MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782203

Total Repeats: 6424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014502	TAAT	2	8	45997	46004	50 %	50 %	0 %	0 %	307149752
1002	NC_014502	TAATTT	2	12	46020	46031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014502	T	9	9	46029	46037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014502	A	6	6	46054	46059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014502	CTTC	2	8	46102	46109	0 %	50 %	0 %	50 %	307149753
1006	NC_014502	A	6	6	46130	46135	100 %	0 %	0 %	0 %	307149753
1007	NC_014502	TTA	2	6	46159	46164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149753
1008	NC_014502	ATAA	2	8	46178	46185	75 %	25 %	0 %	0 %	307149753
1009	NC_014502	CAT	2	6	46228	46233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149753
1010	NC_014502	A	8	8	46311	46318	100 %	0 %	0 %	0 %	307149753
1011	NC_014502	T	6	6	46341	46346	0 %	100 %	0 %	0 %	307149753
1012	NC_014502	ATG	2	6	46382	46387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149753
1013	NC_014502	ACG	2	6	46388	46393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149753
1014	NC_014502	AAT	2	6	46400	46405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149753
1015	NC_014502	TCT	2	6	46410	46415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149753
1016	NC_014502	GAC	2	6	46447	46452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149753
1017	NC_014502	ATA	2	6	46456	46461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149753
1018	NC_014502	CTC	2	6	46531	46536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149753
1019	NC_014502	A	6	6	46543	46548	100 %	0 %	0 %	0 %	307149753
1020	NC_014502	GATCA	2	10	46586	46595	40 %	20 %	20 %	20 %	307149753
1021	NC_014502	ATT	2	6	46625	46630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149753
1022	NC_014502	AAG	2	6	46660	46665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014502	A	6	6	46738	46743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014502	TCAA	2	8	46813	46820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_014502	TA	3	6	46842	46847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014502	TAA	2	6	46853	46858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014502	CAT	2	6	46883	46888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_014502	AAT	2	6	46893	46898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014502	CTT	2	6	46943	46948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_014502	CTAA	2	8	46998	47005	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_014502	ACT	2	6	47012	47017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_014502	GCC	2	6	47030	47035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_014502	A	7	7	47037	47043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014502	CAA	2	6	47088	47093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_014502	AAT	2	6	47100	47105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014502	AAT	2	6	47108	47113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014502	TTG	2	6	47135	47140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014502	A	6	6	47141	47146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014502	TAC	2	6	47239	47244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_014502	ACGG	2	8	47292	47299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_014502	ACGA	2	8	47333	47340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_014502	GATA	2	8	47400	47407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014502	CATAG	2	10	47502	47511	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1044	NC_014502	CCG	2	6	47581	47586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149754
1045	NC_014502	AATT	2	8	47602	47609	50 %	50 %	0 %	0 %	307149754
1046	NC_014502	TATC	2	8	47716	47723	25 %	50 %	0 %	25 %	307149754
1047	NC_014502	CCT	2	6	47793	47798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149754
1048	NC_014502	ATC	2	6	47831	47836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1049	NC_014502	CTC	2	6	47872	47877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307149754
1050	NC_014502	ATC	2	6	47915	47920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1051	NC_014502	AGA	2	6	48009	48014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307149754
1052	NC_014502	ATC	2	6	48041	48046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1053	NC_014502	ATC	2	6	48068	48073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1054	NC_014502	GCC	2	6	48080	48085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149754
1055	NC_014502	ATC	2	6	48218	48223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1056	NC_014502	ACC	2	6	48266	48271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149754
1057	NC_014502	CAT	2	6	48406	48411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1058	NC_014502	TTG	2	6	48561	48566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149754
1059	NC_014502	CCG	2	6	48661	48666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149754
1060	NC_014502	TTA	2	6	48690	48695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149754
1061	NC_014502	CAT	2	6	48709	48714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1062	NC_014502	TTG	2	6	48864	48869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149754
1063	NC_014502	CCG	2	6	48964	48969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149754
1064	NC_014502	CAT	2	6	49012	49017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1065	NC_014502	TTG	2	6	49167	49172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149754
1066	NC_014502	CCG	2	6	49267	49272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149754
