MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 127488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014501	TTG	2	6	191486	191491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150113
4002	NC_014501	GAA	2	6	191512	191517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150113
4003	NC_014501	TTG	2	6	191519	191524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150113
4004	NC_014501	GTT	2	6	191548	191553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150113
4005	NC_014501	TTG	2	6	191624	191629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150113
4006	NC_014501	TTGA	2	8	191657	191664	25 %	50 %	25 %	0 %	307150113
4007	NC_014501	ATT	2	6	191666	191671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150113
4008	NC_014501	AAAT	2	8	191722	191729	75 %	25 %	0 %	0 %	307150113
4009	NC_014501	T	6	6	191756	191761	0 %	100 %	0 %	0 %	307150113
4010	NC_014501	ATC	2	6	191805	191810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150113
4011	NC_014501	TACC	2	8	191815	191822	25 %	25 %	0 %	50 %	307150113
4012	NC_014501	AAC	2	6	191828	191833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150113
4013	NC_014501	GTG	2	6	191850	191855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150113
4014	NC_014501	GA	3	6	191928	191933	50 %	0 %	50 %	0 %	307150113
4015	NC_014501	TA	3	6	192003	192008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_014501	ACT	2	6	192023	192028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_014501	TTAG	2	8	192045	192052	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_014501	TCC	2	6	192084	192089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_014501	ATA	2	6	192093	192098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_014501	T	6	6	192130	192135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_014501	AAGC	2	8	192221	192228	50 %	0 %	25 %	25 %	307150114
4022	NC_014501	AACCTT	2	12	192241	192252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150114
4023	NC_014501	GTC	2	6	192254	192259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150114
4024	NC_014501	A	6	6	192261	192266	100 %	0 %	0 %	0 %	307150114
4025	NC_014501	GCC	2	6	192272	192277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150114
4026	NC_014501	AGG	2	6	192313	192318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	307150114
4027	NC_014501	GCC	2	6	192409	192414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150114
4028	NC_014501	A	6	6	192533	192538	100 %	0 %	0 %	0 %	307150114
4029	NC_014501	GAT	2	6	192620	192625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150114
4030	NC_014501	AC	3	6	192628	192633	50 %	0 %	0 %	50 %	307150114
4031	NC_014501	TG	3	6	192752	192757	0 %	50 %	50 %	0 %	307150114
4032	NC_014501	CAG	2	6	192816	192821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150114
4033	NC_014501	TGG	2	6	192869	192874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150114
4034	NC_014501	CTC	2	6	192875	192880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150114
4035	NC_014501	ATA	2	6	192934	192939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_014501	TGAC	2	8	192966	192973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4037	NC_014501	TTGT	2	8	192979	192986	0 %	75 %	25 %	0 %	307150115
4038	NC_014501	GGC	2	6	193016	193021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150115
4039	NC_014501	CTG	2	6	193147	193152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150115
4040	NC_014501	TC	3	6	193272	193277	0 %	50 %	0 %	50 %	307150115
4041	NC_014501	C	6	6	193277	193282	0 %	0 %	0 %	100 %	307150115
4042	NC_014501	AAGCCT	2	12	193293	193304	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	307150115
4043	NC_014501	AGT	2	6	193305	193310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150115
4044	NC_014501	CCG	2	6	193311	193316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150115
4045	NC_014501	TAC	2	6	193411	193416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150115
4046	NC_014501	ACCA	2	8	193425	193432	50 %	0 %	0 %	50 %	307150115
4047	NC_014501	TCAT	2	8	193462	193469	25 %	50 %	0 %	25 %	307150115
4048	NC_014501	TCC	2	6	193493	193498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150115
4049	NC_014501	TC	3	6	193537	193542	0 %	50 %	0 %	50 %	307150115
4050	NC_014501	ATCA	2	8	193617	193624	50 %	25 %	0 %	25 %	307150115
4051	NC_014501	GCA	2	6	193758	193763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150116
4052	NC_014501	ATT	2	6	193781	193786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150116
4053	NC_014501	CTAT	2	8	193795	193802	25 %	50 %	0 %	25 %	307150116
4054	NC_014501	TTC	2	6	193825	193830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150116
4055	NC_014501	CAT	2	6	193841	193846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150116
4056	NC_014501	TGGC	2	8	193898	193905	0 %	25 %	50 %	25 %	307150116
4057	NC_014501	ATG	2	6	193917	193922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150116
4058	NC_014501	TGT	2	6	193927	193932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150116
4059	NC_014501	TTTATT	2	12	194012	194023	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	307150116
4060	NC_014501	T	6	6	194124	194129	0 %	100 %	0 %	0 %	307150116
