MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014652	A	6	6	241513	241518	100 %	0 %	0 %	0 %	312126440
5502	NC_014652	TTGA	2	8	241566	241573	25 %	50 %	25 %	0 %	312126440
5503	NC_014652	GGT	2	6	241647	241652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126440
5504	NC_014652	AAC	2	6	241655	241660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126440
5505	NC_014652	TGG	2	6	241682	241687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126440
5506	NC_014652	AT	3	6	241748	241753	50 %	50 %	0 %	0 %	312126440
5507	NC_014652	AAGA	2	8	241754	241761	75 %	0 %	25 %	0 %	312126440
5508	NC_014652	A	6	6	241827	241832	100 %	0 %	0 %	0 %	312126440
5509	NC_014652	GAA	2	6	241861	241866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126440
5510	NC_014652	AGA	2	6	241928	241933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126440
5511	NC_014652	ACC	2	6	241982	241987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126440
5512	NC_014652	GCA	2	6	241995	242000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126440
5513	NC_014652	TGA	2	6	242023	242028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126440
5514	NC_014652	GGA	2	6	242034	242039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312126440
5515	NC_014652	A	6	6	242074	242079	100 %	0 %	0 %	0 %	312126440
5516	NC_014652	CAA	2	6	242089	242094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126440
5517	NC_014652	GAC	2	6	242103	242108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126440
5518	NC_014652	AGA	2	6	242214	242219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126441
5519	NC_014652	CATCGG	2	12	242238	242249	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312126441
5520	NC_014652	GAT	2	6	242251	242256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126441
5521	NC_014652	ACT	2	6	242309	242314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126441
5522	NC_014652	CTT	2	6	242385	242390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126441
5523	NC_014652	T	6	6	242516	242521	0 %	100 %	0 %	0 %	312126441
5524	NC_014652	AAT	2	6	242537	242542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126441
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5527	NC_014652	TGA	2	6	242683	242688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126441
5528	NC_014652	TTG	2	6	242718	242723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126441
5529	NC_014652	GTT	2	6	242735	242740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126441
5530	NC_014652	CTT	2	6	242759	242764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126441
5531	NC_014652	ATT	2	6	242831	242836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126441
5532	NC_014652	AGT	2	6	242982	242987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126441
5533	NC_014652	AGG	2	6	243024	243029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_014652	GAT	2	6	243041	243046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126442
5535	NC_014652	GCA	2	6	243083	243088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126442
5536	NC_014652	ATATC	2	10	243100	243109	40 %	40 %	0 %	20 %	312126442
5537	NC_014652	CAA	2	6	243110	243115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126442
5538	NC_014652	ACA	2	6	243132	243137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126442
5539	NC_014652	A	6	6	243144	243149	100 %	0 %	0 %	0 %	312126442
5540	NC_014652	TGT	2	6	243200	243205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126442
5541	NC_014652	T	6	6	243339	243344	0 %	100 %	0 %	0 %	312126442
5542	NC_014652	TTC	2	6	243475	243480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126442
5543	NC_014652	AGGA	2	8	243518	243525	50 %	0 %	50 %	0 %	312126442
5544	NC_014652	TTAC	2	8	243526	243533	25 %	50 %	0 %	25 %	312126442
5545	NC_014652	GTT	2	6	243732	243737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126442
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5547	NC_014652	AAC	2	6	243828	243833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126442
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5550	NC_014652	AG	3	6	244070	244075	50 %	0 %	50 %	0 %	312126443
5551	NC_014652	GAT	2	6	244083	244088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126443
5552	NC_014652	TGTT	2	8	244102	244109	0 %	75 %	25 %	0 %	312126443
5553	NC_014652	A	6	6	244219	244224	100 %	0 %	0 %	0 %	312126443
5554	NC_014652	TGGC	2	8	244225	244232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5555	NC_014652	T	7	7	244250	244256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_014652	TTG	2	6	244264	244269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_014652	AT	3	6	244294	244299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_014652	A	7	7	244318	244324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_014652	T	6	6	244340	244345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_014652	GAGAT	2	10	244447	244456	40 %	20 %	40 %	0 %	312126444
5561	NC_014652	AGCA	2	8	244457	244464	50 %	0 %	25 %	25 %	312126444
5562	NC_014652	A	6	6	244491	244496	100 %	0 %	0 %	0 %	312126444
5563	NC_014652	A	7	7	244580	244586	100 %	0 %	0 %	0 %	312126444
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5569	NC_014652	TAA	3	9	245144	245152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126444
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5572	NC_014652	AGGA	2	8	245218	245225	50 %	0 %	50 %	0 %	312126444
5573	NC_014652	GA	3	6	245224	245229	50 %	0 %	50 %	0 %	312126444
5574	NC_014652	TTG	2	6	245258	245263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126445
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5577	NC_014652	GAA	2	6	245350	245355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126445
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5583	NC_014652	TTG	2	6	245516	245521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126445
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5599	NC_014652	AAG	2	6	246200	246205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126445
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5603	NC_014652	TTG	2	6	246385	246390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_014652	ATT	2	6	246405	246410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_014652	T	6	6	246440	246445	0 %	100 %	0 %	0 %	312126446
5606	NC_014652	TA	3	6	246511	246516	50 %	50 %	0 %	0 %	312126446
5607	NC_014652	AAG	2	6	246540	246545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126446
5608	NC_014652	TAT	2	6	246547	246552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126446
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5612	NC_014652	TGTGGT	2	12	246798	246809	0 %	50 %	50 %	0 %	312126446
5613	NC_014652	TTCC	2	8	246822	246829	0 %	50 %	0 %	50 %	312126446
5614	NC_014652	T	6	6	246839	246844	0 %	100 %	0 %	0 %	312126446
5615	NC_014652	CA	3	6	247005	247010	50 %	0 %	0 %	50 %	312126446
5616	NC_014652	TCA	2	6	247025	247030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126446
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5619	NC_014652	CAC	2	6	247205	247210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5620	NC_014652	TTTA	2	8	247227	247234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_014652	ATT	2	6	247247	247252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126447
5622	NC_014652	TA	3	6	247309	247314	50 %	50 %	0 %	0 %	312126447
5623	NC_014652	TGC	2	6	247344	247349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126447
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5625	NC_014652	TGT	2	6	247401	247406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126447
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5730	NC_014652	AATT	2	8	251927	251934	50 %	50 %	0 %	0 %	312126450
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