MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_014652	A	7	7	110178	110184	100 %	0 %	0 %	0 %	312126340
2503	NC_014652	ATT	2	6	110236	110241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126340
2504	NC_014652	TGC	2	6	110250	110255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126340
2505	NC_014652	TGT	2	6	110270	110275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126340
2506	NC_014652	CAT	2	6	110364	110369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126340
2507	NC_014652	T	6	6	110372	110377	0 %	100 %	0 %	0 %	312126340
2508	NC_014652	TGT	2	6	110386	110391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126340
2509	NC_014652	TAA	3	9	110424	110432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126340
2510	NC_014652	TTC	2	6	110472	110477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126340
2511	NC_014652	TTA	2	6	110501	110506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126340
2512	NC_014652	AT	3	6	110518	110523	50 %	50 %	0 %	0 %	312126340
2513	NC_014652	CTG	2	6	110535	110540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126340
2514	NC_014652	ATA	2	6	110608	110613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126340
2515	NC_014652	T	6	6	110701	110706	0 %	100 %	0 %	0 %	312126340
2516	NC_014652	AT	3	6	110709	110714	50 %	50 %	0 %	0 %	312126340
2517	NC_014652	ATC	2	6	110731	110736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126340
2518	NC_014652	TCAA	2	8	110744	110751	50 %	25 %	0 %	25 %	312126340
2519	NC_014652	CTT	2	6	110790	110795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126340
2520	NC_014652	TA	3	6	110805	110810	50 %	50 %	0 %	0 %	312126340
2521	NC_014652	CTT	2	6	110859	110864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126340
2522	NC_014652	TA	3	6	110914	110919	50 %	50 %	0 %	0 %	312126340
2523	NC_014652	AAC	2	6	110950	110955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126340
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2526	NC_014652	AT	3	6	111025	111030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_014652	ACTGA	2	10	111038	111047	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2528	NC_014652	ATTTTA	2	12	111055	111066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_014652	GAA	2	6	111072	111077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_014652	A	7	7	111076	111082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_014652	ATT	2	6	111102	111107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_014652	T	6	6	111130	111135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_014652	AC	3	6	111183	111188	50 %	0 %	0 %	50 %	312126341
2534	NC_014652	ATC	2	6	111207	111212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126341
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2536	NC_014652	AAG	2	6	111231	111236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126341
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2538	NC_014652	T	6	6	111374	111379	0 %	100 %	0 %	0 %	312126341
2539	NC_014652	TTC	2	6	111384	111389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126341
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2541	NC_014652	AT	3	6	111432	111437	50 %	50 %	0 %	0 %	312126341
2542	NC_014652	TTC	2	6	111447	111452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126341
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2545	NC_014652	TAT	2	6	111576	111581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126341
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2547	NC_014652	CAAG	2	8	111671	111678	50 %	0 %	25 %	25 %	312126341
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2552	NC_014652	ACATC	2	10	111946	111955	40 %	20 %	0 %	40 %	312126341
2553	NC_014652	TAAT	2	8	111962	111969	50 %	50 %	0 %	0 %	312126341
2554	NC_014652	AAG	2	6	112011	112016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126341
2555	NC_014652	T	6	6	112033	112038	0 %	100 %	0 %	0 %	312126341
2556	NC_014652	TA	3	6	112074	112079	50 %	50 %	0 %	0 %	312126341
2557	NC_014652	CTTC	2	8	112213	112220	0 %	50 %	0 %	50 %	312126341
2558	NC_014652	TAA	2	6	112343	112348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126341
2559	NC_014652	AG	3	6	112371	112376	50 %	0 %	50 %	0 %	312126341
2560	NC_014652	ACC	2	6	112388	112393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126341
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2563	NC_014652	TTTC	2	8	112460	112467	0 %	75 %	0 %	25 %	312126341
2564	NC_014652	ATC	2	6	112518	112523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126341
2565	NC_014652	ATG	2	6	112528	112533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126341
2566	NC_014652	TCC	2	6	112574	112579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2567	NC_014652	TAC	2	6	112614	112619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126342
2568	NC_014652	TAC	2	6	112634	112639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126342
2569	NC_014652	T	7	7	112663	112669	0 %	100 %	0 %	0 %	312126342
2570	NC_014652	CTC	2	6	112751	112756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312126342
2571	NC_014652	TG	3	6	112852	112857	0 %	50 %	50 %	0 %	312126342
2572	NC_014652	ATG	2	6	112981	112986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126342
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2574	NC_014652	CCCATG	2	12	113063	113074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	312126342
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2581	NC_014652	CATT	2	8	113305	113312	25 %	50 %	0 %	25 %	312126342
2582	NC_014652	CAT	2	6	113375	113380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126342
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2598	NC_014652	T	6	6	114230	114235	0 %	100 %	0 %	0 %	312126342
2599	NC_014652	GTTT	2	8	114336	114343	0 %	75 %	25 %	0 %	312126342
2600	NC_014652	GAA	2	6	114411	114416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126342
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2602	NC_014652	ATG	2	6	114525	114530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126342
2603	NC_014652	TCT	2	6	114567	114572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126342
2604	NC_014652	T	6	6	114586	114591	0 %	100 %	0 %	0 %	312126342
2605	NC_014652	CAT	2	6	114617	114622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126342
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2607	NC_014652	AAT	2	6	114758	114763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126342
2608	NC_014652	TCA	2	6	114772	114777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126342
2609	NC_014652	TCT	2	6	115047	115052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_014652	AAT	2	6	115058	115063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_014652	A	6	6	115100	115105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_014652	TAAA	2	8	115148	115155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_014652	TAAAAT	2	12	115172	115183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_014652	TTACT	2	10	115223	115232	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2615	NC_014652	AAG	2	6	115239	115244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_014652	ATT	2	6	115352	115357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126343
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2621	NC_014652	TGG	2	6	115491	115496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126343
2622	NC_014652	GA	4	8	115578	115585	50 %	0 %	50 %	0 %	312126343
2623	NC_014652	TTTCTA	2	12	115592	115603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	312126343
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2625	NC_014652	A	6	6	115920	115925	100 %	0 %	0 %	0 %	312126343
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