MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014652	T	6	6	21410	21415	0 %	100 %	0 %	0 %	312126279
502	NC_014652	AT	4	8	21422	21429	50 %	50 %	0 %	0 %	312126279
503	NC_014652	AAT	2	6	21476	21481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126279
504	NC_014652	AT	3	6	21532	21537	50 %	50 %	0 %	0 %	312126279
505	NC_014652	ATT	2	6	21564	21569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126279
506	NC_014652	CAT	2	6	21577	21582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126279
507	NC_014652	ACATT	2	10	21694	21703	40 %	40 %	0 %	20 %	312126279
508	NC_014652	AT	3	6	21720	21725	50 %	50 %	0 %	0 %	312126279
509	NC_014652	T	6	6	21821	21826	0 %	100 %	0 %	0 %	312126279
510	NC_014652	TCC	2	6	21837	21842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_014652	T	6	6	21843	21848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014652	T	6	6	21869	21874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014652	ATAAA	2	10	21912	21921	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014652	TA	3	6	21926	21931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014652	TAT	2	6	21935	21940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014652	T	6	6	21946	21951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014652	AAAT	2	8	21953	21960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014652	A	6	6	21973	21978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014652	TA	4	8	22026	22033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014652	A	6	6	22045	22050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014652	AGGA	2	8	22057	22064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014652	GAA	2	6	22078	22083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014652	GTA	2	6	22121	22126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014652	ACA	2	6	22185	22190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_014652	AAG	2	6	22219	22224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_014652	AGA	2	6	22339	22344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014652	AAAGCA	2	12	22346	22357	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
528	NC_014652	ATC	2	6	22369	22374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_014652	CAGA	2	8	22425	22432	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
530	NC_014652	TGAAAA	2	12	22556	22567	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014652	GAA	2	6	22734	22739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014652	ATTT	3	12	22810	22821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014652	TGT	2	6	22946	22951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014652	TCT	2	6	22968	22973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_014652	A	7	7	22983	22989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014652	GAA	2	6	23007	23012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014652	AT	3	6	23035	23040	50 %	50 %	0 %	0 %	312126280
538	NC_014652	AGA	2	6	23053	23058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126280
539	NC_014652	GAAT	2	8	23133	23140	50 %	25 %	25 %	0 %	312126280
540	NC_014652	A	6	6	23141	23146	100 %	0 %	0 %	0 %	312126280
541	NC_014652	A	6	6	23163	23168	100 %	0 %	0 %	0 %	312126280
542	NC_014652	TGG	2	6	23189	23194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126280
543	NC_014652	TTC	2	6	23214	23219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126280
544	NC_014652	GCA	2	6	23237	23242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126280
545	NC_014652	CAG	2	6	23246	23251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126280
546	NC_014652	A	6	6	23296	23301	100 %	0 %	0 %	0 %	312126280
547	NC_014652	ACAAGA	2	12	23337	23348	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	312126280
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549	NC_014652	AAAG	2	8	23369	23376	75 %	0 %	25 %	0 %	312126280
550	NC_014652	TC	3	6	23407	23412	0 %	50 %	0 %	50 %	312126280
551	NC_014652	TGT	2	6	23449	23454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126280
552	NC_014652	ATC	2	6	23490	23495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126280
553	NC_014652	TGA	2	6	23536	23541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126280
554	NC_014652	GTTT	2	8	23603	23610	0 %	75 %	25 %	0 %	312126280
555	NC_014652	TGG	2	6	23638	23643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126280
556	NC_014652	CAA	2	6	23693	23698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126280
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558	NC_014652	AAC	2	6	23777	23782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126280
559	NC_014652	TCA	2	6	23923	23928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126280
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562	NC_014652	GATA	2	8	23983	23990	50 %	25 %	25 %	0 %	312126280
563	NC_014652	TGTA	2	8	23994	24001	25 %	50 %	25 %	0 %	312126280
564	NC_014652	GCA	2	6	24075	24080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126280
565	NC_014652	GTA	2	6	24158	24163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126280
566	NC_014652	TGG	2	6	24326	24331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014652	ACC	3	9	24360	24368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_014652	TGG	2	6	24391	24396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014652	GGA	2	6	24440	24445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014652	CTC	2	6	24448	24453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_014652	GGT	2	6	24458	24463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014652	A	6	6	24477	24482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014652	TAC	2	6	24518	24523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_014652	TTTC	2	8	24525	24532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
575	NC_014652	T	6	6	24547	24552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_014652	AGA	2	6	24597	24602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014652	CTT	2	6	24616	24621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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579	NC_014652	A	6	6	24668	24673	100 %	0 %	0 %	0 %	312126281
580	NC_014652	TA	3	6	24722	24727	50 %	50 %	0 %	0 %	312126281
581	NC_014652	TTGA	2	8	24730	24737	25 %	50 %	25 %	0 %	312126281
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589	NC_014652	AGC	2	6	25053	25058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126281
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591	NC_014652	ATA	2	6	25168	25173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126281
592	NC_014652	AAAT	2	8	25199	25206	75 %	25 %	0 %	0 %	312126281
593	NC_014652	TGA	2	6	25209	25214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126281
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596	NC_014652	TAT	2	6	25351	25356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126282
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600	NC_014652	T	6	6	25520	25525	0 %	100 %	0 %	0 %	312126282
601	NC_014652	A	6	6	25528	25533	100 %	0 %	0 %	0 %	312126282
602	NC_014652	AAC	2	6	25594	25599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126282
603	NC_014652	GCA	2	6	25692	25697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126282
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605	NC_014652	TTG	2	6	25800	25805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126282
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607	NC_014652	AATT	2	8	25958	25965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014652	A	6	6	25986	25991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014652	ATA	2	6	26008	26013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014652	A	7	7	26061	26067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014652	GCA	2	6	26086	26091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126283
612	NC_014652	CG	3	6	26096	26101	0 %	0 %	50 %	50 %	312126283
613	NC_014652	GTT	2	6	26171	26176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126283
614	NC_014652	CAA	2	6	26194	26199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126283
615	NC_014652	CA	3	6	26207	26212	50 %	0 %	0 %	50 %	312126283
616	NC_014652	CAT	2	6	26284	26289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126283
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618	NC_014652	AG	3	6	26442	26447	50 %	0 %	50 %	0 %	312126283
619	NC_014652	CAA	2	6	26466	26471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126283
620	NC_014652	AGAA	2	8	26506	26513	75 %	0 %	25 %	0 %	312126283
621	NC_014652	TGA	2	6	26539	26544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126283
622	NC_014652	GA	3	6	26579	26584	50 %	0 %	50 %	0 %	312126283
623	NC_014652	CAA	2	6	26757	26762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126283
624	NC_014652	CAT	2	6	26799	26804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126283
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633	NC_014652	GAG	2	6	27197	27202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126283
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635	NC_014652	AT	3	6	27274	27279	50 %	50 %	0 %	0 %	312126283
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641	NC_014652	T	7	7	27469	27475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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765	NC_014652	TC	4	8	33387	33394	0 %	50 %	0 %	50 %	312126288
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