MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor hydrothermalis 108 chromosome

Total Repeats: 63641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014652	GTG	2	6	219556	219561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126423
5002	NC_014652	AAC	2	6	219562	219567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126423
5003	NC_014652	TGA	2	6	219656	219661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126423
5004	NC_014652	TGT	2	6	219662	219667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126423
5005	NC_014652	TTTA	2	8	219751	219758	25 %	75 %	0 %	0 %	312126423
5006	NC_014652	AAT	2	6	219767	219772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126423
5007	NC_014652	TAA	2	6	219835	219840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126423
5008	NC_014652	A	6	6	219872	219877	100 %	0 %	0 %	0 %	312126423
5009	NC_014652	GA	3	6	219884	219889	50 %	0 %	50 %	0 %	312126423
5010	NC_014652	AG	3	6	219912	219917	50 %	0 %	50 %	0 %	312126423
5011	NC_014652	AC	3	6	219941	219946	50 %	0 %	0 %	50 %	312126423
5012	NC_014652	A	7	7	219979	219985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_014652	AGC	2	6	219989	219994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_014652	AATTTT	2	12	220008	220019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_014652	TAA	2	6	220043	220048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_014652	TA	3	6	220051	220056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_014652	ATA	2	6	220112	220117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_014652	GAT	2	6	220121	220126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_014652	GTT	2	6	220140	220145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_014652	TATC	2	8	220147	220154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5021	NC_014652	T	7	7	220185	220191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_014652	A	8	8	220231	220238	100 %	0 %	0 %	0 %	312126424
5023	NC_014652	GAA	2	6	220269	220274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126424
5024	NC_014652	AAC	2	6	220320	220325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126424
5025	NC_014652	AAAG	2	8	220346	220353	75 %	0 %	25 %	0 %	312126424
5026	NC_014652	GCA	2	6	220428	220433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126424
5027	NC_014652	TTGA	2	8	220452	220459	25 %	50 %	25 %	0 %	312126424
5028	NC_014652	GAA	2	6	220494	220499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126424
5029	NC_014652	GCAA	2	8	220518	220525	50 %	0 %	25 %	25 %	312126424
5030	NC_014652	TGAT	2	8	220651	220658	25 %	50 %	25 %	0 %	312126424
5031	NC_014652	TTG	2	6	220717	220722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126424
5032	NC_014652	GAA	2	6	220770	220775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126424
5033	NC_014652	ATT	2	6	220779	220784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126424
5034	NC_014652	TTG	2	6	220801	220806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126424
5035	NC_014652	AG	3	6	220860	220865	50 %	0 %	50 %	0 %	312126424
5036	NC_014652	GTG	2	6	221041	221046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312126424
5037	NC_014652	GAA	2	6	221088	221093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126424
5038	NC_014652	AAG	2	6	221179	221184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126424
5039	NC_014652	GTT	2	6	221202	221207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126424
5040	NC_014652	TGC	2	6	221210	221215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126424
5041	NC_014652	AG	3	6	221221	221226	50 %	0 %	50 %	0 %	312126424
5042	NC_014652	AAG	2	6	221315	221320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126424
5043	NC_014652	ACG	2	6	221365	221370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126424
5044	NC_014652	CTT	2	6	221445	221450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126424
5045	NC_014652	ATT	2	6	221455	221460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126424
5046	NC_014652	CA	3	6	221470	221475	50 %	0 %	0 %	50 %	312126424
5047	NC_014652	CAA	2	6	221479	221484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126424
5048	NC_014652	AGA	2	6	221504	221509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126424
5049	NC_014652	AGAA	2	8	221582	221589	75 %	0 %	25 %	0 %	312126424
5050	NC_014652	GAA	2	6	221658	221663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126424
5051	NC_014652	A	6	6	221667	221672	100 %	0 %	0 %	0 %	312126424
5052	NC_014652	TGT	2	6	221690	221695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126424
5053	NC_014652	TAGTTG	2	12	221698	221709	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	312126424
5054	NC_014652	AGA	2	6	221801	221806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126424
5055	NC_014652	TTG	2	6	221830	221835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126424
5056	NC_014652	GAA	2	6	221919	221924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126424
5057	NC_014652	GAAAAA	2	12	222153	222164	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	312126424
5058	NC_014652	AAGAA	2	10	222251	222260	80 %	0 %	20 %	0 %	312126424
5059	NC_014652	AG	3	6	222304	222309	50 %	0 %	50 %	0 %	312126424