4061	NC_014501	GTTA	2	8	194204	194211	25 %	50 %	25 %	0 %	307150116
4062	NC_014501	CGG	2	6	194333	194338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150116
4063	NC_014501	TTGG	2	8	194410	194417	0 %	50 %	50 %	0 %	307150116
4064	NC_014501	CAA	2	6	194463	194468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150116
4065	NC_014501	TTA	2	6	194472	194477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150116
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4068	NC_014501	AGA	2	6	194552	194557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150116
4069	NC_014501	ATACTT	3	18	194593	194610	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	307150116
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4071	NC_014501	AATT	2	8	194665	194672	50 %	50 %	0 %	0 %	307150116
4072	NC_014501	A	6	6	194746	194751	100 %	0 %	0 %	0 %	307150116
4073	NC_014501	A	6	6	194782	194787	100 %	0 %	0 %	0 %	307150116
4074	NC_014501	AG	3	6	194790	194795	50 %	0 %	50 %	0 %	307150116
4075	NC_014501	TAT	2	6	194809	194814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150116
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4077	NC_014501	AGAA	2	8	194924	194931	75 %	0 %	25 %	0 %	307150116
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4080	NC_014501	GGC	2	6	195069	195074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150117
4081	NC_014501	GGAATG	2	12	195075	195086	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307150117
4082	NC_014501	GGT	2	6	195101	195106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150117
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4084	NC_014501	GGGTT	2	10	195152	195161	0 %	40 %	60 %	0 %	307150117
4085	NC_014501	AAT	2	6	195176	195181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150117
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4089	NC_014501	AAT	2	6	195515	195520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150117
4090	NC_014501	TTAA	2	8	195543	195550	50 %	50 %	0 %	0 %	307150117
4091	NC_014501	CTG	2	6	195625	195630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150117
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4093	NC_014501	TAA	2	6	195670	195675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150117
4094	NC_014501	GCG	2	6	195719	195724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150117
4095	NC_014501	GA	3	6	195740	195745	50 %	0 %	50 %	0 %	307150117
4096	NC_014501	TTA	2	6	195811	195816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150117
4097	NC_014501	ATG	2	6	195822	195827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150117
4098	NC_014501	TG	3	6	195870	195875	0 %	50 %	50 %	0 %	307150117
4099	NC_014501	CTT	2	6	195964	195969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150117
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4102	NC_014501	AGCA	2	8	196079	196086	50 %	0 %	25 %	25 %	307150117
4103	NC_014501	AT	3	6	196142	196147	50 %	50 %	0 %	0 %	307150117
4104	NC_014501	TCA	2	6	196267	196272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150117
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4106	NC_014501	CA	3	6	196472	196477	50 %	0 %	0 %	50 %	307150117
4107	NC_014501	GA	3	6	196480	196485	50 %	0 %	50 %	0 %	307150117
4108	NC_014501	T	6	6	196492	196497	0 %	100 %	0 %	0 %	307150117
4109	NC_014501	TTG	2	6	196515	196520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150117
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4111	NC_014501	GGGAAT	2	12	196547	196558	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307150117
4112	NC_014501	AAG	3	9	196581	196589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150117
4113	NC_014501	ATT	2	6	196614	196619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150117
4114	NC_014501	CTC	2	6	196664	196669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_014501	TTCA	2	8	196697	196704	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_014501	A	6	6	196732	196737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_014501	T	6	6	196771	196776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_014501	AGTA	2	8	196788	196795	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_014501	TTA	2	6	196900	196905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_014501	TAT	2	6	196948	196953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150118
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4122	NC_014501	T	6	6	197045	197050	0 %	100 %	0 %	0 %	307150118
4123	NC_014501	TTC	2	6	197079	197084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150118
4124	NC_014501	CTT	2	6	197147	197152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150118
4125	NC_014501	ATA	2	6	197154	197159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150118
4126	NC_014501	TAA	2	6	197198	197203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150118
4127	NC_014501	TTGA	2	8	197214	197221	25 %	50 %	25 %	0 %	307150118
4128	NC_014501	A	6	6	197226	197231	100 %	0 %	0 %	0 %	307150118
4129	NC_014501	GAA	2	6	197273	197278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150118
4130	NC_014501	TAAAT	2	10	197286	197295	60 %	40 %	0 %	0 %	307150118
4131	NC_014501	AAATA	2	10	197309	197318	80 %	20 %	0 %	0 %	307150118
