MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014652	TC	3	6	64824	64829	0 %	50 %	0 %	50 %	312126313
1502	NC_014652	TTA	2	6	64846	64851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126313
1503	NC_014652	TG	4	8	64865	64872	0 %	50 %	50 %	0 %	312126313
1504	NC_014652	AAG	2	6	64933	64938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126313
1505	NC_014652	A	8	8	64997	65004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_014652	AGG	2	6	65014	65019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_014652	TTG	2	6	65082	65087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126314
1508	NC_014652	GCA	2	6	65117	65122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126314
1509	NC_014652	CTGG	2	8	65136	65143	0 %	25 %	50 %	25 %	312126314
1510	NC_014652	AGA	2	6	65146	65151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126314
1511	NC_014652	A	6	6	65156	65161	100 %	0 %	0 %	0 %	312126314
1512	NC_014652	AAATGA	2	12	65284	65295	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	312126314
1513	NC_014652	AC	3	6	65322	65327	50 %	0 %	0 %	50 %	312126314
1514	NC_014652	TGG	2	6	65351	65356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126314
1515	NC_014652	GAA	2	6	65357	65362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126314
1516	NC_014652	AAG	2	6	65417	65422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126314
1517	NC_014652	CTT	2	6	65434	65439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126314
1518	NC_014652	CAAA	3	12	65448	65459	75 %	0 %	0 %	25 %	312126314
1519	NC_014652	AC	3	6	65517	65522	50 %	0 %	0 %	50 %	312126314
1520	NC_014652	AT	3	6	65552	65557	50 %	50 %	0 %	0 %	312126314
1521	NC_014652	AGA	2	6	65658	65663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126314
1522	NC_014652	GCT	2	6	65727	65732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126314
1523	NC_014652	CTT	2	6	65758	65763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126314
1524	NC_014652	AGA	2	6	65855	65860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126314
1525	NC_014652	AG	3	6	65892	65897	50 %	0 %	50 %	0 %	312126314
1526	NC_014652	GAA	2	6	65906	65911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126314
1527	NC_014652	CAG	2	6	65969	65974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126314
1528	NC_014652	TA	3	6	66008	66013	50 %	50 %	0 %	0 %	312126314
1529	NC_014652	AGT	2	6	66238	66243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126314
1530	NC_014652	CAGA	3	12	66254	66265	50 %	0 %	25 %	25 %	312126314
1531	NC_014652	CCA	2	6	66353	66358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126314
1532	NC_014652	ATG	2	6	66414	66419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126314
1533	NC_014652	ACC	2	6	66427	66432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126314
1534	NC_014652	TAT	2	6	66451	66456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126314
1535	NC_014652	CAG	2	6	66596	66601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126314
1536	NC_014652	AAG	2	6	66602	66607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126314
1537	NC_014652	AGA	2	6	66610	66615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126314
1538	NC_014652	AAG	3	9	66620	66628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126314
1539	NC_014652	TAAA	2	8	66637	66644	75 %	25 %	0 %	0 %	312126314
1540	NC_014652	T	6	6	66716	66721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_014652	TTG	2	6	66737	66742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_014652	TA	3	6	66779	66784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_014652	TA	3	6	66965	66970	50 %	50 %	0 %	0 %	312126315
1544	NC_014652	TCA	2	6	67032	67037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126315
1545	NC_014652	AAC	2	6	67058	67063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126315
1546	NC_014652	AAG	2	6	67099	67104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126315
1547	NC_014652	CGA	2	6	67108	67113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126315
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1549	NC_014652	T	6	6	67193	67198	0 %	100 %	0 %	0 %	312126315
1550	NC_014652	ACAA	2	8	67199	67206	75 %	0 %	0 %	25 %	312126315
1551	NC_014652	AG	3	6	67246	67251	50 %	0 %	50 %	0 %	312126315
1552	NC_014652	AGAT	2	8	67273	67280	50 %	25 %	25 %	0 %	312126315
1553	NC_014652	CAA	2	6	67318	67323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126315
1554	NC_014652	CCG	2	6	67340	67345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312126315
1555	NC_014652	GGT	2	6	67363	67368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126315
1556	NC_014652	TGA	2	6	67438	67443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126315
1557	NC_014652	T	6	6	67445	67450	0 %	100 %	0 %	0 %	312126315
1558	NC_014652	GCGA	2	8	67451	67458	25 %	0 %	50 %	25 %	312126315
1559	NC_014652	T	6	6	67540	67545	0 %	100 %	0 %	0 %	312126315
1560	NC_014652	TAG	2	6	67561	67566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126315
1561	NC_014652	TTG	2	6	67575	67580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126315
1562	NC_014652	A	7	7	67590	67596	100 %	0 %	0 %	0 %	312126315
1563	NC_014652	A	6	6	67607	67612	100 %	0 %	0 %	0 %	312126315
1564	NC_014652	CAG	2	6	67650	67655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126315
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1566	NC_014652	A	6	6	67728	67733	100 %	0 %	0 %	0 %	312126315
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1569	NC_014652	AAG	2	6	67826	67831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126315
1570	NC_014652	TGA	2	6	67903	67908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126315
1571	NC_014652	T	6	6	67933	67938	0 %	100 %	0 %	0 %	312126315
1572	NC_014652	TGG	2	6	67944	67949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126315
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1574	NC_014652	GA	3	6	67971	67976	50 %	0 %	50 %	0 %	312126315
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1582	NC_014652	GAT	2	6	68417	68422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126315
1583	NC_014652	TTG	2	6	68448	68453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126315
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1585	NC_014652	GAA	2	6	68663	68668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_014652	GAT	2	6	68691	68696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126316
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1592	NC_014652	TAA	2	6	68911	68916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126316
1593	NC_014652	ATG	2	6	68923	68928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126316
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1595	NC_014652	AT	3	6	68972	68977	50 %	50 %	0 %	0 %	312126316
1596	NC_014652	A	6	6	68994	68999	100 %	0 %	0 %	0 %	312126316
1597	NC_014652	AAG	3	9	69040	69048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126316
1598	NC_014652	A	6	6	69076	69081	100 %	0 %	0 %	0 %	312126316
1599	NC_014652	ATC	2	6	69120	69125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126316
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1602	NC_014652	TCT	2	6	69212	69217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126316
1603	NC_014652	CAG	2	6	69250	69255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126316
1604	NC_014652	GGAA	2	8	69290	69297	50 %	0 %	50 %	0 %	312126316
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1611	NC_014652	AC	3	6	69706	69711	50 %	0 %	0 %	50 %	312126316
1612	NC_014652	CAC	2	6	69732	69737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126316
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1618	NC_014652	AAAGA	2	10	70005	70014	80 %	0 %	20 %	0 %	312126316
1619	NC_014652	T	6	6	70025	70030	0 %	100 %	0 %	0 %	312126316
1620	NC_014652	CTT	2	6	70071	70076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126316
1621	NC_014652	AGGT	2	8	70114	70121	25 %	25 %	50 %	0 %	312126316
1622	NC_014652	GAAT	2	8	70178	70185	50 %	25 %	25 %	0 %	312126316
1623	NC_014652	A	6	6	70198	70203	100 %	0 %	0 %	0 %	312126316
1624	NC_014652	ATA	2	6	70239	70244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_014652	A	7	7	70267	70273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_014652	TAACTA	2	12	70287	70298	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1627	NC_014652	A	6	6	70298	70303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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