MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782203

Total Repeats: 366

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014502	CT	3	6	543	548	0 %	50 %	0 %	50 %	307149709
2	NC_014502	AT	3	6	2650	2655	50 %	50 %	0 %	0 %	307149710
3	NC_014502	AG	3	6	2839	2844	50 %	0 %	50 %	0 %	307149710
4	NC_014502	AG	3	6	3514	3519	50 %	0 %	50 %	0 %	307149711
5	NC_014502	AT	3	6	4352	4357	50 %	50 %	0 %	0 %	307149712
6	NC_014502	TA	3	6	7833	7838	50 %	50 %	0 %	0 %	307149713
7	NC_014502	TG	3	6	9246	9251	0 %	50 %	50 %	0 %	307149715
8	NC_014502	CT	3	6	9543	9548	0 %	50 %	0 %	50 %	307149715
9	NC_014502	AG	4	8	10349	10356	50 %	0 %	50 %	0 %	307149715
10	NC_014502	TA	3	6	11450	11455	50 %	50 %	0 %	0 %	307149716
11	NC_014502	AT	3	6	11748	11753	50 %	50 %	0 %	0 %	307149717
12	NC_014502	CG	3	6	12489	12494	0 %	0 %	50 %	50 %	307149717
13	NC_014502	AG	3	6	13009	13014	50 %	0 %	50 %	0 %	307149717
14	NC_014502	TA	3	6	13539	13544	50 %	50 %	0 %	0 %	307149717
15	NC_014502	AT	3	6	14085	14090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014502	AT	3	6	14587	14592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014502	AT	3	6	14650	14655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014502	GA	3	6	15259	15264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014502	TA	4	8	15842	15849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014502	TA	3	6	16624	16629	50 %	50 %	0 %	0 %	307149719
21	NC_014502	TA	3	6	16676	16681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014502	AG	4	8	16900	16907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014502	TA	3	6	17367	17372	50 %	50 %	0 %	0 %	307149720
24	NC_014502	AG	3	6	17999	18004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014502	TA	3	6	19103	19108	50 %	50 %	0 %	0 %	307149722
26	NC_014502	AT	3	6	22810	22815	50 %	50 %	0 %	0 %	307149723
27	NC_014502	AG	3	6	26757	26762	50 %	0 %	50 %	0 %	307149728
28	NC_014502	CA	3	6	26808	26813	50 %	0 %	0 %	50 %	307149728
29	NC_014502	AC	3	6	27883	27888	50 %	0 %	0 %	50 %	307149731
30	NC_014502	GA	3	6	28480	28485	50 %	0 %	50 %	0 %	307149732
31	NC_014502	AG	4	8	29197	29204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014502	TC	3	6	29213	29218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014502	TC	3	6	29220	29225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014502	CT	3	6	29714	29719	0 %	50 %	0 %	50 %	307149735
35	NC_014502	TC	3	6	29875	29880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014502	GT	4	8	30450	30457	0 %	50 %	50 %	0 %	307149737
37	NC_014502	GA	4	8	30659	30666	50 %	0 %	50 %	0 %	307149737
38	NC_014502	TG	3	6	30877	30882	0 %	50 %	50 %	0 %	307149737
39	NC_014502	TA	3	6	31302	31307	50 %	50 %	0 %	0 %	307149738
40	NC_014502	CG	3	6	32120	32125	0 %	0 %	50 %	50 %	307149740
41	NC_014502	AT	3	6	32223	32228	50 %	50 %	0 %	0 %	307149740
42	NC_014502	TA	3	6	33151	33156	50 %	50 %	0 %	0 %	307149741
43	NC_014502	AT	3	6	33226	33231	50 %	50 %	0 %	0 %	307149741
44	NC_014502	CT	3	6	34328	34333	0 %	50 %	0 %	50 %	307149743
45	NC_014502	TG	3	6	34997	35002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014502	AT	3	6	36125	36130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014502	AG	3	6	36181	36186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014502	CT	3	6	37739	37744	0 %	50 %	0 %	50 %	307149748
49	NC_014502	CT	3	6	38644	38649	0 %	50 %	0 %	50 %	307149748
50	NC_014502	CT	4	8	39035	39042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014502	GT	3	6	39278	39283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014502	TA	5	10	39477	39486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014502	AC	3	6	42740	42745	50 %	0 %	0 %	50 %	307149750
54	NC_014502	CA	3	6	42905	42910	50 %	0 %	0 %	50 %	307149750
55	NC_014502	AC	3	6	43262	43267	50 %	0 %	0 %	50 %	307149750
56	NC_014502	TA	3	6	43331	43336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014502	TA	3	6	43518	43523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014502	TA	3	6	43538	43543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014502	TA	3	6	44996	45001	50 %	50 %	0 %	0 %	307149752
