MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782203

Total Repeats: 6424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014502	CCA	2	6	228169	228174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149894
5002	NC_014502	GCCTCA	2	12	228274	228285	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	307149894
5003	NC_014502	TGG	2	6	228419	228424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149894
5004	NC_014502	GGC	2	6	228489	228494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307149894
5005	NC_014502	CAC	2	6	228506	228511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307149894
5006	NC_014502	CTAT	2	8	228616	228623	25 %	50 %	0 %	25 %	307149894
5007	NC_014502	TACT	2	8	228650	228657	25 %	50 %	0 %	25 %	307149894
5008	NC_014502	TGG	2	6	228694	228699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307149894
5009	NC_014502	AG	3	6	228761	228766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_014502	CCT	2	6	228803	228808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_014502	TGT	2	6	228809	228814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_014502	T	6	6	228830	228835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_014502	CCT	2	6	228843	228848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_014502	TAA	2	6	228858	228863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_014502	AAC	2	6	228945	228950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_014502	CAT	2	6	229004	229009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_014502	TCT	2	6	229066	229071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_014502	T	6	6	229155	229160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_014502	TGT	2	6	229172	229177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_014502	GCA	2	6	229208	229213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_014502	ATG	2	6	229216	229221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_014502	A	6	6	229265	229270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_014502	TAATT	2	10	229311	229320	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_014502	TCCTCT	2	12	229366	229377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_014502	AATC	2	8	229423	229430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_014502	CAT	2	6	229437	229442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_014502	T	6	6	229453	229458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_014502	AAC	2	6	229637	229642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_014502	AGC	2	6	229647	229652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_014502	ATAA	2	8	229667	229674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_014502	TTTA	2	8	229691	229698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_014502	ATT	2	6	229740	229745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_014502	TAA	2	6	229782	229787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_014502	ATT	2	6	229818	229823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_014502	T	7	7	229851	229857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_014502	A	6	6	229859	229864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_014502	A	8	8	229905	229912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_014502	TAA	2	6	230048	230053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149895
5039	NC_014502	CCG	2	6	230065	230070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307149895
5040	NC_014502	CTGT	2	8	230079	230086	0 %	50 %	25 %	25 %	307149895
5041	NC_014502	CTG	2	6	230128	230133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149895
5042	NC_014502	AAAC	2	8	230186	230193	75 %	0 %	0 %	25 %	307149895
5043	NC_014502	A	6	6	230246	230251	100 %	0 %	0 %	0 %	307149895
5044	NC_014502	ATT	2	6	230267	230272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307149895
5045	NC_014502	GTTT	2	8	230343	230350	0 %	75 %	25 %	0 %	307149895
5046	NC_014502	GAG	2	6	230485	230490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307149895
5047	NC_014502	TCT	2	6	230508	230513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307149895
5048	NC_014502	ACT	2	6	230564	230569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149895
5049	NC_014502	AGTT	2	8	230642	230649	25 %	50 %	25 %	0 %	307149895
5050	NC_014502	AATT	2	8	230701	230708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_014502	TCA	2	6	230734	230739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_014502	TTA	2	6	230759	230764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_014502	ATT	2	6	230772	230777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_014502	AC	3	6	230810	230815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5055	NC_014502	CGC	2	6	230816	230821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_014502	ATT	2	6	230884	230889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_014502	TTC	2	6	230919	230924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_014502	ACATTA	2	12	230929	230940	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5059	NC_014502	ATA	2	6	230941	230946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_014502	ACTT	2	8	231005	231012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5061	NC_014502	ATC	2	6	231108	231113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_014502	CGC	2	6	231119	231124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_014502	CTC	2	6	231146	231151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5064	NC_014502	CTA	2	6	231152	231157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_014502	TCC	2	6	231174	231179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_014502	ATT	2	6	231216	231221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_014502	TAT	2	6	231242	231247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_014502	TCC	2	6	231298	231303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_014502	CAT	2	6	231458	231463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_014502	ATT	2	6	231489	231494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_014502	CTC	2	6	231497	231502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_014502	TAT	2	6	231536	231541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_014502	TAA	2	6	231579	231584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_014502	TG	3	6	231628	231633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_014502	ATT	2	6	231663	231668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_014502	GTT	2	6	231740	231745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_014502	TGG	2	6	231827	231832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_014502	TCC	2	6	231840	231845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_014502	AAGCTG	2	12	231865	231876	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5080	NC_014502	GAG	2	6	231912	231917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_014502	TTA	3	9	231919	231927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_014502	TAT	2	6	232034	232039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_014502	TGCT	2	8	232082	232089	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_014502	TTA	2	6	232108	232113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_014502	GCG	2	6	232114	232119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_014502	GTAT	2	8	232230	232237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_014502	GGT	2	6	232272	232277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_014502	TTA	2	6	232351	232356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_014502	CAC	2	6	232364	232369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5090	NC_014502	TGGG	2	8	232460	232467	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_014502	