1067	NC_014502	CAT	2	6	49315	49320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1068	NC_014502	TTG	2	6	49470	49475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149754
1069	NC_014502	CCG	2	6	49570	49575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149754
1070	NC_014502	TGG	2	6	49585	49590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149754
1071	NC_014502	TTA	2	6	49599	49604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149754
1072	NC_014502	CAT	2	6	49618	49623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1073	NC_014502	TTG	2	6	49773	49778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307149754
1074	NC_014502	CCG	2	6	49873	49878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149754
1075	NC_014502	GTA	2	6	49890	49895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149754
1076	NC_014502	TTA	2	6	49902	49907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149754
1077	NC_014502	CAT	2	6	49921	49926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1078	NC_014502	CCG	2	6	50176	50181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149754
1079	NC_014502	TTA	2	6	50205	50210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149754
1080	NC_014502	CAT	2	6	50224	50229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1081	NC_014502	CCG	2	6	50479	50484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149754
1082	NC_014502	GTA	2	6	50496	50501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149754
1083	NC_014502	TCA	2	6	50508	50513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1084	NC_014502	GGTT	2	8	50526	50533	0 %	50 %	50 %	0 %	307149754
1085	NC_014502	ATCTCC	2	12	50600	50611	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
1086	NC_014502	GCA	2	6	50637	50642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149754
1087	NC_014502	G	6	6	50677	50682	0 %	0 %	100 %	0 %	307149754
1088	NC_014502	TAG	2	6	50721	50726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149754
1089	NC_014502	TCTCCA	2	12	50766	50777	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
1090	NC_014502	G	6	6	50842	50847	0 %	0 %	100 %	0 %	307149754
1091	NC_014502	TAG	2	6	50886	50891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149754
1092	NC_014502	TCTCCA	2	12	50931	50942	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
1093	NC_014502	G	6	6	51007	51012	0 %	0 %	100 %	0 %	307149754
1094	NC_014502	CAA	2	6	51013	51018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307149754
1095	NC_014502	ACCTGT	2	12	51038	51049	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	307149754
1096	NC_014502	TAG	2	6	51057	51062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149754
1097	NC_014502	GCA	2	6	51183	51188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149754
1098	NC_014502	ACT	2	6	51197	51202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1099	NC_014502	TAG	2	6	51222	51227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149754
1100	NC_014502	TCTCCA	2	12	51267	51278	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
1101	NC_014502	GCC	2	6	51366	51371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149754
1102	NC_014502	ACCGTA	2	12	51399	51410	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307149754
1103	NC_014502	TAAA	2	8	51444	51451	75 %	25 %	0 %	0 %	307149754
1104	NC_014502	CGA	2	6	51598	51603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307149754
1105	NC_014502	CGG	2	6	51616	51621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149754
1106	NC_014502	TCA	2	6	51690	51695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1107	NC_014502	GGTT	2	8	51708	51715	0 %	50 %	50 %	0 %	307149754
1108	NC_014502	TCTCCA	2	12	51783	51794	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
1109	NC_014502	GGTG	2	8	51809	51816	0 %	25 %	75 %	0 %	307149754
1110	NC_014502	ATT	2	6	51923	51928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149754
1111	NC_014502	TCTCCA	2	12	51948	51959	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
1112	NC_014502	G	6	6	52024	52029	0 %	0 %	100 %	0 %	307149754
1113	NC_014502	TAG	2	6	52068	52073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149754
1114	NC_014502	ATA	2	6	52085	52090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149754
1115	NC_014502	TCTCCA	2	12	52113	52124	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
1116	NC_014502	TCTCCA	2	12	52278	52289	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
1117	NC_014502	GGC	2	6	52310	52315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149754
1118	NC_014502	G	6	6	52354	52359	0 %	0 %	100 %	0 %	307149754
1119	NC_014502	ACT	2	6	52373	52378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149754
1120	NC_014502	TCTCCA	2	12	52443	52454	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307149754
1121	NC_014502	GGC	2	6	52475	52480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149754
1122	NC_014502	TGA	2	6	52523	52528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149754
1123	NC_014502	CTCA	2	8	52538	52545	25 %	25 %	0 %	50 %	307149754
1124	NC_014502	AGTT	2	8	52548	52555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014502	TTG	2	6	52570	52575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014502	TTA	2	6	52587	52592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014502	ATC	2	6	52635	52640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_014502	T	8	8	52643	52650	0 %	100 %	0 %	0 %	307149755
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1174	NC_014502	AAG	2	6	55257	55262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1249	NC_014502	A	6	6	57982	57987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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