5060	NC_014652	AGA	2	6	222331	222336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126424
5061	NC_014652	TATGAT	2	12	222375	222386	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	312126424
5062	NC_014652	AAAG	2	8	222482	222489	75 %	0 %	25 %	0 %	312126424
5063	NC_014652	T	6	6	222586	222591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_014652	TATT	2	8	222659	222666	25 %	75 %	0 %	0 %	312126425
5065	NC_014652	TTTTC	2	10	222720	222729	0 %	80 %	0 %	20 %	312126425
5066	NC_014652	ATCTC	2	10	222743	222752	20 %	40 %	0 %	40 %	312126425
5067	NC_014652	CAT	2	6	222801	222806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126425
5068	NC_014652	CTT	2	6	222824	222829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126425
5069	NC_014652	ATCA	2	8	222838	222845	50 %	25 %	0 %	25 %	312126425
5070	NC_014652	CCA	2	6	222848	222853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126425
5071	NC_014652	TTA	2	6	222915	222920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126425
5072	NC_014652	AGA	2	6	222953	222958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126425
5073	NC_014652	TAT	2	6	222982	222987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312126425
5074	NC_014652	AG	3	6	223114	223119	50 %	0 %	50 %	0 %	312126425
5075	NC_014652	TCA	2	6	223130	223135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126425
5076	NC_014652	TC	3	6	223165	223170	0 %	50 %	0 %	50 %	312126425
5077	NC_014652	TCA	2	6	223196	223201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126425
5078	NC_014652	CAT	2	6	223242	223247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126425
5079	NC_014652	GAT	2	6	223257	223262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126425
5080	NC_014652	ACA	2	6	223268	223273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126425
5081	NC_014652	CTT	2	6	223278	223283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126425
5082	NC_014652	CAT	2	6	223287	223292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126425
5083	NC_014652	TTG	2	6	223361	223366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126425
5084	NC_014652	CTG	2	6	223382	223387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126425
5085	NC_014652	TCA	2	6	223514	223519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126425
5086	NC_014652	T	7	7	223540	223546	0 %	100 %	0 %	0 %	312126425
5087	NC_014652	TCA	2	6	223604	223609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126425
5088	NC_014652	AAGG	2	8	223641	223648	50 %	0 %	50 %	0 %	312126425
5089	NC_014652	TGCC	2	8	223835	223842	0 %	25 %	25 %	50 %	312126425
5090	NC_014652	T	7	7	223907	223913	0 %	100 %	0 %	0 %	312126425
5091	NC_014652	T	6	6	223931	223936	0 %	100 %	0 %	0 %	312126425
5092	NC_014652	AAT	2	6	223944	223949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126425
5093	NC_014652	TCA	2	6	223968	223973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126425
5094	NC_014652	TTG	2	6	224004	224009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126425
5095	NC_014652	TGT	2	6	224067	224072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126425
5096	NC_014652	AATT	2	8	224083	224090	50 %	50 %	0 %	0 %	312126425
5097	NC_014652	TGC	2	6	224091	224096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312126425
5098	NC_014652	T	6	6	224182	224187	0 %	100 %	0 %	0 %	312126425
5099	NC_014652	GC	3	6	224233	224238	0 %	0 %	50 %	50 %	312126425
5100	NC_014652	TTC	2	6	224360	224365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126425
5101	NC_014652	GCG	2	6	224369	224374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312126425
5102	NC_014652	ACA	2	6	224459	224464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126425
5103	NC_014652	AAT	2	6	224587	224592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126425
5104	NC_014652	T	8	8	224609	224616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_014652	TTTA	2	8	224643	224650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_014652	ATTTT	2	10	224689	224698	20 %	80 %	0 %	0 %	312126426
5107	NC_014652	AAT	2	6	224728	224733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126426
5108	NC_014652	GCTG	2	8	224754	224761	0 %	25 %	50 %	25 %	312126426
5109	NC_014652	CTA	2	6	224790	224795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126426
5110	NC_014652	AGTCCA	2	12	224813	224824	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312126426
5111	NC_014652	A	6	6	224863	224868	100 %	0 %	0 %	0 %	312126426
5112	NC_014652	GAGG	2	8	224883	224890	25 %	0 %	75 %	0 %	312126426
5113	NC_014652	T	6	6	224947	224952	0 %	100 %	0 %	0 %	312126426
5114	NC_014652	CAC	2	6	224973	224978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312126426
5115	NC_014652	ATA	2	6	225053	225058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126426
5116	NC_014652	TAGT	2	8	225123	225130	25 %	50 %	25 %	0 %	312126426
5117	NC_014652	TTTG	2	8	225135	225142	0 %	75 %	25 %	0 %	312126426
5118	NC_014652	CATT	2	8	225236	225243	25 %	50 %	0 %	25 %	312126426
5119	NC_014652	AAT	2	6	225247	225252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126426
5120	NC_014652	CTTT	2	8	225265	225272	0 %	75 %	0 %	25 %	312126426
5121	NC_014652	TTC	2	6	225379	225384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126426
5122	NC_014652	GAT	2	6	225441	225446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126426