60	NC_014502	TC	3	6	45304	45309	0 %	50 %	0 %	50 %	307149752
61	NC_014502	TA	3	6	46842	46847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014502	CT	3	6	54666	54671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014502	GT	3	6	54722	54727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014502	AT	3	6	55462	55467	50 %	50 %	0 %	0 %	307149756
65	NC_014502	AT	3	6	56597	56602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014502	AT	3	6	57327	57332	50 %	50 %	0 %	0 %	307149757
67	NC_014502	TA	3	6	57694	57699	50 %	50 %	0 %	0 %	307149757
68	NC_014502	AT	3	6	57905	57910	50 %	50 %	0 %	0 %	307149757
69	NC_014502	AT	3	6	58065	58070	50 %	50 %	0 %	0 %	307149758
70	NC_014502	AT	3	6	58495	58500	50 %	50 %	0 %	0 %	307149758
71	NC_014502	TA	3	6	59373	59378	50 %	50 %	0 %	0 %	307149759
72	NC_014502	AT	3	6	59776	59781	50 %	50 %	0 %	0 %	307149760
73	NC_014502	AT	3	6	60185	60190	50 %	50 %	0 %	0 %	307149760
74	NC_014502	TA	3	6	62665	62670	50 %	50 %	0 %	0 %	307149762
75	NC_014502	AT	5	10	63355	63364	50 %	50 %	0 %	0 %	307149763
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77	NC_014502	AT	3	6	64907	64912	50 %	50 %	0 %	0 %	307149764
78	NC_014502	CT	3	6	65294	65299	0 %	50 %	0 %	50 %	307149764
79	NC_014502	AT	3	6	65401	65406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014502	TA	4	8	65840	65847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014502	TA	3	6	66375	66380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014502	TA	3	6	67029	67034	50 %	50 %	0 %	0 %	307149765
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84	NC_014502	TG	3	6	68934	68939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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87	NC_014502	CT	3	6	69941	69946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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91	NC_014502	AT	3	6	73077	73082	50 %	50 %	0 %	0 %	307149769
92	NC_014502	AG	3	6	73742	73747	50 %	0 %	50 %	0 %	307149769
93	NC_014502	TA	3	6	74123	74128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014502	AG	3	6	76507	76512	50 %	0 %	50 %	0 %	307149772
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97	NC_014502	TA	3	6	78011	78016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014502	TA	3	6	78032	78037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014502	CT	3	6	78528	78533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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106	NC_014502	AG	3	6	81704	81709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_014502	TA	3	6	82008	82013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014502	TA	3	6	82065	82070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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113	NC_014502	AG	3	6	87502	87507	50 %	0 %	50 %	0 %	307149776
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118	NC_014502	AT	3	6	93560	93565	50 %	50 %	0 %	0 %	307149776
119	NC_014502	AT	3	6	93597	93602	50 %	50 %	0 %	0 %	307149776
120	NC_014502	GA	3	6	94076	94081	50 %	0 %	50 %	0 %	307149776
121	NC_014502	AT	3	6	94268	94273	50 %	50 %	0 %	0 %	307149776
122	NC_014502	AT	3	6	94625	94630	50 %	50 %	0 %	0 %	307149776
123	NC_014502	AT	3	6	95516	95521	50 %	50 %	0 %	0 %	307149776
124	NC_014502	AG	3	6	97064	97069	50 %	0 %	50 %	0 %	307149776
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128	NC_014502	CA	3	6	101452	101457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014502	TA	3	6	102218	102223	50 %	50 %	0 %	0 %	307149777
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131	NC_014502	AT	3	6	102967	102972	50 %	50 %	0 %	0 %	307149777
132	NC_014502	TC	3	6	103354	103359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014502	CA	3	6	105069	105074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014502	TG	3	6	105409	105414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014502	TG	3	6	105454	105459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_014502	TA	3	6	106769	106774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.