MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_014652	AAG	2	6	42016	42021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126295
1003	NC_014652	ATT	2	6	42041	42046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126295
1004	NC_014652	AT	3	6	42076	42081	50 %	50 %	0 %	0 %	312126295
1005	NC_014652	CTG	2	6	42087	42092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126295
1006	NC_014652	TGA	2	6	42100	42105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126295
1007	NC_014652	AAG	2	6	42203	42208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126295
1008	NC_014652	AAAG	2	8	42243	42250	75 %	0 %	25 %	0 %	312126295
1009	NC_014652	TTG	2	6	42259	42264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126295
1010	NC_014652	TGT	2	6	42332	42337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126295
1011	NC_014652	ATGA	2	8	42354	42361	50 %	25 %	25 %	0 %	312126295
1012	NC_014652	GA	3	6	42360	42365	50 %	0 %	50 %	0 %	312126295
1013	NC_014652	GTAA	2	8	42399	42406	50 %	25 %	25 %	0 %	312126295
1014	NC_014652	TGA	2	6	42416	42421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126295
1015	NC_014652	AAT	2	6	42422	42427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126295
1016	NC_014652	TTC	2	6	42433	42438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126295
1017	NC_014652	AAGAAA	2	12	42448	42459	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312126295
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1019	NC_014652	GAA	2	6	42561	42566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126295
1020	NC_014652	TAA	2	6	42574	42579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126295
1021	NC_014652	TGA	2	6	42599	42604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126295
1022	NC_014652	TTG	2	6	42640	42645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126295
1023	NC_014652	TC	3	6	42646	42651	0 %	50 %	0 %	50 %	312126295
1024	NC_014652	TAA	2	6	42700	42705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126295
1025	NC_014652	AAGA	2	8	42739	42746	75 %	0 %	25 %	0 %	312126295
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1028	NC_014652	TGA	2	6	42809	42814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126295
1029	NC_014652	ACA	2	6	42831	42836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126295
1030	NC_014652	AAG	2	6	42848	42853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126295
1031	NC_014652	AAG	2	6	42875	42880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126295
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1033	NC_014652	TTG	2	6	42919	42924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126295
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1035	NC_014652	AT	3	6	42998	43003	50 %	50 %	0 %	0 %	312126295
1036	NC_014652	AG	3	6	43079	43084	50 %	0 %	50 %	0 %	312126295
1037	NC_014652	ATT	2	6	43140	43145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126295
1038	NC_014652	TGG	2	6	43160	43165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126295
1039	NC_014652	A	7	7	43197	43203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_014652	GCAT	2	8	43226	43233	25 %	25 %	25 %	25 %	312126296
1041	NC_014652	GTG	2	6	43262	43267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126296
1042	NC_014652	TTA	2	6	43273	43278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126296
1043	NC_014652	GA	3	6	43311	43316	50 %	0 %	50 %	0 %	312126296
1044	NC_014652	A	7	7	43324	43330	100 %	0 %	0 %	0 %	312126296
1045	NC_014652	ATG	2	6	43426	43431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126296
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1047	NC_014652	TACA	2	8	43476	43483	50 %	25 %	0 %	25 %	312126296
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1050	NC_014652	A	6	6	43596	43601	100 %	0 %	0 %	0 %	312126296
1051	NC_014652	ACT	3	9	43624	43632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126296
1052	NC_014652	TA	3	6	43681	43686	50 %	50 %	0 %	0 %	312126296
1053	NC_014652	TA	3	6	43754	43759	50 %	50 %	0 %	0 %	312126296
1054	NC_014652	CAG	2	6	43859	43864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126296
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1056	NC_014652	TTG	2	6	43895	43900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126296
1057	NC_014652	GTA	2	6	43912	43917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126296
1058	NC_014652	AAT	2	6	43933	43938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126296
1059	NC_014652	TGT	3	9	43944	43952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126296
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1065	NC_014652	TA	3	6	44153	44158	50 %	50 %	0 %	0 %	312126296
1066	NC_014652	GTT	2	6	44242	44247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126296
1067	NC_014652	AATA	2	8	44249	44256	75 %	25 %	0 %	0 %	312126296
1068	NC_014652	TTA	2	6	44272	44277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014652	TA	3	6	44276	44281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014652	ATT	2	6	44291	44296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126297
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1082	NC_014652	TA	3	6	44930	44935	50 %	50 %	0 %	0 %	312126297
1083	NC_014652	CTT	2	6	44938	44943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126297
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1095	NC_014652	TCT	2	6	45262	45267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_014652	AGG	2	6	45288	45293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014652	TA	3	6	45303	45308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014652	TATT	2	8	45311	45318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_014652	CAA	2	6	45344	45349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_014652	TAA	2	6	45352	45357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014652	ACT	2	6	45398	45403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1103	NC_014652	GAA	2	6	45481	45486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014652	GAA	2	6	45574	45579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014652	TTGG	2	8	45621	45628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014652	AT	3	6	45723	45728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014652	A	7	7	45750	45756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014652	AGA	2	6	45822	45827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126298
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1110	NC_014652	GAA	2	6	45895	45900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126298
1111	NC_014652	GAA	2	6	45916	45921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126298
1112	NC_014652	GAA	2	6	46000	46005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126298
1113	NC_014652	GCAG	2	8	46062	46069	25 %	0 %	50 %	25 %	312126298
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1115	NC_014652	AGA	2	6	46254	46259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126298