5123	NC_014652	TATT	2	8	225498	225505	25 %	75 %	0 %	0 %	312126426
5124	NC_014652	CTT	2	6	225516	225521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126426
5125	NC_014652	AG	3	6	225525	225530	50 %	0 %	50 %	0 %	312126426
5126	NC_014652	TAAA	2	8	225549	225556	75 %	25 %	0 %	0 %	312126426
5127	NC_014652	AAT	2	6	225592	225597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126426
5128	NC_014652	AGAAT	2	10	225602	225611	60 %	20 %	20 %	0 %	312126426
5129	NC_014652	TAA	2	6	225612	225617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126426
5130	NC_014652	CTA	2	6	225624	225629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312126426
5131	NC_014652	AT	3	6	225724	225729	50 %	50 %	0 %	0 %	312126426
5132	NC_014652	TCATAG	2	12	225883	225894	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	312126427
5133	NC_014652	TCAA	2	8	225907	225914	50 %	25 %	0 %	25 %	312126427
5134	NC_014652	AGT	2	6	225961	225966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312126427
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5146	NC_014652	A	6	6	226375	226380	100 %	0 %	0 %	0 %	312126427
5147	NC_014652	CAA	2	6	226385	226390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312126427
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5150	NC_014652	AAC	2	6	226502	226507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5151	NC_014652	T	7	7	226528	226534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5166	NC_014652	AT	3	6	227014	227019	50 %	50 %	0 %	0 %	312126428
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5170	NC_014652	GTT	2	6	227269	227274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126428
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5199	NC_014652	CTT	2	6	228374	228379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312126429
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5202	NC_014652	TGAAT	2	10	228445	228454	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5203	NC_014652	TAT	2	6	228506	228511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5204	NC_014652	ATA	2	6	228513	228518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5218	NC_014652	CAA	2	6	229213	229218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5219	NC_014652	AAT	2	6	229220	229225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5220	NC_014652	CAA	2	6	229229	229234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5221	NC_014652	AAC	2	6	229251	229256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5222	NC_014652	A	6	6	229260	229265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5224	NC_014652	CTT	2	6	229284	229289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5225	NC_014652	AAAAC	2	10	229316	229325	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5233	NC_014652	A	6	6	229592	229597	100 %	0 %	0 %	0 %	312126431
5234	NC_014652	GTAT	2	8	229646	229653	25 %	50 %	25 %	0 %	312126431
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5239	NC_014652	TGT	2	6	229945	229950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126431
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5245	NC_014652	CAG	2	6	230288	230293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126431
5246	NC_014652	ATGA	2	8	230297	230304	50 %	25 %	25 %	0 %	312126431
5247	NC_014652	TGT	2	6	230342	230347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126431
5248	NC_014652	AAGATT	2	12	230352	230363	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	312126431
5249	NC_014652	GAA	2	6	230364	230369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126431
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5251	NC_014652	GA	4	8	230464	230471	50 %	0 %	50 %	0 %	312126431
5252	NC_014652	TGAGT	2	10	230525	230534	20 %	40 %	40 %	0 %	312126431
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5359	NC_014652	TAAGA	2	10	234843	234852	60 %	20 %	20 %	0 %	312126436
5360	NC_014652	AATA	2	8	234867	234874	75 %	25 %	0 %	0 %	312126436
5361	NC_014652	A	6	6	234925	234930	100 %	0 %	0 %	0 %	312126436
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5366	NC_014652	TAA	2	6	235039	235044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312126437
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5371	NC_014652	TTTTTA	2	12	235194	235205	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	312126437
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5373	NC_014652	AGA	2	6	235240	235245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312126437
5374	NC_014652	CTGT	2	8	235281	235288	0 %	50 %	25 %	25 %	312126437
5375	NC_014652	CAG	2	6	235311	235316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312126437
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5377	NC_014652	AT	3	6	235403	235408	50 %	50 %	0 %	0 %	312126437
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5379	NC_014652	A	6	6	235440	235445	100 %	0 %	0 %	0 %	312126437
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5489	NC_014652	TA	3	6	241088	241093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_014652	GTT	2	6	241476	241481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312126440
5500	NC_014652	GT	4	8	241482	241489	0 %	50 %	50 %	0 %	312126440

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