3	12	34046	34057	75 %	0 %	25 %	0 %	312126288
74	NC_014652	TTAT	2	8	34169	34176	25 %	75 %	0 %	0 %	312126288
75	NC_014652	TTCA	2	8	34363	34370	25 %	50 %	0 %	25 %	312126288
76	NC_014652	ACAG	2	8	34610	34617	50 %	0 %	25 %	25 %	312126288
77	NC_014652	CAGC	2	8	34899	34906	25 %	0 %	25 %	50 %	312126288
78	NC_014652	AAAG	2	8	35033	35040	75 %	0 %	25 %	0 %	312126288
79	NC_014652	AGAA	2	8	35041	35048	75 %	0 %	25 %	0 %	312126288
80	NC_014652	TAAT	2	8	35204	35211	50 %	50 %	0 %	0 %	312126289
81	NC_014652	AGAA	2	8	35245	35252	75 %	0 %	25 %	0 %	312126289
82	NC_014652	TCCT	2	8	36016	36023	0 %	50 %	0 %	50 %	312126289
83	NC_014652	CAAC	2	8	36187	36194	50 %	0 %	0 %	50 %	312126289
84	NC_014652	ATTT	2	8	36719	36726	25 %	75 %	0 %	0 %	312126290
85	NC_014652	TGGA	2	8	36802	36809	25 %	25 %	50 %	0 %	312126290
86	NC_014652	TGGT	2	8	37601	37608	0 %	50 %	50 %	0 %	312126290
87	NC_014652	TTAT	2	8	38159	38166	25 %	75 %	0 %	0 %	312126291
88	NC_014652	AAAT	2	8	38238	38245	75 %	25 %	0 %	0 %	312126291
89	NC_014652	TGTA	2	8	38252	38259	25 %	50 %	25 %	0 %	312126291
90	NC_014652	GCAA	2	8	38621	38628	50 %	0 %	25 %	25 %	312126291
91	NC_014652	AAGA	2	8	39289	39296	75 %	0 %	25 %	0 %	312126292
92	NC_014652	CTTT	2	8	39318	39325	0 %	75 %	0 %	25 %	312126292
93	NC_014652	TACA	2	8	39834	39841	50 %	25 %	0 %	25 %	312126292
94	NC_014652	ATTT	2	8	41067	41074	25 %	75 %	0 %	0 %	312126294
95	NC_014652	GATA	2	8	41134	41141	50 %	25 %	25 %	0 %	312126294
96	NC_014652	TGAT	2	8	41289	41296	25 %	50 %	25 %	0 %	312126294
97	NC_014652	ATTT	2	8	41882	41889	25 %	75 %	0 %	0 %	312126295
98	NC_014652	TATT	2	8	41988	41995	25 %	75 %	0 %	0 %	312126295
99	NC_014652	AAAG	2	8	42243	42250	75 %	0 %	25 %	0 %	312126295
100	NC_014652	ATGA	2	8	42354	42361	50 %	25 %	25 %	0 %	312126295
101	NC_014652	GTAA	2	8	42399	42406	50 %	25 %	25 %	0 %	312126295
102	NC_014652	AAGA	2	8	42739	42746	75 %	0 %	25 %	0 %	312126295
103	NC_014652	TGTT	2	8	42793	42800	0 %	75 %	25 %	0 %	312126295
104	NC_014652	CTTT	2	8	42882	42889	0 %	75 %	0 %	25 %	312126295
105	NC_014652	GCAT	2	8	43226	43233	25 %	25 %	25 %	25 %	312126296
106	NC_014652	TACA	2	8	43476	43483	50 %	25 %	0 %	25 %	312126296
107	NC_014652	AATA	2	8	43876	43883	75 %	25 %	0 %	0 %	312126296
108	NC_014652	ATTG	2	8	43980	43987	25 %	50 %	25 %	0 %	312126296
109	NC_014652	AATA	2	8	44249	44256	75 %	25 %	0 %	0 %	312126296
110	NC_014652	TCCT	2	8	44492	44499	0 %	50 %	0 %	50 %	312126297
111	NC_014652	ATGA	2	8	44971	44978	50 %	25 %	25 %	0 %	312126297
112	NC_014652	TATT	2	8	45311	45318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014652	TAAA	2	8	45466	45473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014652	TTGG	2	8	45621	45628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014652	GCAG	2	8	46062	46069	25 %	0 %	50 %	25 %	312126298
116	NC_014652	GAAA	2	8	46293	46300	75 %	0 %	25 %	0 %	312126298
117	NC_014652	ATAA	2	8	46326	46333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014652	TCAA	2	8	46513	46520	50 %	25 %	0 %	25 %	312126299
119	NC_014652	TGTA	2	8	46680	46687	25 %	50 %	25 %	0 %	312126299
120	NC_014652	TTAT	2	8	46756	46763	25 %	75 %	0 %	0 %	312126299
121	NC_014652	TTTC	2	8	46922	46929	0 %	75 %	0 %	25 %	312126299
122	NC_014652	ATTT	2	8	46937	46944	25 %	75 %	0 %	0 %	312126299
123	NC_014652	CAAA	2	8	47293	47300	75 %	0 %	0 %	25 %	312126300
124	NC_014652	CTTT	2	8	47604	47611	0 %	75 %	0 %	25 %	312126301
125	NC_014652	TCCA	2	8	47985	47992	25 %	25 %	0 %	50 %	312126301
126	NC_014652	ATTC	2	8	48071	48078	25 %	50 %	0 %	25 %	312126301
127	NC_014652	TGTT	2	8	49140	49147	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014652	CTTT	2	8	49407	49414	0 %	75 %	0 %	25 %	312126302
129	NC_014652	ATAA	2	8	50942	50949	75 %	25 %	0 %	0 %	312126304
130	NC_014652	AAAC	2	8	50985	50992	75 %	0 %	0 %	25 %	312126304
131	NC_014652	AATT	2	8	51558	51565	50 %	50 %	0 %	0 %	312126304
132	NC_014652	TTAT	2	8	51810	51817	25 %	75 %	0 %	0 %	312126304
133	NC_014652	CAAA	2	8	52032	52039	75 %	0 %	0 %	25 %	312126304
134	NC_014652	AAGA	2	8	53106	53113	75 %	0 %	25 %	0 %	312126304
135	NC_014652	ATGT	2	8	53342	53349	25 %	50 %	25 %	0 %	312126304
136	NC_014652	GCAA	2	8	53408	53415	50 %	0 %	25 %	25 %	312126304
137	NC_014652	GCAT	2	8	53422	53429	25 %	25 %	25 %	25 %	312126304
138	NC_014652	AACT	2	8	53596	53603	50 %	25 %	0 %	25 %	312126304
139	NC_014652	TGAA	2	8	54918	54925	50 %	25 %	25 %	0 %	312126304
140	NC_014652	CAAG	2	8	56822	56829	50 %	0 %	25 %	25 %	312126305
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