1116	NC_014652	GACAT	2	10	46268	46277	40 %	20 %	20 %	20 %	312126298
1117	NC_014652	GAAA	2	8	46293	46300	75 %	0 %	25 %	0 %	312126298
1118	NC_014652	A	6	6	46298	46303	100 %	0 %	0 %	0 %	312126298
1119	NC_014652	ATAA	2	8	46326	46333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014652	A	6	6	46355	46360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_014652	ATT	2	6	46391	46396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126299
1122	NC_014652	TAA	2	6	46401	46406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126299
1123	NC_014652	TCA	3	9	46441	46449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126299
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1125	NC_014652	A	6	6	46495	46500	100 %	0 %	0 %	0 %	312126299
1126	NC_014652	TCAA	2	8	46513	46520	50 %	25 %	0 %	25 %	312126299
1127	NC_014652	TGTA	2	8	46680	46687	25 %	50 %	25 %	0 %	312126299
1128	NC_014652	TTAT	2	8	46756	46763	25 %	75 %	0 %	0 %	312126299
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1130	NC_014652	T	6	6	46896	46901	0 %	100 %	0 %	0 %	312126299
1131	NC_014652	T	6	6	46910	46915	0 %	100 %	0 %	0 %	312126299
1132	NC_014652	TTTC	2	8	46922	46929	0 %	75 %	0 %	25 %	312126299
1133	NC_014652	ATTT	2	8	46937	46944	25 %	75 %	0 %	0 %	312126299
1134	NC_014652	T	7	7	46965	46971	0 %	100 %	0 %	0 %	312126300
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1139	NC_014652	T	6	6	47237	47242	0 %	100 %	0 %	0 %	312126300
1140	NC_014652	ATT	2	6	47274	47279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126300
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1145	NC_014652	CTC	2	6	47514	47519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1146	NC_014652	GTA	2	6	47526	47531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_014652	TA	3	6	47541	47546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1152	NC_014652	TA	3	6	47703	47708	50 %	50 %	0 %	0 %	312126301
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1248	NC_014652	TGT	2	6	52555	52560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126304
1249	NC_014652	AACAT	2	10	52613	52622	60 %	20 %	0 %	20 %	312126304
1250	NC_014652	CAA	2	6	52662	52667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126304
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1253	NC_014652	ATG	2	6	52905	52910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
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1256	NC_014652	AAG	2	6	53119	53124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126304
1257	NC_014652	ATGT	2	8	53342	53349	25 %	50 %	25 %	0 %	312126304
1258	NC_014652	TTG	2	6	53379	53384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126304
1259	NC_014652	GCAA	2	8	53408	53415	50 %	0 %	25 %	25 %	312126304
1260	NC_014652	GCAT	2	8	53422	53429	25 %	25 %	25 %	25 %	312126304
1261	NC_014652	GAT	2	6	53480	53485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
1262	NC_014652	GGA	2	6	53498	53503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126304
1263	NC_014652	GAT	3	9	53537	53545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
1264	NC_014652	TGG	2	6	53561	53566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126304
1265	NC_014652	AACT	2	8	53596	53603	50 %	25 %	0 %	25 %	312126304
1266	NC_014652	TAC	2	6	53618	53623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126304
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1269	NC_014652	TAC	2	6	53746	53751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126304
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1273	NC_014652	ATG	2	6	53988	53993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
1274	NC_014652	GTA	2	6	54059	54064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
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1283	NC_014652	ATG	2	6	54576	54581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126304
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1385	NC_014652	CA	3	6	59361	59366	50 %	0 %	0 %	50 %	312126308
1386	NC_014652	AT	3	6	59371	59376	50 %	50 %	0 %	0 %	312126308
1387	NC_014652	CAGCA	2	10	59403	59412	40 %	0 %	20 %	40 %	312126308
1388	NC_014652	CAG	2	6	59470	59475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126308
1389	NC_014652	TTG	2	6	59504	59509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126308
1390	NC_014652	TGA	3	9	59580	59588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126308
1391	NC_014652	AG	3	6	59599	59604	50 %	0 %	50 %	0 %	312126308
1392	NC_014652	GTG	2	6	59684	59689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126308
1393	NC_014652	TG	4	8	59739	59746	0 %	50 %	50 %	0 %	312126308
1394	NC_014652	AGA	2	6	59768	59773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126308
1395	NC_014652	GTG	2	6	59809	59814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126308
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1397	NC_014652	GAG	2	6	59923	59928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126308
1398	NC_014652	GAT	2	6	59974	59979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126308
1399	NC_014652	CAAGG	2	10	60015	60024	40 %	0 %	40 %	20 %	312126308
1400	NC_014652	TGG	2	6	60036	60041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126308
1401	NC_014652	TGA	2	6	60066	60071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126308
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1406	NC_014652	TAA	3	9	60211	60219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_014652	TAT	2	6	62283	62288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126311
1453	NC_014652	ATA	2	6	62326	62331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126311
1454	NC_014652	ACC	2	6	62395	62400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126311
1455	NC_014652	T	7	7	62422	62428	0 %	100 %	0 %	0 %	312126311
1456	NC_014652	TA	3	6	62484	62489	50 %	50 %	0 %	0 %	312126311
1457	NC_014652	CAT	2	6	62735	62740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126311
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1465	NC_014652	T	6	6	62943	62948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1466	NC_014652	TAA	2	6	62969	62974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1467	NC_014652	AAAT	2	8	62983	62990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1468	NC_014652	A	6	6	63008	63013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1469	NC_014652	GAAG	2	8	63027	63034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1472	NC_014652	AGA	2	6	63096	63101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126312
1473	NC_014652	GGCAAT	2	12	63137	63148	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312126312
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1479	NC_014652	TGA	2	6	63287	63292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126312
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1485	NC_014652	ATA	2	6	63630	63635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126312
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