MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014652	AAAG	2	8	153626	153633	75 %	0 %	25 %	0 %	312126370
3502	NC_014652	CAG	3	9	153667	153675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126370
3503	NC_014652	TTC	2	6	153720	153725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126370
3504	NC_014652	AG	3	6	153729	153734	50 %	0 %	50 %	0 %	312126370
3505	NC_014652	AGA	2	6	153743	153748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126370
3506	NC_014652	GAA	2	6	153752	153757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126370
3507	NC_014652	TAT	2	6	153872	153877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126370
3508	NC_014652	TCA	2	6	153908	153913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126370
3509	NC_014652	TCAA	2	8	153939	153946	50 %	25 %	0 %	25 %	312126370
3510	NC_014652	GCA	2	6	153957	153962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126370
3511	NC_014652	CAT	2	6	154045	154050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126370
3512	NC_014652	CAA	2	6	154079	154084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126370
3513	NC_014652	GAT	2	6	154086	154091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126370
3514	NC_014652	TGT	2	6	154157	154162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126370
3515	NC_014652	CAA	2	6	154174	154179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126370
3516	NC_014652	GAA	2	6	154200	154205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126370
3517	NC_014652	ACG	2	6	154231	154236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126370
3518	NC_014652	CAA	2	6	154297	154302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126370
3519	NC_014652	AGA	2	6	154379	154384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126370
3520	NC_014652	GAA	2	6	154388	154393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126370
3521	NC_014652	A	6	6	154446	154451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_014652	TGCAAT	2	12	154522	154533	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312126371
3523	NC_014652	TAAAAA	2	12	154614	154625	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312126371
3524	NC_014652	GTG	2	6	154713	154718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126371
3525	NC_014652	TCAA	2	8	154812	154819	50 %	25 %	0 %	25 %	312126371
3526	NC_014652	CTGG	2	8	154840	154847	0 %	25 %	50 %	25 %	312126371
3527	NC_014652	A	7	7	154895	154901	100 %	0 %	0 %	0 %	312126371
3528	NC_014652	TTG	2	6	154962	154967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126371
3529	NC_014652	CTT	3	9	155055	155063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126371
3530	NC_014652	AAT	2	6	155095	155100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126371
3531	NC_014652	AAT	2	6	155128	155133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126371
3532	NC_014652	TA	3	6	155135	155140	50 %	50 %	0 %	0 %	312126371
3533	NC_014652	GAA	2	6	155153	155158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126371
3534	NC_014652	AAT	2	6	155185	155190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126371
3535	NC_014652	GA	3	6	155191	155196	50 %	0 %	50 %	0 %	312126371
3536	NC_014652	GTT	2	6	155204	155209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126371
3537	NC_014652	ATG	2	6	155243	155248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126371
3538	NC_014652	AGAT	2	8	155278	155285	50 %	25 %	25 %	0 %	312126371
3539	NC_014652	A	6	6	155292	155297	100 %	0 %	0 %	0 %	312126371
3540	NC_014652	AGAAC	2	10	155429	155438	60 %	0 %	20 %	20 %	312126371
3541	NC_014652	AAG	2	6	155461	155466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126371
3542	NC_014652	AAG	2	6	155472	155477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126371
3543	NC_014652	AAG	2	6	155499	155504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126371
3544	NC_014652	AGA	2	6	155557	155562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126371
3545	NC_014652	ATT	2	6	155579	155584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126371
3546	NC_014652	AT	3	6	155595	155600	50 %	50 %	0 %	0 %	312126371
3547	NC_014652	ACC	2	6	155609	155614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126371
3548	NC_014652	A	7	7	155663	155669	100 %	0 %	0 %	0 %	312126371
3549	NC_014652	AT	3	6	155697	155702	50 %	50 %	0 %	0 %	312126371
3550	NC_014652	CAT	2	6	155718	155723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126371
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3552	NC_014652	CAG	2	6	155759	155764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126371
3553	NC_014652	CAA	2	6	155823	155828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126371
3554	NC_014652	TAA	2	6	155868	155873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126371
3555	NC_014652	TAT	3	9	155899	155907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126371
3556	NC_014652	TCA	2	6	155912	155917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126371
3557	NC_014652	TG	3	6	155961	155966	0 %	50 %	50 %	0 %	312126371
3558	NC_014652	AG	3	6	155989	155994	50 %	0 %	50 %	0 %	312126371
3559	NC_014652	AGA	3	9	156007	156015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126371
3560	NC_014652	ATT	2	6	156052	156057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_014652	GAG	2	6	156061	156066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_014652	ATTT	2	8	156124	156131	25 %	75 %	0 %	0 %	312126372
