MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782201

Total Repeats: 18663

< Previous12...26272829303132333435363738Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_014533	CAGA	2	8	872512	872519	50 %	0 %	25 %	25 %	307592489
18502	NC_014533	CT	3	6	872533	872538	0 %	50 %	0 %	50 %	307592489
18503	NC_014533	AG	3	6	872566	872571	50 %	0 %	50 %	0 %	307592489
18504	NC_014533	TTCC	2	8	872577	872584	0 %	50 %	0 %	50 %	307592489
18505	NC_014533	AG	3	6	872672	872677	50 %	0 %	50 %	0 %	307592489
18506	NC_014533	TCA	2	6	872681	872686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592489
18507	NC_014533	T	7	7	872754	872760	0 %	100 %	0 %	0 %	307592489
18508	NC_014533	CCA	2	6	872962	872967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307592489
18509	NC_014533	CGG	2	6	873015	873020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307592489
18510	NC_014533	T	6	6	873142	873147	0 %	100 %	0 %	0 %	307592489
18511	NC_014533	TTG	2	6	873232	873237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592489
18512	NC_014533	AAG	2	6	873316	873321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307592489
18513	NC_014533	GAG	2	6	873375	873380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307592489
18514	NC_014533	TC	3	6	873391	873396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18515	NC_014533	TAA	2	6	873448	873453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18516	NC_014533	ATT	2	6	873463	873468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18517	NC_014533	A	7	7	873474	873480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18518	NC_014533	A	6	6	873551	873556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18519	NC_014533	A	6	6	873659	873664	100 %	0 %	0 %	0 %	307592490
18520	NC_014533	AGG	2	6	873790	873795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307592490
18521	NC_014533	CGT	2	6	873904	873909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307592490
18522	NC_014533	GTT	2	6	873921	873926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592490
18523	NC_014533	CCT	2	6	873928	873933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307592490
18524	NC_014533	TTC	2	6	874046	874051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592490
18525	NC_014533	AG	3	6	874088	874093	50 %	0 %	50 %	0 %	307592490
18526	NC_014533	GAA	2	6	874101	874106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307592490
18527	NC_014533	TTG	2	6	874151	874156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592490
18528	NC_014533	GGC	2	6	874160	874165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307592490
18529	NC_014533	GATT	2	8	874201	874208	25 %	50 %	25 %	0 %	307592490
18530	NC_014533	TTG	2	6	874245	874250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592490
18531	NC_014533	T	6	6	874281	874286	0 %	100 %	0 %	0 %	307592490
18532	NC_014533	TTGC	2	8	874412	874419	0 %	50 %	25 %	25 %	307592490
18533	NC_014533	TGG	2	6	874420	874425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307592490
18534	NC_014533	CTT	2	6	874490	874495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592490
18535	NC_014533	AGG	2	6	874499	874504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307592490
18536	NC_014533	GGA	2	6	874507	874512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307592490
18537	NC_014533	TAA	2	6	874549	874554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592490
18538	NC_014533	CAT	2	6	874555	874560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592490
18539	NC_014533	TCT	2	6	874578	874583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592490
18540	NC_014533	TG	3	6	874585	874590	0 %	50 %	50 %	0 %	307592490
18541	NC_014533	TAG	2	6	874618	874623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592490
18542	NC_014533	CCT	2	6	874692	874697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307592490
18543	NC_014533	GGA	2	6	874710	874715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307592490
18544	NC_014533	CTG	2	6	874743	874748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307592490
18545	NC_014533	GA	3	6	874781	874786	50 %	0 %	50 %	0 %	307592490
18546	NC_014533	TTC	2	6	874796	874801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592490
18547	NC_014533	TTG	2	6	874830	874835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592490
18548	NC_014533	GGA	2	6	874969	874974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307592490
18549	NC_014533	TCA	2	6	874998	875003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592490
18550	NC_014533	T	7	7	875008	875014	0 %	100 %	0 %	0 %	307592490
18551	NC_014533	AGG	2	6	875061	875066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307592490
18552	NC_014533	CTC	2	6	875073	875078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307592490
18553	NC_014533	C	6	6	875092	875097	0 %	0 %	0 %	100 %	307592490
18554	NC_014533	ATC	2	6	875123	875128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592490
