MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014652	AAG	2	6	287269	287274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_014652	TAT	2	6	287306	287311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126482
6503	NC_014652	T	6	6	287331	287336	0 %	100 %	0 %	0 %	312126482
6504	NC_014652	T	6	6	287382	287387	0 %	100 %	0 %	0 %	312126482
6505	NC_014652	CAA	2	6	287506	287511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126482
6506	NC_014652	TA	4	8	287524	287531	50 %	50 %	0 %	0 %	312126482
6507	NC_014652	AATT	2	8	287582	287589	50 %	50 %	0 %	0 %	312126482
6508	NC_014652	CAA	2	6	287590	287595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126482
6509	NC_014652	GTT	2	6	287607	287612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126482
6510	NC_014652	ATGC	2	8	287636	287643	25 %	25 %	25 %	25 %	312126482
6511	NC_014652	TCT	2	6	287718	287723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126482
6512	NC_014652	T	7	7	287739	287745	0 %	100 %	0 %	0 %	312126482
6513	NC_014652	T	6	6	287755	287760	0 %	100 %	0 %	0 %	312126482
6514	NC_014652	GCT	2	6	287767	287772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126482
6515	NC_014652	T	6	6	287822	287827	0 %	100 %	0 %	0 %	312126482
6516	NC_014652	ATC	2	6	287850	287855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126482
6517	NC_014652	TCATA	2	10	287863	287872	40 %	40 %	0 %	20 %	312126482
6518	NC_014652	CTT	2	6	287904	287909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126482
6519	NC_014652	CTG	2	6	287944	287949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126482
6520	NC_014652	ATA	2	6	288060	288065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126482
6521	NC_014652	CTT	2	6	288076	288081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126482
6522	NC_014652	ATCC	2	8	288119	288126	25 %	25 %	0 %	50 %	312126482
6523	NC_014652	AAG	2	6	288128	288133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126482
6524	NC_014652	TGG	2	6	288137	288142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126482
6525	NC_014652	AAC	2	6	288182	288187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126482
6526	NC_014652	TAAA	2	8	288235	288242	75 %	25 %	0 %	0 %	312126482
6527	NC_014652	A	6	6	288240	288245	100 %	0 %	0 %	0 %	312126482
6528	NC_014652	CTGC	2	8	288262	288269	0 %	25 %	25 %	50 %	312126482
6529	NC_014652	AT	3	6	288279	288284	50 %	50 %	0 %	0 %	312126482
6530	NC_014652	T	6	6	288305	288310	0 %	100 %	0 %	0 %	312126482
6531	NC_014652	TC	3	6	288355	288360	0 %	50 %	0 %	50 %	312126482
6532	NC_014652	ATA	2	6	288379	288384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126482
6533	NC_014652	CAA	2	6	288415	288420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126482
6534	NC_014652	ATAAA	2	10	288432	288441	80 %	20 %	0 %	0 %	312126482
6535	NC_014652	CCT	2	6	288442	288447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6536	NC_014652	ATT	3	9	288458	288466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_014652	A	6	6	288519	288524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_014652	CTC	2	6	288536	288541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6539	NC_014652	GTA	2	6	288548	288553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_014652	TA	3	6	288563	288568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_014652	CTA	2	6	288580	288585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_014652	GAG	2	6	288587	288592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_014652	CTTT	2	8	288626	288633	0 %	75 %	0 %	25 %	312126483
6544	NC_014652	CT	3	6	288666	288671	0 %	50 %	0 %	50 %	312126483
6545	NC_014652	TA	3	6	288725	288730	50 %	50 %	0 %	0 %	312126483
6546	NC_014652	CTT	3	9	288732	288740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126483
6547	NC_014652	CTA	2	6	288751	288756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126483
6548	NC_014652	TTG	2	6	288802	288807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126483
6549	NC_014652	ACTCA	2	10	288865	288874	40 %	20 %	0 %	40 %	312126483
6550	NC_014652	ATA	2	6	288999	289004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126483
6551	NC_014652	TCCA	2	8	289007	289014	25 %	25 %	0 %	50 %	312126483
6552	NC_014652	TTC	2	6	289030	289035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126483
6553	NC_014652	AATCTT	2	12	289036	289047	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	312126483
6554	NC_014652	ACA	2	6	289052	289057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126483
6555	NC_014652	ATTC	2	8	289093	289100	25 %	50 %	0 %	25 %	312126483
6556	NC_014652	CTG	2	6	289106	289111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126483
6557	NC_014652	CT	3	6	289159	289164	0 %	50 %	0 %	50 %	312126483
6558	NC_014652	TTC	2	6	289171	289176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126483
6559	NC_014652	CTG	2	6	289237	289242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126483
6560	NC_014652	CTTTAG	2	12	289284	289295	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312126483
6561	NC_014652	AAG	2	6	289335	289340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126483
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6563	NC_014652	TAC	2	6	289528	289533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126483
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6565	NC_014652	TAC	2	6	289717	289722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126483
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6567	NC_014652	A	6	6	289817	289822	100 %	0 %	0 %	0 %	312126483
6568	NC_014652	ACC	2	6	289848	289853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126483
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6570	NC_014652	A	6	6	290015	290020	100 %	0 %	0 %	0 %	312126483
6571	NC_014652	TAC	2	6	290033	290038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_014652	T	6	6	290041	290046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_014652	A	6	6	290062	290067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_014652	GTTTT	2	10	290074	290083	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_014652	AAG	2	6	290110	290115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_014652	ATT	2	6	290125	290130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_014652	T	6	6	290134	290139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_014652	GTT	2	6	290143	290148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_014652	TGTT	2	8	290162	290169	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_014652	ATT	2	6	290174	290179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_014652	TTG	2	6	290181	290186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_014652	ATA	2	6	290193	290198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_014652	TCTTT	2	10	290214	290223	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6584	NC_014652	CAC	2	6	290274	290279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6585	NC_014652	ATT	2	6	290304	290309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_014652	ATTCT	2	10	290324	290333	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6587	NC_014652	ATT	2	6	290345	290350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6590	NC_014652	A	7	7	290468	290474	100 %	0 %	0 %	0 %	312126484
6591	NC_014652	A	7	7	290478	290484	100 %	0 %	0 %	0 %	312126484
6592	NC_014652	TCTT	2	8	290616	290623	0 %	75 %	0 %	25 %	312126485
6593	NC_014652	AT	3	6	290706	290711	50 %	50 %	0 %	0 %	312126485
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6599	NC_014652	GTATT	2	10	290983	290992	20 %	60 %	20 %	0 %	312126486
6600	NC_014652	TCT	2	6	291000	291005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126486
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6603	NC_014652	AT	3	6	291210	291215	50 %	50 %	0 %	0 %	312126486
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6613	NC_014652	T	6	6	291749	291754	0 %	100 %	0 %	0 %	312126486
6614	NC_014652	AG	3	6	291768	291773	50 %	0 %	50 %	0 %	312126486
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6622	NC_014652	T	6	6	292087	292092	0 %	100 %	0 %	0 %	312126487
6623	NC_014652	TTTA	2	8	292095	292102	25 %	75 %	0 %	0 %	312126487
6624	NC_014652	TAT	2	6	292115	292120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126487
6625	NC_014652	TTG	2	6	292135	292140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126487
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