3563	NC_014652	TCA	2	6	156217	156222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126372
3564	NC_014652	ATT	2	6	156232	156237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126372
3565	NC_014652	GTT	2	6	156313	156318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126372
3566	NC_014652	CTG	2	6	156338	156343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126372
3567	NC_014652	AAG	2	6	156351	156356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126372
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3574	NC_014652	TTG	2	6	156656	156661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126372
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3582	NC_014652	TTA	2	6	157022	157027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126372
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3584	NC_014652	T	6	6	157107	157112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3586	NC_014652	TG	3	6	157179	157184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_014652	GCA	2	6	157241	157246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126373
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3589	NC_014652	AGTA	2	8	157371	157378	50 %	25 %	25 %	0 %	312126373
3590	NC_014652	GTAAG	2	10	157409	157418	40 %	20 %	40 %	0 %	312126373
3591	NC_014652	CCTT	2	8	157463	157470	0 %	50 %	0 %	50 %	312126373
3592	NC_014652	GCA	2	6	157508	157513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126373
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3594	NC_014652	GAAG	2	8	157619	157626	50 %	0 %	50 %	0 %	312126373
3595	NC_014652	ACA	2	6	157640	157645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126373
3596	NC_014652	TTG	2	6	157725	157730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126373
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3598	NC_014652	CTG	2	6	157776	157781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126373
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3602	NC_014652	TGG	2	6	157876	157881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126373
3603	NC_014652	CTT	2	6	157894	157899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126373
3604	NC_014652	TAT	2	6	157915	157920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126373
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3606	NC_014652	CT	3	6	157963	157968	0 %	50 %	0 %	50 %	312126373
3607	NC_014652	ATT	2	6	157975	157980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126373
3608	NC_014652	CAT	2	6	158028	158033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126373
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3613	NC_014652	CA	3	6	158218	158223	50 %	0 %	0 %	50 %	312126373
3614	NC_014652	GCA	2	6	158264	158269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126373
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3617	NC_014652	CA	3	6	158381	158386	50 %	0 %	0 %	50 %	312126373
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3621	NC_014652	TTC	2	6	158576	158581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126374
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3623	NC_014652	TCA	2	6	158653	158658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126374
3624	NC_014652	ATT	2	6	158683	158688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126374
3625	NC_014652	TCA	2	6	158782	158787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126374
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3629	NC_014652	GTTTT	2	10	159146	159155	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_014652	T	6	6	159152	159157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3643	NC_014652	TTTA	2	8	159707	159714	25 %	75 %	0 %	0 %	312126375
3644	NC_014652	TGG	2	6	159724	159729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126375
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3735	NC_014652	T	6	6	163208	163213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3736	NC_014652	TTA	2	6	163226	163231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3737	NC_014652	TAAA	2	8	163248	163255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3738	NC_014652	T	6	6	163272	163277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3739	NC_014652	A	6	6	163322	163327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3740	NC_014652	CAA	2	6	163445	163450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126381
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3744	NC_014652	A	6	6	163520	163525	100 %	0 %	0 %	0 %	312126381
3745	NC_014652	CAA	2	6	163559	163564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126381
3746	NC_014652	T	6	6	163663	163668	0 %	100 %	0 %	0 %	312126381
3747	NC_014652	A	6	6	163701	163706	100 %	0 %	0 %	0 %	312126381
3748	NC_014652	GCA	2	6	163833	163838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126381
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3998	NC_014652	CATCAC	2	12	176208	176219	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	312126393
3999	NC_014652	GTT	2	6	176251	176256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126393
4000	NC_014652	TGT	2	6	176289	176294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126393

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