18555	NC_014533	TCT	2	6	875139	875144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592490
18556	NC_014533	AAT	2	6	875289	875294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18557	NC_014533	AG	3	6	875301	875306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18558	NC_014533	CTACC	2	10	875311	875320	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18559	NC_014533	A	6	6	875351	875356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18560	NC_014533	TAA	2	6	875405	875410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18561	NC_014533	CAAA	2	8	875412	875419	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18562	NC_014533	T	7	7	875423	875429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18563	NC_014533	A	7	7	875493	875499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18564	NC_014533	TAA	2	6	875544	875549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18565	NC_014533	A	7	7	875553	875559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18566	NC_014533	GA	3	6	875594	875599	50 %	0 %	50 %	0 %	307592491
18567	NC_014533	TTC	2	6	875600	875605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592491
18568	NC_014533	AAT	2	6	875633	875638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592491
18569	NC_014533	TTC	2	6	875660	875665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592491
18570	NC_014533	GGT	2	6	875756	875761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307592491
18571	NC_014533	A	7	7	875780	875786	100 %	0 %	0 %	0 %	307592491
18572	NC_014533	GTG	2	6	875787	875792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307592491
18573	NC_014533	TTC	2	6	875828	875833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592491
18574	NC_014533	TGA	2	6	875967	875972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592491
18575	NC_014533	A	6	6	875982	875987	100 %	0 %	0 %	0 %	307592491
18576	NC_014533	CTTTT	2	10	876002	876011	0 %	80 %	0 %	20 %	307592491
18577	NC_014533	TAT	2	6	876022	876027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307592491
18578	NC_014533	T	6	6	876119	876124	0 %	100 %	0 %	0 %	307592491
18579	NC_014533	TAAA	2	8	876138	876145	75 %	25 %	0 %	0 %	307592491
18580	NC_014533	TTA	2	6	876168	876173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307592491
18581	NC_014533	TAA	2	6	876193	876198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592491
18582	NC_014533	AGG	2	6	876218	876223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307592491
18583	NC_014533	CAA	2	6	876235	876240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307592491
18584	NC_014533	AGA	2	6	876273	876278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307592491
18585	NC_014533	A	6	6	876301	876306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18586	NC_014533	ATA	2	6	876324	876329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18587	NC_014533	AT	3	6	876344	876349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18588	NC_014533	ACAG	2	8	876401	876408	50 %	0 %	25 %	25 %	307592492
18589	NC_014533	AGA	2	6	876409	876414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307592492
18590	NC_014533	TAGTG	2	10	876433	876442	20 %	40 %	40 %	0 %	307592492
18591	NC_014533	CTA	2	6	876446	876451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592492
18592	NC_014533	GTT	2	6	876471	876476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592492
18593	NC_014533	GAT	2	6	876506	876511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592492
18594	NC_014533	AGC	2	6	876523	876528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307592492
18595	NC_014533	AGAA	2	8	876544	876551	75 %	0 %	25 %	0 %	307592492
18596	NC_014533	CAG	2	6	876662	876667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307592492
18597	NC_014533	TC	3	6	876672	876677	0 %	50 %	0 %	50 %	307592492
18598	NC_014533	CTG	2	6	876762	876767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307592493
18599	NC_014533	CAA	2	6	876795	876800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307592493
18600	NC_014533	AAG	3	9	876835	876843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307592493
18601	NC_014533	AAG	2	6	876877	876882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307592493
18602	NC_014533	TTC	2	6	876896	876901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592493
18603	NC_014533	AAG	2	6	876916	876921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307592493
18604	NC_014533	AGA	2	6	876988	876993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307592493
18605	NC_014533	T	6	6	877034	877039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18606	NC_014533	TAA	2	6	877098	877103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18607	NC_014533	A	7	7	877158	877164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18608	NC_014533	TAATC	2	10	877180	877189	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18609	NC_014533	GAG	2	6	877215	877220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18610	NC_014533	TTGC	2	8	877265	877272	0 %	50 %	25 %	25 %	307592494