4132	NC_014501	A	7	7	197346	197352	100 %	0 %	0 %	0 %	307150118
4133	NC_014501	TCC	2	6	197391	197396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	307150118
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4135	NC_014501	AT	5	10	197533	197542	50 %	50 %	0 %	0 %	307150118
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4143	NC_014501	TAAT	2	8	197723	197730	50 %	50 %	0 %	0 %	307150119
4144	NC_014501	AT	3	6	197768	197773	50 %	50 %	0 %	0 %	307150119
4145	NC_014501	GGC	2	6	197786	197791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150119
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4151	NC_014501	A	6	6	198012	198017	100 %	0 %	0 %	0 %	307150119
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4156	NC_014501	ATG	2	6	198195	198200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150119
4157	NC_014501	CTG	2	6	198230	198235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150119
4158	NC_014501	CCG	2	6	198252	198257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150119
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4165	NC_014501	ATCG	2	8	198533	198540	25 %	25 %	25 %	25 %	307150119
4166	NC_014501	CTT	2	6	198604	198609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	307150119
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4183	NC_014501	GCC	2	6	199304	199309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	307150119
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4193	NC_014501	ATGAG	2	10	199623	199632	40 %	20 %	40 %	0 %	307150119
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4200	NC_014501	TTCCCA	2	12	199874	199885	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	307150119
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4206	NC_014501	GAATT	2	10	199998	200007	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4226	NC_014501	T	9	9	200831	200839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4227	NC_014501	TAA	2	6	200844	200849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4228	NC_014501	A	7	7	200862	200868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4229	NC_014501	A	6	6	200878	200883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4230	NC_014501	TTCT	2	8	200912	200919	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4231	NC_014501	TA	3	6	200928	200933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_014501	CAA	2	6	200953	200958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4233	NC_014501	TCA	2	6	200991	200996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4234	NC_014501	AGG	2	6	201075	201080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_014501	CAA	2	6	201086	201091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4236	NC_014501	A	7	7	201090	201096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4237	NC_014501	GTA	2	6	201235	201240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150121
4238	NC_014501	TTA	2	6	201299	201304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150121
4239	NC_014501	TAA	2	6	201420	201425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_014501	TTA	2	6	201427	201432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_014501	CTGAT	2	10	201475	201484	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4242	NC_014501	CAG	3	9	201491	201499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4243	NC_014501	ATT	2	6	201509	201514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_014501	ACA	2	6	201550	201555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4245	NC_014501	GCCTTT	2	12	201581	201592	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4246	NC_014501	CTTT	2	8	201698	201705	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4247	NC_014501	GTAGAG	2	12	201754	201765	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	307150122
4248	NC_014501	ATTTT	2	10	201896	201905	20 %	80 %	0 %	0 %	307150122
4249	NC_014501	GTA	2	6	201982	201987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150122
4250	NC_014501	ATT	2	6	202152	202157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150122
4251	NC_014501	T	6	6	202203	202208	0 %	100 %	0 %	0 %	307150122
4252	NC_014501	TGA	2	6	202227	202232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150122
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4254	NC_014501	AGT	2	6	202438	202443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150122
4255	NC_014501	GAT	2	6	202476	202481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150122
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4258	NC_014501	CCG	2	6	202706	202711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4259	NC_014501	ATT	2	6	202761	202766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4263	NC_014501	T	7	7	202811	202817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4372	NC_014501	AT	3	6	207339	207344	50 %	50 %	0 %	0 %	307150125
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4499	NC_014501	CGA	2	6	212942	212947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150129
4500	NC_014501	CAC	2	6	212962	212967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	307150129

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