GAT	2	6	232494	232499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_014502	G	6	6	232596	232601	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_014502	TGG	2	6	232652	232657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_014502	CGG	2	6	232697	232702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_014502	CGA	2	6	232709	232714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_014502	CCAA	2	8	232794	232801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_014502	TTG	2	6	232863	232868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_014502	CGG	2	6	232958	232963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_014502	ATG	2	6	232969	232974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_014502	GGA	2	6	232986	232991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_014502	GAT	2	6	232995	233000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_014502	TCC	2	6	233080	233085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_014502	AAC	2	6	233175	233180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_014502	CCA	2	6	233206	233211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5105	NC_014502	CCAA	2	8	233214	233221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_014502	AGC	2	6	233256	233261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_014502	TCC	2	6	233283	233288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_014502	TCC	3	9	233313	233321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_014502	ATCC	2	8	233354	233361	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_014502	ACC	2	6	233385	233390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_014502	TCC	2	6	233403	233408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_014502	TCC	2	6	233418	233423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_014502	TTG	2	6	233460	233465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_014502	TA	3	6	233486	233491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_014502	AATT	2	8	233492	233499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_014502	TAA	2	6	233528	233533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_014502	GT	3	6	233549	233554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_014502	TCGC	2	8	233561	233568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_014502	C	6	6	233600	233605	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5120	NC_014502	CAA	2	6	233717	233722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_014502	CAT	2	6	233741	233746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_014502	CGC	2	6	233754	233759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_014502	CCAAAC	2	12	233783	233794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_014502	CAT	2	6	233924	233929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_014502	C	6	6	234010	234015	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5126	NC_014502	AAATT	2	10	234026	234035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_014502	CAT	2	6	234044	234049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_014502	CCT	2	6	234064	234069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_014502	ATT	2	6	234090	234095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_014502	CAT	2	6	234152	234157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_014502	ACG	2	6	234261	234266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_014502	TCA	2	6	234310	234315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_014502	CAT	2	6	234317	234322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_014502	AAC	2	6	234337	234342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_014502	CCATTC	2	12	234379	234390	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5136	NC_014502	GAC	2	6	234404	234409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5137	NC_014502	ATA	2	6	234433	234438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_014502	TAG	2	6	234497	234502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_014502	GATC	2	8	234515	234522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5140	NC_014502	ACG	2	6	234531	234536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5142	NC_014502	TCA	2	6	234607	234612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5144	NC_014502	ACT	2	6	234627	234632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5146	NC_014502	TAAT	2	8	234742	234749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_014502	CGA	2	6	234760	234765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5149	NC_014502	ATAACT	2	12	234861	234872	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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5151	NC_014502	TAT	2	6	235010	235015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5152	NC_014502	ATTA	2	8	235020	235027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5153	NC_014502	CTT	2	6	235090	235095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5154	NC_014502	TA	3	6	235115	235120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5155	NC_014502	CTC	2	6	235160	235165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5156	NC_014502	AATC	2	8	235221	235228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5157	NC_014502	TAT	2	6	235262	235267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5158	NC_014502	ATAAGT	2	12	235323	235334	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5160	NC_014502	TGT	2	6	235377	235382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5162	NC_014502	TCT	2	6	235594	235599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5163	NC_014502	TCC	2	6	235614	235619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5164	NC_014502	TAAA	2	8	235682	235689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5165	NC_014502	CTA	2	6	235726	235731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5167	NC_014502	TCA	2	6	235798	235803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5256	NC_014502	T	6	6	239434	239439	0 %	100 %	0 %	0 %	307149896
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5260	NC_014502	T	6	6	239536	239541	0 %	100 %	0 %	0 %	307149896
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5262	NC_014502	GGAG	2	8	239588	239595	25 %	0 %	75 %	0 %	307149896
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5264	NC_014502	GTA	2	6	239679	239684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307149896
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5385	NC_014502	ACAA	2	8	243897	243904	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5387	NC_014502	ATT	2	6	244011	244016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5388	NC_014502	C	6	6	244018	244023	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5390	NC_014502	T	6	6	244044	244049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5391	NC_014502	CGT	2	6	244080	244085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307149905
5392	NC_014502	TTCTCG	2	12	244088	244099	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	307149905
5393	NC_014502	ACT	2	6	244130	244135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307149905
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5395	NC_014502	T	6	6	244249	244254	0 %	100 %	0 %	0 %	307149905
5396	NC_014502	ATA	2	6	244283	244288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307149905
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5400	NC_014502	T	7	7	244424	244430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5401	NC_014502	AT	3	6	244481	244486	50 %	50 %	0 %	0 %	307149906
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5497	NC_014502	CA	3	6	249308	249313	50 %	0 %	0 %	50 %	307149906
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