18611	NC_014533	TAC	2	6	877312	877317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592494
18612	NC_014533	AT	3	6	877343	877348	50 %	50 %	0 %	0 %	307592494
18613	NC_014533	TCC	3	9	877396	877404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307592494
18614	NC_014533	TTA	2	6	877420	877425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307592494
18615	NC_014533	A	6	6	877455	877460	100 %	0 %	0 %	0 %	307592494
18616	NC_014533	AGT	2	6	877514	877519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592494
18617	NC_014533	A	6	6	877557	877562	100 %	0 %	0 %	0 %	307592494
18618	NC_014533	A	7	7	877590	877596	100 %	0 %	0 %	0 %	307592494
18619	NC_014533	ATT	2	6	877617	877622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307592494
18620	NC_014533	AAGA	2	8	877676	877683	75 %	0 %	25 %	0 %	307592494
18621	NC_014533	GCG	2	6	877690	877695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307592494
18622	NC_014533	CGG	2	6	877697	877702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307592494
18623	NC_014533	AGA	2	6	877716	877721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307592494
18624	NC_014533	GTG	2	6	877775	877780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307592494
18625	NC_014533	TGA	2	6	877805	877810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592494
18626	NC_014533	CAAG	2	8	877813	877820	50 %	0 %	25 %	25 %	307592494
18627	NC_014533	TAA	2	6	877829	877834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307592494
18628	NC_014533	A	6	6	877846	877851	100 %	0 %	0 %	0 %	307592494
18629	NC_014533	GAAC	2	8	877882	877889	50 %	0 %	25 %	25 %	307592494
18630	NC_014533	TCG	2	6	877911	877916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307592494
18631	NC_014533	ATT	2	6	878038	878043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18632	NC_014533	CAATT	2	10	878078	878087	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18633	NC_014533	CAA	2	6	878111	878116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18634	NC_014533	T	6	6	878124	878129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18635	NC_014533	GCA	2	6	878242	878247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307592495
18636	NC_014533	GCA	2	6	878308	878313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307592495
18637	NC_014533	TTG	2	6	878388	878393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592495
18638	NC_014533	TAGA	2	8	878411	878418	50 %	25 %	25 %	0 %	307592495
18639	NC_014533	CCTC	2	8	878427	878434	0 %	25 %	0 %	75 %	307592495
18640	NC_014533	TTC	2	6	878442	878447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592495
18641	NC_014533	GA	3	6	878500	878505	50 %	0 %	50 %	0 %	307592495
18642	NC_014533	GAT	2	6	878546	878551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307592495
18643	NC_014533	AGC	3	9	878617	878625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307592496
18644	NC_014533	TCA	2	6	878627	878632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592496
18645	NC_014533	ACC	2	6	878670	878675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307592496
18646	NC_014533	T	8	8	878683	878690	0 %	100 %	0 %	0 %	307592496
18647	NC_014533	GTT	2	6	878760	878765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307592496
18648	NC_014533	CAT	2	6	878824	878829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18649	NC_014533	CAATC	2	10	878857	878866	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18650	NC_014533	TAAT	2	8	878871	878878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18651	NC_014533	ATT	2	6	878893	878898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307592497
18652	NC_014533	AGGA	2	8	878915	878922	50 %	0 %	50 %	0 %	307592497
18653	NC_014533	AGG	2	6	878933	878938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307592497
18654	NC_014533	AT	3	6	878970	878975	50 %	50 %	0 %	0 %	307592497
18655	NC_014533	CTT	2	6	879007	879012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307592497
18656	NC_014533	TCA	2	6	879130	879135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307592497
18657	NC_014533	ACTAAT	2	12	879168	879179	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18658	NC_014533	GAA	2	6	879307	879312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18659	NC_014533	AATA	2	8	879368	879375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18660	NC_014533	AAG	2	6	879391	879396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18661	NC_014533	CTT	2	6	879472	879477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18662	NC_014533	A	6	6	879478	879483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18663	NC_014533	ACT	2	6	879494	879499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12...26272829303132333435363738Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.