MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 chromosome

Total Repeats: 127488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014501	T	6	6	167307	167312	0 %	100 %	0 %	0 %	307150092
3502	NC_014501	CTGC	2	8	167322	167329	0 %	25 %	25 %	50 %	307150092
3503	NC_014501	GCA	2	6	167355	167360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150092
3504	NC_014501	GAA	2	6	167403	167408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150092
3505	NC_014501	CGG	2	6	167426	167431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	307150092
3506	NC_014501	TAA	2	6	167474	167479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150092
3507	NC_014501	ATT	2	6	167480	167485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150092
3508	NC_014501	A	7	7	167622	167628	100 %	0 %	0 %	0 %	307150092
3509	NC_014501	CAAA	2	8	167712	167719	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3510	NC_014501	A	6	6	167717	167722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_014501	CG	3	6	167725	167730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_014501	GAA	2	6	167833	167838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_014501	A	7	7	167926	167932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_014501	ACT	2	6	168013	168018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_014501	CT	4	8	168028	168035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3516	NC_014501	TCA	2	6	168068	168073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_014501	AGT	2	6	168076	168081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_014501	AAAC	2	8	168091	168098	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3519	NC_014501	A	7	7	168116	168122	100 %	0 %	0 %	0 %	307150093
3520	NC_014501	CAA	2	6	168124	168129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150093
3521	NC_014501	CAA	2	6	168165	168170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150093
3522	NC_014501	CAA	2	6	168180	168185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	307150093
3523	NC_014501	ATT	2	6	168240	168245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150093
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3528	NC_014501	AAG	2	6	168355	168360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150093
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3531	NC_014501	A	6	6	168558	168563	100 %	0 %	0 %	0 %	307150094
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3534	NC_014501	TGT	2	6	168909	168914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150094
3535	NC_014501	ATT	2	6	168921	168926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	307150095
3536	NC_014501	T	6	6	168947	168952	0 %	100 %	0 %	0 %	307150095
3537	NC_014501	ATC	2	6	169013	169018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150095
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3539	NC_014501	GAT	2	6	169114	169119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150095
3540	NC_014501	AAT	2	6	169121	169126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150095
3541	NC_014501	AG	3	6	169170	169175	50 %	0 %	50 %	0 %	307150095
3542	NC_014501	AGT	2	6	169178	169183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150095
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3545	NC_014501	ATG	2	6	169263	169268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	307150095
3546	NC_014501	ATC	5	15	169277	169291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	307150095
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3549	NC_014501	ACG	2	6	169444	169449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_014501	TTGCTT	2	12	169463	169474	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3551	NC_014501	ATA	2	6	169539	169544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_014501	A	6	6	169554	169559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_014501	A	7	7	169663	169669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_014501	T	6	6	169709	169714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_014501	CT	3	6	169715	169720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_014501	TGA	2	6	169730	169735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3558	NC_014501	TGA	2	6	169830	169835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_014501	TCCGA	2	10	169884	169893	20 %	20 %	20 %	40 %	307150096
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3563	NC_014501	AAG	2	6	170114	170119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	307150096
3564	NC_014501	TCTG	2	8	170146	170153	0 %	50 %	25 %	25 %	307150096
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3572	NC_014501	CTG	2	6	170609	170614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150096
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3580	NC_014501	AATT	2	8	170859	170866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_014501	TGT	2	6	170890	170895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_014501	T	7	7	170895	170901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_014501	TATC	2	8	170905	170912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_014501	TTA	2	6	170923	170928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_014501	TAGT	2	8	170979	170986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_014501	T	9	9	171023	171031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3588	NC_014501	TTTA	2	8	171109	171116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_014501	AT	3	6	171186	171191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_014501	AGAT	2	8	171196	171203	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_014501	A	8	8	171205	171212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_014501	TAAA	2	8	171216	171223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_014501	AATTA	2	10	171229	171238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_014501	A	6	6	171245	171250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_014501	TAA	2	6	171306	171311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_014501	GTC	2	6	171312	171317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_014501	AAT	2	6	171357	171362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_014501	ACTA	2	8	171384	171391	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3599	NC_014501	T	6	6	171396	171401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_014501	TCA	2	6	171405	171410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_014501	AGTA	2	8	171429	171436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_014501	ATAA	2	8	171444	171451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_014501	CCCCTT	2	12	171507	171518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_014501	CCT	2	6	171565	171570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_014501	AAAG	2	8	171648	171655	75 %	0 %	25 %	0 %	307150097
3606	NC_014501	TGG	2	6	171737	171742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	307150097
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3609	NC_014501	GGGT	2	8	172062	172069	0 %	25 %	75 %	0 %	307150097
3610	NC_014501	CAG	2	6	172109	172114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	307150097
3611	NC_014501	TAA	3	9	172170	172178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150097
3612	NC_014501	TAA	2	6	172191	172196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	307150097
3613	NC_014501	T	6	6	172212	172217	0 %	100 %	0 %	0 %	307150097
3614	NC_014501	CTA	2	6	172247	172252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_014501	CAT	2	6	172367	172372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3619	NC_014501	TTG	2	6	172462	172467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150098
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3621	NC_014501	CT	3	6	172499	172504	0 %	50 %	0 %	50 %	307150098
3622	NC_014501	GTAA	2	8	172535	172542	50 %	25 %	25 %	0 %	307150098
3623	NC_014501	CGT	2	6	172559	172564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	307150098
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3999	NC_014501	GTT	2	6	191440	191445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150113
4000	NC_014501	TTG	2	6	191471	191476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	307150113

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